İmmünoglobulin G (IgG) N-glikan hidrofilik etkileşim kromatografiu UPLC ile karakterizedir. Buna ek olarak, IgG N-glikan yapısı açıkça ayrılır. Burada sunulan yaygın araştırma ortamlarında kullanılabilir, böylece bu deneysel yönteme bir giriştir.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
* These authors contributed equally
İmmünoglobulin G (IgG) N-glikan hidrofilik etkileşim kromatografiu UPLC ile karakterizedir. Buna ek olarak, IgG N-glikan yapısı açıkça ayrılır. Burada sunulan yaygın araştırma ortamlarında kullanılabilir, böylece bu deneysel yönteme bir giriştir.
Glycomics hastalık yatkınlığı, ilaç hedef keşif ve hassas tıp için yeni nesil biyobelirteçler keşfetmek önemli bir potansiyel sunan omics sistem araştırmayeni bir alt uzmanlık olduğunu. Alternatif IgG N-glikanlar çeşitli yaygın kronik hastalıklarda bildirilmiştir ve klinik uygulamalarda büyük potansiyele sahip olduğu ileri sürülmüştür (yani, hastalıkların tanı ve tahmini için biyobelirteçler). IgG N-glikanlar hidrofilik etkileşim kromatografisi (HILIC) ultra-performanslı sıvı kromatografisi (UPLC) yöntemi kullanılarak yaygın olarak karakterize edilir. UPLC iyi tekrarlanabilirlik ve yüksek göreli kantitatif doğruluk ile istikrarlı bir algılama teknolojisidir. Buna ek olarak, IgG N-glikan yapısı açıkça ayrılır, ve glikan bileşimi ve plazmada göreceli bolluk karakterizedir.
N-insan proteinlerinin glikozilasyon yaygın ve temel post-translational modifikasyon1 ve nispeten doğru hastalıkların oluşumu ve gelişimini tahmin yardımcı olabilir. Yapısının karmaşıklığı nedeniyle, 5.000'den fazla glikan yapısı olması beklenmektedir, hastalıklar için tanısal ve tahmine dayalı biyobelirteçler olarak büyük bir potansiyel sağlayan2. N -glikanlar immünglobulin G bağlı (IgG) IgG fonksiyonu için gerekli olduğu gösterilmiştir, ve IgG N-glikozilasyon pro- ve anti-inflamatuar sistemler arasındaki dengeye katılır3. Diferansiyel IgG N-glikozilasyon hastalık gelişimi ve ilerlemesinde rol oynar ve hastalık patolojisinde yer alan yatkınlık ve fonksiyonel mekanizmayı temsil emdir. IgG N-glikozilasyon inflamatuar rolü yaşlanma ile ilişkili olmuştur, inflamatuar hastalıklar, otoimmün hastalıklar, ve kanser4.
Algılama teknolojisinin geliştirilmesi ile, aşağıdaki yöntemler en yaygın olarak yüksek iş yapma glycomics kullanılır: hidrofilik etkileşim kromatografisi (HILIC) floresan saptama ile ultra-performans sıvı kromatografisi (UPLC-FLR), lazer indüklenen flor ile multipleks kapiller jel elektroforezi eskuss algılama (xCGE-LIF), matris destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyon zaman-of-flight kütle spektrometresi (MALDI-TOF-MS) ve sıvı kromatografi elektrosprey kütle spektrometresi (LC-ESI-MS) . Bu yöntemler düşük akı önceki eksiklikleri aşmak var, kararsız sonuçlar, ve kötü duyarlılık özgüllüğü5,6.
UPLC yaygın IgG N-glikozilasyon ve bazı hastalıklar arasındaki ilişkiyi keşfetmek için kullanılır (yani, yaşlanma7, obezite8, dislipidemi9, tip II diyabet10, hipertansiyon11, iskemik inme12, ve Parkinson hastalığı13). Yukarıda belirtilen diğer üç yöntemle karşılaştırıldığında, UPLC aşağıdakiavantajlarasahiptir 5,14. İlk olarak, göreceli bir nicel analiz yöntemi sağlar ve toplam alan normalleştirme içeren veri analizi her örnek karşılaştırılabilirliğini artırır. İkinci olarak, ekipman maliyeti ve gerekli uzmanlık nispeten düşüktür, bu da glikozilasyon biyobelirteçlerinin klinik uygulamalara uygulanmasını ve dönüştürülmesini kolaylaştırır. Daha yaygın olarak kullanılabilir böylece Burada Sunulan UPLC bir giriştir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Protokolde yer alan tüm konular Sermaye Tıp Üniversitesi Etik Komitesi tarafından onaylanmıştır, Pekin, Çin12. Çalışmanın başında her konudan yazılı bilgilendirilmiş onay alındı.
1. IgG izolasyon
2. Glikan salınımı
3. Glikan etiketleme ve arınma
4. Hidrofilik etkileşim kromatografisi ve glikan analizi
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Şekil 1'degösterildiği gibi, IgG N-glikanlar pik pozisyon ve tutma süresine göre 24 ilk IgG glikan piki (GPs) olarak analiz edildi. N-glikan yapıları bir önceki çalışmaya göre kütle spektrometresi tespiti ile kullanılabilir (Tablo 1)15. Sonuçların karşılaştırılabilir olmasını sağlamak için, her tepedeki glikan miktarının toplam entegre alanın yüzdesi olarak ifade edildiği toplam alan normalizasyonu uy...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
UPLC göreceli nicel analizyöntemi5,15olarak hizmet vermektedir. Sonuçlar UPLC iyi tekrarlanabilirlik ve göreceli nicel doğruluk ile istikrarlı bir algılama teknolojisi olduğunu göstermektedir. Her tepedeki glikan miktarı, göreli değer olan UPLC kullanılarak toplam tümleşik alanın yüzdesi olarak ifade edilir. Göreli nicelik, test örneklerinin karşılaştırılabilirliğini artırır. Buna ek olarak, 96 iyi protein G plakaları yüksek iş lenme tespiti için bir seferde 96 ö...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.
Bu çalışma, Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı (81673247 & 81872682) ve Avustralya-Çin İşbirlikçi Hibe (NH & MRC - APP1112767 -NSFC 81561128020) tarafından desteklenmiştir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| 2-aminobenzamid, 2-AB | Sigma, Çin | ||
| 96 oyuklu toplama plakası | AXYGEN | ||
| 96 oyuklu filtre plakası | Pol | 0.45 um GHP | |
| 96 oyuklu monolitik plaka | BIA Ayrımları | ||
| 96 oyuklu plakalı rotor | Eppendorf Co., Ltd, Almanya | T_1087461900 | |
| Asetik asit | Sigma, Çin | ||
| Asetonitril | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, Çin | ||
| Amonyum bikarbonat | Shenggong Biological Engineering Co., Ltd, Çin | ||
| Amonyum format | Beijing Minruida Technology Co., Ltd. | ||
| Sürekli sallanan inkübatör / rocker | Zhicheng analitik enstrüman imalat co, Ltd, Çin | ZWY-10313 | |
| Dekstran Kalibrasyon Merdiveni / Glikopeptid sütunu | Watts technology Co., Ltd, Çin | BEH sütunu | |
| Dimetil sülfoksit (DMSO) | Sigma, Çin | ||
| Disodyum fosfat | Shenggong Biyoloji Mühendisliği Co, Ltd, Çin | ||
| Elektrikli fırınlar | Test cihazı aletleri Co., Ltd | 202-2AB | |
| 3.0 Waters | technology Co., Ltd., Amerika'yı | ||
| güçlendirin Etanol | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, Çin | ||
| Formik asit | Sigma, Çin | ||
| GlycoProfile 2-AB Etiketleme kiti | Sigma, Çin | ||
| HCl | Junrui Biotechnology Co., Ltd, Çin | ||
| Yüksek hızlı santrifüj | Eppendorf Co., Ltd, Almanya | 5430 | |
| Igepal | Sigma, Çin | ||
| Düşük sıcaklık santrifüjü | Eppendorf Co., Ltd, Almanya | ||
| Düşük sıcaklık buzdolabı | Qingdao Haier Co., Ltd | ||
| Manifold 96 kuyulu plaka | Watt teknolojisi Co., Ltd, Çin | 186001831 | |
| Metanol | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, Çin | ||
| Milli-Q saf su sayacı | Millipore Co., Ltd, Amerika | Avantajı A10 | |
| NaOH | Shenggong Biyoloji Mühendisliği Co., Ltd, Çin | ||
| PH test cihazı | Sartorius Co., Ltd, Almanya | PB-10 | |
| Fosfat tamponlu tuzlu su, PBS | Shenggong Biyoloji Mühendisliği Co, Ltd, Çin | ||
| Pipet | Eppendorf Co., Ltd, Almanya | 4672100, 0.5-10μ l & 10-100 & mu; l & 20-200μ l & 1000 & mu; l | |
| PNGase F enzimi | Sigma, Çin | ||
| Potasyum dihidrojen fosfat | Shenggong Biyoloji Mühendisliği Co, Ltd, Çin | ||
| Propan-2-ol | Huihai Keyi Technology Co., Ltd, Çin | ||
| SDS | Sigma, Çin | ||
| Sodyum klorür | Shenggong Biyoloji Mühendisliği Co, Ltd, Çin | ||
| Sodyum siyanoborohidrit (NaBH3CN) | Sigma, Çin | ||
| Spektrofotometre | Şangay Yuanxi enstrüman Co, Ltd | B-500 | |
| Transfer sıvı tabancası | Smer Fell Science and Technology Co., Ltd, Çin | 4672100 | |
| Tris | Amresco, Amerika | ||
| Ultra düşük sıcaklıklı buzdolabı | Thermo Co., Ltd, Amerika | MLT-1386-3-V; MDF-382E | |
| Ultra performanslı sıvı kromatografisi | Watts technology Co., Ltd, Çin | Acquity MLtraPerformance LC | |
| Vakum Pompası | Watts technology Co., Ltd, Çin | 725000604 | |
| Uçuculaştırma makinesi/Kurutucu | Eppendorf Co., Ltd, Almanya | T_1087461900 | |
| Vortex | Changzhou Enpei instrument Co., Ltd, Çin | NP-30S | |
| Su banyosu | Test cihazı aletleri Co, Ltd | DK-98-IIA | |
| Tartı terazisi | Shanghai Jingke Scientific Instrument Co., Ltd. | MP200B |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.