Avrupa Parlamentosu'nun 2010/63/AB Konsey Direktifi de dahil olmak üzere ulusal ve kurumsal yönergelere uygun olan ve tam İçişleri Bakanlığı etik onayına sahip olan tüm hayvan deneyleri (Heidelberg Üniversitesi Hayvan Refahı Ofisi ve Regierungspraesidium Karlsruhe, T14/21 ve T13/21 lisansları). Primer hipokampal ve kortikal nöronlar yenidoğan fare veya sıçan yavrularından standart prosedürlere göre hazırlandı ve daha önce tanımlandığı gibi 12-14 gün boyunca muhafaza edildi13.
1. Çözümlerin hazırlanması
- Görüntüleme tamponu için stok çözümleri
- Her stok çözeltisini Tablo 1'e göre hazırlayın ve 4 °C'de tutun. Uzun süreli depolama için (>3 ay), aliquots 'u -20 °C'de tutun.
| Parça | MW | Konsantrasyon (M) | Tutar (g) | Birim (mL) |
| NaCl | 58.44 | 5 | 14.61 | 50 |
| Kartal | 74.55 | 3 | 1.12 | 5 |
| MgCl2· 6H2O | 203.3 | 1.9 | 2 | 5 |
| CaCl2·2H2O | 147.01 | 1 | 1.47 | 10 |
| Glisin | 75.07 | 0.1 | 0.375 | 50 |
| Sakaroz | 342.3 | 1.5 | 25.67 | 50 |
| Sodyum piruvat | 110.04 | 0.1 | 0.55 | 50 |
| HEPES | 238.3 | 1 | 11.9 | 50 |
| Glikoz | 180.15 | 2.5 | 45 | 100 |
Tablo 1: Görüntüleme tamponu için stok çözümleri.
- İlaç ve boyaların stok çözümleri
- 0,5 M stok çözeltisi (örneğin, 11.615 mL su içinde 1 g) elde etmek için suda diamid (DA; maksimum 405:488 oranının kalibrasyonu için kullanılır) çözün. Aliquot ve -20 °C'de saklayın.
- 1 M stok çözeltisi (örneğin, 32.425 mL su içinde 5 g) elde etmek için suda dithiothreitol (DTT; minimum 405:488 oranının kalibrasyonu için kullanılır) çözün. Aliquot ve -20 °C'de en fazla 3 ay saklayın.
- 10 mM stok çözeltisi (örneğin, 16.991 mL suda 25 mg) elde etmek için N-metil-D-aspartatını (NMDA; eksotoksisite ve mitokondriyal oksidasyona neden olmak için kullanılır) suda çözün. Aliquotları -20 °C'de saklayın. Uzun süreli depolama için (>6 ay), aliquotları -80 °C'de tutun.
- Tetrametrinhodamin etil ester perklorat (TMRE; mitokondriyal membran potansiyelinin küçük moleküllü bir göstergesi)
- 20 mM stok elde etmek için TMRE tozunu metanolde çözün (örneğin, 2.427 mL metanolde 25 mg).
- 20 μM stok elde etmek için 20 mM stoku 1:1.000 metanolde seyreltin.
- 20 mM ve 20 μM stok çözeltilerini aliquot, parafilm ile mühürleyin ve -20 °C'de ışıktan korunan depolayın.
NOT: Her iki stok çözümü de birkaç yıldır istikrarlıdır. Deneyler için 1.000x stok çözeltisini (20 μM) kullanın.
- Görüntüleme arabelleği
- Tablo 2'den 80 mL'ye kadar tüm bileşenleri bir ölçüm silindirine ekleyerek 100 mL görüntüleme tamponu hazırlayın. Hacmi steril suyla 100 mL'ye kadar getirin. Çözelti homojen görünene kadar ölçüm silindirini dikkatlice sallayarak karıştırın.
NOT: Tamponun omomolaritesini kontrol etmek için bir kilometre sayacı kullanılması önerilir. Hücrelerin büyüme ortamına mümkün olduğunca yakın olmalıdır. Burada, bu 315 mOsmol / L. Görüntüleme tamponunun ve büyüme ortamının ozmolaritesine uyacak şekilde sakkaroz konsantrasyonunun gerektiği gibi arttırın veya azaltın.
- pH'ı 7,4'e ayarlayın. Aliquots yapın ve iki haftaya kadar 4 °C'de tutun. Uzun süreli depolama için aliquotları -20 °C'de tutun. Kullanmadan önce görüntüleme tamponu oda sıcaklığına ulaşsın.
| Parça | Stok çözümü (M) | Son konsantrasyon (mM) | Birim (mL) |
| NaCl | 5 | 114 | 2.3 |
| Kartal | 3 | 5.29 | 0.176 |
| MgCl2
| 1.9 | 1 | 0.053 |
| CaCl2
| 1 | 2 | 0.2 |
| Glisin | 0.1 | 0.005 | 0.005 |
| Sakaroz | 1.5 | 52 | 3.5 |
| Sodyum piruvat | 0.1 | 0.5 | 0.5 |
| HEPES | 1 | 10 | 1 |
| Glikoz | 2.5 | 5 | 0.2 |
Tablo 2: Görüntüleme tamponunun bileşimi. Belirtilen birimler 100 mL görüntüleme tamponunun hazırlanması için kullanılır.
- Stimülasyon ve kalibrasyon çözümleri
NOT: Deneyden hemen önce görüntüleme tamponu içine belirtilen ilaçların stok çözeltilerini ekleyerek her zaman taze stimülasyon çözümleri hazırlayın. Stimülasyon ve kalibrasyon çözümleri bir deney sırasında görüntüleme odasına ardışık olarak eklenecektir (bkz. bölümler 3-5). Deney türüne bağlı olarak, görüntüleme odasındaki ilgili son hacimde aynı uç konsantrasyona ulaşmak için farklı çözümler gereklidir.
- 6.937 mL görüntüleme tamponuna 10 mM NMDA stoğunun 63 μL'sini ekleyerek 3x NMDA çözeltisi (90 μM; haznede son konsantrasyon: 30 μM) hazırlayın. Elde eden çözeltinin 500 μL'lik kısmını odaya ekleyin (son hacim: 1,5 mL).
- 6.986 mL görüntüleme tamponuna 0,5 M DA stoğunun 14 μL'si ekleyerek 3 ve 4 adım (1 mM; haznedeki son konsantrasyon: 0,5 mM) için 2x DA çözeltisi hazırlayın. Hazneye 1 mL ekleyin (son hacim: 2 mL).
- 6.972 mL görüntüleme tamponuna 0,5 M DA stoğunun 28 μL'si ekleyerek 4x DA çözeltisini 5. Odaya 500 μL ekleyin (son hacim: 2 mL).
- 8955 μL görüntüleme tamponuna 45 μL 1 M DTT stok ekleyerek 1x DTT çözeltisi (5 mM; haznede son konsantrasyon: 5 mM) hazırlayın. Görüntüleme tamponu (son hacim: 1 mL) aspirasyondan sonra bu çözeltinin 1 mL'lik kısmını odaya ekleyin.
2. Hücrelerin TMRE ile yüklenmesi
NOT: Bu protokolde, TMRE söndürme olmayan mod15'te 20 nM'lik son konsantrasyonda kullanılır. Genel olarak, tercih ettiği mikroskopta hala yeterli sinyal yoğunluğu sağlayan mümkün olan en düşük TMRE konsantrasyonu kullanılmalıdır. Düzensiz buharlaşma nedeniyle, farklı kuyulardaki ortamın hacmi uzun vadeli birincil kültürlerde farklılık gösterebilir. Tüm kuyularda tutarlı bir TMRE konsantrasyonu sağlamak için TMRE'yi doğrudan kuyulara eklemeyin. Bunun yerine, her kuyudaki ortamı aynı miktarda TMRE içeren ortamla değiştirin. Aşağıdaki protokol, kuyu başına ~1 mL orta içeren 24 kuyulu plakalardaki birincil nöronlar için tasarlanmıştır.
- Bir doku kültürü laminar akış davlumbazında çalışarak, her kuyudan tek bir konik tüpe 500 μL orta toplayın.
- Kuyu başına, konik boruya 0,5 μL 20 μM TMRE stoğu ekleyin (örneğin, 24 kuyu için 12 μL).
- Kalan ortamı ilk kuyudan dikkatlice emiş ve 500 μL TMRE içeren ortamla değiştirin. Kalan kuyularla devam edin.
NOT: Hücrelerin kurumasına ve hücreleri rahatsız etmemeye dikkat edin.
- Hücreleri inkübatöre geri verin ve boya denge için en az 60 dakika bekleyin.
NOT: Yükleme süresi olumsuz etkileri olmadan birkaç saate kadar uzatılabilir.
- Görüntüleme deneyi boyunca tutarlı TMRE konsantrasyonları ve denge sağlamak için, görüntüleme tamponuna ve tüm stimülasyon çözeltilerine 20 nM TMRE'lik son bir konsantrasyon eklenin.
3. Tarama konfokal mikroskop ayarlarının optimizasyonu
NOT: Bu adım, canlı görüntüleme sırasında görüntü kalitesi ve hücre canlılığı arasında en iyi uzlaşmayı bulmayı amaçlamaktadır. Bu bölümde roGFP görüntüleme ayarlarının en iyi duruma getirilmesi açıklanmaktadır. Çokparametrik görüntüleme yapılırsa, ek göstergeler için ağartma veya fototoksiklik belirtisi olmadan kararlı bir taban çizgisi kontrolü de dahil olmak üzere benzer optimizasyonun yapılması gerekir.
- Konfokal mikroskobu başlatın ve GFP görüntüleme için standart ayarları yükleyin (488 nm heyecan, 505 - 550 nm emisyon).
- Dedektörü 12 bit veya 16 bit olarak ayarlayın.
NOT: Genellikle nicel görüntüleme için 8 bit yeterli değildir.
- Sıralı tarama modunu etkinleştirin ve ikinci sırayı / parçayı ekleyin (405 nm heyecan, 505 - 550 nm emisyon).
- Her iki kanal için de aşırı ve az maruz kalan pikselleri (örneğin GLOW OU) gösteren bir sahte renk arama tablosu seçin.
- İlgi çekici nesneye uygun bir hedef seçin.
NOT: 10x-40x tek hücreli analiz için, 63x-100x tek mitokondrion analizi için uygundur.
- Görüntüleme odasına hücrelerle bir kapak kapağı takın, 1 mL görüntüleme tamponu ekleyin ve odayı mikroskop üzerine yerleştirin.
- Hücreleri odaklamak için göz merceği ve iletilen ışığı kullanın.
NOT: Hücreleri bulmak ve odaklamak için epifluoresans ışığı kullanmayın. Düşük güçte bile, bu hücreleri olumsuz yönde etkileyecektir.
- Görüntüleri farklı piksel formatlarıyla kaydedin. Bu görüntülere dayanarak, ilgi çekici yapının kabul edilebilir bir çözünürlüğünü veren en düşük piksel numarasını seçin.
NOT: Genellikle, 512 x 512 piksel 20x ve 40x hedefleri olan tek hücreli görüntüleme için iyi çalışır ve 1024 x 1024 veya 2048 x2048 pikselleri genellikle 63x hedefli tek mitokondrion görüntüleme için iyi çalışır.
- Farklı iğne deliği boyutlarıyla görüntüleri kaydedin. Bu görüntülere dayanarak, ilgi çekici yapının kabul edilebilir bir çözünürlüğünü veren en büyük iğne deliği boyutunu seçin.
NOT: Tipik olarak, 3-7 havadar ünite iyi çalışır.
- Farklı lazer yoğunluklarıyla görüntüleri kaydedin.
- Dedektör kazancını ve eşiğini buna göre ayarlayın. Bu görüntülere dayanarak, kabul edilebilir sinyal yoğunluğu ve sinyal-arka plan oranı sağlayan en düşük lazer yoğunluğunu seçin.
- Sinyal-arka plan oranını belirlemek için, hücre veya mitokondri (ROI1) içeren ilgi çekici bir bölgedeki (ROI) ve hücreleri veya mitokondrilerin (ROI2) olmadığı bir yatırım getirisinde sinyal yoğunluğunu ölçün. Ardından, ROI1'in yoğunluğunu ROI2'nin yoğunluğuna bölün.
NOT: > %1-3 lazer gücü ile 405 nm heyecan için 200-1.000 200-1.000 bireysel 100-1.000 1 ve 300-1.500 bireysel RBI'lerin yoğunlukları için 488 nm'lik bir sinyal-arka plan oranı ve %1 lazer gücü ile 488 nm'lik bir ekscitasyon hedefleyin.
- Görüntüleri farklı tarama hızları ve kare ortalamalarının sayısıyla kaydedin. Ayarların her birleşimi için 4-5 görüntü kaydedin. Bu görüntü serilerine bağlı olarak, kabul edilebilir görüntü paraziti ve görüntüden görüntüye değişkenlik sağlayan en yüksek hızı ve en düşük ortalama ayarları seçin.
NOT: Ortalama için 600 Hz ve 1-2 kare tarama hızı çoğu durumda iyi çalışır.
- Yeni bir kapak kılıfı kullanarak, optimize edilmiş ayarlarla bir zaman atlamalı seri kaydedin.
NOT: Serinin süresi ve görüntü aralığı planlanan deneylere benzemelidir.
- Hızlandırılmış serinin sonunda, kayıt odasına 1 mL 2x DA çözeltisi ekleyin. Ek 2 dakika için görüntü.
- Görüntüleme tamponu peristaltik bir pompa veya el pipeti kullanarak epire edin. 1 mL 1x DTT çözümü ekleyin. Ek 5 dakika için görüntü.
- Zaman atlamalı denemeyi analiz edin (bkz. bölüm 5).
- Optimize edilmiş ayarlarla DA ve DTT tedavisi sırasında iki kanaldan hiçbirinin aşırı veya az maruz kalmadığını doğrulayın.
- Zaman atlamalı kayıt sırasında iki kanaldan hiçbirinin önemli ölçüde ağartma olmadığından emin olun; ilk ve son görüntüler arasında %<2 yoğunluk kaybı hedeflenmektedir.
- Görüntüleme sırasında 405:488 oranının önemli ölçüde değişmediğini doğrulayın.
- Sürekli olarak kabul edilebilir sonuçlar sağlayan ayarlar tanımlanana kadar, birkaç kapak kılıfı kullanarak tüm yordamı yinelemeli bir şekilde tekrarlayın.
4. Bazal redoks durumunun değerlendirilmesi
- Mikroskobu başlatın ve optimize edilmiş ayarları bölüm 3'ten yükleyin.
- Çerçeve ortalamasını 3-5 olarak ayarlayın.
- Görüntüleme odasına hücrelerle bir kapak kapağı takın, 1 mL görüntüleme tamponu ekleyin ve odayı mikroskop üzerine yerleştirin.
- Hücreleri odaklamak için göz merceği ve iletilen ışığı kullanın.
NOT: Hücreleri bulmak ve odaklamak için epifluoresans ışığı kullanmayın. Düşük güçte bile, bu hücreleri olumsuz yönde etkileyecektir.
- Tarama moduna geçin ve görüntüleme için hücreleri odaklamak ve bulmak için canlı görünümde 488 nm kanalını kullanın.
- Kapak arasında 3-5 görüş alanı seçmek için çok noktalı işlevi kullanın.
- Temel görüntü kaydedin.
- Odaya 1 mL 2x DA çözeltisi ekleyin.
- 1, 2 ve 3 dakika sonra, odağı onaylamak /ayarlamak ve ardından bir görüntü kaydetmek için canlı görünümü kullanın.
NOT: Hücreler genellikle 2 dakika sonra tamamen oksitlenir.
- Görüntüleme odasındaki tamponu 1 mL 1x DTT çözelti ile değiştirin.
- 3 ve 5 dakika sonra, odağı onaylamak / ayarlamak ve ardından bir görüntü kaydetmek için canlı görünümü kullanın.
NOT: Hücreler genellikle 4-5 dakika sonra tamamen azalır.
5. Akut tedavilerin canlı görüntülenmesi
NOT: Aşağıdaki protokolde NMDA tedavisine mitokondriyal redoks yanıtının görüntülenmesi açıklanmaktadır. Diğer tedaviler için görüntü aralıklarının ve deneme süresinin ayarlanması gerekebilir.
- Mikroskobu başlatın ve optimize edilmiş ayarları bölüm 3'ten yükleyin.
- Zaman atlama aralığını 30 s'ye ve süreyi 25 dakikaya ayarlayın.
- Görüntüleme odasına hücrelerle bir kapak kapağı takın, 1 mL görüntüleme tamponu ekleyin ve odayı mikroskop üzerine yerleştirin.
NOT: Termal odak sürüklenmesini önlemek için, zaman atlamalı görüntülemeye başlamadan önce hücreleri mikroskop aşamasında 10-15 dakika bekletin.
- Hücreleri odaklamak için göz merceği ve iletilen ışığı kullanın.
NOT: Hücreleri bulmak ve odaklamak için epifluoresans ışığı kullanmayın. Düşük güçte bile, bu hücreleri olumsuz yönde etkileyecektir.
- Tarama moduna geçin ve görüntüleme için hücreleri odaklamak ve bulmak için canlı görünümde 488 nm kanalını kullanın.
- İsteğe bağlı: Çalışma başına kaydedilen hücre sayısını artırmak için, kapak altlığı başına 2-3 görüş alanını görüntülemek için çok noktalı işlevi kullanın.
- Zaman atlamalı alıma başlayın ve 5 görüntü 2 dakikalık temel kayıt olarak kaydedin.
- Odaya 500 μL 3x NMDA çözeltisi ekleyin (son konsantrasyon 30 μM) ve 10 dakikalık NMDA yanıtı olarak ek 20 görüntü kaydedin.
NOT: Nöronlar ozmolaritedeki değişikliklere karşı çok hassastır. Bu nedenle, görüntüleme arabelleği buharlaşmasını en aza indirdiğinizi unutmayın. Daha uzun tedaviler için görüntüleme odası bir kapakla kaplanmalıdır.
- Hazneye 500 μL 4x DA çözeltisi ekleyin ve 6 görüntü daha kaydedin (3 dakika maksimum kalibrasyon).
- Tamponu görüntüleme odasından epire edin ve 1 mL 1x DTT çözelti ile değiştirin. 10 görüntü daha kaydedin (5 dakika minimum kalibrasyon).
- Kaydı sonlandırın ve görüntü serisini kaydedin.
6. Veri analizi
- FIJI'de veri alma ve görüntü ön işleme
- 4. adımdan bir görüntü grubunu veya 5. Eklentiler | tıklayın Biyo-Formatlar | Biyo-Format İthalatçısı. iletişim kutusunda Yığını görüntüle'yi kullanın: Hyperstack, Renk modunu ayarla: varsayılan, Otomatik Ölçeklendir'i seçin ve ayrı pencerelere bölmeyin.
NOT: Otomatik ölçeklendirme , verilerin bilgisayar ekranında görüntülenmesini en iyi duruma getirmektedir. Piksel yoğunluklarını değiştirmez.
- 4. adımdaki tek tek görüntüler açıldıysa, Resim | Yığınlar | Araçlar | Bunları tek bir görüntü yığınında birleştirmek için birleştirin.
- Görüntü serisi sırasında XY-drift varsa, Eklentiler | Görüntüleri kaydetmek için StackReg . iletişim kutusunda Sert Gövde veya Çeviri'yi seçin.
- Resim | tıklayarak görüntü biçimini 32 bit olarak değiştirme | yazın 32-bit.
- Görüntü |'na tıklayarak renk kanallarını ayrı pencerelere bölme Renk | Kanalları Böl.
- Kanal 1'i (405 nm) seçin ve Görüntü | tıklayarak analiz için mitokondriyi seçmek için eşiği ayarlayın | ayarlama Eşik. iletişim kutusunda Varsayılan, Kırmızı, Koyu arka plan ve Yığın histogramı'nı seçin ve seçili piksellerin kırmızı görünmesini bekleyin. Uygula'yı tıklatın. Arka Plan Piksellerini NaN Olarak Ayarla'yı seçin ve Tüm görüntüleri işleyin.
NOT: Olası gözlemci önyargısını önlemek için otomatik eşik belirleme kullanılmalıdır. FIJI, eşik iletişim kutusundaki bir açılır menüden seçilebilen çeşitli otomatik yöntemler (Varsayılan, Huang, Intermodes, Otsu gibi) sunar. Genellikle, Default yöntemi iyi bir sonuç verir. Verilen görüntü kümesi için en iyi eşik yöntemini bulmak için ilk analiz sırasında birkaç yöntemi karşılaştırmanız önerilir. Bir yöntem seçildikten sonra, tüm görüntülere uygulanması gerekir.
- Kanal 2 (488 nm) için 6.1.6 adımlarını yineleyin.
- İşlem | tıklayarak 405:488 nm oranını görselleştirmek için bir oran görüntüsü oluşturun Görüntü hesaplayıcısı. İletişim kutusunda Görüntü 1: kanal 1, İşlem: Bölme, Görüntü 2: kanal 2, Yeni pencere oluştur, Tüm görüntüleri işle'yi seçin.
- Oran görüntüsünün arama tablosunu sahte renkle değiştirin. Örneğin, Ateş olarak değiştirmek için Resim | Arama Tabloları | Ateş, ateş.
- Görüntü analizi
- Oran görüntüsünde, ROI'leri tek tek hücrelerin veya mitokondrilerin etrafına çizin. Her yatırım getirisini çizdikten sonra yatırım getirisi yöneticisine ekleyin. | Çözümle Araçlar | Yatırım Getirisi Yöneticisi | Ekle. (klavye kısayol: 'T') Tümlerini Göster'i seçin.
NOT: Arka plan pikselleri 6.1.6 ve 6.1.7 adımlarında 'sayı değil' (NaN) olarak ayarlandığı için ölçüm sonucunu etkilemez. Bu nedenle, yatırım getirisine bazı arka plan pikselleri dahil etmek kabul edilebilir.
- Tüm ROI'leri seçmek için Yatırım Getirisi Yöneticisi | ctrl+A tuşlarına tıklayarak tek tek hücrelerin 405:488 oranlarını ölçün| Daha fazla | Çok Ölçülü. iletişim kutusunda Tüm dilimleri ölç ve Dilim başına bir satır'ı seçin.
- Ölçümleri elektronik tablo yazılımına dışa aktarın.
- 405 nm görüntüyü seçin. Adım 6.2.2'de olduğu gibi tüm ROI'lerin yoğunluklarını ölçün. yatırım getirisi yöneticisinde depolanan ROI'leri kullanarak.
- Ölçümleri elektronik tablo yazılımına dışa aktarın.
- 488 nm görüntüyü seçin. Adım 6.2.2'de olduğu gibi tüm ROI'lerin yoğunluklarını ölçün. yatırım getirisi yöneticisinde depolanan ROI'leri kullanarak.
- Ölçümleri elektronik tablo yazılımına dışa aktarın.
- Tüm ROI'leri seçmek için YATıRıM Getirisi Yöneticisi | ctrl+A tuşlarına tıklayarak ROI'leri ileride başvurmak üzere kaydedin| Daha fazla | Kaydet.
- Önerilen: 405 ve 488 nm izlemelerinin zaman çizi çizilerine göre yoğunluk oluşturun. Her iki kanalda da belirgin bir ağartma olmadığını doğrulayın (görüntüleme serisinin sonundaki sinyal yoğunluğu ≥1 ilk görüntünün % 98'i olmalıdır) ve sensör yanıtları sırasında iki izin zıt yönlere doğru hareket ettiğini doğrulayın (örneğin, 488 nm iz azalırken oksidasyon sırasında 405 nm iz artmalıdır).
- Veri normalleştirme
- Oran görüntüsünden her yatırım getirisi için, DA tedavisi (Rmax) sırasında maksimum değeri ve DTT tedavisi (Rmin) sırasında minimum değeri belirleyin.
- Normalleştirilmiş oranı aşağıdaki gibi hesaplayın:

NOT: Bu, maksimum oranı 1,0'a ve minimum oranı 0 olarak ayarlar.
- Mitokondriyal morfolojinin analizi
- 6.2.6 adımındaki roGFP yoğunluklarına paralel olarak mitokondriyal morfoloji ölçümleri elde etmek için Analiz | Ölçümleri ayarlayın ve Şekil tanımlayıcılarını ve Elips sığdır'ı kontrol edin.
NOT: Ortalama yoğunluğa ek olarak, sonuçlar penceresindeki ölçümler ana eksenin uzunluğunu (Majör), küçük eksenin uzunluğunu (Minör), en boy oranını (AR; küçük eksene bölünmüş ana ekseni; yuvarlak mitokondri bir AR ~1'e, uzun mitokondriler daha büyük bir AR'ye sahiptir) ve dairesellik (Circ.) ve yuvarlaklık (Yuvarlak) ölçümlerini içerecektir.