Barnacle kültür Tjärnö deniz Araştırma Laboratuvarı (İsveç) 20 yılı aşkın süredir çalışmakta olduğu ve birçok farklı araştırma alanda çalışmalar için kullanılır. 30'dan fazla bilimsel makale kodlamayla sistem çalışmaları da dahil olmak üzere zehirli13,22, hidrodinamik23, kimyasal ekoloji24son yıl içinde kullanılan yayınlanmıştır, iklim değişikliği16 , Evrimsel biyoloji5ve moleküler biyoloji2.
Laboratuar ortamında (vahşi nüfus temsilcisi olmayabilir bireyler) daha adapte olmuşlardır belirli kişilerin seçimine önlemek için yeni bir broodstock alandan her yıl toplamak için önerilir. Buna ek olarak, Ayrıca bu yana yaklaşık yetişkin mortalite % 50-80 normal bir yıl boyunca her yıl, kültür gençleştirmek için iyi bir yöntemdir. Ancak, amaç doğuştan hatları üretmeye veya deneysel evrim çalışmalar ayarlamak için ise, sadece Laboratuvar yetiştirilen aileler kullanılmak üzere vardır.
Çünkü o zaman, cyprid larva denizin içinde iyi bir kaynağı B. improvisus Tjärnö deniz araştırma laboratuvarı panelleri üzerinde toplamak için iyi bir zaman Haziran-Ağustos ayında var. Kontrol panelleri haftalık barnacle kapatma başladığında görmek ve diğer el ile kaldırmak için yerleşmiş türler B. improvisus (Örneğin, midye, tunicates, bryozoans, hydroids, nemerteans/tubeworms ve diğer barnacle türler) daha--dan paneller (Örneğin, bir diş fırçası ile). Tjärnö var üç sığ su barnacle tür mevcut (B. improvisus, Semibalanus balanoidesve Balanus crenatus). Ancak, B. improvisus Temmuz – Ağustos sırasında yumuşak sert yüzeylerin Orklar'dan baskın olduğunu. S. balanoides erken bahar sırasında onun kapanış dönemi vardır ve çoğunlukla doğal yüzeylerde (Örneğin, taş) tercih ediyor. B. crenatus yaz aylarında panellerinde düşük numaralarından oluşabilir.
Bazı linages belirli özellikleri ile kurulmuş varsa gerekli olacaktır, kültürlü cyprids veya deneysel evrim çalışmalarda yeni yetişkin barnacle nesiller başlatmak mümkündür. Yetişkin yeni nesil başlatmak için en uygun cyprids laboratuvarda termoplastik paneller üzerine yerleşmek için yoludur. Bu paneller yeni kapatılan cyprids ile de deneysel tedaviler veya maruz alanında kullanılabilir. Acil durumlarda, bir de yakın bir sitede (Örneğin, Idefjorden Tjärnö deniz araştırma laboratuvarı durumunda) B. improvisus ortak nerede gelen kayalar üzerinde yetişkin kullanabilirsiniz. Zaten kurulmuş bu yetişkinlerin böylece tepsilerde konuyor panellerinde, yetişkin olarak aynı şekilde tedavi ve sistem üzerinden akış yoluyla beslenir. Akış hücreleri panelleri kıskaç25ile kurmak için de kullanılabilir. Bu akış yoluyla chambers ile plankton net üzerinde cyprids, panel larvaların için tek yerleşim yüzey olarak ile razı değil tarafta vardır.
Tüm yaşam evreleri de dahil olmak üzere bir uzun vadeli işleyen barnacle kültürünü ayarlamak için kritik olan birkaç adım vardır. Kültür B. improvisus kullanılan yöntemleri muhtemelen, büyük ölçüde, free-swimming, planktotrophic larvaları ile deniz diğer omurgasız için de geçerli bulunmaktadır. Kodlamayla yordamlar için bazı türler zaten iyi açıklanan (Örneğin, mavi midye ve istiridye ve farklı türler için)26, diğer deniz omurgasızlar iken için sadece birkaç örnek hayatı boyunca yayılan uzun vadeli kültürlerin vardır döngüsü. İlk başarılı deneme kültür kıskaç (d. amphitrite) için birini Rittschof vd tarafından yapıldı 15. uzun vadeli finansal ve kişisel kaynakları barnacle kültür tesis kurma düşünmeden önce yerde olmalı. Yılın bu tür bakım-barnacle kültür en az bir kişi çalışma yarı süresi gerektirir. Bazı adımlar mikroalg27kültür ağırlıklı üretim hattında gelecekteki otomasyon için bazı potansiyel olabilir. Buna ek olarak, başarılı olmak adına, büyük miktarda yüksek kaliteli deniz suyu için erişim olması esastır. Mikroalg, Artemia ve kaya midyeleri kültür herhangi bir belirli güvenlik prosedürleri anlamına gelmez. Ancak, bazı zehirli maddeler veya toksik kimyasallar testleri özel önlemler gerekebilir.
Paneller contaminations için haftada birkaç kez kontrol edildi. Kültürde kullanılan deniz suyu Tjärnö deniz araştırma laboratuvarı dışında Koster fiyort 40 m derinlemesine dan pompalanır oldu ve iki kum filtreleri yoluyla Laboratuvar su sistemi girmeden önce kabul edildi. Filtre yok sudan yapılmış eğer çok daha fazla kirlenme kültür olur. Düzenli olarak döküntü ve deniz suyu temini sisteminden alandan girin (Örneğin, stolon-bina hydroids ve yırtıcı nemerteans) diğer omurgasızlar kültüründen panellerinde temizlemek için esastır. Hiçbir larva rağmen üretilen Eğer örneğin, kültür iyi beslenmiş ve aksi halde olmuştur aslında iyi durumda gibi görünüyor sorun çiftleşme etkisizleştirmek için görünür nemerteans varlığı olabilir. Doğal olarak, birçok bulaşıcı canlılar kültür Tjärnö deniz araştırma laboratuvarı arasında İsveç Batı kıyısında belirli ve organizmaların bulaşıcı başka türleri yaygın ve diğer coğrafi alanlarda bir sorun daha olabilir. İsveç'in Batı kıyısında kirlenme panellerinde diğer barnacle türler tarafından bulmak olağandışı bir durum. Bazen, S. balanoides kurulması bulundu, ama çok marjinal sorun (en azından, bir balanoides S. kirletici 10.000 B. improvisus örnekleri için) bu. Türler kirletici eksikliği büyük olasılıkla yeni kültürler larvaefrom B. improvisus son derece hakim olduğu zaman yaz aylarında kurmak için rejim bağımlı. Buna ek olarak, ayrıca oldu B. improvisus açık bir zenginleştirme panellerinde bu tür pürüzsüz yüzeylerde13için seçime bağlı olduğu için.
Ölü yetişkin kıskaç kaldırmak gereklidir. Boş kabukları panelleri üzerinde kalması durumunda, hem Artemia nauplii yanı sıra çeşitli bulaşıcı türler için bir sığınak haline gelebilir. Buna ek olarak, bu ölü bireylerin bireylerle, ayrışma sırasında toksik bileşikler sürümü muhtemelen komşu iyi olmak etkilemek fark edilmiştir. Bir ek, yetişkin ölüm bazı kişilerin rahat ve çok uzakta çiftleşme (kaya midyeleri en uzun penis büyüklüğü ile ilgili olarak hayvan dünyada olsa bile) izin vermek için herhangi bir yetişkin gelen kalır ki sonucudur28. Bu kişilerin hayatta kalacak ama larva için sigara-üretken. Ancak, bu yalnız yetişkin bireyler yavaşça Bankası-plaka zarar vermeden kaldırılabilir ve diğerlerine yakın çiftleşme etkinleştirmek için yatay olarak yerleştirilmiş. Kıskaç da üstünde her-paneller bir yetişkin ile yerleştirerek şeklindeki ama böylece karşılıklı etkileşimlere oluşabilir yeterince yakın. Bu şekilde, genetik satırları üretilen14olabilir.
Bir yem kaliteli üretmek için ve hemen hemen her gün kültürler beslemek için önemlidir. Hatta bir kaç gün yiyeceksiz larva azalan bir sürümde neden olabilir. Diyet kompozisyon önceki testler Diyatomlarla barnacle nauplii hayatta kalma ve büyüme için gerekli olan göstermiştir. Birçok diatom türü olarak yeterli gibi görünüyor besleme, her ne kadar küçük ya da soliter hücreleri (çapı 10 µm) nauplii'nın sindirim için gerekli olabilir. S. marinoi, C. simplexve T. pseudonana türlerin hepsi B. improvisus nauplii, yanı sıra kolay yetiştirmek için yeterli yem olduğu kanıtlanmıştır. Buna ek olarak, yem kalitesi genellikle yosun katlanarak büyüyen için yüksektir. Ayrıca Diyatomlarla B. amphitrite15üretken kültürleri kurmak için gerekli olan bildirilmiştir. Bir teori Diyatomlarla önemini bir benzersiz yağ asidi profile sahip ve özellikle son derece çoklu doymamış 20:5 yağ asidi29zengindir. Bu, bazı yağ asitleri istiridye larva30başarılı gelişimi için önemlidir gösterilmiştir.
Yıllar içinde barnacle kültüründe zararlı hastalıkları yok olaylar olmuştur. İstiridye ve midye gibi birçok ticari omurgasız aquacultures hastalıklar oldukça yaygındır ve çok zararlı olabilir. Virüsler zararlı etkileri de vahşi nüfus bildirilmistir. Fransa'da yerli istiridye 1925 yılında Portekizli istiridye Crassostrea angulata tarafından değiştirildi, ancak bu tür bir iridovirus 197031çevresinde tarafından yok olmuş. Daha yakın zamanlarda, Pasifik istiridye ostreid herpesvirus 132ile ilişkili gibi görünüyor Crassostrea gigas kültürlerde dünya çapında, içinde büyük ölüm hadise olmuştur. Patojenler, bakteri veya virüsler kıskaç üzerinde hiçbir rapor defa yayınlanmıştır. Ancak, devam eden genom-devam eden proje B. improvisus, virüs sıraları bulunmuştur (Alm Rosenblad vd., yayınlanmamış veri) ama hastalıklarının belirtileri belirgin bir bağlantı ile. Karışımlar antibiyotik bakteriyel enfeksiyonlar riskini en aza indirmek için kültürler daha önce uygulanmış olan; Ancak, bu yordamı Şu anda durdurulmuş ve şimdiye kadar bu herhangi bir kirlenme sorunları neden oldu değil.
Deniz suyu (yukarıda açıklandığı gibi) ısıtılır, aşırı ısınma kültür üretim hattı en ciddi tehlikede olabilir. Bu, tabii ki, sensörler ve uygun uyarı sistemleri (sorumlu kişilere e-posta veya metin mesajları gönderme kullanılanÖrneğin,) olabilir, ancak aşırı ısınma karşı korumak zordur. Olaylar geçmişte bu tür yetişkin kültüründe önemli öldürülmesi sonuçlandı. Bu, tabii ki, yıkıcı ve zaman ve para uzun vadeli yatırımlar berbat. Özellikle, bu doğuştan genetik çizgiler kurulmuş varsa felaket olabilir. Bu satırları uzun ömür sağlamak ve onları kayıplara karşı güvence altına almak için kıskaç bir dondurma metodoloji geliştirmeye arzu olurdu. Bu larvalar Pasifik İstiridye üzerinden aşağı donmuş ve kısmi başarı33ile canlanan bildirilmiştir. Cryobanking da çok çeşitli türler34genetik kaynakları korumak için değerli bir araç olmuştur. B. amphitrite üzerinden bile nauplii dondurucu35hayatta kalmak için rapor edilen ve dondurulmuş aşağı bireylerin % 20'si başarılı bir şekilde cyprids36başkalaşıma bulundu. Ancak, donma kültürlerin uzun vadeli sürdürülebilirlik için uygulama defa değil kabul edilmiştir, ama bu gerçekten seçili satırları bakımı için gerekli olacaktır; Bu sıkıca B. improvisus güçlü bir deniz modelsystem kurulması için önemli bir adım olacaktır.
Burada, bir protokol B. improvisus (yani, cirri, soma ve şömine) yetişkinlerden çeşitli dokularda diseksiyon için sunuldu. Ancak, diğer dokularda da çıkarılan stres. Örneğin, yumuşak doku Bankası membranöz türler Tetraclita japonica formosana dış ve iç manto arasında edilmiş dikkatli bir şekilde izole ve bir RNA çıkarma ve gen ifade37RNA-seq analizi için kullanılır. Burada açıklanan Seviyelendirilmiş en iyi duruma getirilmiş ayıklama Protokolü malzeme başlayan en az bir miktar üzerinden sıralama için yeterli miktarda yüksek kaliteli RNA sağlar. İlk olarak, bireysel larva koleksiyonu homojenizasyon tüpler içine doğrudan herhangi bir kayıp bir tüp transfer sırasında en aza indirir. Ayrıca, farklı yöntemler arasında test, Seramik Boncuklar RNA açısından en verimli verim olduğunu kanıtladı ve dürüst sonication veya havaneli homojenizasyon için karşılaştırıldığında, homojenizasyon. Gen ifadesinin veya genomik deneyler için planlama yaparken, bir kıskaç, yüksek genetik varyasyon meydan en az B. improvisusiçin unutmayın vardır. Barnacle Kodlayıcı bölgeler (Alm Rosenblad vd., yayınlanmamış veri) içinde bile 3-%5, aralıktaki bir genetik çeşitlilik var. Bu, tabii ki, qPCR analiz için astar tasarım belirli talepleri koyar, nerede daha korunmuş bölge tespit ve tutarlı ifade sonuçları betweenbatches almak için astar için şablon olarak kullanılır. Hedef genlerin, korunmuş bölgelerde gibi aquaporins ve Na +/ K + ATPases, RNA-seq veri bireylerin yüzlerce içeren cyprids gruplarından elde Bu genler sıra değişkenliği inceleyerek belirlenebilir. DNA Genom Analizi için örnek. Ancak, B. improvisus yüksek kaliteli DNA alma21zor olabilir.
Sonuç olarak, kurulan barnacle kültür deneysel çalışmalar farklı türde vesile olduğu ispatlanmıştır. Özellikle, larva üretim her yıl çevresinde ezelî varlık mahdut doğal olarak meydana gelen yumurtlama dönemine deneyler için bize izin verir ( B. improvisusiçin yaz aylarında bu). Elde edilen larvaların deneysel çalışmalar, yerleşim deneyleri, davranış deneyleri, belirli genlerin ifade çalışmaları yanı sıra genom-wide transcriptome çalışmaları da dahil olmak üzere geniş bir dizi gerçekleştirmek için kullanılabilir.