$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Aβ40 ya Aβ42 Peptid 1. Hazırlayıcı HPLC saflaştırma
- HPLC saflaştırması için, aşağıdaki tamponlar hazırlamak.
- Ultra saf su 1000 ml NH4OH (% 28 çözelti) 1.3 mL ilave edilerek tampon A (20 mM NH4OH) hazırlayın.
- HPLC-grade asetonitril 800 mL ve ultra saf su 200 mL çözeltisine NH4OH (% 28 çözelti) 1.3 mL ilave edilerek tampon B (20 mM NH4 OH ile% 80 asetonitril) hazırlayın.
- Ultra saf su ve 100 mL NH4OH (% 28 çözelti), 100 uL eklenmesiyle Örnek erime tamponu (% 0.1 NH4OH) hazırlayın.
- Kurulum, Şekil 1 'de gösterildiği gibi, HPLC aleti.
- A tampon ve polimer tüp kullanarak HPLC pompası girişlerine B tampon içeren çözücü şişe yerleştirin. tek parça uydurma HPLC pompası polimer boru takın. polimer boru emin olunher bir tampon aygıtının doğru giriş valfı takılmıştır. Bir degazör ile HPLC pompası takın.
- Çift 300 Å 8 mikron 25 mm х 300 mm hazırlayıcı sütun girişi ile HPLC pompası polimer boru kullanılarak (Şekil 1B, aşırı sol sütun, Malzeme Listesi bakınız).
- tek parça parmak sıkı geçme ile hazırlayıcı sütun polimer boru takın. Polimer sütunu doğru bir şekilde yönlendirilmesini sağlamak.
Not: Hazırlama sütunun durağan faz poli (stiren-divinilbenzen) parçacıklar oluşur. Polimer kolonun doğru yönelim tek yönlü ok ile dış gövde üzerinde işaretlenir.
- Polimer boru kullanarak ikili dalga boyu dedektörü sütunun çıkışını bağlayın ve 214 nm ve 280 nm dalga boyu dedektörü ayarlayın.
- kurulum enstrüman yöntemi seçeneği belirleme dalgaboyu parametrelerini değiştirerek dalga boyu AlterDahili HPLC yazılımı.
- tek parçalı bir parmak sıkı geçme ile bir dalga boyu detektörü girişine polimer boru takın. dalga boyu dedektörü çıkış vanasına polimer boru takın. tek parça parmak sıkı geçme ile HPLC dedektörü çıkış vanasına polimer boru takın. Bu örnek toplama tüp olacaktır.
Not: Aβ peptidi üzerinde güçlü bir kromofor eksikliği 214 nm pik toplama primer ultraviyole (UV) bir dalga boyu olarak kullanılması zorunlu kılar.

Şekil 1: beta amiloid peptidlerin saflaştırılması için kullanılan HPLC aygıtının deney düzeneği. (A) bir gaz giderici ve 214 nm ve 280 nm ayarlı değişken dalga uzunluğu detektörü ile donatılmış kuaterner HPLC pompası; (B) olarak hazırlanmıştır HPLC sütunları arasında, beta amiloid peptidlerin saflaştırılması için kullanılansoldan sağa, 25 x 300 mm, 2, hazırlayıcı kolon, 7.5 x 300 mm, 2, yarı preparatif kolonu ve 4.6 x 250 mm 2 Analitik kolon; (C) analitik HPLC için kullanılan 20 uL paslanmaz çelik enjeksiyon döngü ile Manuel enjektör; (D) hazırlayıcı ve yarı hazırlayıcı saflaştırma için kullanılan 10 ml paslanmaz çelik enjeksiyon döngü ile manuel enjektör. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
- (HPLC yazılımı yerleşik kurulum enstrüman yöntemi seçeneği) çözücü tarife parametresini değiştirerek arıtma yöntemi giriniz Tablo 1'de görüldüğü gibi arıtma yöntemini çalıştırmak için HPLC yazılım programı. HPLC yazılım üzerinde "açık" butonuna tıklayarak HPLC pompası açın.
NOT: Pompa tampon A başlangıç oranını temin başlar ve hazırlık yoluyla B tampon olacakarative kolon ve HPLC aleti. - 30 dakika tamamen dengelenmesi için sistem bırakın.
| Saat / dakika | Tampon A% 'si | Tampon B b% | Akış Hızı d / ml dak -1 |
| 0 | 80 | 20 | 6 |
| 45 | 75.5 | 24.5 | 6 |
| 45.01 | 80 | 20 | 6 |
| 52.01 | 80 | 20 | 6 |
| 52.02 | 73 | 27 | 6 |
| 85 | 73 | 27 | 6 |
| 92 | 5 | 95 ° C | 6 |
Tablo 1: 25 × 300 mm polimer kolon kullanılarak Aβ42 ve Aβ40 peptidler saflaştırılması için zaman çizelgesi. Bir Tampon A - 20 mM NH4 OH ile H2O; 20 mM NH4 OH ile B% 80 MeCN /% 20 H2O; örnek aşağıdaki enjeksiyondan önce sütun yıkama 15 dakika Cı Ran; D HPLC enstrümantasyon 6 mL / dakika bir akış hızı çalıştırmak için, basınç sınırı 200 bar azaltılması gerekir.
- Aβ peptidi numunenin saflaştırılması
Not: Ham peptid bir otomasyonlu katı faz peptid sentezi ile elde edildi. 10 - Örnek erime 4 ml tampon ham Aβ peptidi 3 mg eritin. Oda sıcaklığında 30-60 sn ve çözünmeye yardımcı olması için 40 kHz frekansta örnek sonikasyon.
- 16-gauge ile donatılmış 5 mL'lik bir plastik bir şırınga kullanılarak HPLC kolonuna Numunenin tamamı enjektepaslanmaz çelik iğne. alt aşama 1.3 belirtildiği gibi arıtma yöntemi çalıştırın.
NOT: Sistem numune enjeksiyon 10 ml paslanmaz çelik enjeksiyon döngüsü (Şekil 1D) ile donatılmış bir el enjektörün kullanımı ile yapılabilir sağlar. İstenen Aβ peptid keskin çözülmesi tepe (Şekil 2C) olarak 72 ila 74 dakika Zehir. - 50 ml konik santrifüj tüpüne örnek toplamak. Toplanan eluent doğrudan enjeksiyon kütle spektrometresi ile Aβ zirve kimliğini onaylamak. 11 -20 ° C'de en fazla 12 saat boyunca yıkama sıvısı.
NOT: daha uzun 12 saat peptid oksidasyonu için potansiyeli nedeniyle tavsiye edilmez dönemler için çözümün depolama. - Toplanan kısım dondurma flaş saflaştırılmış peptid Yalıtmak / sıvı azot ve Lyophilize içinde Aβ peptid alikotları. -60 ° C ve bir pres içinde bir sıcaklıkta dondurularak kurutulması örnek tarafından liyofilizasyon gerçekleştirmek24 saatlik bir süre için 20 mTor olun.
- Aβ peptidi saflığını belirlemek için aşağıda verilen analitik HPLC protokolü çalıştırın. 6 aya kadar bir süre için -20 ° C 'de bunların liyofilize formda saklayın peptidler.
Saflaştırılmış Aβ Proteininin 2. Analitik HPLC Analizi
- alt bölümde 1.1 belirtildiği gibi HPLC tamponlar hazırlayın. Yukarıdaki protokol.
- Kurulum aşama 1.2.1 uyarınca ve 4.6 x 250 mm analitik sütun (Şekil 1B, en sağ sütun) ve 20 uL, paslanmaz çelik enjeksiyon döngüsü ile el enjektör ile, Şekil 1 'de gösterildiği gibi (Şekil 1C) monte analitik HPLC Enstrüman.
- Adım 1.3 ile benzer talimatları izleyerek Tablo 2'de görüldüğü gibi analitik yöntemini çalıştırmak için HPLC yazılım programı.
| Zaman /dk | Tampon A% 'si | Tampon B b% | Hızı / ml dak akış -1 |
| 0 | 95 | 5 | 1 |
| 30 | 50 | 50 | 1 |
Tablo 2: Aβ peptidi HPLC saflığı analizi için takvim. Bir Tampon A - 20 mM NH4 OH ile H2O; 20 mM NH 4 OH b% 80 MeCN /% 20 H 2 O.
- Aβ peptidi saflığı analizi
- Örnek tampon çözeltisi içinde peptidin çözülmesi yoluyla saflaştırılmış peptidin 1 mg / ml çözelti hazırlayın.
NOT: Tampon tarifi alt bölümde 1.1 bulunabilir. Protein konsantrasyonu, 280 nm'de (A 280nm) protein emiliminin ölçülmesi ile belirlenir. 12 m konsantrasyonunu belirlemek için kullanılır olar yok olma katsayısı (ε) ε = 1.490 dm3 mol-1 cm-1 olan. 13 - HPLC kolonuna 1 mg / ml (222 uM) çözeltisinin 20 ul enjekte edilir ve adım 2.3 kurulum oldu analitik yöntem çalıştırın.
Not: analiz için kullanılmaz kalan çözelti, sıvı nitrojen içinde dondurulur ve Aβ peptidi kurtarmak için liyofilize edilebilir. Liyofilizasyon ayrıntıları alt bölümde 1.4.4 bulunabilir. Aβ peptidi 16 ve 18 dakika boyunca (Şekil 2B) arasındaki analitik sütundan elute olur. Aβ peptidi saflığını belirlemek için HPLC aleti birlikte yerleşik entegre analiz yazılımı kullanarak. Saflık spektrumunun bireysel zirveleri her entegre ve peptit tepe yüzdesi alanını hesaplanarak belirlenir. Tipik olarak,>% 95 bir saflaştırma saptanmalıdır.
"Şekil 2" src = "/ files / ftp_upload / 55482 / 55482fig2.jpg" />
Şekil 2: Aβ42 Temsilcisi HPLC izleri. (A) Geleneksel C4 silika saflaştırma koşulları: Tampon A: H2O,% 0.1 trifluoroasetik asit (TFA), B tampon maddesi ile:% 0.1 TFA, gradyan ile MeCN (asetonitril): 20 tampon B 40 dakika boyunca,% 27 ve ardından izokratik% 27 B tamponu ile; (B) 25 x 300 mm, 2 Polimer kolonu, koşullar kullanılarak hazırlayıcı saflaştırma: 20 mM NH4OH, tampon B ile H2O: Tampon A% 80 MeCN /% 20, H, 20 mM NH4 OH ile 2, O, gradyan : izokratik% 27 tampon B, ardından 70 dakika boyunca% 20 ila 27 tampon B; 25 x 300 mm, 2 Polimer kolonu kullanılarak hazırlayıcı saflaştırmaya Optimize (C) koşulları alt bölüm protokolü açıklama metni 1.3 bulunan Tablo 1 'de tarif edilir; (D) Analitik HPLC 4.6 x 250 mm 2 Polimer kolonu, kon kullanılarakitions: Tampon A: H2O, 20 mM NH4OH, tampon B ile: 30 dakika boyunca 20 mM NH4OH, gradyan% 5 ila 50 tampon B% 80 MeCN /% 20 H2O. Bölüm A, B ve C Aβ42 tekabül zirve bir yıldızla işaretlenir. Bölüm D. Kütle spektrometrisi gösterildiği gibi C>% 95 bir saflığa ortaya kısmen işaretlenmiş Aβ42 tepe toplama Aβ42 zirvesinin ne olduğu belirlemek için kullanılmıştır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.