Yöntem makalesi

Algılama ve miktar için Plasmodium falciparum içinde sulu kırmızı kan hücreleri tarafından toplam yansıma kızılötesi spektroskopi zayıflatılmış ve çok değişkenli veri analizi

DOI:

10.3791/56797

⸱

2 Kasım 2018

 ,  ,  ,  ,  , 
1Centre for Biospectroscopy, Monash University, 2Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Nursing and Health Sciences, Monash University, 3Centre for Biomedical Research, Burnet Institute, 4Department of Medicine, University of Melbourne

Bu makalede

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Burada, bir protokol için Plasmodium falciparum miktar virüslü sulu kırmızı kan hücrelerinde bir zayıflatılmış toplam yansıma kızılötesi Spektrometre ve çok değişkenli veri analizi kullanarak ve algılama mevcut.

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Biz miktar yöntemi ve parazitler ve sulu kırmızı kan hücrelerinde (RBCs) algılama çok değişkenli veri analizi () ile birlikte basit benchtop zayıflatılmış toplam yansıma Fourier Transform Infrared (ATR-FTIR) spektrometresi kullanılarak göstermek MVDA). 3D 7 P. falciparum % 10 parasitemia yüzük sahne parazitler için kültürlü ve seri 0-1 arasında bir seyreltme oluşturmak için taze donör izole RBCs spike için kullanılan %. Her örneğinin 10 µL spektrum elde etmek için ATR elmas pencerenin ortasına yerleştirildi. Örnek verileri sinyal gürültü oranı artırmak için ve su katkısını kaldırmak için tedavi edildi ve sonra ikinci türev spektral özellikleri gidermek için uygulandı. Verileri daha sonra MVDA iki tür kullanarak analiz edildi: ilk asıl bileşen analizi (herhangi bir aykırı ve sonra kısmi en küçük kareler regresyon (PLS-R) miktar model oluşturmak için belirlemek için PCA).

Giriş

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Sıtma bizim zaman en yıkıcı hastalıklar arasında olduğunu; endemik bölgelerde risk yarım nüfus yaşıyor ve orantısız yoksul1,2,3,4durumu. Sorunun büyük bir parçası asemptomatik taşıyıcılar ve toplumlarda kalıcı olması izin ve sivri enfeksiyon sırasında ıslak mevsim neden rezervuarlar için sivrisinek vektörel çizimler5, aracı olarak erken sahne hastalar var. Sıtma en ölümcül hastalık2en ağır formu neden P. falciparum olduğunu beş Plasmodium parazitler tarafından nedeniyle oluşur.

Şu anda, sıtma tanısı için mükemmel daha az tekniklerdir. Optik mikroskobu, geçerli altın standart, sadece 62-88 parazitler/µL kullanılan yöntem6bağlı olarak algılayabilir. Ayrıca, intensiveness ve yüksek beceri gerekli, birçok bölgeler mikroskopi misdiagnoses nedeniyle > özellikle düşük parasitaemia sahip olanlar doğrudan kaynakları alanında ve sonuçlarında eksikliği bağlanabilir2, seviyesi %50 Olguların anti-sıtma ilaçları suistimal. Hızlı tanı antikorlar algılama ve ayırımcılık ve parazitlerin DNA'ölçmek polimeraz zincir tepkimesi (PCR) deneyleri için kullanan testleri (RDTs), diğer 2 ana tanı yöntemleri vardır. Şu anda, RDTs sadece P. falciparum ve P. bağlı en az 100 parazit/µL kan hastalığı tedavi edilmezse nadir formlarda kaynaklanan tespit edebiliyoruz. 7 , 8 buna ek olarak, PCR deneyleri ayırımcılık ve Plasmodium farklı tür bir duyarlılık 0.0004-5, ölçmek parazitler/µL kan. Ancak, bu pahalı reaktifler, ekipman ve teknik beceri gerektirir ve böylece alan uygulama için uygun değildir.

Son derece hassas, güvenilir ve uygun fiyatlı bir teknik tanı kez, böylece hasta sonuçları iyileştirilmesi ve hastalık ortadan kaldırılması mümkün hale geliştirmek için önemlidir. Zayıflatılmış toplam yansıma Fourier dönüşümü (ATR-FTIR) spektroskopisi bu sorun için olası bir çözüm sunar. Önceki çalışma algılamak ve P. falciparum kan filmler algılama sınırları elde sabit metanol ölçmek mümkün olduğunu göstermiştir < 1 parazit/µL kan (< %0.0002 parasitemia) PCR yöntemleri için karşılaştırılabilir olan9,. Son yıllarda yapılan çalışmalarda algılamak ve parazitler sulu örneklerinde ölçmek ve böylece fiksasyon adım ortadan kaldırmak mümkün olduğunu göstermiştir. Ancak, su buharı, spektral gürültü ve veri tedavi gibi faktörler en iyi sonuçları10için dikkate alınması gerekir.

Yeni kullanıcılar ATR-FTIR spectra almak ve sulu kırmızı kan hücreleri (RBC) örnekleri10 P. falciparum tespiti için bir regresyon modeli hazırlamak nasıl göstermek için bu protokolü amaçlamaktadır.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Lütfen uygun malzeme güvenlik veri sayfaları (MSDS) başvurun ve uygun seviye 2 (BSL-2) eğitim aramak. Tüm kodlamayla adımları aseptik teknik kullanılarak, eğer zararlı UV ışınlarına maruz dekontaminasyon adımları, iğne sopa yaralanmalar ve biyolojik etkilenme olasılığını ortadan kaldırmak ve enfeksiyon riski olduğu anlamına gelir bir BSL-2 dolapta yapılmalıdır parazit kültür herhangi bir yaralanma girer. Ayrıca, stok kan kan bankalardan belirli hastalıklar ve kan hastalıkları kaynaklı yaymak için potansiyel ekranlı sadece potansiyel bir risk olduğunu. Yaralanma oluşumunu acil tıbbi yardım isteyin.

1. hazırlık ve 3D 7 ölçümü Plasmodium falciparum parazit seyreltme serisi

Not: Plasmodium sp. kültür son derece duyarlıdır. Taze/geçmemiş reaktifler kullanın ve parazitler düzenli olarak medya değiştirerek yem. Besleme kültürleri % 5 parasitemia iki günde aşağıda; kültürler arasında 6-%10 parasitemia bir veya iki kez bir gün besleme; ve kültürler arasında 11 – %20 4 kere a gün kadar yem. Açlıktan ölmeye başlıyor parazitler kaybetmek onların şekil ve sözleşme başlar. Böyle bir durumda, yem ve hemen da medyayı değiştirerek ve hisse senedi RBCs. toplamak donör kan antikoagülan ve ilk 6 saat içinde ölçü olarak heparin içeren kan toplama tüpler ekleyerek oranında seyreltin.

  1. Kültür 3D 7 30 mL toplam parasitemia % 10 yüzük ulaşıncaya kadar Plasmodium falciparum parazitler standart protokolüne göre süzün.
  2. Parazitler ve eşitleme
    1. 11 h parazit yaşam döngüsü içine shizogeny sonra resuspend kültür ve transfer bir otomatik pipet kullanarak bir 50 mL konik tüp içine.
    2. 300-400 x g ve 5 min için Standart laboratuvar koşulları (25 ° C ve 100 kPa) kültür santrifüj kapasitesi.
    3. Süpernatant pipet ile çizim veya pelet bozmadan bir vakuma bağlı bir Pasteur pipet kullanarak kaldırın. Atık medya % 10 çamaşır suyu çözüm atın.
    4. Yavaş yavaş 12-15 mL % 4 sorbitol çözeltisi kullanarak bir otomatik pipet Pelet ve kapatma ve kültür homojen olana tüp ters çevirme kültür karıştırın.
    5. 15 dakika 37 ° C'de kültür kuluçkaya.
    6. 300-400 x g ve 5 min için Standart laboratuvar koşulları kültür santrifüj kapasitesi.
    7. Süpernatant 1.2.3 adımda anlatıldığı gibi kaldırın.
    8. 10-15 mL % 0,9 serum için Pelet ve çözüm kapatma ve kültür homojen olana tüp ters çevirme karıştırın.
    9. Adımları 1.2.6–1.2.8 sorbitol tüm kalıntıları yıkamak için iki kez daha tekrarlayın.
  3. Parasitemia seyreltme serisi hazırlanması
    1. Stok RBCs adımları 1.2.6–1.2.9 olduğu gibi yıkayın.
    2. Standart laboratuvar koşulları, hisse senedi RBCs 300 – 400 x g 5 min için de, kültür santrifüj kapasitesi ve süpernatant adım 1.2.3 olduğu gibi atın.
    3. Microcentrifuge tüpler % 0, %0.010, % 0,025, %0.075, %0,100, %0,250, %0.750 ve %1.000 etiketleyin ve 0 µL, 1 µL, 2.5 µL, 7.5 µL, 10 µL, 25 µL, 75 µL ve kültürünün sırasıyla 0,2-20 µL pipet kullanarak 100 µL ekleyin.
    4. 100 µL, 99 µL, 97,5 µL, 92.5 µL, 80 µL, 75 µL, 25 ve 0 µL stokunun RBCs tüpler etiketli %0, %0.010, % 0,025, %0.075, %0,100, %0,250, %0.750 ve %1.000, sırasıyla ekleyin.
    5. 1200 x g ve 10 min için Standart laboratuvar koşulları, antikoagülan tüpler santrifüj taze donör kan toplanır.
    6. Bu bir pipet ile çizerek ve 1.2.3. adımda açıklandığı gibi atarak plazma kaldırın.
    7. İzole RBCs 900 µL her microcentrifuge tüp içine ve 10 x ters çevirme tarafından iyice karıştırın.
  4. Spektral edinme
    1. Eşlik eden spektral satın alma programı kullanarak, "Enstrüman Set-Up" tıklatın ve veri koleksiyon parametrelerini şu şekilde ayarlayın: 128 taramalar için arka plan; örnek için 32 inceden inceye gözden geçirmek; ve çözünürlük 8/cm enstrümanın en büyük örnek aralığında.
    2. ATR-FTIR Spektrometre üreticisinin tavsiye başı sıcaklık ayarlayın veya bir gece.
    3. Kristal ücretsiz mendil Ultrasaf Su ile nemlendirilmiş lint kullanarak dairesel bir hareketle hafifçe ovma tarafından temiz. O zaman başka bir tüysüz ücretsiz temizleme işlemi kullanarak iyice kurulayın.
    4. "Arka plan ölçüm" tıklatarak arka plan ölçüm hava almak. Her 20 dk, kristal adım 1.4.3 olduğu gibi temiz ve bu ölçüm yineleyin.
    5. Canlı görüntü "Önizleme" seçeneğini tıklatarak açın. Kristal temiz olduğunu gösterir bir düz, yatay temel gözlemlemek.
    6. Deiyonize su doğrudan orta kristalin üzerinde 10 µL pipet ve "Ölçü örnek"'ı tıklatın. Her beşinci örnek sonra bu su ölçüm yineleyin.
    7. Tüysüz ücretsiz mendil ve yumuşak dairesel hareketlerle kullanarak kristal kuru.
    8. Örnek 10 µL pipet ve "Ölçü örnek"'ı tıklatın.
    9. Adım 1.4.3 olduğu gibi örnek arasında kristal temiz.
    10. Örnekleri ve çoğaltır sırasını rastgele emin 3 çoğaltır iktisap kadar yineleyin.

2. çok değişkenli veri analizi (MVDA)

Not: Veri tedavi tüm veri kümesi üzerinde gürültü ve biyolojik olmayan kökenli doruklarına ilavesi önlemek için yapmanız gerekir. Buna ek olarak, biyolojik olarak ilgili bölgeleri üzerinde analiz: 2980-2800/cm ve 1750-850/cm.

  1. Veri tedavi
    Not: İki yazılım, Örneğin, Matlab (bundan böyle 1 yazılım olarak da adlandırılır) ve Unscrambler (bundan böyle 2 yazılım olarak da adlandırılır) X MVDA için örnek olarak kullanılır. Yazılım 1 MVDA bir grafik kullanıcı arabirimi (GUI) ek gerçekleştirme yeteneğine sahiptir. Ancak, bu bir GUI (Tablo reçetesi) satın almak için tavsiye edilir. Yazılım 1 atıfta bu üstlenecek yaparken aşağıdaki talimatlara piyasada bulunan GUI araç kutusu ile birlikte, ve örnek veri tedavi senaryo bağlı.
    1. Uygun çok değişkenli veri analizi yazılımı açın, "Veri al" seçeneğini tıklatın ve çözümleme için dosya türünü seçin.
      1. Yazılım 1, "Analiz" GUI açmak için command window içine girdi. Sağ X box "Veri al" bulmak için tıklatın.
      2. Yazılım 2, "Alma" bulmak için "dosya" sekmesini tıklatın.
    2. Tüm spectra her kümede ayrı ayrı seçip "Aç" düğmesini tıklatarak veri kümeleri olarak örnek, su ve temel spectra çalışma alanına alma ve her kümesi, Örneğin, 'wat' su spectra ürününün veri kümesi için kısa bir ad verin.
    3. Yeni Tablo/Matris "yeni Matrix/vektör" tıklatarak seçin ve n örnek sayısına nerede bir n × 1 vektör oluşturmak. Her örnek parasitemia giriş ve vektör 'Parasitemia' adını verin.
      1. Yazılım 1, "Yeni değişken" komut penceresinde tıklatın.
      2. Yazılım 2, "Yeni Matrix" simgesini tıklatın.
    4. Verileri ' "Çizmek veri simgesini" çizmek. "Zoom" tıklayarak ve 1800-1400/cm üzerinde yakınlaştırma spectra su buharı efektler için incelemek; en açık biçimde gözlenen Amid yamaçları boyunca kısa, keskin, dar tepeler olarak ben ve Amid II bantları.
    5. Aşırı su buharı durumlarda Düzenle/pre-process data sekmesini açın ve "Düzeltme" seçin. Gürültü ve/veya güçlü su buharı katkıları düzgünleştirme 25 puan kullanarak örnek ve su spectra yumuşatma tarafından azaltmak veya su buharı düzeltme yöntemini kullanabilirsiniz.
    6. Uygunsa, adım 2.1.4 aynı Düzenle/pre-process veri sekmesindeki temel düzeltme algoritması kullanarak doğru yatay-temel.
    7. Su spectra ortalama ve örnek veri kümesi için eşdeğer bir n × m matris satırları kopyalayın ve 0,7 tarafından çarpılarak % 70 yoğunluğu azaltmak.
      1. Yazılım 1, bunu komut penceresinde aşağıdaki komut dosyası "AverageWater=mean(WaterDataset)" girerek. Sonra Kopyala-Yapıştır örnek veri kümesi eşleşen satırları. Giriş yoğunluğu azaltmak için "AverageWater70 AverageWater = * 0,70".
    8. Her örnek spektrum üzerinden ortalama su spectra çıkarma.
      1. Yazılım 1, komut penceresinde aşağıdaki komut dosyası girerek bunu "WaterCorrectedData SampleDataset-AverageWater70 =".
    9. İkinci türev işlevi uygular ve sonra verileri tek normal değişken (SNV) işlevi seçerek normal duruma getirmeye ve ortalama Merkezi veri Düzenle/pre-process veri sekmesini açın.
      1. Yazılım 1, tek seferde bunu. Önce "Türev" ve giriş 25 puan yumuşatma, polinom 3 sırasını ve düzgünleştirme 25 puan ve çetinkaya-deniyordun işlevini kullanarak Ayarla örnek üzerinde türev sipariş seçin. O zaman seçme "SNV" ve "Demek Merkez". Tamam/Uygula "'ı" tıklatın.
    10. Düzenle/pre-process data sekmesini açın ve sadece onların kutuları işaretli olmasını sağlayarak 2.980-2800/cm ve 1750 – 850/cm "Sütun değişkenleri", seçin.
  2. Veri Analizi
    1. Asıl adı bileşen analizi (PCA)
      1. Tıklatın "analiz | Ayrışma"ve seçme PCA.
        1. Yazılım 1, "Model inşa"'i tıklatın.
        2. Yazılım 2, PCA yöntemleri girdi. En iyi dizi sorumlusu bileşen (adet) - iş, 7 - giriş ve en çok 100 yinelemeden ve seçim çapraz doğrulama için doğrulama yöntemi. "Çalıştır" ı tıklatın.
      2. % 95 güven sınırı, kesikli halkada puanları Arsa PC1 ve PC2 arasında gözlemlemek.
      3. Örnek spectra sınırı dışında "Seçin Spectra aracı" kullanarak potansiyel aykırı ortaya puanları ile işaretleyin.
      4. İşaretli spectra yüksek varsa Hotellings T2 değerleri ve yüksek Q fazlalıklar onları daha fazla çözümleme dışı bırakmak.
    2. Kısmi en küçük kareler regresyon (PLS-R)
      1. Tıklatın "analiz | Regresyon"ve seçme"PLS-R".
        1. Yazılım 1, şu Y bloğu'nu tıklatın ve vektör seçin "Parasitemia | Model oluşturmak".
        2. Yazılım 2, PLS-R yöntemleri girdi. "Parasitemia" vektör seçim çapraz doğrulama doğrulama yöntemi olarak örnek veri kümesi olarak "X veri kümesi" ve "Y başvuru" olarak seçin. "Çalıştır" ı tıklatın.
      2. Regresyon modelini analiz. R2 değerleri üzerinden 0,80 ve %0,1 parasitemia daha az olan çapraz doğrulama (RMSECV) değerleri, ortalama karekök hata kabul edilebilir modellerdir.
      3. Regresyon vektör analiz ve biyolojik grupları tanımlar.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kısmi en küçük kareler (PLS-R) Arsa ve onun ilişkili regresyon vektör, Şekil 1a ve 1b sırasıyla, parazit sinyal bir doğrusal regresyon modeli için kullanılacak form için kullanılabilir RBCs yeterince farklı olduğunu göstermektedir tahmin parazitler ve gelecekteki veri kümesi.

Sağlam, doğrusal PLS-R modeli 0,87 bir R-kare değeri ile oluşturulan ve %0.13 parasitemia,

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

PLS-R modeli Doğrusal bir ilişki, Y bulduğu bir yöntemdir denetimli birden fazla varyasyon = bX + E on, akıllı değişken X arasındaki (burada, her wavenumber absorbans) ve sürekli değişken Y (burada, parasitemia düzey). Kısacası, model değişkenleri x korelasyon x ile Y farkı yakalamak gizli değişkenler (LVs) yeni bir dizi oluşturmak için birleştirir ve regresyon vektör (b) hesaplar bu y değeri tahmin yeni bir spektrum sonuçları ile çarpılır. İki değer modeli gücünü alınabilir: R2 değeri ve ortalama karekök hata...

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarlar ifşa gerek yok.

Teşekkürler

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarlar için finansman Avustralya Araştırma Konseyi tarafından sağlanan (gelecek bursu FT120100926 BRW için), Ulusal Sağlık ve tıbbi araştırma Konseyi, Avustralya'da (Program grant ve kıdemli araştırma bursu için JGB; Erken kariyer bursu JSR; Altyapı araştırma enstitüleri destek düzeni Grant Burnet Enstitüsü için), ve Victoria Eyalet hükümeti operasyonel alt yapıyı desteklemek Burnet Enstitüsü için Grant. Bay Finlay Shanks enstrümantal desteği anıyoruz.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Donör kanı-Eğitimli bir tıp doktoru tarafından toplanmalıdır
Stok kanıAvustralya Kızıl Haçı'-
3D7 Plasmodium falciparumBurnetEnstitüsü-Laboratuvarsuşu vahşi tip eşdeğeri
RPMI-1640 ortamı, Sodyum Bikarbonat içermeyen L-hepes ileSigma AldrichR6504
Albümaks (Gibco)Thermofisher,Aliquot'u 50 mL'lik şahin tüplerine E003000PJ ve dondurucuda saklayın
Sodyum BikarbonatSigmaAldrich S5761
Giemsa LekeSigma Aldrich48900
SorbitolSigma AldrichS1876Kültürde kullanılmadan önce filtrelenmelidir
Kan alma tüpleri (Vacutainers)Becton, Dickonson and Company367671
Daldırma YağıThermofisherM3004
50 mL kültür kaplarıFalcon353025
25 mL pipet uçlarıFalcon357515
10 mL pipet uçlarıFalcon357530
Mikroskop SlaytlarıSigma AldrichS8902
Santrifüj tüpleri 50 mLSigma AldrichT2318
Otomatik pipet kontrolörüIntegra-biosciences155 015
Sorvall Legend X1R SantrifüjThermofisher75004260
Forma™ 310 Doğrudan Isı CO2 İnkübatörleriThermofisher310TS
Nikon Eclipse E-100 Binoküler MikroskopNikon InstrumentsE100_2CE-MRTK-1Satın alırken 100x lensin yağ olduğundan emin olun daldırma lensi
Bruker Alpha Ft-IR ATR Hızlı Yakalama Bağlantılı SpektrometreBruker9308-3700
Çok Değişkenli veri analiz yazılımı
The Unscrambler XCAMOÇok Değişkenli veri analiz yazılımı
PLS-ToolboxMathworks, Inc.Matlab için GUI
, Matlab Mathworks Inc satın alırken "Eco-ATR" eki talep ettiğinizden emin olun.

Kaynaklar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Hommel, M., Gilles, H. Chapter 20. Topley & Wilson's Microbiology and Microbial Infections. Vol. 5 Parasitology. Collier, L., Balows, A., Sussman, M. , Arnold. Great Britain. 361(1998).
  2. World Health Organization. World Malaria Report 2016. , (2016).
  3. Rogers, W. Chapter 105. Manual of Clinical Microbiology. Murray, P., Baron, E., Pflaller, M., Tenover, F., Yolken, R. , American Society for Microbioogy, USA. 1355(1999).
  4. White, N. J. Chapter 9. Manson's Tropical Infectious Diseases. 23, Elsevier, USA. 532-600 (2014).
  5. Lindblade, K. A., Steinhardt, L., Samuels, A., Kachur, S. P., Slutsker, L. The silent threat: asymptomatic parasitemia and malaria transmission. Expert Rev Anti Infect Ther. 11 (6), 623-639 (2013).
  6. Hanscheid, T., Grobusch, M. How useful is PCR in the diagnosis of malaria. Trends Parasitol. 18 (9), 395-398 (2002).
  7. Joanny, F., Löhr, S. J., Engleitner, T., Lell, B., Mordmüller, B. Limit of blank and limit of detection of Plasmodium falciparum thick blood smear microscopy in a routine setting in Central Africa. Malar J. 13 (1), 234-241 (2014).
  8. World Health Organisation. Malaria Rapid Diagnostic Test Performance: results of WHO product testing of malaria RDTs: round 6 (2014-2015). , (2014).
  9. Khoshmanesh, A., et al. Detection and quantification of early-stage malaria parasites in laboratory infected erythrocytes by attenuated total reflectance infrared spectroscopy and multivariate analysis. Anal Chem. 86, 4379-4386 (2014).
  10. Martin, M., et al. The effect of common anticoagulants in detection and quantification of malaria parasitemia in human red blood cells by ATR-FTIR spectroscopy. Anal. 142 (8), 1192-1199 (2017).
  11. Fabian, H., Mäntele, W. Handbook of Vibrational Spectroscopy. , John Wiley & Sons, Ltd. (2006).
  12. Whelan, D., et al. Monitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscoptMonitoring the reversible B to A-like transition of DNA in eukaryotic cells using Fourier transform infrared spectroscopy. Nucleic Acid Res. 39 (13), 5439-5448 (2011).
  13. Wood, B. The importance of hydration and DNA conformation in interpreting infrared spectra of cells and tissues. Chem Soc Rev. 45, 1980-1998 (1980).
  14. Plyler, E. K. Infrared spectra of methanol, ethanol, and rn-propanol. J Res Natl Bur Stand. 48 (4), (1952).

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

ATR FTIR SpektroskopisiS tma ParasitemisiTemel Bile en AnaliziK smi En K k Kareler RegresyonuSpektral Veri lemeBiyospektroskobik TanBak m Noktas Testleri

İlgili makaleler