Yöntem makalesi

Miyokardiyal Mekanik Deformasyonun Yer Değiştirme Analizi (DIAMOND) Embriyonik Zebrabalığında Kardiyak Fonksiyonun Segmental Heterojenliğini Ortaya Çıkarır

DOI:

10.3791/60547

⸱

6 Şubat 2020

 , 
1Division of Cardiology, Department of Medicine, David Geffen School of Medicine at University of California, Los Angeles, 2Ronald Reagan UCLA Medical Center, 3Veterans Affairs West Los Angeles Medical Center

Bu makalede

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu protokolün amacı, embriyonik zebrabalıklarında segmental kardiyak fonksiyonun hem fizyolojik hem de patolojik koşullarda değerlendirilmesi için yeni bir yöntemin ayrıntılarını vermektir.

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Zebra balıkları giderek kardiyomiyopatiler ve rejenerasyon için bir model organizma olarak kullanılmaktadır. Kardiyak fonksiyonu değerlendiren mevcut yöntemler segmental mekaniği güvenilir bir şekilde saptayamazlar ve zebra balıklarında kolayca mümkün değildir. Burada dört boyutlu (4D) segmental kardiyak fonksiyonun kantitatif değerlendirilmesi için yarı otomatik, açık kaynak yöntemi salıyoruz: miyokardiyal mekanik deformasyonun yer değiştirme analizi (DIAMOND). Transgenik embriyonik zebra balıkları 4D kardiyak hareket senkronizasyonu ile hafif yapraklı floresan mikroskopi sistemi kullanılarak in vivo olarak görüntülendi. Elde edilen 3D dijital kalpler end-systole ve end-diastole yeniden inşa edildi ve ventrikül el ile ikili veri kümeleri halinde segmente edildi. Daha sonra, kalp yeniden yönlendirildi ve izotropik gerçek kısa eksen boyunca yeniden örneklendi ve ventrikül kısa eksen boyunca sekiz bölüme (I-VIII) eşit olarak ayrıldı. End-systole ve end-diastole farklı resampling düzlemleri ve matrisler nedeniyle, yeniden örneklenmiş sistolik ve diyastolik görüntü matrisler arasındaki orijinal mekansal ilişkiyi geri yüklemek için görüntü kaydı için bir dönüşüm matris uygulanmıştır. Görüntü kaydından sonra, her segmentin yer değiştirme vektörü uç-systole'den son diyastole'e kütle sentroidlerinin üç boyutlu (3D) yer değiştirmesine göre hesaplanmıştır. DIAMOND, atriyoventriküler kanala bitişik bazal miyokardiyal segmentlerin en yüksek mekanik deformasyona tabi olduğunu ve doksorubisin indüklenen kardiyak yaralanmalara en yatkın olduğunu göstermektedir. Genel olarak DIAMOND, hem fizyolojik hem de patolojik koşullar altında geleneksel ejeksiyon fraksiyonu (EF) ötesinde zebra balığı embriyolarında segmental kardiyak mekaniği ne yeni bilgiler sağlar.

Giriş

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kemoterapiye bağlı kardiyak toksisite ve ardından gelen kalp yetmezliği kemoterapi kesilmesinin başlıca nedenlerinden biridir1. Bu nedenle kardiyak fonksiyonel değerlendirme, kardiyak toksisitenin belirlenmesinde ve daha da önemlisi kemoterapi sonrası erken kardiyak yaralanmanın tahmininde önemli bir rol oynamaktadır2. Ancak kardiyak fonksiyonel değerlendirme için güncel yaklaşımlar sınırlamalarla karşılaşın. Sol ventrikül ejeksiyon fraksiyonu (LVEF) gibi yöntemler sadece küresel ve genellikle yaralanma dan sonra gecikmiş kardiyak mekaniği sağlar3,4. Doku Doppler görüntüleme segmental miyokardiyal deformasyon bilgi sağlar ama önemli intraobserver ve interobserver değişkenlik muzdarip, kısmen ultrason ışın açısı bağımlılığı nedeniyle5. İki boyutlu (2D) benek izleme, teorik olarak açı bağımlılığını ortadan kaldıran ekokardiyografinin B-modunu kullanır, ancak doğruluğu düzlem dışı hareket6ile sınırlıdır. Bu nedenle, segmental kardiyak fonksiyonun ölçülmesi için titiz bir yaklaşım hem araştırma hem de klinik ortamlarda eksiktir.

Bu bağlamda, miyokardiyal mekanik deformasyonun (DIAMOND) yer değiştirme analiziadını verdiğimiz segmental kardiyak fonksiyonun analizi için, 3Boyutlu alanda miyokardiyal kitle sentroidlerinin yer değiştirme vektörlerini belirlemek için 4Boyutlu bir niceleme yöntemi geliştirdik. Biz hayvan modeli olarak zebra balığı ile kardiyak fonksiyon ve doksorubisin kaynaklı kardiyak toksisite in vivo değerlendirilmesi için DIAMOND uygulanan (Danio rerio) hayvan modeli olarak, onların rejenere miyokardiyum ve son derece korunmuş gelişimgenleri nedeniyle seçilen7. Ayrıca segmental DIAMOND deplasmanı ile küresel ejeksiyon fraksiyonu (EF) tayini ve doksorubisin tedavisi sonrası 2D suş ile karşılaştık. 4D ışık yaprak floresan mikroskopi ile DIAMOND deplasman entegre ederek (LSFM) embriyonik zebrabalığı kalpleri elde render, DIAMOND bazal miyokardiyal segmentleri atriyoventriküler kanal bitişik en yüksek mekanik deformasyon geçmesi ve akut doksorubisin kardiyak yaralanma8duyarlı olduğunu gösterir .

   

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Burada açıklanan tüm yöntemler UCLA Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) tarafından onaylanmıştır ve deneyler UCLA Hayvan Araştırma Ofisi tarafından onaylanan protokollere uygun olarak yapılmıştır.

1. Üreme Tg(cmlc2:mCherry) zebra balığı ve embriyo toplama

  1. Daha önce kurulmuş hayvancılık ve ıslah uygulamalarında açıklandığı gibi konut, ıslah ve embriyo toplama prosedürlerini takip edin. Ayrıntılar için Messerschmidt ve ark.9'abakın.
  2. Toplanan embriyoları % 0.003 1-fenil-2-tiourea (PTU) ile Tedavi E3 orta 18 h postfertilizasyon LSFM görüntüleme için embriyoların şeffaflığı korumak için.

2. Kardiyak yaralanmaya neden olmak için doksorubisin tedavisi

  1. 3 gün postfertilizasyon (dpf), E3 balık suyu orta 10 μM konsantrasyonda doksorubisin ile embriyolar tedavi. 4 dpf için 24 saat tedaviden sonra, taze E3 orta doksorubisin orta değiştirin.
    DİkKAT: Doksorubisin bir kemoterapi ilacıdır. Uygun kişisel koruyucu ekipman (PPE) gereklidir ve atıklar biyolojik tehlike atık kaplarında bertaraf edilmelidir.

3. Çentik yol modülasyonu

  1. Zebra balığı embriyolarına Notch yolu inhibitörü (2S)-N-[(3,5-diflorofenil)asetil]-L-alanyl-2-fenil]glisin 1,1-dimetiletil ester (DAPT) 3-6 dpf'den itibaren E3 balık suyu ortasında 10 μM konsantrasyonda tedavi edin.
  2. 10 pg /nL ve 5 pg/nL konsantrasyonlarında notch downstream efektörleri Notch hücre içi etki alanı (NICD) ve Neuregulin-1 (Nrg-1) mRNA, sırasıyla, 1 hücreli evre zebrabalığı embriyoları8,10.
    NOT: Mikroenjeksiyon, enjekte edilen hacmi doğru bir şekilde kontrol etmek için bir hava pompası desteği ile mikroskop altında gerçekleştirilir. Hücreiçine mRNA mikroenjeksiyonu, döllenmiş yumurta ilk hücre evresinde olduğunda yapılır. mRNA'ların hazırlanması ve sırası hakkında ayrıntılı bilgi için Chen ve ark.8'ebakınız. Enjeksiyon iğnelerinin mikroenjeksiyonu ve hazırlanması hakkında ayrıntılı bilgi için Rosen ve ark.10'abakınız.

4. LSFM görüntüleme ve post-görüntüleme senkronizasyonu

  1. LSFM görüntüleme teknikleri ve post-görüntüleme senkronizasyon algoritması için, önceki yayınlarda ayrıntıları görmek9,11.
    NOT: Kısaca, sistemimiz tüm transgenik zebra balığı hatlarını görüntülemek için aydınlatma kaynağı olarak sürekli dalga lazeri kullanmaktadır. Algılama modülü iki bilimsel tamamlayıcı metal oksit yarı iletken (sCMOS) kamera ve çift kanallı görüntüleme için iki filtre kümesinden oluşur. Algılama modülü aydınlatma düzlemine dik olarak monte edilmiştir. Her LSFM çerçevesi 20 msn pozlama süresi içinde elde edilirken, kesitteki çözme gücü ~0,65 μm ve ardışık kareler arasındaki adım boyutu ~2 μm'dir. 589 nm lazer mCherry floresan sinyalleri heyecanlandırmak için kullanılmıştır.

5. 3D sistolik ve diyastolik kalbin rekonstrüksiyonu

  1. Post eşitleme algoritması tarafından oluşturulan klasörü açın, sonra "Çıktı" klasörünü açın. Kalbin orta düzlemini seçin ve tüm klasörü ImageJ'e yükleyin. İlk diyastolik ve sistolik fazı bulun ve kare numarasını kaydedin.
  2. "Çıktı/Duruma Göre" klasörünü açın ve az önce kaydedilmiş kare numaralarıyla aynı sayılara sahip klasörleri bulun. Klasördeki görüntüleri 3B TIFF (etiketli resim dosyası biçimi) dosyalarına dönüştürün ve onlara "diastole.tif" ve "systole.tif" adını ver.

6. Ventrikül segmentasyonu

  1. Görüntü çözümleme yazılımını açın (bkz. Malzeme Tablosu). Dosyayı Tıklatın | Verileri açınve "diastole.tif" ve "systole.tif" yüklerini yükleyin. Görüntüleme ayarlarına göre voxel boyutunu girin.
    NOT: Kullanılan LSFM sistemi için tipik voxel boyutu 0,65 μm x 0,65 μm x 2 μm'dir.
  2. "SEGMENTASYON" paneline tıklayın ve kalbin ventrikül kısmını el ile ayırın. Belirli bir yoğunluğun üzerindeki tüm bölgeleri seçebilen yerleşik "Eşik" aracı bu işlemi kolaylaştırabilir. Ventrikül daha güçlü bir floresan ile kalın oda.
    NOT: Atriyoventriküler kanalı ve segmentli ventriküldeki çıkış yollarını çıkardığından emin olun, çünkü bu yer değiştirme analizini etkiler.
  3. Segmentasyon yapıldıktan sonra "Project" paneline tıklayın. Sağ tıklayın "diastole. Etiketler.tif" ve "systole. Etiketler.tif" sekmeleri konsolda ve 3D TIFF dosyaları olarak veri kaydetmek için "Veri Dışa aktarın" tıklayın.

7. Resim kaydı için dikdörtgen paralelepipedlerin oluşturulması

  1. "prepImage_1.m" yi programlama ortamında çalıştırın (bkz. Malzemeler Tablosu). 5. satırda "prepImage_1.m", "ImPath" dosyasını açın, böylece klasör orijinal ve bölümlü TIFF dosyalarını içerir ve "slice" satır 4'ü 3D tif dosyalarının dilim sayısına değiştirin.
  2. Kodu çalıştırdıktan sonra beş yeni 3D TIFF dosyası ("test.tif", "diastole_200.tif", "systole_200.tif", "diaLabel.tif", "sysLabel200.tif") ve iki yeni klasör ("resample_dia" ve "resample_sys") oluşturur.

8. Kısa eksen düzlemi boyunca sistolik ve diyastolik 3D kalpleri yeniden örnekleme

  1. Beş adet 3B TIFF dosyasını görüntü çözümleme yazılımına aktarın (bkz. Malzeme Tablosu).
    NOT: Voxel boyutu değişmez.
  2. MULTIPLANAR paneline gidin. Birincil veri olarak "diastole_200.tif"i seçin. X eksenini (XY düzlemindeki yeşil çizgi) ventrikülün dikey uzun ekseniyle hizala ve Z eksenini (YZ düzlemindeki kırmızı çizgi) ventrikülün yatay uzun ekseniyle hizala.
    NOT: Dikey uzun eksen, XY düzleminde apeks ve çıkış yolu bağlayan en uzun eksen bulunarak belirlenir ve yatay uzun eksen, tepeyi ve YZ düzlemindeki çıkış yolu bağlayan en uzun ekseni bularak belirlenir. İmleci eksenin sonuna yerleştirerek ekseni döndürün.
  3. Oblik YZ düzleminden (kısa eksen düzlemi) saat yönünün tersine üç rasgele nokta seçin ve 3B konum koordinatlarını kaydedin.
    NOT: Noktaların saat yönünün tersine seçildiğinden emin olun.
  4. "systole_200.tif" için 8.2 ve 8.3 adımlarını tekrarlayın.
  5. "PROJE" paneline tıklayın. "diastole_200.tif" düğmesine sağ tıklayarak ve "Slice" nesnesi arayarak "diastole_200.tif" için "Dilim" nesnesi oluşturun. Yeni oluşturulan Dilim nesnesini sol tıklatın ve Özellikler panelinde | Seçenekler, "Düzlem Iseti" seçeneğini işaretleyin ve "Düzlem Tanımı"nda üç nokta seçin. Adım 7.3'ten üç noktanın koordinatlarını girin.
  6. "systole_200.tif" için 8.5 adımLarını tekrarlayın.
    NOT: Oluşturulan dilim nesnesi "Slice 2" adı olmalıdır.
  7. Sağ tıklayın "diastole_200.tif" ve "Resample Transformed Image" için arama ve nesne oluşturun. Özellikler panelinde "Slice" ı " "Reference" olarak seçin ve Uygula'yıtıklatın. Bu , "diastole_200.transformed" adlı bir nesne oluşturmalıdır.
  8. Sağ tıklayın "diastole_200.transformed" ve "Resample" için arama ve nesne oluşturun. "Voxel Size" i seçinve Özellikler panelinde " Voxel Size " seçeneğini belirleyin ve "Voxel Size" x = 1, y = 1 ve z = 1'i değiştirin.
  9. "Uygula" seçeneğini tıklatın. Bu , "diastole_200.resampled" adlı bir nesne oluşturmalı. Sağ tıklayın "diastole_200.resampled" ve bir 3D TIFF dosyası olarak kaydedin.
  10. "diaLabel.tif" ve "test.tif" için aynı adımı yineleyin. "diaLabel.resampled" ve "test.resampled" dosyalarını 3B TIFF dosyaları olarak kaydedin. "systole_200.tif", "sysLabel.tif" ve "test.tif" için"Slice 2" kullanarak aynı adımı başvuru olarak tekrarlayın ve "systole_200.resampled", "sysLable.resampled" ve "test2.resampled" dosyalarını 3D TIFF dosyaları olarak kaydedin.
    NOT: Bu adımda toplam altı TIFF dosyası kaydedildiemin.

9. Yeniden örneklenmiş kalbin bölünmesi

  1. Yeniden örneklenmiş altı dosyanın tümlerini 8 adımdan ImageJ'e aktarın. Atriyoventriküler kanalın açıkça görüntülendiği "systole_200.resampled" dilimini seçin. Dilimin numarasını kaydedin.
    1. " Resmi Kullanın| Dönüştür | Atriyoventriküler kanal dikey olacak şekilde ImageJ "fonksiyonu nu döndürün. Tüm dosyalara aynı döndürmeyi uygulayın. Tüm pencereleri kapatın ve tüm değişiklikleri kaydedin.
    2. "diastole_200.resampled", "diaLabel.resampled" ve "test.resampled"i "resample_dia" klasörüne taşıyın ve "systole_200.resampled", "sysLable.resampled" ve "test2.resampled"i "resample_sys" klasörüne taşıyın.
  2. "divider_2_8_pieces.m"i aç. "ImPath" satır 5 ve "ImPath" satır395'i görüntü dizinine değiştirin. "Orta" satır 22 ve satır 411'i atriyoventriküler kanalın açıkça "systole_200.resampled" ve "diastole_200.resampled" olarak görselleştirildiği dilim numaralarına değiştirin.
  3. Kodu çalıştırın ve istenilen pencerelerde ventrikülün ortasına bir kez tıklayın ve atriyoventriküler kanalın merkezinde bir kez tıklatın. Bu hem systole ve diastole görüntüler için iki kez yapılması gerekir.

10. Sistolik ve diyastolik görüntü matrislerinin kaydı

  1. "register_3.m"yi açın ve"ImPath"satır4'ü resim klasörü yoluna değiştirin. Sistemin hesaplama gücüne bağlı olarak bu kodu çalıştırmak 5-20 dakika sürebilir.
    NOT: 7. adımda yapay olarak oluşturulan dikdörtgen paralelepipedler, iki nokta ve üç nokta ile abone olunan açılar arasındaki mesafeyi koruyan 3B rijit kayıt için kullanılır. Son diyatobluk dikdörtgen paralelepiped (kırmızı) son-systole dikdörtgen parallelepiped (yeşil) kaydedildiğinde, takip eden diskrepant 3D konumu, son diyatoblum matrisinden son-sistole matrisine dönüş ve çeviriden oluşan benzersiz bir rijit dönüştürme matrisinin türemine izin verir (Şekil 1H). Bir görüntü işleme araç kutusunu kullanarak dönüşümden sonra matrisi bozacak kayıt ve düzenli enerji minimizasyonu gerçekleştiriyoruz (Bkz. Malzeme Tablosu). Ayrıntılı bir matematiksel açıklama için chen ve ark.8'ebakın.

11. Yer değiştirme vektörlerinin çıkışı

  1. "displacement_4.m" dosyasını açın ve "ImPath" satırını 4'teki resim klasörü yoluna değiştirin.
  2. "vektörler" klasöründe "vector8.txt" dosyası oluşturan "displacement_4.m"yiçalıştırın. "vector8.txt" dosyası açıldıktan sonra 8 x 4 matris olacaktır. Matrisin her satırı, X bileşeninin büyüklükleri, Y bileşeni, Z bileşeni ve ventrikülün belirli bir bölümünün yer değiştirme vektörünün TOPLAM büyüklüğü olan dört sayıya sahiptir.
    NOT: Yer değiştirme vektörü, her bir segmentin kütle sentroidinin 3B alanda yer değiştirmesi hesaplanarak elde edilir. Systole'den diastole'e segmentasyon veri setinde figure-protocol-1 her segmentin (I-VI) 3B kütle merkezsoid (PS ve PD)koordinatlarını (k'nin sırasıyla X, Y veya Z koordinatını gösterdiği yerde) hesaplıyoruz. 3B alanda kütle figure-protocol-2 merkezroidini aşağıdaki gibi tanımlıyoruz:
    figure-protocol-3
    Cx x, Cy = Y ve Cz = Z, Mi = her segmentin kütlesi (I ≤ i ≤ VI), m = her segmentin voxel sayısı ve ρ = segmentli bölge olarak yoğunluk fonksiyonu 1 ise geri kalanı 0'dır. X-, Y- ve Z eksenleri boyunca yer değiştirme vektörlerinin L2 normları ve toplam yer değiştirme vektörü kardiyak döngü sırasında hesaplanır. Matriste toplam sekiz satır vardır. Birinci ve sekizinci sıra atriyoventriküler kanalı içerir ve bu nedenle analizimizde göz ardı edilir. I'den VI'ya kadar olan segmentler yedinci satırın ikinci satırıyla temsil edilir.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

DIAMOND'ın 3Boyutlu segmental kardiyak fonksiyonunu değerlendirmek için geliştirildiği süreç Şekil 1'desunulmuştur. Embriyonik zebra balığı kalbinin 3Boyutlu LSFM görüntü edinimi ve rekonstrüksiyonu(Şekil 1A),gerçek kısa eksen düzlemi dikey ve yatay uzun eksenlere dik düzlem olarak belirlenmiştir ve bunların her ikisi de çok düzlemli bir görüntüleyicide belirlenir (Şekil 1B). Kalp daha sonra kısa ek...

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Segmental miyokardiyal fonksiyonun sayısallaştırılması için sıkı bir strateji geleneksel EF ötesinde kardiyak mekaniği değerlendirmek için önemlidir, miyokardiyal yaralanma duyarsız ve gecikmiş bir göstergesi olduğu bilinen1,4,12. Bu nedenle, erken miyokardiyal değişikliklerin belirteçleri artan bir ilgi olmuştur, ve literatür büyüyen bir vücut ventriküler disfonksiyon tahmin etmek için erken bir gösterge olarak miyokardiyal def...

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarlar çıkar çatışması olmadığını beyan etmişler.

Teşekkürler

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Mevcut çalışma Amerikan Kalp Derneği hibe 16SDG30910007 ve 18CDA34110338 ve Ulusal Sağlık Enstitüleri tarafından HL083015, HL1111437, HL118650 ve HL129727 hibe tarafından finanse edilmiştir.

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Amira6FEIGörüntü analiz yazılımı
DAPTMillipore SigmaD5942-5MG
Doksorubisin hidroklorürMillipore SigmaD1515-10MG
Etil 3-aminobenzoat metansülfonatMillipore SigmaE10521-10GTrikain
MATLABMathWorksProgramlama ortamı
MATLAB Görüntü İşleme Araç KutusuMathWorksGörüntü İşleme Araç Kutusu

Kaynaklar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Ewer, M. S., Ewer, S. M. Cardiotoxicity of anticancer treatments. Nature Reviews Cardiology. 12 (9), 547-558 (2015).
  2. Thavendiranathan, P., Wintersperger Bernd, J., Scott, F. D., Thomas D, M. H. Cardiac MRI in the Assessment of Cardiac Injury and Toxicity From Cancer Chemotherapy. Circulation: Cardiovascular Imaging. 6 (6), 1080-1091 (2013).
  3. Mickoleit, M., et al. High-resolution reconstruction of the beating zebrafish heart. Nature Methods. 11 (9), 919-922 (2014).
  4. Thavendiranathan, P., et al. Use of Myocardial Strain Imaging by Echocardiography for the Early Detection of Cardiotoxicity in Patients During and After Cancer Chemotherapy. A Systematic Review. 63 (25), Part A 2751-2768 (2014).
  5. Collier, P., Phelan, D., Klein, A. A Test in Context: Myocardial Strain Measured by Speckle-Tracking Echocardiography. Journal of the American College of Cardiology. 69 (8), 1043-1056 (2017).
  6. Hanekom, L., Cho, G. Y., Leano, R., Jeffriess, L., Marwick, T. H. Comparison of two-dimensional speckle and tissue Doppler strain measurement during dobutamine stress echocardiography: an angiographic correlation. European Heart Journal. 28 (14), 1765-1772 (2007).
  7. Poss, K. D., Wilson, L. G., Keating, M. T. Heart regeneration in zebrafish. Science. 298 (5601), 2188-2190 (2002).
  8. Chen, J., et al. Displacement analysis of myocardial mechanical deformation (DIAMOND) reveals segmental susceptibility to doxorubicin-induced injury and regeneration. JCI Insight. 4 (8), e125362(2019).
  9. Messerschmidt, V., et al. Light-sheet Fluorescence Microscopy to Capture 4-Dimensional Images of the Effects of Modulating Shear Stress on the Developing Zebrafish Heart. Journal of Visualized Experiments. (138), e57763(2018).
  10. Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. Microinjection of Zebrafish Embryos to Analyze Gene Function. Journal of Visualized Experiments. (25), e1115(2009).
  11. Lee, J., et al. 4-Dimensional light-sheet microscopy to elucidate shear stress modulation of cardiac trabeculation. The Journal of Clinical Investigation. 126 (5), 1679-1690 (2016).
  12. Lenneman, C. G., Sawyer, D. B. Cardio-Oncology: An Update on Cardiotoxicity of Cancer-Related Treatment. Circulation Research. 118 (6), 1008-1020 (2016).
  13. Geyer, H., et al. Assessment of Myocardial Mechanics Using Speckle Tracking Echocardiography: Fundamentals and Clinical Applications. Journal of the American Society of Echocardiography. 23 (4), 351-369 (2010).
  14. Castro, P. L., Greenberg, N. L., Drinko, J., Garcia, M. J., Thomas, J. D. Potential pitfalls of strain rate imaging: angle dependency. Biomedical Sciences Instrumentation. 36, 197-202 (2000).
  15. Seo, Y., Ishizu, T., Aonuma, K. Current Status of 3Dimensional Speckle Tracking Echocardiography: A Review from Our Experiences. Journal of Cardiovascular Ultrasound. 22 (2), 49-57 (2014).
  16. Amzulescu, M. S., et al. Improvements of Myocardial Deformation Assessment by Three-Dimensional Speckle-Tracking versus Two-Dimensional Speckle-Tracking Revealed by Cardiac Magnetic Resonance Tagging. Journal of the American Society of Echocardiography. 31 (9), 1021-1033 (2018).
  17. Wolterink, J. M., Leiner, T., Viergever, M. A., Išgum, I. Reconstruction, Segmentation, and Analysis of Medical Images. Zuluaga, M. A., et al. , Springer International Publishing. 95-102 (2016).
  18. Avendi, M. R., Kheradvar, A., Jafarkhani, H. A combined deep-learning and deformable-model approach to fully automatic segmentation of the left ventricle in cardiac MRI. Medical Image Analysis. 30, 108-119 (2016).
  19. Packard, R. R. S., et al. Automated Segmentation of Light-Sheet Fluorescent Imaging to Characterize Experimental Doxorubicin-Induced Cardiac Injury and Repair. Scientific Reports. 7 (1), 8603(2017).
  20. Jay Kuo, C. C., Chen, Y. On data-driven Saak transform. Journal of Visual Communication and Image Representation. 50, 237-246 (2018).
  21. Natarajan, N., et al. Complement Receptor C5aR1 Plays an Evolutionarily Conserved Role in Successful Cardiac Regeneration. Circulation. 137 (20), 2152-2165 (2018).
  22. Zhukov, L., Barr, A. H. IEEE Visualization VIS 2003. , 597-602 (2003).
  23. Nielles-Vallespin, S., et al. In vivo diffusion tensor MRI of the human heart: Reproducibility of breath-hold and navigator-based approaches. Magnetic Resonance in Medicine. 70 (2), 454-465 (2013).

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

Miyokardiyal DeformasyonZebrafish EmbriyolarI k Sayfas Mikroskopisi4B Kardiyak G r nt lemeVentrik l SegmentasyonuG r nt KaydDoksorubisin Toksisitesi

İlgili makaleler