Klorofil floresansı kullanılarak düşük CO2 ile muamele edildikten sonra bitkilerde fotosentetik verimlilikteki değişiklikleri ölçmek için bir yaklaşım tanımladık.
Yöntem makalesi
Klorofil floresansı kullanılarak düşük CO2 ile muamele edildikten sonra bitkilerde fotosentetik verimlilikteki değişiklikleri ölçmek için bir yaklaşım tanımladık.
Fotosentez ve fotorespirasyon, bitki primer metabolizmasındaki en büyük karbon akışlarını temsil eder ve bitki hayatta kalması için gereklidir. Fotosentez ve fotorespirasyon için önemli olan enzimlerin ve genlerin birçoğu on yıllardır iyi çalışılmıştır, ancak bu biyokimyasal yolakların bazı yönleri ve bunların birkaç hücre altı süreçle olan etkileşimleri henüz tam olarak anlaşılamamıştır. Bitki metabolizmasında önemli olan genleri ve proteinleri tanımlayan çalışmaların çoğu, fotosentez ve fotorespirasyonun doğal ve tarım ortamlarında nasıl çalıştığını en iyi şekilde temsil etmeyebilecek oldukça kontrollü ortamlar altında gerçekleştirilmiştir. Abiyotik stresin fotosentetik verimliliğin bozulmasına neden olduğu göz önüne alındığında, hem abiyotik stresi hem de fotosentez üzerindeki etkisini izleyebilen yüksek verimli bir ekranın geliştirilmesi gereklidir.
Bu nedenle, klorofil floresan analizi ve düşük CO2 taraması kullanarak fotorespirasyonda rolleri olan karakterize edilmemiş genleri tanımlayabilen fotosentetik verimlilikte abiyotik strese bağlı değişiklikleri taramak için nispeten hızlı bir yöntem geliştirdik. Bu yazıda, Arabidopsis thaliana'da transfer edilen DNA (T-DNA) nakavt mutantlarında fotosentetik verimlilikteki değişiklikleri incelemek için bir yöntem açıklanmaktadır. Aynı yöntem, etil metansülfonat (EMS) kaynaklı mutantların taranması veya baskılayıcı taramanın yapılması için de kullanılabilir. Bu yöntemin kullanılması, bitki primer metabolizması ve abiyotik stres yanıtlarında daha fazla çalışma için gen adaylarını belirleyebilir. Bu yöntemden elde edilen veriler, artan stres ortamlarına maruz kalana kadar tanınmayabilecek gen fonksiyonu hakkında fikir verebilir.
Çiftçi tarlalarında yaygın olarak görülen abiyotik stres koşulları, fotosentetik verimliliği azaltarak mahsul verimini olumsuz yönde etkileyebilir. Isı dalgaları, iklim değişikliği, kuraklık ve toprak tuzluluğu gibi zararlı çevresel koşullar, CO2 kullanılabilirliğini değiştiren ve bir bitkinin yüksek ışık stresine tepkisini azaltan abiyotik streslere neden olabilir. En büyük iki karasal karbon akışı, bitki büyümesi ve mahsul verimi için gerekli olan fotosentez ve fotoresolunumdur. Bu süreçlerde yer alan önemli proteinlerin ve enzimlerin birçoğu laboratuvar koşullarında karakterize edilmiş ve genetik seviye1'de tanımlanmıştır. Fotosentez ve fotorespirasyonun anlaşılmasında çok ilerleme kaydedilmesine rağmen, bitki organelleri arasındaki taşıma da dahil olmak üzere birçok adım karakterize edilmemiştir 2,3.
Fotosentezden sonra bitkilerdeki en büyük ikinci karbon akışı olan fotorespirasyon, Rubisco enziminin karbondioksit yerine oksijeni ribuloz 1,5 bisfosfata (RuBP) sabitleyerek inhibitör bileşik 2-fosfoglikolat (2PG) 1'i üretmesiyle başlar. 2PG'nin inhibitör etkilerini en aza indirmek ve daha önce sabitlenmiş karbonu geri dönüştürmek için, C3 bitkileri çok organellar fotorespirasyon sürecini geliştirmiştir. Fotorespirasyon, 2PG'nin iki molekülünü, C3 karbon fiksasyon döngüsü1'e tekrar girebilen bir 3-fosfogliserat (3PGA) molekülüne dönüştürür. Böylece, fotorespirasyon, daha önce sabitlenmiş karbonun sadece% 75'ini 2PG üretiminden dönüştürür ve süreçte ATP tüketir. Sonuç olarak, fotorespirasyon işlemi, su mevcudiyetine ve büyüme mevsimi sıcaklıklarına bağlı olarak, fotosentetik işlem üzerinde% 10 -% 50'lik önemli bir sürüklenmedir4.
Fotorespirasyonda yer alan enzimler on yıllardır araştırma odağı olmuştur, ancak en az 25 taşıma adımısürece dahil olmasına rağmen, genetik düzeyde sadece az sayıda taşıma proteini karakterize edilmiştir 5,6,7. Fotorespirasyon sürecinde üretilen karbonun hareketine doğrudan dahil olan iki taşıma proteini, her ikisi de kloroplast 5,6'dan glikolat ihracatında rol oynayan plastidik glikolat / gliserat taşıyıcı PLGG1 ve safra asidi sodyum simporter BASS6'dır.
Ortam [CO2] altında, Rubisco bir oksijen molekülünü RuBP'ye zamanın yaklaşık% 20'sinde sabitler1. Bitkiler düşük [CO 2] 'ye maruz kaldığında, fotorespirasyon oranları artar, bu da düşük [CO2] 'yi, yüksek fotorespirasyon stresi altında önemli olabilecek mutantları test etmek için ideal bir ortam haline getirir. 24 saat boyunca düşük CO2 altında ek varsayılan kloroplast taşıma proteini T-DNA hatlarının test edilmesi ve klorofil floresansındaki değişikliklerin ölçülmesi, fotorespirasyon mutant fenotip5'i gösteren bass6-1 bitki hatlarının tanımlanmasına yol açmıştır. Daha ileri karakterizasyon, BASS6'nın kloroplastın iç zarında bir glikolat taşıyıcı olduğunu göstermiştir.
Bu makale, başlangıçta BASS6'yı kloroplast zarı içinde bulunan varsayılan taşıma proteinlerinin bir listesinden gelen bir fotorespirasyon taşıyıcısı olarak tanımlamak için kullanılana benzer bir protokolü ayrıntılı olarak açıklamaktadır8 Bu protokol, Arabidopsis T-DNA mutantlarını veya EMS tarafından üretilen mutant bitkileri, ısı gibi bir dizi abiyotik stres altında fotosentetik verimliliği korumak için önemli olan genleri tanımlamanın bir yolu olarak karakterize eden yüksek verimli bir deneyde kullanılabilir. yüksek ışık stresi, kuraklık ve CO2 kullanılabilirliği. Klorofil floresansı kullanarak bitki mutantlarının taranması, geçmişte primer metabolizma için önemli olan genleri hızlı bir şekilde tanımlamak için kullanılmıştır9. Arabidopsis genomunun% 30'u bilinmeyen veya zayıf karakterize edilmiş fonksiyona sahip proteinleri kodlayan genleri içerdiğinden, fotosentetik verimliliğin strese bağlı analizi, mutant bitkilerde kontrollü koşullar altında gözlenmeyen moleküler fonksiyonlar hakkında fikir verebilir10. Bu yöntemin amacı, düşük CO2 taraması kullanarak fotorespiratuar yolun mutantlarını tanımlamaktır. Düşük CO2'ye maruz kaldıktan sonra fotorespirasyonu bozan mutantları tanımlamak için bir yöntem sunuyoruz. Bu yöntemin bir avantajı, nispeten kısa sürede yapılabilecek fideler için yüksek verimli bir tarama olmasıdır. Video protokolü bölümleri, tohum hazırlama ve sterilizasyonu, bitki büyümesi ve düşük CO2 arıtma, floresan görüntüleme sisteminin konfigürasyonu, işlenmiş numunelerin kuantum veriminin ölçülmesi, temsili sonuçlar ve sonuçlar hakkında ayrıntılı bilgi sağlar.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. Tohum hazırlama ve sterilizasyon
NOT: Tohum hazırlama, tohum imbibleme ve tohum sterilizasyonundan oluşur. Tüm bu adımların steril koşulları korumak için laminer bir akış davlumbazında gerçekleştirileceğine dikkat etmek önemlidir. Gerekli tüm malzemeler, reaktifler ve büyüme ortamları otoklavlanmalıdır ( bkz.
2. Bitki büyümesi ve düşük CO2 arıtımı
3. Floresan görüntüleme sisteminin yapılandırılması
4. Kuantum verim programını tasarlayın
5. İşlenmiş numunelerin kuantum veriminin ölçülmesi
6. Veri dosyasını açma
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Sonuçlar, WT ve test mutantlarının ortam ve düşük CO2 taramasından ham ve floresan görüntülerin plaka görüntülerini göstermektedir. Her plantlet, QY olarak verilen karşılık gelen floresan okumaları ile alan numarası ile etiketlenir. Veriler metin dosyası olarak dışa aktarılır ve analiz için bir elektronik tabloda açılabilir (bkz. Ek Tablo S1). Fotorespiratuar stres ile ilişkili genlerin pozitif ve negatif tanımlanmasını göstermek için plgg1-1 ve abcb26 mutant hatları seçildi....
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu makalede özetlenen deneysel yöntemler bazı avantajlar ve sınırlamalarla birlikte gelir. Bir avantaj, bu yöntemin birçok bitki fidesini tarayabilmesidir, ancak kaplama ve yetiştirme işlemi sırasında bitki ortam plakasının kirlenmesini önlemek için bazı önlemler alınmalıdır. Bu nedenle, Arabidopsis plakalarını cerrahi bantla kapatmak çok önemlidir. Bu deneyin bir diğer avantajı, daha önceyayınlanan 8 çalışmasına kıyasla 12 saatlik daha kısa bir fotorespiratuar stres süresine sahip olmasıdır. Teda...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarların rakip finansal çıkarları veya çıkar çatışmaları yoktur.
Bu araştırma Louisiana Regents Kurulu (AWD-AM210544) tarafından finanse edilmiştir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| 1.5 mL mikrosantrifüj tüpü | VWR | 10810-070 | tohum sterilizasyonu için |
| kap | agaroz VWR | 9012-36-6 | kaplama kolaylığı için tohumları askıya almak için kullanılan kimyasal |
| Arabidopsis thaliana tohumlar (abcb26) | ABRC, TAIR aracılığıyla sipariş edilen www.arabidopsis.org | SALK_085232 | arabidopsis tohumları deney grubu |
| olarak kullanıldıArabidopsis thaliana tohumları (plgg1-1) | ABRC, TAIR www.arabidopsis.org aracılığıyla sipariş edilen SALK_053469C | ebeveyn arabidopsis tohumları | |
| Arabidopsis thaliana tohumları (WT) | ABRC, TAIR aracılığıyla sipariş edilen www.arabidopsis.org | Col-0 | arabidopsis yabani türü tohumlar kontrol grubu olarak kullanılır |
| çamaşır suyu | Clorox | Jenerik Çamaşır Suyu | Tohumları sterilize etmek için kullanılan kimyasal |
| Karbolime emici | Medline ürünleri | S232-104-001 | CO2 emici |
| Kapalı FluorCam | Foton Sistemleri Enstrümanlar | FC 800-C | Floresan görüntüleyici |
| FluoroCam FC 800-C | Foton Sistemleri Aletleri | Kapalı FluorCam FC 800-C/1010-S | Floresan görüntüleyici |
| FluoroCam7 | Foton Sistemleri Aletleri | Kapalı FluorCam FC 800-C/1010- S | Floresan görüntü analiz yazılımı |
| Gelzan (bitki agar) | Phytotech labs | 71010-52-1 | MS ortamını plakalar halinde katılaştırmak için kullanılan kimyasal |
| cam şişe 1 L | Fisherbrand | FB5011000 | kabı MS medya büyüme odası yapmak ve otoklavlamak için |
| odası | caron | 7317-50-2 | bitki yetiştirmek için kullanılır |
| Murashige & Skoog Bazal Ortam Vitaminler ve Vitaminler İçeren 1.0 g/L MES (MS) | Phytotech labs | M5531 | Arabidopsis fidanları için büyüme ortamı |
| potasyum Hidroksit (KOH) | Phytotech labs | 1310-58-3 | ph ayarı örümcek ışıkları için 1 M'lik bir çözelti oluşturur |
| Mean Well Enterprises | XLG-100-H-AB | ışıkları | |
| Izgaralı Kare Petri Kabı, steril | Simport Scientific | D21016 | arabidopsis fideleri için MS ortamını tutmak için kullanılır, |
| cerrahi bant | 3M | 1530-1 | bant, 20 biorad arası plakaları kapatmak için kullanılır |
| ; 9005-64-5 | Tohum sterilizasyonuna yardımcı olmak için kullanılan yüzey aktif madde |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste