Son yıllarda, begomoviruses (cins Begomovirus, aile İkizler )birçok sebze üretimine ciddi zarar neden oldu, lif, ve süs bitkileri dünya çapında1. Begomoviruses whitefly Bemisia tabaci tarafından kalıcı bir şekilde iletilir (Hemiptera: Aleyrodidae), hangi üzerinde içeren karmaşık bir tür 35 şifreli türler2,3. Begomoviruses doğrudan veya dolaylı olarak whitefly fizyolojisi ve davranış etkileyebilir, fecundity4gibi , uzun ömür4, ve konaktercihi 5,6. Ayrıca, belirli bir begomovirüs türlerinin iletim verimliliği / zorlanma farklı whitefly şifreli türler için bile aynı deneysel koşullar altında değişir7,8,9,10, begomovirüsler ve beyaz sinekler arasında karmaşık bir etkileşim olduğunu gösteren. Whitefly-begomovirus etkileşimlerinin altında yatan mekanizmaları daha iyi anlamak için, whitefly dokularında virüsün lokalizasyonu ve nicelemesi esastır.
Domates sarı yaprak kıvırcık virüs (TYLCV) ilk İsrail'de bildirilen bir begomovirus ama günümüzde domates üretimi dünya çapında ciddi hasara neden olur11,12. Ekonomik önemi nedeniyle, en iyi çalışılan begomoviruses13biridir. Diğer monopartite begomoviruses gibi, TYLCV yaklaşık bir genom boyutu ile tek iplikli dairesel DNA virüsü14. Hala tartışma altında iken, kanıt çeşitli satırları whiteflies15,16,17TYLCV çoğaltılması destek . Ayrıca, TYLCV parçacıkları ve whitefly proteinlerin etkileşimi bildirilmiştir6,18,19,20. Virüs bulaşması için, beyaz sinekler virüs bulaşmış bitkilerle beslenerek TYLCV elde, virions yemek borusuna ulaşmak için besin kanalı boyunca geçmek, hemolenf ulaşmak için midgut duvar nüfuz, ve daha sonra birincil tükürük bezleri içine translocates (PSGs). Son olarak, virions bitki phloem içine tükürük kanalı boyunca tükürük ile egestedvardır 21. Ayrıca, çeşitli çalışmalar TYLCV transovarial dişi beyaz sinekler kendi yavrularına22,23iletilir mümkün olduğunu göstermektedir. Başka bir deyişle, verimli iletim elde etmek için, virüs bir dokudan diğerine translocate için whitefly içinde hücresel engelleri aşmak zorundadır. Bu engellerin aşılması sırasında, whitefly ve virüs proteinleri arasındaki etkileşimler muhtemelen virüslerin bulaşma verimliliğini belirleyen oluşabilir.
İmmünofloresans protein dağılım analizi nde yaygın olarak kullanılan bir tekniktir. Antikorların antijenlerine bağlanan özgüllüğü immünfloresansın temelini oluşturur. TYLCV'nin ekonomik önemi nedeniyle, TYLCV kat proteinine karşı monoklonal antikorlar geliştirilmiştir ve virüsün lokalize edilmesi için son derece hassas bir yol24geliştirilmiştir. Kantitatif PCR (qPCR) nükleik asitlerin hassas ve spesifik nicelemasını sağlar. Bu teknik en sık hidroliz probu (örneğin, TaqMan) veya floresan boya (örneğin, SYBR Green) tespiti kullanımına dayanır. Hidroliz prob tabanlı qPCR için, belirli problar gereklidir, bu da dolayısıyla maliyeti artırır. Floresan boya bazlı qPCR daha basit ve daha uygun maliyetlidir, çünkü etiketli amplicon spesifik hibridizasyon probları25. Şimdiye kadar, çeşitli çalışmalarda karmaşık begomovirus-whitefly etkileşimleri araştırmak için diğer yöntemlerle birlikte immünoresans ve qPCR kullandık. Örneğin, Pan ve ark. whitefly dokularda virüsün qPCR ve immünoforeskence analizi yapıldı ve beyaz sinek türleri AsiaII 1 ve Orta Doğu Asya Küçük 1 (MEAM1) arasında tütün kıvırcık ateş virüsü (TbCSV) iletmek için yeteneği farkı etkili AsiaII1 ama MEAM1 8 midgut duvar çapraz edememek için virüs nedeniyle bulundu8. Benzer şekilde, Akdeniz (MED) beyaz sinekler kolayca TYLCV iletebilirsiniz iken, onlar domates sarı yaprak kıvırmak Çin virüsü (TYLCCNV) iletmek için başarısız. Seçici iletim, TYLCCNV'nin MED whiteflies26'nınPSG'lerini kolayca geçmediğini gösteren PSG'lerde immünororesans virüsü nisbi tespiti kullanılarak araştırıldı. TYLCV CP ve whitefly midguts otofaji marker protein ATG8-II immünofloresan kolokalizasyonu otofin whitefly27TYLCV enfeksiyonu baskı kritik bir rol oynadığını göstermektedir.
Burada, örnek olarak TYLCV kullanarak, bir immünofloresan tekniği ile whitefly midguts, PSGs ve yumurtalıklarda begomovirüslerin lokalizasyonu için bir protokol açıklar. Bu teknik, primer ve boya etiketli ikincil antikorlarla diseksiyon, fiksasyon ve kuluçkayı içerir. Floresan sinyalleri daha sonra bir konfokal mikroskop altında tespit edilebilir whitefly dokularda viral proteinlerin yerini gösteren. Daha da önemlisi, bu protokol begomoviral ve whitefly proteinleri colocalize için kullanılabilir. Ayrıca, farklı whitefly doku örneklerinde virüs miktarını karşılaştırmak için kullanılabilecek whitefly midguts, PSGs, hemolenf ve yumurtalıklarda SYBR Yeşil tabanlı qPCR kullanılarak TYLCV'nin sayısallaştırılması için bir protokol tanımlayın.