Burada, zebra balığı embriyoları ve larvalarının tüm preparatlarında floresan antikor aracılı proteinlerin tespiti için bir protokol salıyoruz.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Burada, zebra balığı embriyoları ve larvalarının tüm preparatlarında floresan antikor aracılı proteinlerin tespiti için bir protokol salıyoruz.
İmmünohistokimya hem normal gelişimsel hem de hastalık durumlarında protein ekspresyonu ve lokalizasyonunu araştırmak için yaygın olarak kullanılan bir tekniktir. Birçok immünohistokimya protokolü memeli doku ve doku bölümleri için optimize edilmiş olsa da, bu protokoller genellikle memeli olmayan model organizmalar için modifikasyon ve optimizasyon gerektirir. Zebra balıkları, gelişim süreçlerinin moleküler, genetik ve hücresel biyolojik mekanizmalarını araştırmak için temel, biyomedikal ve çevirisel araştırmalarda giderek daha fazla model sistem olarak kullanılmaktadır. Zebra balığı bir model sistemi olarak birçok avantaj sunmak ama aynı zamanda optimal protein tespiti için modifiye teknikleri gerektirir. Burada, zebra balığı embriyoları ve larvalarda tam montaj floresan immünohistokimyası için protokolümüzü sağlıyoruz. Bu protokol ayrıca, istihdam edilebilen birkaç farklı montaj stratejisini ve her stratejinin sağladığı avantaj ve dezavantajlara genel bir bakışı açıklar. Ayrıca, tüm montaj dokusunda kromojenik substratların saptanmasını ve kesitli larva dokusunda floresan tespitine olanak sağlayacak değişiklikler de tanımlıyoruz. Bu protokol birçok gelişimevrelerinin ve embriyonik yapıların incelenmesi için geniş ölçüde geçerlidir.
Zebra balığı(Danio rerio)kısa nesil zaman, hızlı gelişme ve genetik teknikler için amenability dahil olmak üzere çeşitli nedenlerle biyolojik süreçlerin çalışması için güçlü bir model olarak ortaya çıkmıştır. Sonuç olarak, zebra balıkları genellikle toksikolojik araştırma ve ilaç keşif için yüksek iş ölçekli küçük molekül ekranlarda kullanılır. Zebra balığı aynı zamanda tek bir dişinin rutin olarak bir seferde 50-300 yumurta üretebildiği ve optik olarak berrak embriyoların gelişim süreçlerinin verimli bir şekilde görüntülenmesi için dışarıdan geliştiği göz önüne alındığında gelişimsel süreçlerin incelenmesi için de cazip bir modeldir. Ancak, erken araştırma n-etil-N-nitrozourea (ENU) veya diğer mutajenler ters genetik teknikler kurulmasında zorluklar nedeniyle kullanarak ileri genetik ekranlar çoğunlukla dayanıyordu. Kabaca yirmi yıl önce, morpholinos ilk zebra balığı nda hedeflenen genleri yıkmak için kullanılmıştır1. Morfolinonos erken gelişim aşamasında bir embriyo içine mikroenjeksiyon aşağıdaki hedef mRNA çeviri inhibe küçük antisense oligonükleotidler vardır. Morfolinoların en büyük zaafı, hücrelerin bölünmesiyle seyreltilmeleri ve genellikle döllenme sonrası (hpf) 72 saat etkisini kaybetmeleridir. Morpholos zebrabalığı gen bozulması için güçlü bir araç olmaya devam ederken, transkripsiyon aktivatör benzeri efektör nükleazlar (TALENs), çinko-parmak nükleazlar (ZFNs), ve düzenli olarak aralıklı kısa palindromik tekrarlar (CRISPR) daha yakın zamanda doğrudan zebra balığıgenomu2,3hedef için kullanılmaktadır . Bu ters genetik stratejiler, ileri genetik ve yüksek iş elde ekranları ile birlikte, gen ekspresyonu ve fonksiyonu çalışma güçlü bir model olarak zebra balığı kurduk.
Gen fonksiyonunu inceleme yeteneği genellikle gen veya gen ürün ekspresyonunun spatio-temporal dağılımının değerlendirilmesi gerektirir. Erken gelişim sırasında bu tür ifade kalıplarını görselleştirmek için en sık kullanılan iki teknik yerinde hibridizasyon (ISH) ve tüm immünohistokimya (IHC) bulunmaktadır. In situ hibridizasyon ilk olarak 1969 yılında geliştirilmiştir ve birorganizmadamRNA ifadesini tespit etmek için etiketli antisense RNA problarının kullanımına dayanır 4 . Buna karşılık, etiketli antikorlar protein ekspresyonunu görselleştirmek için immünohistokimyada kullanılır. Algılama için proteinlerin etiketleme fikri 1930'ların5'ine kadar uzanır ve ilk IHC deneyi 1941'de FITC etiketli antikorların enfekte dokularda patojenik bakterileri tespit etmek için kullanıldığında yayınlanmıştır6. ISH ve IHC gelişti ve sonraki yıllarda önemli ölçüde geliştirilmiş ve şimdi her ikisi de rutin moleküler ve tanısal araştırma laboratuvarı7,8,9,10,11kullanılır . Her iki tekniğin de avantajları ve dezavantajları olsa da, IHC ISH üzerinde çeşitli avantajlar sunar. Pratik olarak, IHC ISH çok daha az zaman alıcı ve birincil antikor maliyetine bağlı olarak genellikle daha az pahalıdır. Buna ek olarak, mRNA ekspresyonu her zaman güvenilir bir protein ekspresyonu metomu değildir, çünkü farelerde ve insanlarda protein bolluğu varyasyonunun sadece üçte birinin mRNA bolluğu ile açıklanabileceği gösterilmiştir12. Bu nedenle, IHC ish verilerini onaylamak için önemli bir ektir, mümkün olduğunda. Son olarak, IHC ISH 13,14,15tarafından belirlenemeyen hücre altı ve eş yerelleştirme verileri sağlayabilir. Burada, zebra balığı embriyoları ve larvaları halinde immünohistokimya ile proteinleri güvenilir bir şekilde tespit etmek için adım adım bir yöntem tanımlıyoruz. Bu tekniğin amacı tüm embriyo ilgi bir proteinin mekansal ve zamansal ekspresyonu belirlemektir. Bu teknoloji antijene özgü primer antikorlar ve floresan etiketli ikincil antikorlar kullanır. Protokol, slayta monte edilmiş doku bölümlerinde ve floresan yerine kromojenik yüzeylerle kullanıma hazır dır. Bu protokolü kullanarak, biz zebra balığı iskelet kası gelişmekte olduğunu göstermek iyonotropik glutamat reseptörleri ifade eder, asetilkolin reseptörlerine ek olarak. NMDA tipi glutamat reseptör alt birimleri 23 hpf'de uzunlamasına kasüzerinde saptanabilir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu protokolde tanımlanan zebra balığı yetiştiriciliği yetişkinler ilahı ve embriyolarla çalışma prosedürleri Murray State Üniversitesi Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi tarafından onaylanmıştır.
1. Embriyo Toplama ve Fiksasyon
2. Embriyo Hazırlama
3. Primer Antikor Kuluçka
4. Sekonder Antikor Kuluçka
İsteğe Bağlı Adımlar
5. Beyazlatma
6. Embriyo Diseksiyon ve Deyolking
7. Slaytlarda Düz Montaj
8. Agarose Montaj
9. Köprülü Slaytlara Montaj
10. DAB Boyama
NOT: Bu bölüm yukarıdaki adım 4.2'den sonra başlar ve 4.
11. Slaytlara Monte Edilen Kesitli Dokunun Boyandırılmasını Sağlayacak Modifiye Protokol
12. Dokümantasyon
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Tüm monte immünohistokimya bozulmamış hayvan protein ekspresyonunun mekansal desen tespit etmek için antikorlar kullanır. İmmünohistokimyanın temel iş akışı (Şekil 1'degösterilmiştir) zebra balıklarının üremesini, embriyoların yetiştirilmesini ve hazırlanmasını, spesifik olmayan antijenlerin engellenmesini, ilgi proteinini hedeflemek için antijene özgü bir primer antikor kullanılmasını, etiketlenmiş ikincil antikorla birincil antikortespit ini, numuneyi monte...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
İmmünohistokimya bir organizmada ilgi hemen hemen herhangi bir protein in spatio-temporal ifade karakterize etmek için kullanılabilecek çok yönlü bir araçtır. İmmünohistokimya dokular ve model organizmaların geniş bir yelpazede kullanılır. Bu protokol zebra balıklarında kullanılmak üzere optimize edilmiştir. Farklı türlerde immünohistokimya farklı fiksasyon ve işleme teknikleri, türlere ve endojen peroksidazların varlığına bağlı olarak çözümler engelleme ve dokuların kalınlığı ve bileşimi nedeniyle kuluçka süreleri gerek...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarların açıklayacak bir bilgileri yok.
NIH hibe 8P20GM103436 14 fon.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Agarose | Fisher Scientific | BP160-100 | |
| Alüminyum folyo, ağır hizmet tipi | Kirkland | Herhangi bir marka ikame edilebilir | |
| Anti-NMDA antikoru | Millipore Sigma | MAB363 | |
| Anti-fosfo-histon H3 (Ser10), klon RR002 | Millipore Sigma | 05-598 | |
| Anti-pan-AMPA reseptörü (GluR1-4) | Millipore Sigma | ||
| Sığır serum albümini (BSA) | Fisher Scientific | BP1600-100 | |
| Kalsiyum Nitrat [Ca(NO3)2] | Sigma Aldrich | C4955 | |
| Santrifüj tüpleri, 1.5 mL | Axygen | MCT150C | |
| Şeffaf oje | Sally Hanson | Herhangi bir oje veya sertleştirici ikame edilebilir | |
| Depresyon (içbükey) slayt | Elektron Miskroskopi Bilimleri | 71878-01 | |
| Diaminobenzidin | Termo Bilimsel | 1855920 | |
| Embriyo ortamı, Danieau, % | 17.4 mM NaCl, 0.21 mM KCl, 0.12 mM MgS04, 0.18 mM Ca(NO3< / sub>) 2< / sub>, 1.5 mM HEPES ultra saf suda. | ||
| Embriyo ortamı, E2 | 7.5 mM NaCl, 0.25 mM KCl, 0.5 mM MgSO4< / sub>, 75 & mu; M KH2< / alt>PO<>< /alt>, 25 uM Na2< / alt>HPO4< / alt>, 0,5 mM CaCl2, 0,35 mM NaHCO3, 0,5 mg/L metilen mavisi | ||
| Yüzer tüp tutucu | Thermo Scientific | 59744015 | |
| Floresan bileşik mikroskobu | Leica Biosystems | DMi8 | |
| Floresan stereomikroskop | Leica Biosystems | M165-FC | |
| Cam lameller 18 mm x 18 mm | Corning | 284518 | |
| Cam lameller 22 mm x 60 mm | Thermo Scientific | 22-050-222 | |
| Cam slaytlar | Fisher Scientific | 12-544-4 | |
| Gliserol | Fisher Scientific | BP229-1 | |
| Keçi anti-fare IgG Alexa 488 | Invitrogen | A11001 | |
| HEPES çözeltisi | Sigma Aldrich | H0887 | |
| Kapaklı nem odası | Simport | M920-2 | |
| Hidrojen peroksit, %30 | Fisher Scientific | H325-500 | |
| Immunedge pap kalem | Vektör laboratuvarları | H-4000 | |
| Böcek iğneleri, boyut 00 | Çalmak | 5213323 | |
| Magnezyum Sülfat (MgSO4 ve orta nokta; 7H2O) | Sigma Aldrich | 63138 | |
| Mesh süzgeç | Oneida | Herhangi bir marka ikame edilebilir | |
| Metanol | Sigma Aldrich | 34860 | |
| Metilen mavisi | Sigma Aldrich | M9140 | |
| Mikro tüp kapak kilidi | Araştırma Ürünleri Uluslararası | 145062 | |
| Mikrodalga fırın | Toastmaster | ||
| Mouse IgG | Sigma Aldrich | I8765 | |
| Normal keçi serumu | Millipore Sigma | S02L1ML | |
| Somunlama karıştırıcı | Fisher Scientific | 88-861-044 | |
| Paraformaldehit | Fisher Scientific | 04042-500 | |
| Pasteur pipetleri | Fisher Scientific | 13-678-20C | |
| PBTriton | 1x PBS'de %1 TritonX-100 | ||
| Permount montaj ortamı | Fisher Chemical | SP15-500 | |
| Petri kabı (cam) | Pyrex | 3160100 | |
| Petri kabı (plastik) | Fisher Scientific | FB0875713 | |
| 1-fenil 2-tiyoüre | Acros Organics | 207250250 | |
| Fosfat tamponlu tuzlu su (PBS), 10x, pH 7.4 | Gibco | 70011-044 | |
| Fosfat tamponlu tuzlu su (PBS), 1x | 1x, dH2O | ||
| Potasyum Klorür (KCl) | Sigma Aldrich | P9333 | |
| Potasyum Hidroksit (KOH) | Fisher | P250-500 | |
| Potasyum Fosfat Monobazik (KH2< / sub>PO4< / sub>) | Sigma Aldrich | P5655 | |
| Pronaz | Sigma Aldrich | 10165921001 | |
| Proteinaz K | Invitrogen | AM2544 | |
| Sodyum Klorür (NaCl) | Sigma Aldrich | S7653 | |
| Sodyum Fosfat Dibazik (Na2< / sub>HPO4< / sub>) | Sigma Aldrich | S7907 | |
| Kapaklı ve ekli yumurtlama tankı | Aquaneering | ZHCT100 | |
| SuperBlock PBS | Thermo Scientific | 37515 | |
| Superfrost + slaytlar | Fisher Scientific | 12-550-15 | |
| Süper yapıştırıcı jel | 3M Scotch | ||
| TNT | 100 mM Tris, pH 8.0; 150 mM NaCl; % 0.1 Ara20; dH2O | ||
| Transfer pipetinde | Fisher | 13-711-7M | |
| Triklorasetik Asit (Cl3CCOOH) | Sigma Aldrich | T6399 | |
| Tris Tabanı | Fisher Scientific | S374-500 | |
| TritonX-100 | Sigma Aldrich | T9284 | |
| Tween20 | Fisher Scientific | BP337-500 | |
| Ultra ince forseps | Fisher Scientific | 16-100-121 | |
| Su, ultra saf/çift damıtılmış | Fisher Scientific | W2-20 |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.