Hipokampus, nispeten büyük boyutu ve belirgin laminer yapısı nedeniyle memeli beyninde tartışmasız en iyi çalışılmış yapıdır. Hipokampus bir dizi davranışsal süreçte rol oynamıştır: uzamsal navigasyon, bağlamsal bellek ve bölüm oluşumu. Bu, kısmen, in vivo analiz için kemirgenlerde hipokampusun dorsal kısımlarına göreceli erişim kolaylığından kaynaklanmaktadır. Gerçekten de, ana çıkış hücreleri tipik olarak piyal yüzeyden 2 mm'den daha azdır.
Kemirgenlerde, hipokampus, dorsal septumdan ventral neokortekse uzanan telensefalonun istilasından oluşan nispeten büyük bir yapıdır. 2 ana bölgeden oluşur: dentat girus ve cornu ammonis (CA); ikincisi, bağlantı, hücresel anatomi ve genetik özelliklere dayalı olarak dentat girus hilusa (eski adıyla CA4) uzanan iyi tanımlanmış 3 alt bölgeye (CA1-3) ayrılmıştır1. Bu yapı, sinaptik özellikler 2,3,4, anatomi5, genetik çeşitlilik 6,7,8 ve davranışsal işlev 9,10'da büyük farklılıklar olmasına rağmen, hipokampusun dorso-ventral kapsamı boyunca korunur. CA bölgelerinden, CA1 alt alanı büyük ölçüde glutamaterjik CA1 piramidal hücrelerden (CA1 PC'ler) oluşur, bunun için 3 alt tiptanımlanmıştır 11 ve nöronların ~%10'unu oluşturan inhibitör internöronlar, ancak tanımlanan 30'dan fazla alt tip ile oldukça çeşitlidir 12,13,14. Bölgesel spesifik farklılıklara ek olarak, normal yaşlanmanın sinaptik iletim15,16,17, anatomi18 ve genetik profil19 üzerinde dramatik etkileri olduğu gösterilmiştir. Hücresel ve sinaptik özelliklerin karmaşıklıklarını kontrollü bir şekilde değerlendirmek için mevcut altın standart yöntem, akut beyin dilimlerinden20 tam hücre yama-kelepçe kayıtlarının kullanılmasıdır.
Hipokampal fonksiyonun anlaşılması, davranışsal görevler, elektrotların veya görüntüleme pencerelerinin implantasyonu veya viral plazmit ekspresyonu için cerrahi veya anatomik olarak erişim kolaylığı nedeniyle büyük ölçüde dorsal manipülasyona dayanmaktadır. Ek olarak birçok çalışmada, bu işlemler gelişim sırasında beyin yapısındaki değişkenliği önlemek için geç juvenil veya yetişkin kemirgenlerle gerçekleştirilmektedir. Buna rağmen, hücresel ve hücre altı elektrofizyolojiyi incelemek için birçok yaklaşım, çoğunlukla hipokampusun enine düzlemindeki ventro-medial kısmından erken ve orta juvenil kemirgenlerdegerçekleştirilir 21,22,23,24,25. Tüm dorso-ventral kapsamın değerlendirildiği durumlarda, enine genişliği 4,26 korumak için bir doku kıyıcı kullanılır veya deney genç sıçanlarda27 veya farelerde28 gerçekleştirilmiştir. Ayrıca, beynin diseksiyonundan önce dokunun soğutulmasının, sıçanlarda29 hipokampal yapıyı ve farelerde30,31 neokortikal nöronları koruduğu bilinmektedir. Bununla birlikte, olgun sıçanlarda, modifiye edilmiş koronal dilimler tarafından üretildiği gibi, hipokampusun dorsal enine ekseninden beyin dilimlerinin üretimi ile ilgili bir ayrıntı yetersizliği vardır.
Bu protokol, yaşlı sıçanlardan alınan modifiye edilmiş dorsal hipokampus dilimlerindeki tek veya çift nöronlardan tam hücre yama kelepçesi kayıtlarının elde edilebileceği ve ardından post-hoc morfolojik tanımlamanın yapılabileceği bir yaklaşımı tanımlar. Soğutulmuş yapay beyin omurilik sıvısının (ACSF) transkardiyal perfüzyonunu takiben sağlıklı beyin dilimleri elde edilir, bu da CA1 PC'lerden ve lokal internöronlardan elektrofizyolojik özelliklerin ölçümünü kolaylaştırır.