$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Özetle, doğrudan dönüşüm, hasta cilt fibroblastlarından indüklenmiş nöronal progenitör hücreler üretmek için hızlı ve kolay bir yöntemdir. Bu yöntem, hızı ve bakımı kolay üretilen çok sayıda hücre nedeniyle avantajlıdır. Dahası, artan kanıtlar, doğrudan yeniden programlama yöntemlerinin klasik iPSC yeniden programlama teknolojisine kıyasla daha az epigenetik izi ortadan kaldırdığını, bu nedenle hastalık ortamını daha sağlam bıraktığını göstermektedir4,7,8. INPC'lerin astrositlere farklılaşması çok düzdür ve birden fazla bağımsız laboratuvar arasında bile oldukça tekrarlanabilir19,29,33. iNPC'ler küçük porsiyonlarda dondurulabilir ve farklılaşma amacıyla doğrudan çözülebilir, bu da geçiş sayıları benzer tutulabildiğinden deneyler arasındaki varyasyonu azaltmaya yardımcı olur. Astrositler birçok nörolojik hastalıkta hastalığın ilerlemesinde çok önemli bir rol oynar ve bu nedenle çalışmak için ilginç bir hücre tipidir. Astrositler mekanistik çalışmalar, metabolik çalışmalar veya ilaç testi tahlilleri için kullanılabilir ve genellikle monolayer olarak yetiştirilir. Ayrıca, astrositler, her ikisi de ilaç testi için iyi okumalar olan nöronal sağkalım ve morfoloji üzerindeki etkisini değerlendirmek için fare veya insan nöronları ile ortak kültür sistemlerinde birleştirilebilir34.
Bu protokolün başarıyla kullanılabilmesi için birkaç noktanın ve potansiyel sınırlamaların akılda tutulması gerekir. Örneğin insan derisi fibroblastları, viral vektörlere yanıt olarak hücre bölünme oranlarına göre büyük ölçüde değişir. Bunlar standart hücre hatları olmadığından, insanlığın kendisi kadar değişkendir, her çizgi farklıdır. Birçok yeniden programlama yöntemine gelince, orta ila hızlı hücre bölünme oranına sahip fibroblastları zar zor çoğalan hücrelere göre yeniden programlamak daha kolaydır. Replikasyon oranı, cilt biyopsisi kalitesinden ve işlenmesinden, fibroblastların geçiş sayısından ve elleçlemeden etkilenebilir. Birincil cilt fibroblastları ile çalışırken, senescence indüksiyonunu önlemek için hücrelerin çok yoğun olmasına izin vermemek önemlidir. Fibroblastlar iyi büyümezse, yeni bir stok veya daha düşük bir pasaj denemek en iyisidir, ancak bazı durumlarda hastalığın kendisi de bir rol oynayabilir. Hücre bölünmesi bazen fibroblast ortamlarında standart %10'a kıyasla %15 veya %20 FBS kullanılarak iyileştirilebilir.
Yeniden programlayan viral vektörlerin kalitesi başarı için büyük önem taşımaktadır. Elimizde retroviral vektörler lentiviral vektörlere veya entegre olmayan diğer virüslere kıyasla daha verimliydi; bununla birlikte, bu viral vektör kalitesine ve saflığına bağlı olabilir. Ticari retroviral vektör kitleri genellikle viral vektör konsantrasyonunu ve genellikle belirli bir hücre hattı için enfeksiyonun çokluğunu belirtir. Birincil fibroblastların viral vektör alımını belirlemek için şirketler tarafından kullanılan hücre hattından farklı olduğunu akılda tutmak önemlidir. Ayrıca, aynı ticari kiti sipariş ederken bile, partiler arasındaki değişim yaygındır. Ayrıca, viral vektörlerin alımı da fibroblast hücre çizgileri arasında değişir. Bazı çizgiler daha hassas olabilir ve bu nedenle transdüklenmiş hücreler ölebilirken, diğer hücre hatları viral alıma karşı daha dirençli olabilir. Bu nedenle, belirli bir hücre hattı için transdüksiyon verimliliğinin belirlenmesi, özellikle hücre çizgisi yavaş büyüyorsa veya önceki dönüştürme girişimleri başarısız olursa önemli olabilir. Elimizde, dönüşüm için belirli bir retroviral vektörün ne kadarının gerekli olduğunu değerlendirmenin en iyi yolu, viral vektörün birkaç seyreltme ile immünofluoresan boyama yapmaktır. Her vektör için transjeni ifade eden hücrelerin sayısı daha sonra% 70 veya daha yüksek bir transdüksiyon verimliliği amacıyla sayılabilir. Deneyimlerimize göre, çoğu hücre hattı için benzer MOI'ler kullanılabilir, ancak gerekirse MOI ayarlanabilir.
Dönüştürme işlemi sırasında, hücreleri çok erken bölmemek önemlidir. Hücrelerin bölünmeye hazır olduğu süre, birincil hücre çizgisi ve özellikleri, kullanılan viral vektörün kalitesi ve ortam kalitesi dahil olmak üzere birden fazla faktöre bağlıdır. Daha da önemlisi, hücreler yüksek yoğunlukta tutulduğunda dönüşümün başarı oranı çok daha yüksektir. Hücreler morfolojiyi değiştirmeye başlasa bile, hücreleri erken bölmektense ilk kuyuda daha uzun süre bırakmak daha iyidir. Bölünme çok erken gerçekleşirse, dönüştürme ilerlemesinde durabilir ve hücrelerin fibroblast benzeri şekil ve davranışa geri dönmesine neden olabilir. Ayrıca, çok erken seyreltmek, daha önce gözlenen NPC'lerin küçük ve kompakt hücre gövdelerine kıyasla daha uzun hücre gövdelerine neden olabilir. Bu nedenle, ilk bölünmeler her zaman muhafazakar olmalıdır; hücreleri çok fazla seyreltmeye kıyasla 1:1 veya 1:2 bölünmesiyle çok yoğun tutmak daha iyidir. İlk bölünmeden sonra bir miktar hücre ölümü bekleniyor. Not olarak, hücreler bölündükten sonraki ilk gün her zaman daha kötü (daha düz) görünür, bu normaldir. Hücre şekli hakkında en iyi kararlar 2-3 gün sonra verilmelidir. Daha da önemlisi, büyüme faktörlerinin ve medya bileşenlerinin kalitesi de çok önemlidir. Tamamen hazırlanmış medyanın en fazla 5-7 gün kullanılabilmesi için büyüme faktörleri içeren az miktarda medya hazırlamak önemlidir. Ortamı oda sıcaklığında veya 37°C'de uzun süre tutmayın. Hızlı kullanın ve ortam değişikliği yapılır yapılmaz soğutun. Ayrıca, ortam hacmini 2 mL yerine 1 mL'de düşük tutmak, özellikle dönüştürmeye daha dayanıklı hücre hatları için yardımcı olabilir. Hücreler ortamı hızla tüketirse, bu da kırmızı ortam renk formunda sarıya (asitleşme oranı) bir değişiklikle gözlemlenebilir, ortamın hacmini 2 mL'ye kadar ayarlayın. Hızlı medya tüketimi olumlu bir işarettir ve genellikle dönüşümün sonraki aşamalarında artan çoğalma ile birlikte gözlenir.
NPC'ler de medyadaki accutase varlığına karşı çok hassastır ve akutase inkübasyon süresini kısa tutmak çok önemlidir. 2-4 dakikalık bir kuluçka süresi öneriyoruz, hücreleri ne zaman ayrıldıklarını görmek için mikroskop altında sık sık kontrol edin. Enzim karışımını ortamdan çıkarmak için bölündükten sonra hücrelerin santrifüjlenimi esastır. İfade profillerinin değiştirilmesine yol açan genişletilmiş kültleme üzerine hücre çizgileri değişebileceğinden, geçiş numarasını akılda tutmak da önemlidir. Bu nedenle, birçok hücre stoklarını erken geçişlerde dondurmak önemlidir. Hücreler % 10 DMSO ve% 90 NPC ortamlarında dondurulmalı ve sıvı nitrojende uzun süre saklanmalıdır. Bu ortamdaki serum eksikliği nedeniyle, donma odaları kullanılarak yavaş bir donma sağlamak ve bir kez bir gecede dondurulduktan sonra derhal sıvı nitrojene aktarılması kritik öneme sahiptir. Bu protokolde klonal seleksiyon yapılmazken, genişletilmiş kültleme ve pas geçmenin, ilk hücre popülasyonunun olumlu büyüme ve sağkalım oranı ile doğal olarak seçilmesine yol açtığı mümkündür. Bu nedenle, deneyler yaparken geçiş numarasını ve işlemeyi akılda tutmak önemlidir. Deneyler için daha düşük pasajlar kullanmayı tercih ediyoruz, mümkünse hücre çizgilerini 20'den fazla kez geçmeyi aşmuyoruz. NPC'ler hızla büyüdüğünden, deneyler için daha düşük geçitlerde çok sayıda stok dondurulabilir. Özellikle yüksek büyüme oranlarına sahip hücre hatları, medya asitlenmesi riski daha yüksektir. Bu nedenle, hücre hatları farklı bir hızla büyüdükçe, ortam miktarının çoğalmaya göre ayarlanması gerekebilir. Hücreler sürekli olarak yüksek asitli ortamda bırakılırsa, hem kontrol hem de hastalık hücre hatlarının sağlığını etkileyebilir. Bu, sağlıklı astrositlerin bile reaktif hale gelmesine neden olur ve daha fazla farklılaşma ve deneylerde kullanımlarını etkiler.
Astrosit farklılaşması için, yüksek yoğunluk hücrelerin farklılaşmasını önleyeceğinden ve daha yüksek oranlarda çoğalmaya devam edeceklerinden, hücreleri düşük yoğunlukta tutmak önemlidir. Bu nedenle, tohumlama yoğunluğunun çoğalma oranlarına bağlı olarak her hücre hattı için ayarlanması gerekir. Uygun farklılaşmayı sağlamak için farklı tohumlama yoğunluklarını denemenizi ve astrosit işaretleyicilerle boyama/RT-PCR gerçekleştirmenizi öneririz. IAs kalitesi, nöronlarla ortak kültür tahlilleri kullanılarak sağlıklı kontrollerle birlikte değerlendirilebilir. Hastalık patolojisi reaktif bir fenotipe yol açmadığı için, nöronlar birkaç gün boyunca iA'larla temas halinde canlı kalmalıdır. Astrosit morfolojisi bireysel hücre hatları arasında büyük ölçüde değişebilir ve hastalık fenotipi tarafından da etkilenebilir. Ayrıca, astrositlerin yoğun olarak etkilendiği hastalıklarda, büyük, uzun uzantılı reaktif bir fenotip gösterebilirler.