$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Dünya üzerinde önemli konsantrasyonlarda moleküler oksijen atmosfer ile doğrudan temas eden alanlarda veya oksijenli fototrofların varlığında mevcuttur. Oksijenin olmadığı ortamlara anaerobik denir. Ancak, enerji dönüşüm hala iki farklı metabolik süreçler, fermantasyon ve anaerobik solunum1ile anaerobik koşullar altında mümkündür.
Aerobik solunum geçiren organizmalar terminal elektron kabul edici olarak oksijen kullanırken, anaerobik solunum nitrat veya sülfat2 gibi alternatif elektron kabul ediciler gerektirir. "Elektron kulesi" olarak adlandırılan, redoks çiftleri en negatif olanlar üstte (elektron donörleri) ve en altta pozitif redoks potansiyeline sahip en güçlü oksidasyon ajanları (elektron alıcıları) ile redoks potansiyellerine göre düzenlenirler. Donörler ve kabul edenler arasındaki elektron transferi sözde solunum zinciri üzerinden enerji tasarrufu yol açar ve elektronlar elektron kabul edenler tarafından yakalanabilir - resimde kalmak için - kulenin farklı katlarında. Bu nedenle, elektronların elektron kulesinden düşmesi ne kadar yüksekse, ilgili reaksiyon la o kadar fazla enerji korunabilir. Bu nedenle, solunum da anaerobik habitatlarda mümkündür, örneğin, NO3dahil redoks çiftleri ile-/NO2-, fumarik asit / süksinik asit, SO32-/H2S, S°/H2S, Mn(IV)/Mn(II ), Fe(III)/Fe(II)2,3. İlk olarak, elde edilen enerji membran potansiyeli olarak korunur, daha sonra membranbağlı ATP-sintalseler tarafından adenozin-trifosfat (ATP) sentezi için elektron taşıma fosforilasyon tarafından kullanılır. Aerobik solunum aksine, anaerobik solunum tarafından korunabilir enerji miktarı önemli ölçüde azaltılabilir; ancak, en anaerobik solunum enerji çıkışı hala fermantasyon ile karşılaştırıldığında daha yüksektir, oksijen ve diğer terminal elektron alıcılar 2 eksik habitatlarda bir anaerobik enerji koruma yolu.
Fermantasyon sırasında, enerji açısından zengin, organik substratlar genellikle genel sürecin adını tanımlayan çeşitli fermantasyon ürünleri, örneğin, alkollü fermantasyon bozulur. Solunum süreçlerinin aksine, fermantasyon sırasında ATP üretimi, enerji açısından zengin fosforlu substrat 2'den adenozin-di-fosfata (ADP) aktarılan substrat düzeyinde fosforilasyon ile sınırlıdır. Fermantasyon mikroorganizmaları, substrat dökümünde anahtar oyuncular oldukları için organik maddenin anaerobik bozulmasında merkezi bir rol oynarlar. Birincil fermantasyon ürünleri, organik asitler gibi, alkoller, CO2, ve H2, daha sonra asetik asit üretmek için ikincil fermantasyon mikroorganizmalar tarafından kullanılabilir, CO2, ve H2. Fermantasyon ürünleri için örnekler laktik asit, çeşitli uçucu yağ asitleri (formik, asetik-, propiyonik-, bütirik-, valeric asit), n-butanol, 2,3-butandiol, aseton ve etanol içerir.
Mikroorganizmaların kesinlikle anaerobik koşullarda yetiştirilmesi, aerobik organizmaların yetiştirilmesine kıyasla tamamen farklı yöntem ve ekipmanlar gerektirir. Oksijene dayanıklı organizmalar genellikle agar yemekleri, sözde yüzey kültürleri üzerinde yetiştirilen iken, bu - birkaç istisna dışında - neredeyse kesinlikle anaerobik mikroorganizmalar için mümkündür. Bu nedenle, kesinlikle anaerobik mikroorganizmaların zenginleştirme kültürleri esas olarak bir oksijen-free headspace atmosfer4sağlamak gaz geçirmez septa ile mühürlü kültür kapları uygulayarak sıvı ortamda kurulmuştur 4,6, 7 .
Mevcut protokol tanımı, anaerobik biyogaz bitkisinden elde edilen karışık popülasyondaki hedef mikroorganizmalar için uygun yetiştirme yöntemleri sağlayacaktır. Saf kültürlerin izole edilmesi ve yetiştirilmesi daha da zor ama bu çalışmanın bir parçası değildir.
Burada, proteinaceous substratların anaerobik sindirim sırasında fenil asitoluşumu ile ilgili bir çalışmaya dayalı bir anaerobik mikrobiyal topluluk yetiştirmek için prosedür göstermek8. Mikrobiyal topluluk anaerobik sindirimin dört evresinden üyelerden oluşuyordu: hidroliz, asidozez, asetongenez ve metanogenez. Bir mineral tuz orta karbon kaynağı ile takviye, redoks-indikatör, vitamin ve iz element çözeltisi ve azaltıcı ajan uygulandı9. Ortam ilgili proteinaceous fenil asit öncüsü substratlarıiledeğiştirilmiştir 8 .