Yöntem makalesi

Sinapslardaki yapısal ve fonksiyonel değişiklikleri görselleştirme yöntemleri

2K görüntülenme

⸱

DOI:

10.3791/63746

⸱

21 Ocak 2022

Bu makalede

Özet

TARTIŞILAN MAKALELER:

Pekarek, B. T., Hunt, P. J., Belfort, B. D. W., Liu, G., Arenkiel, B. R. CLARITY doku temizleme yoluyla sağlam nöronal dendritlerin görüntülenmesi ve miktarının belirlenmesi. Görselleştirilmiş Deneyler Dergisi: JoVE. (170), E62532 (2021).

Frankfurt, M., Bowman, R. Hipokampus ve prefrontal kortekste dendritik omurga görselleştirmesi için hızlı Golgi boyası. Görselleştirilmiş Deneyler Dergisi: JoVE. (178), E63404 (2021).

Śliwińska, M. A., Cały, A., Szymański, J., Radwańska, K. Dendritik dikenlerin incelenmesi için Seri Blok Yüz Taramalı Elektron Mikroskobu (SBEM). Görselleştirilmiş Deneyler Dergisi: JoVE. (176), E62712 (2021).

Chan, U., Gautam, D., West, A. E. Serebellar granül nöron morfolojisi ve sinaps gelişimini incelemek için in vivo doğum sonrası elektroporasyonun kullanılması. Görselleştirilmiş Deneyler Dergisi: JoVE. (172), E62568 (2021).

Cuentas-Condori, A., Miller III, D. M. Caenorhabditis elegans'ta dendritik dikenlerin görüntülenmesi. Görselleştirilmiş Deneyler Dergisi: JoVE. (175), E62676 (2021).

Editöryal

Memeli beynindeki uyarıcı sinapslarda, presinaptik olarak salınan glutamat, postsinaptik membran 1,2'ye gömülü reseptörleri aktive eder. Bu sinaptik bağlantıların gücü, çeşitli öğrenme ve hafıza biçimlerine izin veren bir özellik olan deneyime bağlı plastisiteye uğrar 3,4,5,6,7,8,9. Sinaps sayılarındaki ve sinyal özelliklerindeki patolojik değişiklikler, çok sayıda nörolojik ve psikiyatrik bozuklukta 10,11,12 görüntülenen değişmiş devre aktivitesine ve bilgi işlemeye yol açar. Bu nedenle, sinirsel bağlantıyı ve sinaptik bağlantıların gücünü yöneten altta yatan mekanizmaları anlamak için kritik bir ihtiyaç vardır.

Uyarıcı sinapslar, dendritik dikenlerde, iskele proteinleri, reseptörler, sinyal faktörleri, hücre iskeleti proteinleri ve kaçakçılık organelleri 1,2,13,14,15,16 içeren küçük postsinaptik çıkıntılar üzerinde oluşur. Bu mikron boyutundaki sinyal bölmeleri, sinaps bazında sinaps bazında sinaptik gücün kontrolüne izin verir13,16. Dendritik omurga morfolojisi, nöronal dendritlerin uzunluğu boyunca değişir ve omurga şekilleri tipik olarak ince, filopodial, güdük, mantar veya dallı13 olarak tanımlanır. Daha da önemlisi, omurga şekli sinaptik fonksiyon ve stabilite ile ilişkilidir. Örneğin, daha büyük dikenler artan sayıda reseptöre ve daha fazla sinaptik güce sahiptir 16,17,18. İnce dikenlerin aksine, daha büyük dikenler in vivo olarak aylarca kalabilir, bu da kararlı sinaptik bağlantılara ve uzun süreli bellek depolamaya izin verebilecek bir özelliktir19,20.

Bir dendrit boyunca omurga morfolojisi ve yoğunluğu, hem normal hem de hastalık durumlarında belirli bir beyin bölgesindeki nöral bağlantı derecesini ve uyarıcı sinapsların özelliklerini araştırmak için yaygın olarak izlenir13. Standart ışık ve floresan mikroskobunun yanı sıra süper çözünürlüklü ve elektron mikroskobu (EM)21 kullanılarak farklı doku preparatlarında ve model sistemlerinde omurga morfolojisini görselleştirmek için çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. Bu güçlü görüntüleme teknikleri, beyin organizasyonu, işlevi ve hastalığı hakkındaki mevcut anlayışımız hakkında muazzam bir fikir vermiştir. Bu yöntem koleksiyonu, dendritlerin ve dikenlerin morfolojik karmaşıklığını izlemek için önemli görüntüleme tekniklerinin yanı sıra dendritlerde ve tek dikenlerde nöral aktiviteyi aktive etmek ve ölçmek için optogenetik araçları içerir.

Pekarek ve ark.22 , sağlam sinir dokusunun derinliklerindeki nöronal dendritlerin yapısını görüntülemek ve ölçmek için nispeten hızlı, yüksek verimli bir protokol sunmaktadır. Yazarlar, lipitleri beyin dokusundan uzaklaştıran ve sonraki görüntüleme sırasında ışık saçılımını en aza indirmeye yardımcı olan bir doku temizleme tekniği olan Clear Lipid ile değiştirilmiş Akrilamid-hibritleştirilmiş Rigid Imaging/immün boyama/in situ hibridizasyon uyumlu Tissue-hYdrogel (CLARITY) gerçekleştirirler23. Temizlendikten sonra, floresan proteinleri eksprese eden nöronların Z-yığınları, konfokal veya iki foton mikroskobu ile toplandı. Görüntü analizi ve otomatik niceleme, omurga yoğunluğu ve şeklinin yanı sıra dendritik ağaç karmaşıklığının hassas ölçümlerine olanak sağladı. Bu protokol, tek dikenlerden dendritik ağaçlara kadar değişen yapıların aynı anda görüntülenmesine olanak tanır ve ince kesitli kesimin zaman alıcı ve potansiyel olarak zarar verici adımını ortadan kaldırır. Bu teknik, ilgilenilen gen(ler)in eklenmesini veya çıkarılmasını takiben omurga morfolojisindeki değişiklikleri ve bozulmamış beyin dokularındaki dendritik karmaşıklığı ölçmek isteyen araştırmacılar için oldukça yararlı olacaktır.

100 yılı aşkın bir süre öncegeliştirilen 24 Golgi boyama, sinir sistemi organizasyonunu ve nöronal morfolojiyi görselleştirmek için güçlü bir araç olmaya devam ediyor. Bu yöntemde, seyrek nöron popülasyonları, gümüş kromatın mikrokristalizasyonu ile boyanır ve aksonların, dendritik ağaçların ve dikenlerin25 görselleştirilmesine izin verir. Frankfurt ve Bowman26 , sıçan hipokampusu ve medial prefrontal korteksteki nöronları ve dendritik dikenleri görselleştirmek için hızlı bir Golgi emprenye protokolünü detaylandırıyor. Yazarlar, sonraki ışık mikroskobu için dokunun nasıl hazırlanacağını, boyanacağını ve görüntüleneceğini ve ayrıca dendritik ağaçlar boyunca omurga yoğunluğunun nasıl ölçüleceğini gösterir. Burada açıklanan protokol, nöronların tutarlı, güvenilir bir şekilde emprenye edilmesini sağlar ve toksik kimyasallara maruz kalmayı azaltır.

Işık ve floresan mikroskobu, dendritleri ve dikenleri görüntülemek için çok uygun olsa da, EM, sinaptik öncesi ve sonrası yapıların nanometre çözünürlüğünde görselleştirilmesine izin verir21. EM yaklaşımları tipik olarak, postsinaptik yoğunluğun boyutları ve ayrıca sinaptik veziküllerin21 sayıları ve boyutu dahil olmak üzere sinapsların ultrastrüktürel özelliklerini ölçmek için kullanılır. Bu koleksiyonda, Śliwińska ve ark.27, hipokampal fare dokusunda Serial Bkilit yüz taraması Electron Mikroskopisi (SBEM) ile üç boyutlu (3D) EM görüntüleri elde etmek için bir protokol sağlar28,29. Spesifik olarak, numunelerin nasıl hazırlanacağını, dokunun reçineye nasıl gömüleceğini, numunelerin nasıl monte edileceğini ve kırpılacağını, SBEM'in nasıl gerçekleştirileceğini ve 3D rekonstrüksiyonlar oluşturmak için görüntülerin nasıl analiz edileceğini açıklarlar. Bu protokol, iyi tanımlanmış membranlarla yüksek kontrastlı görüntüler üretir ve çeşitli doku tiplerine uyarlanabilir.

Sinir sisteminin gelişimi sırasında, sinaptik bağlantılar nöral aktivite30,31 tarafından oluşturulup rafine edildiğinden, nöronlar dramatik morfolojik değişikliklere uğrar. Gelişmekte olan serebellumdaki nöronal olgunlaşmayı izlemek için Chan ve ark.32, gelişmekte olan granül nöronların in vivo postnatal elektroporasyonu için bir protokol sağlamıştır. Burada araştırmacılar, seyrek bir nöron popülasyonunu floresan proteinlerle transfekte etmek için doğum sonrası fare yavrularının arka beynine DNA enjekte etti ve elektroporasyon yaptı. Yüksek çözünürlüklü konfokal mikroskopi ve 3D görüntüleme, araştırmacıların doğum sonrası gelişimin çeşitli aşamalarında dendritlerin ve dendritik pençelerin morfolojisini karakterize etmelerine olanak sağladı. Daha da önemlisi, bu yaklaşım, granül hücre olgunlaşmasını ve işlevini etkileyebilecek genlerin eklenmesine veya çıkarılmasına izin verebilir ve serebellar gelişim ve granül nöron olgunlaşmasını inceleyen araştırmacıların büyük ilgisini çekecektir.

Son olarak, Cuentas-Condori ve Miller33'ün protokolleri, nematoddaki GABAerjik nöronların aktivitesini incelemek için süper çözünürlüklü görüntüleme34, optogenetik35 ve kalsiyum dinamiklerinin36 canlı hücre görüntülemesini kullanır. Yazarlar, süper çözünürlüklü görüntüleme37 için donatılmış bir konfokal mikroskop kullanarak, farklı omurga şekillerinin sıklığını ölçmek için dendritlerdeki floresan proteinleri eksprese ederler. Ayrıca, yazarlar nöral fonksiyonu bir optogenetik proteinin presinaptik olarak ekspresyonu ve postsinaptik olarak bir kalsiyum göstergesinin ekspresyonu ile değerlendirirler. Terminallerin ışık aktivasyonunu takiben, bireysel dendritik dikenler içinde kalsiyum geçişleri gözlendi. Bu protokoller, son bulgular38 ile birlikte, C. elegans'ın omurga morfolojisini ve sinaptik aktiviteyi izlemek için güçlü bir model sistem olarak heyecan verici kullanımını vurgulamaktadır.

Birlikte ele alındığında, bu yöntem koleksiyonunda açıklanan protokoller, nöral yapıyı ve işlevi21 görselleştirmek için zaten zengin olan araç kutusuna eklenecektir. Bu yöntemlerin gelecekteki çalışmalarda uygulanması, muhtemelen öğrenmeyle ilgili sinaptik plastisiteyi yönlendiren süreçler ve hastalık durumlarının altında yatan hücresel mekanizmalar hakkında ek bilgiler sağlayacaktır.

Açıklamalar

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Teşekkürler

Bu el yazması hakkındaki yararlı yorumları için Shelley Newpher'a teşekkür ederiz. Bu çalışma Duke Üniversitesi ve Duke Üniversitesi'ndeki Charles Lafitte Vakfı Psikolojik ve Sinirbilim Araştırmaları Programı tarafından finanse edildi.

Kaynaklar

  1. Okabe, S. Molecular anatomy of the postsynaptic density. Molecular and Cellular Neurosciences. 34 (4), 503-518 (2007).
  2. Sheng, M., Hoogenraad, C. C. The postsynaptic architecture of excitatory synapses: a more quantitative view. Annual Review of Biochemistry. 76, 823-847 (2007).
  3. Citri, A., Malenka, R. C. Synaptic plasticity: multiple forms, functions, and mechanisms. Neuropsychopharmacology. 33 (1), 18-41 (2008).
  4. Derkach, V. A., et al. Regulatory mechanisms of AMPA receptors in synaptic plasticity. Nature Reviews. Neuroscience. 8 (2), 101-113 (2007).
  5. Herring, B. E., Nicoll, R. A. Long-term potentiation: From CaMKII to AMPA receptor trafficking. Annu Rev Physiol. 78, 351-365 (2016).
  6. Newpher, T. M., Ehlers, M. D. Glutamate receptor dynamics in dendritic microdomains. Neuron. 58 (4), 472-497 (2008).
  7. Shepherd, J. D., Huganir, R. L. The cell biology of synaptic plasticity: AMPA receptor trafficking. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 23, 613-643 (2007).
  8. Malenka, R. C., Bear, M. F. LTP and LTD: an embarrassment of riches. Neuron. 44 (1), 5-21 (2004).
  9. Nicoll, R. A. A Brief History of Long-Term Potentiation. Neuron. 93 (2), 281-290 (2017).
  10. Blanpied, T. A., Ehlers, M. D. Microanatomy of dendritic spines: emerging principles of synaptic pathology in psychiatric and neurological disease. Biological Psychiatry. 55 (12), 1121-1127 (2004).
  11. Penzes, P., et al. Dendritic spine pathology in neuropsychiatric disorders. Nature Neuroscience. 14 (3), 285-293 (2011).
  12. Newpher, T. M., et al. Regulation of spine structural plasticity by Arc/Arg3.1. Seminars in Cell & Developmental Biology. 77, 25-32 (2018).
  13. Bourne, J. N., Harris, K. M. Balancing structure and function at hippocampal dendritic spines. Annual Review of Neuroscience. 31, 47-67 (2008).
  14. Hotulainen, P., Hoogenraad, C. C. Actin in dendritic spines: connecting dynamics to function. The Journal of Cell Biology. 189 (4), 619-629 (2010).
  15. Kennedy, M. J., Ehlers, M. D. Organelles and trafficking machinery for postsynaptic plasticity. Annual Review of Neuroscience. 29, 325-362 (2006).
  16. Nishiyama, J., Yasuda, R. Biochemical Computation for Spine Structural Plasticity. Neuron. 87 (1), 63-75 (2015).
  17. Holtmaat, A. J., et al. Transient and persistent dendritic spines in the neocortex in vivo. Neuron. 45 (2), 279-291 (2005).
  18. Matsuzaki, M., et al. Structural basis of long-term potentiation in single dendritic spines. Nature. 429 (6993), 761-766 (2004).
  19. Kasai, H., et al. Structure-stability-function relationships of dendritic spines. Trends in Neurosciences. 26 (7), 360-368 (2003).
  20. Hayashi-Takagi, A., et al. Labelling and optical erasure of synaptic memory traces in the motor cortex. Nature. 525 (7569), 333-338 (2015).
  21. Arenkiel, B. R., Ehlers, M. D. Molecular genetics and imaging technologies for circuit-based neuroanatomy. Nature. 461 (7266), 900-907 (2009).
  22. Pekarek, B. T., et al. Imaging and quantification of intact neuronal dendrites via CLARITY tissue clearing. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (170), (2021).
  23. Chung, K., et al. Structural and molecular interrogation of intact biological systems. Nature. 497 (7449), 332-337 (2013).
  24. Pannese, E. The Golgi stain: invention, diffusion and impact on neurosciences. Journal of the History of the Neurosciences. 8 (2), 132-140 (1999).
  25. Gabbott, P. L., Somogyi, J. The 'single' section Golgi-impregnation procedure: methodological description. Journal of Neuroscience Methods. 11 (4), 221-230 (1984).
  26. Frankfurt, M., Bowman, R. Rapid Golgi stain for dendritic spine visualization in hippocampus and prefrontal cortex. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (178), (2021).
  27. Sliwinska, M. A., et al. Serial Block-Face Scanning Electron Microscopy (SBEM) for the Study of Dendritic Spines. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (176), (2021).
  28. Wanner, A. A., Kirschmann, M. A., Genoud, C. Challenges of microtome-based serial block-face scanning electron microscopy in neuroscience. Journal of Microscopy. 259 (2), 137-142 (2015).
  29. Smith, D., Starborg, T. Serial block face scanning electron microscopy in cell biology: Applications and technology. Tissue & Cell. 57, 111-122 (2019).
  30. Reichardt, L. F. Neurotrophin-regulated signalling pathways. Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B. Biological Sciences. 361 (1473), 1545-1564 (2006).
  31. Kolodkin, A. L., Tessier-Lavigne, M. Mechanisms and molecules of neuronal wiring: a primer. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 3 (6), (2011).
  32. Chan, U., Gautam, D., West, A. E. Utilizing in vivo postnatal electroporation to study cerebellar granule neuron morphology and synapse development. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (172), (2021).
  33. Cuentas-Condori, A., Miller, D. M. Imaging dendritic spines in Caenorhabditis elegans. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (175), (2021).
  34. Jacquemet, G., et al. The cell biologist's guide to super-resolution microscopy. Journal of Cell Science. 133 (11), (2020).
  35. Rajasethupathy, P., Ferenczi, E., Deisseroth, K. Targeting Neural Circuits. Cell. 165 (3), 524-534 (2016).
  36. Lin, M. Z., Schnitzer, M. J. Genetically encoded indicators of neuronal activity. Nature Neuroscience. 19 (9), 1142-1153 (2016).
  37. Huff, J. The Airyscan detector from ZEISS: confocal imaging with improved signal-to-noise ratio and super-resolution. Nature Methods. 12, (2015).
  38. Cuentas-Condori, A., et al. C. elegans neurons have functional dendritic spines. eLife. 8, (2019).

Yeniden basım ve izinler

Daha fazla makale keşfet

Synapse VisualizationStructural ChangesNeuronal DendritesCLARITY Tissue ClearingGolgi StainDendritic SpineHippocampusPrefrontal CortexSerial Block-Face Scanning Electron MicroscopySBEMCerebellar Granule NeuronsSynapse DevelopmentCaenorhabditis ElegansImaging Techniques