Gelişmiş bir iletişim kuralı muhabir yapıları arpa aleurone hücrelerdeki geçici gen ifadeden sonra partikül bombardımanı ölçümü için sunulmaktadır. Otomatik tahıl 96-şey plaka enzim deneyleri ile bileme yordamı için yüksek üretilen iş sağlar.
Yöntem makalesi
Gelişmiş bir iletişim kuralı muhabir yapıları arpa aleurone hücrelerdeki geçici gen ifadeden sonra partikül bombardımanı ölçümü için sunulmaktadır. Otomatik tahıl 96-şey plaka enzim deneyleri ile bileme yordamı için yüksek üretilen iş sağlar.
Arpa taneleri aleurone tabakası bir hormon düzenlenir gen ekspresyonu tesislerinde önemli model sistemidir. Aleurone hücrelerdeki genler çimlenmesi için gerekli ya da stres yanıt ile ilişkili genlerin absisik asit (ABA) tarafından aktif hale gelir iken erken fide geliştirme Giberellin (GA), tarafından aktive. GA ve ABA sinyal verme mekanizmaları muhabir gen yapıları partikül bombardımanı, via aleurone hücreye enzim deneyleri kullanarak ölçülen elde edilen geçici ifadesi ile tanıtımı tarafından sorguya çekilmeyi. Gelişmiş bir iletişim kuralı bu kısmen otomatikleştirir ve tahıl homojenizasyon adım ve enzim deneyleri düzene bildirilmektedir varolan yöntemlerine göre önemli ölçüde daha fazla üretilen iş sağlar. Homojenizasyon tahıl örneklerinden bir otomatik doku homogenizer kullanarak gerçekleştirilir ve GUS (β-glucuronidase) deneyleri bir 96-şey plaka sistemi kullanılarak yapılmaktadır. Temsilcisi sonuçları iletişim kuralını kullanarak fosfolifaz D faaliyet HVA1 gen ekspresyonu ABA tarafından transkripsiyon faktörü TaABF1 aracılığıyla etkinleştirme önemli bir rol oynamaktadır öneririz.
Arpa aleurone katman hormon düzenlenir gen ekspresyonu bitkiler1incelenmesi için köklü modeli sistemidir. Özellikle, stres yanıt ile ilişkili genlerin absisik asit (ABA) tarafından aktif hale gelir iken çimlenme veya erken fide gelişimi için gerekli genler bir dizi Giberellin (GA), tarafından etkinleştirilir. GA-aktive bazı genlerin ifade ABA ve ahlak bozukluğu-çok yönlü1tarafından inhibe gibi GA ve yolları sinyal ABA, iç içe geçmiş bulunmaktadır.
GA/ABA sinyal içinde belirli aktörlerin rolü efektör gen yapıları partikül bombardımanı, üzerinde oluşturduğu efekt izin muhabir yapıları, geçici ifade tarafından takip yoluyla getirilmesi olmuştur anlamak için değerli bir strateji aşağı akım gen ekspresyonu belirlenecek. Muhabir gen GUS (β-glucuronidase) veya Luciferase gibi özellikle efektör yapı almış hücrelerde gen ekspresyonu hassas ve nicel ölçüm sağlar. Örneğin, ABA kaynaklı genlerin HVA1 gibi Amy32b gibi GA kaynaklı genlerin ise TaABF1 tarafından indüklenir kodlama transkripsiyon faktörü TaABF15,6 bir efektör yapı getirilmesi kurulan baskı. Partikül bombardımanı deneysel bir strateji olarak GA/ABA sinyal çeşitli yönlerini incelemek için birden fazla Laboratuvarları tarafından kullanılmıştır. Bu iş yol organizatörü öğeleri2 GA kaynaklı ve ABA kaynaklı genlerin3aktivasyonu için önemli tanımlaması ve protein kinaz4 keşfi ve transkripsiyon faktörleri düzenleyen5 Bu genlerin ifade.
Varolan iletişim kuralları2,3,4,5,6 partikül bombardımanı ve geçici gen ekspresyonu sonraki ölçümü için oldukça emek yoğun, her kümesi, bombardıman olarak vardır güç bela taneleri bir harç ve havan Tokmağı elle homojenize ve enzim deneyleri ayrı ayrı yapılmaktadır. Bu el yazması kısmen otomatikleştirir ve homojenizasyon adım akıcılık, gelişmiş bir iletişim kuralını raporları ve GUS anlamlı olarak daha fazla işlem hacmi, izin vermek için aynı deneyde, test edilecek tedaviler daha çok sayıda izin deneyleri ve/veya Her tedavi daha istatistiksel olarak sağlam sonuçlar elde etmek için daha fazla çoğaltır eklenmesi. Temsilcisi sonuçları muhabir yapıları, HVA1 ve Amy32b de GA, ABA ve diğer düzenleyici molekül transkripsiyon faktörü TaABF1 tarafından düzenlenir, ifade için gösterilir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. hazırlanması efektör ve muhabir gen yapıları
2. bombardıman için arpa taneleri hazırlanması
3. bombardıman için plazmid DNA hazırlanması
4. partikül bombardımanı Embryoless arpa taneleri
5. çıkarma çözünür protein alı tahıl
6. ölçüm tahıl özler Luciferase etkinliği
7. ölçüm tahıl GUS etkinliği ayıklar
8. veri analizi
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Burada açıklanan teknik herhangi bir test gen yapısı arpa taneleri aleurone hücrelere tanıtmak için kullanılabilir. Test gen ifade düzeyini daha sonra olabilir uygun ölçülen (Şekil 2). Burada büyük ölçüde açıklanan yüksek üretilen iş Protokolü tohum öğütme ve enzim tahlil adımları verimliliğini artırır. Bu yöntem transkripsiyon faktörü TaABF15,6 ifade ABA kaynaklı gen HVA17<...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Efektör gen getirilmesi yolu ile partikül bombardımanı oluşturur, geçici muhabir yapıları, deyimden GA/ABA sinyal ve ortaya çıkan hormon düzenlenir gen belirli aktörlerin rolü dissekan için değerli bir stratejidir ifade.
Ancak, bu tür deneyleri arpa aleurone hücreleri2,3,4,5,6 taşımak için varolan çok emek yoğun iletişim kurallarıdır. Her grup alı zar zor t...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar ifşa gerek yok.
Yazarlar Greyson Butler ve Margaret Barrett deneyler, tahıl homojenizasyon tavsiye için Judy taş ve Lynn Hannum tavsiye fluorometry için yürütmek yardım için teşekkür ederiz. Bu eser Ulusal Bilim Vakfı tarafından (IOB 0443676), bir kurumsal geliştirme Ödülü (fikir) üzerinden Ulusal Genel tıbbi Bilimler Enstitüsü Ulusal Sağlık Enstitüleri grant numarası P20GM0103423 altında ve gelen hibe tarafından desteklenmiştir Doğa Bilimleri Colby üniversite bölümü.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| GeneElute HP plazmid Maxiprep kiti | Sigma | NA0310-1KT | |
| UV-vis spektrofotometresi | Nanodrop | ND-1000 | |
| Himalaya arpa taneleri | / | / | Çeşitli hulless arpa (karanlıkta 4 ° C'de saklayın; C) |
| sodyum süksinat | Sigma | S2378 | Çözelti İçme Reaktifi |
| kalsiyum klorür (dihidrat) | Fisher | C79-500 | İçme Çözeltisi |
| İçme Çözeltisi | ev yapımı | / | 20 mM sodyum süksinat, 20 mM kalsiyum klorür, pH 5.0. Kullanmadan önce otoklavlayarak sterilize edin. |
| kloramfenikol | Sigma | C0378 | % 70 etanol içinde 10 mg / mL'lik bir stok çözeltisi hazırlayın. |
| vermikülit | Fisher | NC0430369 | Vermikülit plakaları için kullanılır. |
| filtre kağıdı daireleri (90 mm) | Whatman | 1001 090 | Vermikülit ve bombardıman öncesi tahıl hazırlama için kullanılır |
| Vermikülit Plakalar | ev yapımı | / | Bir cam petri kabına 50 mL vermikülit ekleyin. Vermikülitin üzerine 90 mm'lik bir kağıt daire yerleştirin. Otoklav. |
| forseps (ince uçlu) | Fisher | 13-812-42 | Arpa tanelerinden tohum kabuğunu çıkarmak için kullanılır. |
| forseps (ultra ince nokta) | Fisher | 12-000-122 | Arpa tanelerinden tohum kabuğunu çıkarmak için kullanılır. |
| Altın mikro taşıyıcılar (1.6 & mu; m) | BioRad | 1652264 | |
| makrotaşıyıcılar | BioRad | 1652335 | |
| kalsiyum klorür (dihidrat) | Fisher | C79-500 | 2,5 M'lik bir stok çözeltisi hazırlayın ve 1 mL alikotları -20°C'de saklayın. |
| spermidin | Sigma | S0266 | 100 mM'lik bir stok çözeltisi hazırlayın ve 500 &u saklayın; L alikotları -20° C (2 ay içinde kullanın). |
| Yırtılma diskleri (1550 psi) | BioRad | 1652331 | |
| durdurma ekranları | BioRad | 1652336 | |
| makrotaşıyıcı tutucular | BioRad | 1652322 | |
| Biyolistik partikül dağıtım sistemi | BioRad | PDS-1000/He | |
| sodyum fosfat monobazik monohidrat | Sigma | S9638 | 1M sodyum fosfat pH 7.2 |
| sodyum fosfat dibazik | Sigma | S9763 | 1M sodyum fosfat pH 7.2 1M |
| sodyum fosfat pH 7.2 | için reaktif | 6.9 g sodyum fosfat monobazik monohidratı 7.1 g sodyum fosfat dibazik ile birleştirin. 100 mL'ye kadar su ekleyin. PH 7.2 elde etmek için NaOH ekleyin. | |
| ditiothrietol (DTT) | Sigma | 43819 | Suda 1 M'ye kadar çözülür. -20 ° C'de; 1 mL alikotlarda saklayın. |
| leupeptin | Sigma | L2884 | Suda 10 mg / mL'ye kadar çözülür. -20 ° C'de saklayın; |
| C.glycerol | Sigma | G5516 | Suda% 50'lik bir çözelti hazırlayın. |
| Öğütme Tamponu | ev yapımı | / | 10 mL 1 M sodyum fosfat pH 7.2, 500 & mu'yu birleştirin; L 1 M DTT, 100 μ L 10 mg / mL leupeptin ve 40 mL% 50 gliserol. 100 mL'ye kadar su ekleyin. |
| paslanmaz çelik boncuklar (5 mm) | Qiagen | 69989 | |
| 2.0 mL tüpler | Eppendorf | 22363352 | Bu özel tüp modelinin homojenizatör ile kullanılması önerilir. |
| boncuk homojenizatör (TissueLyser) | Qiagen | 85210 | |
| 12mm x 75 mm cam test tüpleri | Fisher | ||
| luciferin | Goldbio | LUCK-100 | 25 mM'lik bir stok çözeltisi hazırlayın ve 1 mL alikotları -20°C'de saklayın. |
| ATP | Sigma | A7699 | 100 mM'lik bir stok çözeltisi hazırlayın ve 250 &u depolayın; L alikotları -20° C. |
| 1M Tris sülfat | pH 7.7 için Tris baz Sigma T1503 Reaktifi. | ||
| sülfürik asit | Sigma | 258105 | 1M Tris sülfat pH 7.7 için Reaktif. |
| 1M Tris sülfat pH 7.7 | ev yapımı | / | 12.1 g Tris bazını 100 mL suda çözün. Sülfürik asit ile pH'ı 7.7'ye ayarlayın. |
| magnezyum klorür | Sigma | M9397 | Suda 2 M'ye kadar çözülür. |
| Luciferaz Test Tamponu (LAB) | ev yapımı | / | 3 mL 1 M Tris sülfat pH 7.7, 500 & mu'yu birleştirin; L 2 M magnezyum klorür, 1 mL 1 M DTT ve 200 μ 0,5 m EDTA'nın L'si. 50&nbst'ye su ekleyin; Ml. |
| Lusiferaz Test Karışımı | ev yapımı | / | 15 mL LAB, 800 & mu'yu birleştirin; L 25 mM lusiferin, 200 μ L 100 mM ATP ve 4 mL su. Bu yeterli tahlil karışımı yapar (20 mL) 100 lusiferaz testi için. |
| luminometre (Sirius) | Berthold | / | |
| 4-metilumbelliferil -β -D-glukuronid (MUG) | Goldbio | MUG1 | DMSO'da 100 mM'ye kadar çözülür. |
| sodyum azid | Sigma | S8032 | Suda% 2'lik bir stok çözeltisi hazırlayın ve 1 mL alikotları -20 ° C'de saklayın. |
| 96 kuyulu plaka (standart) | Fisher | 12565501 | |
| GUS tahlil tamponu | ev yapımı | / | 2.5 mL MUG, 5 mL 1 M sodyum fosfat pH 7.2, 400 & mu'yu birleştirin; L 0,5 M EDTA, 1 mL 1 M DTT, 100 μ L 10 mg / ml leupeptin, 20 mL metanol ve 1 mL% 2 sodyum azid. 100 mL'ye kadar su ekleyin. |
| TempPlate sızdırmazlık filmi | USA Scientific | 2921-1000 | |
| 96 kuyulu plakalar (siyah) | Costar | 3916 | |
| sodyum karbonat | Sigma | S7795 | Suda 200 mM'lik bir çözelti hazırlayın. |
| 4-metilumbelliferon | Sigma | M1381 | 100 & mu hazırlayın; Sudaki M çözeltisi. 1 mL alikotları -20 ° C'de dondurun; C. |
| mikroplaka fluouresence okuyucu | Bio-Tek | FLX-800 |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste