Biz derleme işlemi, tarif ve gerçek zamanlı akış iken altında görüntü mantar biyofilm oluşumu için bir akış cihazları temizlik tasarlanmış. Biz de sağlamak ve elde edilen görüntülerde kullanılmak üzere sayısal algoritmalar tartışıyorlar.
Yöntem makalesi
Biz derleme işlemi, tarif ve gerçek zamanlı akış iken altında görüntü mantar biyofilm oluşumu için bir akış cihazları temizlik tasarlanmış. Biz de sağlamak ve elde edilen görüntülerde kullanılmak üzere sayısal algoritmalar tartışıyorlar.
Oropharyngeal kandidiyazis içinde Candida cinsinin üyeleri uygun ve süre tükürük akışı etkileri altında oral mukozal yüzeyinde büyümek gerekir. Akış altında büyüme modellerinde geliştirilmiş olsa da, bu sistemlerin pek çok pahalı veya hücreleri akış altında iken görüntüleme izin vermiyor. Büyüme ve gelişme Candida albicans hücre akışı altında ve gerçek zamanlı görüntü için bize izin verir yeni bir cihaz geliştirdik. Burada, derleme ve bu akışı cihaz kullanımı yanı sıra oluşturulan veri miktar için protokolü ayrıntılı. Biz bu hücreleri ekleyin ve slayttan slayt üzerinde biyokütle ölçüsü zaman içinde belirlemek için, de ayırmak oranları ölçmek edebiliyoruz. Ve bu sistem hem ekonomik hem çok yönlü, ışık mikroskoplar, ucuz benchtop mikroskoplar, dahil olmak üzere birçok türleri ile çalışma yeteneğine sahip olan diğer akış sistemlerine göre kez Imaging genişletilir. Genel olarak, bu son derece ayrıntılı gerçek zamanlı bilgi akışı altında mantar türlerinin biyofilm büyüme sağlayabilen bir düşük işlem hacmi sistemdir.
Candida albicans (C. albicans) bir fırsatçı mantar patojen oral mukozal yüzeyler de dahil olmak üzere, oropharyngeal kandidiyazis neden ve daha düşük bir yaşam kalitesi için etkilenen bireylerin1sonuçlanan birçok doku türler, enfekte olabilir insanlar var. Biyofilm oluşumu için C. albicanspatogenezinde önemli bir özelliğidir ve oluşumu ve işlev C. albicans biyofilmler2,3,4çok sayıda çalışma yapılmıştır, 5birçoğu gerçekleştirdik statik (akımı) vitro kullanarak, modelleri. Ancak, C. albicans uygun ve ağız boşluğu tükürük akışında huzurunda büyümek gerekir. Çok sayıda akış sistemleri canlı hücre görüntüleme6,7,8,9,10için izin vermek için geliştirilmiştir. Bu farklı akış sistemleri farklı amaçlar için tasarlanmıştır ve bu nedenle her sistem farklı güçlü ve zayıf yönleri vardır. Bulduk çok akış sistemleri C. albicans için uygun maliyetli, gerekli karmaşık parçaları, fabrikasyon veya değil olabilir akışı sırasında yansıma ve görüntüleme önce durdurulması gerekiyordu. Bu nedenle, C. albicans biyofilm oluşumu akışı11altında çalışmaya bir roman akışı aparatı geliştirdik. Akış cihazlarımızı tasarım sırasında bu önemli konuları takip ettik. İlk olarak, biyofilm büyüme ve gelişme içinde birden çok yönlerini ölçmek mümkün istedim floresan hücreleri (bize çalışma mutant suşları ve değiştirilmemiş klinik yalıtır kolayca izin) kullanımı gerektiren olmadan gerçek zamanlı. İkinci olarak, biz hiçbir değişiklik için çok az ile ticari olarak kullanılabilir olması için tüm parçaları istedim (i.e., hiçbir özel imalat), diğerleri daha kolayca sistemimiz yeniden sağlayan ve kolay onarımlar için izin. Üçüncü olarak, aynı zamanda genişletilmiş için izin istedim zaman makul yüksek akış oranları görüntüleme. Son olarak, döneminden sonra hücre yüzey akışı altında için ekleme bir genişletilmiş bir zaman içinde biyofilm büyüme yeni hücre tanıtımı olmadan izlemek edebilmek için istedik.
Bunu göz önünde iki şişeye dolaşım akış sistemi Şekil 1' de gösterildiği geliştirmek için bize yol. İki şişe deney iki aşama, hücre numaralı seribaşı eki balonun çizer bir eki faz ve biyofilm büyüme yeni hücreler ek olmadan devam etmek için medya boş hücre kullanır bir büyüme aşamasında içine bölmek sağlamak. Bu sistem (2-5 Şekil 1) inkübatör içinde konuyor kendisinden önce boru ve slayt ile mikroskop için bir kuluçka odası ile çalışacak şekilde tasarlanmıştır ve tüm diğer bileşenleri yerleştirilen dışında büyük bir ikincil kap içinde mikroskop. Ayrıca, bir Pinar karıştırıcı bir ekli sıcaklık probu ile 37 ° C'de eki şişeyi mantar hücreleri korumak için kullanılır Sirkülasyon gibi bu sistem (36 h üzerinden koşullara bağlı olarak olabilir) akışı sırasında sürekli görüntüleme yeteneğine sahiptir ve dik veya ters benchtop mikroskoplar dahil olmak üzere çoğu standart mikroskoplar kullanılabilir. Burada, biz derleme işlemi, ele ve akış aparatı temizlik, de gibi videoları bir deneyden sonra analiz etmek için bazı temel ImageJ nicel algoritmalar sağlar.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. montaj akışı aparatı
2. deney gerçekleştirmek

3. temiz akışı aparatı
4. miktarının videoları
Not: Tüm dosyaları çalışmak için etiket görüntü dosya (TIF) biçimine dönüştürülmesi gerekir. Ayrıca, deneyler arasında karşılaştırmak için yukarıda da açıklandığı gibi tüm görüntüleri görüntüleme parametreleri ve aynı mikroskop ile alınır çok önemlidir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Temsili resim normal bir gecede hızlandırılmış deney vahşi-türü C. albicans kullanarak hücreleri 37 ° C'de Şekil 2A ve Tamamlayıcı Video 1' de görülebilir. Görüntüleri görünürlüğünü artırmak için gelişmiş kontrast olmuştur. Miktar özgün verilerin gerçekleştirilmiş ve temsilcisi grafikler Şekil 2' deBgörülebilir. Bu grafikler oluşturmak için verileri ilk görüntüleme alanı...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Akış sistemi kullanarak yukarıda belirtildiği gibi nicel hızlandırılmış videoları mantar biyofilm büyüme ve gelişme üretimi için izin verir. Deneyler arasında karşılaştırmalar için izin vermek için görüntüleme parametreleri aynı kalmasını sağlamak için kritik öneme sahiptir. Bu mikroskop için Köhler aydınlatma (birçok kılavuzları online Bu işlem için kullanılabilir) her deneme için ayarlanır sağlanması içerir. Parametreleri görüntüleme bir yana, akış aparatı ile çalışırken dikkat edilmesi gereken bazı önemli adımlar vard...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar ifşa gerek yok.
Yazarlar Dr. Wade Sigurdson değerli giriş akışı aparat tasarımı sağlamak için kabul etmek istiyorum.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Pompa | Cole Parmer | 07522-20 | 6 |
| Pompa kafası | Cole Parmer | 77200-60 | 6 |
| Boru | Cole Parmer | 96410-14 | |
| Yok Kabarcık tuzağı adaptörü | Cole Parmer | 30704-84 | |
| 1/4" için 3 Kabarcık tutucu vakum adaptörü ID vakum hattı | Cole Parmer | 31500-55 | 3 |
| Sıralı filtre adaptörü (4 gerekli) | Cole Parmer | 31209-40 | 8,9 |
| Turuncu tarafı Y | Cole Parmer | 31209-55 | 7 |
| Yeşil tarafı Y | ibidi | 10827 | 2 |
| * Slaytlar | ibidi | 80196 | 4 |
| * Sürgülü luers | ibidi | 10802 | 4 |
| Vakum destekli Kabarcık tuzağı | Elveflow/Darwin mikroakışkanları | KBTLarge - Mikroakışkan Kabarcık Tuzağı Kiti | 3 |
| Medya şişeleri | Corning | 4980-500 | 1 |
| 0.2 & mikro; m hava filtresi | Corning | 431229 | 1 |
| PD ve filtre şişesi için dişli cam şişe (2 gerekli) | Corning | 1395-100 | 5,10 |
| Portlu PD ve filtre şişesi için vidalı kapak (2 gerekli) | Wheaton | 1129750 | 5,10 |
| Vidalı boru konektörü | Wheaton | 1129814 | 5,10 |
| Boru konektörü eğimli rondela | Danco | 88579 | 5,10 |
| Boru konektörü düz yıkayıcı | Danco | 88569 | 5,10 |
| Hat içi filtreler ve aşağı akış Y için kelepçeler (7 gerekli) | Oetiker/MSC Endüstriyel Tedarik Şirketi | 15100002-100 | 7,8,9 |
| Kelepçe aleti | Oetiker/MSC Endüstriyel Tedarik Şirketi | 14100386 | N/A |
| 20 μ m in-line medya filtresi | Analitik Bilimsel Cihazlar | 850-1331 | 8 |
| 10 μ m in-line medya filtresi | Analitik Bilimsel Cihazlar | 850-1333 | 9 |
| 2 & mu; m giriş medya filtresi | Supelco/Sigma-Aldrich | 58267 | 10 |
| *, 0.22 & m medya filtresi | Millipore | SVGV010RS | 11 |
| * 0.22 & mikro; M Medya Filtresi " adaptör" | BD Biosciences | 329654 | 11 |
| Kauçuk tıpa | Fisher Scientific | 14-131E | 1 |
| Harici prob portuna sahip ocak gözü karıştırıcı | ThermoFisher Scientific | 88880006 | N/A |
| Sıcaklık probu | ThermoFisher Scientific | 88880147 | N/A |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste