Bu protokol Tayvan yarasalar lyssavirus antijenlerin tanısal test için standart bir laboratuvar işletim prosedürü tanıttı.
Yöntem makalesi
Bu protokol Tayvan yarasalar lyssavirus antijenlerin tanısal test için standart bir laboratuvar işletim prosedürü tanıttı.
Lyssavirus cinsinden virüsler zoonotik patojenlerdir ve en az yedi lyssavirüs türü insan vakalarıile ilişkilidir. Yarasalar çoğu lyssaviruses doğal rezervuarlar olduğundan, yarasaların bir lyssavirus izleme programı yarasalar bu virüslerin ekolojianlamak için 2008 yılından bu yana Tayvan'da yürütülmektedir. Bu programda, sivil toplum yarasa koruma örgütleri ve yerel hayvan hastalığı kontrol merkezleri ölü yarasalar veya yarasalar zayıflık veya hastalık tan ölen toplamak için işbirliği yaptı. Yarasaların beyin dokuları nekropsi yoluyla elde edildi ve lyssavirus antijenleri ve nükleik asitlerin saptanması için doğrudan floresan antikor testi (FAT) ve ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonuna (RT-PCR) tabi tutuldu. FAT için en az iki farklı kuduz tanı konjugatları önerilir. RT-PCR için lyssavirus nükleoprotein geninin kısmi dizisini yükseltmek için iki set astar (JW12/N165-146, N113F/N304R) kullanılır. Bu gözetim programı yarasalarda lyssaviruses ve diğer zoonotik ajanları izler. Tayvan yarasa lyssavirus 2016-2017 yılında Japon pipistrelle(Pipistrellus abramus)iki olguda bulunmuştur. Bu bulgular halk, sağlık profesyonelleri ve yarasalar ve diğer yaban hayatı temas potansiyel riskleri bilim adamları bilgilendirmek gerekir.
Lyssavirus cinsinden virüsler zoonotik patojenlerdir. İnsan vakaları ile ilişkili en az yedi lyssavirus türü vardır1. Bu cins116 türek olarak,2,3, Tayvan yarasa lyssavirus (TWBLV)4 ve Kotalahti yarasa lyssavirus5 son zamanlarda yarasatespit edilmiştir, ancak taksonomik durumları henüz belirlenmelidir.
Yarasalar en lyssaviruses doğal konaklar, Mokola lyssavirus ve Ikoma lyssavirus hariç, henüz herhangi bir yarasa tespit edilmemiştir1,2,3,6. Asya yarasalarında lyssaviruses hakkında bilgi hala sınırlıdır. Asya yarasalar iki tanımsız lyssaviruses (Hindistan ve Taylanddiğer) 7,8 bildirilmiştir. Çin'de bir yarasa ısırığı ile ilişkili bir insan kuduz durumda 2002 yılında bildirilmiştir, ancak tanı sadece klinik gözlem9ile konulmuştu . Orta Asya'da, Aravan lyssavirus 1991 yılında Kırgızistan'da fare kulaklı yarasa(Myotis blythi)ve Khujand lyssavirus 2001 yılında Tacikistan'daki bıyıklıyarasada(Myotis mystacinus)tespit edilmiştir. Güney Asya'da, Gannoruwa yarasa lyssavirus Hint uçan tilki tespit edildi(Pteropus medius) Sri Lanka'da 20153. Güneydoğu Asya'da, Filipinler yarasalar üzerinde çeşitli serolojik çalışmalar, Tayland, Bangladeş, Kamboçya, ve Vietnam değişken seroprevalans11gösterdi,12,13,14, 15. yıl. Irkut lyssavirus jilin eyaleti, Çin 201216yılında büyük tüp burunlu yarasa(Murina leucogaster)tespit edilmiş olmasına rağmen, Doğu Asya yarasa popülasyonlarında lyssaviruses tam türleri ve yerleri bilinmemektedir.
Tayvanyarasa popülasyonlarında lyssavirus varlığını değerlendirmek için, hem doğrudan FAT hem de RT-PCR kullanan bir gözetim programı başlatıldı. Tayvan yarasa lyssavirus 2016-2017 yılında Japon pipistrelle(Pipistrellus abramus)4 iki olgutespit edilmiştir. Bu makalede, Tayvan yarasa nüfusunun lyssavirus gözetim için bir laboratuvar standart işletim prosedürü tanıtıldı. Laboratuvarımızda yarasa lyssavirus tanısının akış şeması Şekil1'de vettir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. Lyssavirüsleri kullanırken güvenlik önlemleri
2. Örnek toplama
3. Yarasa örneklerinin nekropsisi
4. Doğrudan floresan antikor testi (FAT)
5. Nükleik asit ekstraksiyonu
6. RT-PCR ve filogenetik analiz
NOT: Bilinen tüm lyssaviruses veya belirli lyssaviruses tespit etmek için çeşitli astar setleri yayınlanmıştır. Burada açıklanan protokol, laboratuvarımızın kullandığı ve tüm deneysel ihtiyaçlar için uygun olmadığı bir örnektir. Laboratuvar ihtiyaçlarına göre uygun astarları seçin.
7. Virüs yalıtımı
NOT: 1) FAT veya 2) RT-PCR pozitifliği gösterdiğinde virüs yalıtımı yapın.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
2014-Mayıs 2017 tarihleri arasında 13 türden 332 yarasa leşi gözetim altında toplandı. İki test pozitif çıktı. İlk yarasa durumunda, beyin izlenimi, ticari FITC konjuge anti-kuduz antikorlarından biriyleFAT kullanılarak negatif test edildi (Şekil 2), iki astar kümesinin her birini kullanan RT-PCR'ler (JW12/N165-146, N113F/N304R) olumlu sonuçlar (Şekil 3). 428 bp amplicon dizisi (N113F/N304R ile güçlendirilmiş ve kısmi nükleoprotein geni içeren) elde edildi. Dizi...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu laboratuvar standart işletim prosedürü (SOP) Tayvan lyssavirus antijenlerin varlığı için yarasa örnekleri test etmek için bir seri süreç sağlar. Önemli adımlar arasında FAT ve RT-PCR istihdamı yer alıyor. Uygun örneklerin seçilmesi ve virüsün başarılı bir şekilde izole edilmesi de önemlidir. Ayrıca, yarasa lyssaviruses izlenmesi sırasında bazı sorun giderme yapılmıştır. En büyük fark hedef hayvanlardı. Başlangıçta (2008-2009), yarasa lyssavirus gözetim hedef hayvanlar tayvan Kinmen Adası'nda sıkışıp sonra ötanazi sonr...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Çıkar çatışması bildirilmemiştir.
Biz Tien-Cheng Li, Yi-Tang Lin, Chia-Jung Tsai ve Ya-Lan Li bu çalışma sırasında yardım için teşekkür ederiz. Bu çalışma, Hayvan ve Bitki Sağlığı Teftiş ve Karantina Bürosu, Tarım Konseyi, Executive Yuan, Tayvan'dan 107AS-8.7.1-BQ-B2 (1) numaralı hibe ile desteklenmiştir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| % 2.5 Tripsin (10x) | Gibco | 15090046 | Tripsin |
| 25 cm <2 / sup> şişesi | Greiner bio-one | 690160 | |
| Aseton | Honeywell | 32201-1L | |
| Agaroz I | VWR Yaşam Bilimleri | 97062-250 | |
| Alkol | NIHON SHIYAKU REAKTIFI | NS-32294 | |
| AMV Ters Transkriptaz | Promega | M5101 | |
| Antibiyotik-Antimikotik(100X) | Gibco | 15240-062 | MEM-10 Bıçaklı |
| Braun | BA215 | ||
| Santrifüj | eppendorf | 5424R | |
| Kemilümineans sistemi | TOP BIO CO. | MGIS-21-C2-1M Toplama | |
| tüpü | Qiagen | 990381 | |
| Toplama tüpü | SSI | 2341-SO | |
| Kapak sürgüsü | Muto Pure chemical Co., LTD. | 24505 | |
| DNA analizörü | Applied Biosystems | 3700XL | |
| Fetal sığır serumu | Gibco | 10437028 | MEM-10 |
| FITC Anti-Kuduz Monoklonal Globulin | Fujirebio Teşhis A.Ş. | 800-092 | FITC konjuge anti-kuduz antikorları: reaktif B |
| Dört kuyulu Teflon kaplama cam slayt | Thermo Fisher Scientific | 30-86H-WHITE | |
| Jel Elektroforez Sistemi | Ana Bilim | MJ-105-R | |
| HBSS (1x) | Gibco | 14175095 | Tripsin |
| İnkübatörü | ASTEC | SCA-165DS | |
| Ters Mikroskop | Olympus | IX71 | |
| L-Glutamin 200 mM (100x) | Gibco | A2916801 | MEM-10 |
| HAFİF TEŞHİS Kuduz YAĞ reaktifi | EMD Millipore Corporation | 5100 | FITC-konjuge anti-kuduz antikorları: reaktif A |
| MagNA Saf Kompakt Alet | Roche | 03731146001 | |
| MagNA Saf Kompakt NA İzolasyon Kiti 1 | Roche | 03730964001 | |
| MEM (10x) | Gibco | 11430030 | MEM-10 |
| MEM NEAA (100x) | Gibco | 11140050 | MEM-10 |
| MEM vitamin çözeltisi | Gibco | 11120052 | MEM-10 |
| NaHCO3 | Merck | 1.06329.0500 | MEM-10 |
| İğne | Terumo | NN*2332R9 | |
| PBS | Medicago | 09-8912-100 | |
| Astar sentezi | Misyon Biyoteknoloji | ||
| RNasin ribonükleaz inhibitörü | Promega | N2111 | |
| Sıralama hizmeti | Misyon Biyoteknoloji | ||
| Slayt | Termo Bilimsel | AA00008032E00MNT10 | |
| Sodyum Piruvat (100 mM) | Gibco | 11360070 | MEM-10 |
| Paslanmaz Çelik | Boncuk QIAGEN | 69989 | |
| Steril emici ped | 3M | 1604T-2 | |
| Şırınga filtresi | Nalgene | 171-0045 | |
| Taq polimeraz | JMR Holdings | JMR-801 | |
| Termal döngüleyici | Uygulamalı Biyosistemler | 2720 | |
| TissueLyser II | QIAGEN | 85300 | |
| Dil bastırıcı | HONJER CO., LTD. | ||
| Cımbız | Tennyson tıbbi alet geliştirme CO., LTD. | A0601 | |
| Tylosin Tartarat | Sigma | T6271-10G | MEM-10 |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste