$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bu çalışma, Ulusal Tıbbi Araştırma Geliştirme Enstitüsü ve Araştırma Etiği İnceleme Komitesi, No. 958680 tarafından onaylanmıştır. Lentivirüsler BSL-2 organizmaları olarak sınıflandırılır; Bu nedenle, bu protokoldeki tüm laboratuvar kültürü prosedürleri steril laboratuvar uygulamaları kullanılarak gerçekleştirilmiş ve NIH kılavuzlarına göre laminer bir akış başlığı altında yürütülmüştür. Şekil 1 , farklı E. granulosus aşamaları için çalışma protokolünün şematik bir sunumunu göstermektedir.
1. Kist hidatik toplanması
- Bir mezbahada rutin olarak kesilen doğal olarak enfekte olmuş koyunlardan karaciğer hidatik kistlerini toplayın.
- Protoskolesleri (PSC'ler) aspire etmeden önce steril gazlı bez ve% 70 alkol kullanarak kist yüzeyini tamamen sterilize edin.
- 20-50 mL hidatit sıvısını steril 50 mL konik tüplere aspire edin.
- Boşalttıktan sonra, kisti keskin bir bıçakla lekeleyin, germinal tabakayı steril bir 50 mL konik tüpe aktarın ve PSC'lerin toplanmasını arttırmak için kısa bir süre (~ 2 dakika) sallayın.
- PSC'leri 3-5x fosfat tamponlu salin (PBS) ile yıkayın.
- Bir ışık mikroskobu altında PSC'nin yaşayabilirliğini belirlemek için PSC'leri 5 dakika boyunca %0,1 eozin içinde gözlemleyin. Kültür için en az %95 uygulanabilirliğe sahip PSC'ler kullanın.
- PSC çökeltiyi 15-20 dakika boyunca 2 mL pepsin (2 mg / mL, pH 2) ile tedavi edin.
- Tek tek PSC'leri izole etmek için, PBS'deki PSC tortusunu yeniden askıya alın ve iki kat steril gazlı bezden yeni bir steril 50 mL konik tüpe geçirin.
NOT: Bir ışık mikroskobu kullanarak 50 μL PSC tortuları üzerinde ortalama üç sayım hesaplayın. Sonraki denemelerde, PSC'leri/μL'yi belirlemek için tahmini değeri kullanın. Her bir kist hidatik izolatı, PCR dizilimi17 veya yüksek çözünürlüklü erime eğrisi analizi18 gibi moleküler yöntemlerle nükleotid polimorfizmlerine dayanarak karakterize edilmelidir.
2. Yetişkin solucanlar elde etmek için E. granulosus'un PSC'lerinin bifazik yetiştiriciliği
NOT: İzole PSC'ler, laminer akış kabini Sınıf II altında steril koşullarda kültürlenmelidir. Sonraki adımlara geçmeden önce bifazik kültür ortamının katı ve sıvı fazlarını ayrı ayrı hazırlayın19.
- Bifazik kültür ortamını iki aşamadan oluşacak şekilde hazırlayın.
-
Katı faz için, 25 mL'lik bir şişeye 10 mL sığır serumu ekleyin ve 20-30 dakika boyunca 76 ° C'de pıhtılaşmaya bırakın.
-
Sıvı faz (modifiye CMRL) için, 100 mL ısıyla inaktive edilmiş fetal buzağı serumu (FCS), 36 mL% 5 maya ekstresi, 5.6 mL% 30 glikoz (damıtılmış suda), PBS'de 1.4 mL% 5 köpek safrası, 20 mM HEPES tamponu ve 260 mL CMRL-1066 ortamında 10 mM NaHCO3 karıştırın. Son olarak, karışıma penisilin (100 IU / mL) ve streptomisin (100 mg / mL) ekleyin.
- Her 25cm2 kültür şişesine 10 mL sıvı faz ortamı ekleyin.
- Kültür şişesine ~5.000 PSC ekleyin ve şişeyi CO 2 inkübatörüne aktarın (37 °C, %5 CO2).
- 24-48 saat sonra, PSC'leri katı fazlı (sığır serumu) yeni bir şişeye aktarın ve şişe başına aynı taze sıvı faz ortamından 1 mL ekleyin. Şişeleri CO 2 inkübatörüne aktarın (37 °C, %5 CO2).
- Her 5-7 günde bir, kültür ortamının rengindeki değişikliklere ve farklılaştırılmış PSC'lerin tahmini oranına bağlı olarak ortamı taze sıvı faz ortamı ile değiştirin.
NOT: Protoscoleces kültürlendikten sonra çevresel değişikliklere hızlı bir şekilde tepki verir ve çoğu 2-3 hafta içinde farklılaşır. Besin maddelerinin tüketimi ve protoscoleces'in büyümesi ve gelişmesi nedeniyle, kültür ortamının pH'ı değişir ve rengi turuncu ve sarıya doğru kayar.
3. E. granulosus'un PSC'lerinin monofazik yetiştiriciliği
- Monofazik ekimin transdüksiyondan 24-48 saat önce yapıldığından emin olun.
- RPMI ve% 10 fetal sığır serumu (FBS) ile25 cm2'lik bir kültür şişesinde kültür ~ 5.000 PSC.
- Şişeleri kullanıma kadar CO 2 inkübatörüne (37 °C, %5 CO2) aktarın.
4. Virüs üretimi ve hazırlanması için hücre kültürü
NOT: Kerman Tıp Bilimleri Üniversitesi Patoloji ve Kök Hücre Araştırma Merkezi'nden vektör üretimi için insan embriyonik böbrek 293T (HEK293T) hücreleri elde edilmiştir.
- 5 × 105 HEK293T hücresini, %10 FBS, 100 U/mL penisilin ve 100 μg/mL streptomisin içeren 5 mL DMEM içeren25 cm2'lik bir şişeye aktarın.
- HEK293T hücrelerini 37 ° C'de% 5 CO2'de inkübe edin ve her 48 saatte bir tam kültür ortamında geçirin. Son olarak, transdüksiyon20 için düşük pasajlı HEK293T hücreleri kullanın.
5. Üçüncü nesil lentiviral vektörlerle virüsün üretimi ve hazırlanması
NOT: GFP muhabir genini eksprese etmek için lentivirüs vektörü pCDH513b (transfer vektörü) ve PLPII, PLPI ve PMD2G (yardımcı vektörler) kullanılmıştır. Bkz. Malzeme tablosu ve Ek Şekil S1.
- 1. Gün:
- HEK293T hücreleri21'i 6 kuyucuklu kültür plakalarında tripsinize ettikten sonra, tohum 7 ×% 10 FBS içeren taze antibiyotik içermeyen DMEM ile kuyu başına 10 4 hücre.
- Kalsiyum fosfat yöntemi ile transdüksiyon için% 50-60 akıcılıkta hücreler kullanın.
- 2. Gün:
- Deneyden 2-3 saat önce hücre kültürü ortamını % 2 FBS içeren taze antibiyotik içermeyen DMEM ile değiştirin.
- 1,5 mL'lik bir tüpte, 7 μg/μL pCDH513b (transfer vektörü), 4 μg/μL PLPII, 4 μg/μL PLPI ve 2 μg/μL PMD2G (yardımcı vektörler) dahil olmak üzere üçüncü nesil lentiviral plazmidleri karıştırın.
- Karışıma HEPES tamponunu (0,28 M NaCl, 0,05 M HEPES ve 1,5 mM Na2HPO4; optimum pH aralığı, 7,00-7,28) 422 μL'lik bir hacme ekleyin.
- Karışıma 16 μL %1 Tris-EDTA (TE) tamponu ekleyin.
- Tüplere 62 μL 2,5 mM kalsiyum klorür ekleyin ve iyice karıştırın.
- Bir Pasteur pipeti kullanarak karışıma 500 μL 2x HEPES-tamponlu salin (HBS) ekleyin, damla damla, damla damla. Yarı opak bir çözelti elde edilene kadar hafifçe karıştırın ve karışımı oda sıcaklığında 20 dakika inkübe edin.
- Karışımı her plakaya yavaşça ekleyin ve yavaş dairesel hareketlerle dağıtın.
- Plakaları% 5 CO2 inkübatöründe 37 ° C'de inkübe edin ve 4-6 saat sonra ortamı % 10 FBS içeren antibiyotiksiz DMEM ile değiştirin.
- 3. Gün:
- Ters çevrilmiş floresan mikroskobu kullanarak başarılı geçici transdüksiyonu ve hücre canlılığını onaylayın.
- 4. Gün:
- Her bir kuyucuğun süpernatantını toplayarak virüsleri kültür ortamından toplayın ve kullanıma kadar -70 ° C'de saklayın.
NOT: Hasat edilen lentivirüsler konsantre edilebilir ve hassas transfeksiyon için titre edilebilir22.
6. E. granulosus'un farklı evrelerinin virüs ile geçici transdüksiyonu
- 1. Gün:
- Gen transferi için 12 kuyucuklu bir kültür plakası kullanın. Kültür 5 × 103-5 × 104 HEK293T hücreleri üçlü olarak, iç referans olarak tam DMEM ortamı ile.
- Kültür RPMI ve %10 FBS'de üçlü olarak 150 taze PSC.
- Kültür 30% 10 ısı-inaktive FBS içeren DMEM'de üçlü olarak strobilated solucanlar.
NOT: Tüm transdüksiyon ortamları antibiyotiksiz olmalıdır. Bu süreçte HEK293T hücreleri, PSC'ler ve strobilated solucanlar için üç adet tedavi edilmemiş kontrol kuyusu bulundurun.
- HEK293T hücrelerini ve solucanın farklı aşamalarını dönüştürmek için 4 μg / mL transfeksiyon reaktifi ile 1 × 106 virüsün bir karışımını hazırlayın ( Malzeme Tablosuna bakınız).
- Karışımı her plakaya yavaşça ekleyin ve yavaş dairesel hareketlerle dağıtın. Plakaları bir CO 2 inkübatöründe 4-6 saat boyunca inkübe edin (37 ° C,% 5 CO2). Transfeksiyon reaktifinin toksik etkilerini en aza indirmek için her numunenin ortamını aynı tam kültür ortamıyla değiştirin.
- 2. Gün:
- HEK293T hücreleri, PSC'ler ve strobilated solucanlar için geçici iletim verimliliğini artırmak üzere 6.1.4-6.1.5 arasındaki adımları yineleyin.
- Tüm plakaları, hücre ortamının tipine bağlı olarak aynı kültür koşullarına sahip bir CO2 inkübatöründe 24-48 saat boyunca inkübe edin.
- 3. Gün:
- Floresan mikroskobu kullanarak transdüksiyonun başarılı olup olmadığını kontrol edin.
NOT: Gen transfer prosedüründe PCR / qPCR 20,23 veya Western blotting24 teknikleri gibi daha fazla doğrulayıcı tahlil kullanmayı düşünün.