Yöntem makalesi

Kardiyak Fonksiyonun Görüntülenmesi ve Optogenetik Kontrolü için Drosophila melanogaster Modellerinin Geliştirilmesi

DOI:

10.3791/63939

⸱

25 Ağustos 2022

 ,  ,  ,  ,  , 
1Department of Biomedical Engineering, Washington University in St. Louis, 2Department of Computer Science and Engineering, Washington University in St. Louis

Bu makalede

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Mevcut protokol, OCT görüntüleme ve optogenetik kalp pacing için kalpte eNpHR2.0 veya ReaChR opsinlerini eksprese eden Drosophila melanogaster'in oluşumunu tanımlamaktadır. Farklı gelişim aşamalarında canlı hayvanlarda restore edilebilir kalp durması, bradikardi ve taşikardi simülasyonu da dahil olmak üzere Drosophila OCT görüntüleme ve kalp atışı modülasyonu için ayrıntılı talimatlar bildirilmiştir.

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Drosophila melanogaster'nin (meyve sineği) model organizma olarak kullanılması, hücresel organizasyon ve genomik araştırmalardan davranışsal çalışmalara kadar biyoloji biliminin birçok alanında önemli ilerlemeler sağlamıştır. Biriken bilimsel bilgi birikimi nedeniyle, son yıllarda, Drosophila, kalp rahatsızlıkları da dahil olmak üzere insan hastalıklarının modellenmesi alanına getirildi. Sunulan çalışma, kırmızı ışık (617 nm) kullanan ve invaziv prosedürler olmadan bütün bir canlı organizma bağlamında kalp fonksiyonunu izlemek ve manipüle etmek için deneysel sistemi açıklamaktadır. Optogenetik araçlar kullanılarak kalp üzerinde kontrol sağlandı. Optogenetik, ışığa duyarlı transgenik opsinlerin ekspresyonunu ve ilgilenilen biyolojik dokuyu düzenlemek için optik aktivasyonlarını birleştirir. Bu çalışmada, 3. instar larva ve erken pupa gelişim evrelerinde işleyen D. melanogaster kalbini görselleştirmek ve modüle etmek için özel entegre optik koherens tomografi (OCT) görüntüleme ve optogenetik stimülasyon sistemi kullanılmıştır. UAS / GAL4 ikili genetik sistemi, özellikle sinek kalbinde, halorhodopsin (eNpHR2.0) ve kırmızıya kaymış kanalrodopsini (ReaChR) eksprese etmek için kullanıldı. D. melanogaster'in canlı OCT görüntüleme ve optogenetik pacing için hazırlanması ile ilgili ayrıntılar verilmiştir. Laboratuvar tarafından geliştirilen bir entegrasyon yazılımı, Drosophila kalp fonksiyonunun görsel sunumlarını ve nicel özelliklerini oluşturmak için görüntüleme verilerini işledi. Sonuçlar, eNpHR2.0 aktivasyonunun neden olduğu kalp durması ve bradikardi başlatmanın ve ReaChR aktivasyonu üzerine kalp pacing yapmanın fizibilitesini göstermektedir.

Giriş

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

2010 yılının sonunda, Nature Methods dergisi optogenetiğiYılın Yöntemi 1 olarak seçti. İlgilenilen biyolojik dokuları benzeri görülmemiş bir hassasiyet ve hızla kontrol etmek için ışıkla düzenlenen genetik araçların (transgenik opsinler) kullanılması, yeni uygulamalar için bir sel kapısı açtı. Bugüne kadar, başarıların çoğu sinirbilime aittir. Teknoloji, tek nöronların hassas kontrolü için yeni bir yöntem olarak tanıtıldı2 ve canlı organizma bilişsel işlevleri alanındaki keşiflereilerledi 3. En başından beri, sinirbilimciler tüm organizmanın davranışını modüle etme yeteneğini gösterdiler. Farelerde dopaminerjik nöronlarda ChR2 opsin'in ekspresyonu ve ışık aktivasyonu aktivasyonlarına neden oldu ve davranışsal koşullanmayı sürdürmek için yeterliydi4. Kemirgen beyninin epileptik odağına verilen halorhodopsin NpHR2.0 içeren nöronların bir alt kümesinin optogenetik inhibisyonu elektroensefalografik nöbetlerin zayıflamasına neden olmuştur5.

Kardiyolojide optogenetik uygulamalar istikrarlı bir hızla gelişmektedir6. ChR2, kardiyomiyositler hücre kültüründe ve farelerde başarıyla eksprese edildi; kalp hızı, mavi ışığın yanıp sönmesiyle gerçekleştirildi (canlı hayvanlarda implante edilmiş bir lif kullanılarak gerçekleştirildi)7. Zebra balığında, ChR2 eksprese edildi ve hız yapan kalp bölgesini tanımlamak için kullanıldı; NpHR aktivasyonuna bağlı kalp durması8. Optogenetik kardiyak pacing, yeni pacing ve resenkronizasyon tedavileri geliştirmek için eşsiz bir potansiyele sahiptir9. Son zamanlarda otojen aritmi sonlandırma sistemi kurma girişimleri de bildirilmiştir10.

Kapsamlı araştırmalar ve yeni terapötik tedavilerin geliştirilmesi, hücre kültüründen memelilere kadar çeşitli model sistemlerin uygulanmasını gerektirir. Bir omurgalının kalbi çok karmaşık bir organdır. Kardiyomiyositler (CM) tüm kalp hücrelerinin üçte birini oluşturur; diğer hücreler arasında nöronlar, vasküler düz kas hücreleri ve uyarılamayan hücreler (yani, endotel hücreleri, fibroblastlar ve bağışıklık hücreleri) bulunur. CM hücre kültürünün araştırılması, elde edilen sonuçların insan tıbbi uygulamalarına çevrilmesini sınırlar. Memeli model organizmaların genetik manipülasyonları sınırlıdır ve zaman alıcıdır. Daha küçük omurgasız modellerin birçok avantajı vardır; kardiyovasküler sistemleri tüm gerekli histolojik unsurları taşır. Drosophila melanogaster (meyve sineği), kalp hastalıkları da dahil olmak üzere insan hastalıklarıyla ilişkili genlerin rolünü araştırmak için basit ve güçlü bir genetik model sistemidir11,12,13. Kısa ömürlü hayvanlar olarak, meyve sinekleri yaşam boyunca izlenebilen yaşa veya hastalığa bağlı kardiyak fonksiyon değişikliklerini modellemek için mükemmel bir fırsatı temsil eder14,15,16,17. Meyve sineğinin kalp tüpü, vücudunun sırt tarafında, kütikül yüzeyinin 200 μm içinde bulunur ve yakın kızılötesi ışığın kalp tüpüne ulaşmasına izin verir. Bu anatomik özellik, mevcut optogenetik araçları kullanarak Drosophila kalbinin invaziv olmayan optik temposunu sağlar.

Drosophila kalbini izlemek için, entegre kırmızı ışık LED uyarma modülüne sahip özel bir spektral-alan optik koherens tomografi (SD-OCT) görüntüleme sistemi geliştirilmiştir18. Nispeten basit bir meyve sineği kalbindeki morfolojik ve ritmik değişiklikler, bu non-invaziv biyomedikal görüntüleme teknolojisi ile kolayca analiz edilebilir 12,19,20,21. Gelişmiş optik kesitleme performansı ve mikron ölçeğinde uzamsal çözünürlük ile OCT, Drosophila kalbinin yapısını araştırmak ve 3. instar larva ve erken pupa18 dahil olmak üzere farklı gelişim aşamalarındaki işlevini izlemek için başarıyla kullanılmıştır. Bu sistem aynı zamanda Drosophila'nın bozulmamış hayvandaki kalp durumunun eşzamanlı olarak izlenmesini ve uyarılmasını sağlar. OCT sisteminin şematik görünümü Şekil 1'de gösterilmiştir. SD-OCT sistemi, ışık kaynağı olarak bir süperlüminesan diyot (SLD) kullanır (merkez dalga boyu: 850 nm ± 10 nm, FWHM: 165 nm, bakınız Malzeme Tablosu). 10x objektif lens kullanarak, OCT görüntüleme sistemi havada ~ 4.4 μm ve dokuda ~ 3.3 μm'lik bir eksenel çözünürlük ve ~ 2.8 μm'lik bir yanal çözünürlük elde edebilir, bu da sinek kalp yapılarının ince ayrıntılarını çözmek için yeterlidir18,22. Referans kolundan ve örnek koldan yansıyan ışığın parazit sinyalleri, 2048 piksel çizgi tarama kameralı bir spektrometre kullanılarak algılanır (maksimum çizgi hızı: 80 kHz, bkz. Ölçülen sistem hassasiyeti ~ 95.1 dB'dir. Her B modu OCT taraması, xz görüntü düzleminde kesitsel bir görüntü oluşturur. Tekrarlanan B modu görüntüleri, ~ 30 s 18,22,23'ün üzerinde atan kalbi yakalayan M modu görüntüleri oluşturmak için aynı yerde elde edilir. M modu görüntüleme için kare hızı, meyve sineği kalp atış dinamiklerini yakalamak için yeterli olan ~ 125 kare / s'dir.

Drosophila kalp fonksiyonunun optogenetik regülasyonu için, 617 nm LED ışık kaynağına sahip bir aydınlatma modülü, SD-OCT sisteminin örnek koluna entegre edilmiştir. Stimülasyon ışığı, numune yüzeyindeki ~ 2,2 mm çapında bir noktaya, görüntüleme odak noktasıyla aynı konumda odaklanır. Aydınlatma modunu (ışık yoğunluğu, darbe genişliği ve görev döngüsü) kontrol etmek, ışık darbesi stimülasyon frekansını ayarlamak ve LED modül aydınlatmasını ve M modu OCT görüntüleme alımını senkronize etmek için özel olarak yazılmış bir yazılım kullanılır22.

Son yayınlar, UAS / GAL4 genetik sistemini kullanarak mekansal olarak düzenlenmiş ChR2, ReaChR ve eNpHR2.0 opsinlerinden oluşan Drosophila transgenik sistemini tanımladı. Elde edilen sonuçlar, eNpHR2.0'ın kırmızı ışık aktivasyonunun neden olduğu kalp durması ve bradikardi ve ChR2'nin mavi ışık aktivasyonunun neden olduğu daha yüksek frekanslı kalp temposunu başlatma yeteneğini göstermiştir. Benzer pacing deneyleri, kırmızı ışık aydınlatması22,23,24 ile indüklenebilen başka bir channelrhodopsin olan ReaChR ile gerçekleştirildi. Tarif edilen tüm deneylerdeki opsin ekspresyonu, opsin ekspresyonunun kardiyomiyositler ve çevresindeki kas hücreleri de dahil olmak üzere çok çeşitli dokularda gözlendiği 24B-GAL4 tarafından yönlendirildi. Bu çalışmada, kalbe özgü eNpHR2.0 ve ReaChR opsins ekspresyonunu elde etmek için 24B-GAL4 bir Hand-GAL4 sürücüsü ile değiştirildi.

Genel olarak, sunulan deneysel sonuçlar restore edilebilir kalp durması ve indüklenebilir bradikardi ve taşikardi kalp rahatsızlıklarını göstermektedir. Transgenik Drosophila modelleri oluşturma ve canlı hayvanlarda eşzamanlı OCT görüntüleme ve optogenetik pacing deneyleri yapma konusunda adım adım talimatlar içeren ayrıntılı bir protokol sağlanmaktadır.

Protokol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu çalışmada eNpHR2.0 transgenik hat w[*]; P{y[+t7.7] w[+mC]=UAS-eNpHR-YFP}attP2, ReaChR transgenik çizgi w[*]; P{y[+t7.7] w[+mC]=UAS-ReaChR}su(Hw)attP5/CyO ve El geni düzenleyici fragmanı içeren kalbe özgü GAL4 sürücüsü w[1118]; P{y[+t7.7] w[+mC]=GMR88D05-GAL4}attP2/TM3 Sb[1] (bu sürücü stoğu Hand-GAL4 olarak belirtilecektir) kullanılmıştır. y[*] w[*]; GFP muhabir satırı olarak P{w[+mC]=UAS-2xEGFP}AH3 kullanılmıştır. Söz konusu Drosophila stokları Bloomington Drosophila Stok Merkezi'nden (BDSC, bakınız Malzeme Tablosu) elde edilmiş ve standart mısır unu ortamında oda sıcaklığında veya 18 °C'de muhafaza edilmiştir. Bu çalışmada geliştirilen Drosophila modelleri, işbirlikçi çalışma için talep üzerine mevcuttur.

1. Drosophila genetik haçları ve medya hazırlığı

  1. 3. kromozom dengeleyici TM3 Sb[1] 'yi TM6 Sb Tb olarak değiştirin, w [1118] oluşturun; P{y[+t7.7] w[+mC]=GMR88D05-GAL4}attP2/TM6 Sb Tb (Hand-GAL4/TM6 Sb Tb). Geçiş şeması için Ek Şekil 1'e bakınız. Haçları normal mısır unu ortamı ile şişelere yerleştirin.
    NOT: Bir Tb işaretleyicisinin varlığı, kullanıcıların opsin transgeni içeren larva ve pupaları ve GAL4 sürücüsünü opsin içeren hayvanlardan ayırt etmelerini sağlar, ancak sürücü25 içermez.
  2. Genetik haçları, larva toplama için 5 gün ve pupa toplama için 6 gün boyunca karanlıkta özel olarak formüle edilmiş all-trans retinaI (ATR) içeren ortam üzerinde 25 °C, %70 nem inkübatöründe tutun ( Malzeme Tablosuna bakınız).
  3. Şişe başına beş Hand-GAL4 / TM6 Sb Tb bakire dişi ve UAS-opsin stoklarından (eNpHR2.0 veya ReaChR) iki ila üç erkeği birleştirin. Sırasıyla Şekil 2A ve Şekil 2B'deki eNpHR2.0 ve ReaChR opsin için çapraz diyagrama bakın.
  4. Ertesi gün, ATR içeren medya şişeleri hazırlayın.
    1. BDSC26'nın talimatlarına göre Yarı Tanımlı Yiyecekler hazırlayın. Sakkaroz ve glikoz yerine, sadece sakkaroz (5.14 g / 100 mL) ekleyin. Sürekli karıştırarak ~ 60 ° C'ye kadar soğutun.
    2. Dar sinek şişeleri hazırlayın ve her şişeye 50 μL 100 mM ATR-etanol çözeltisi ekleyin.
    3. Serolojik bir pipet kullanarak, sinek şişelerini daraltmak için sinek yiyeceklerini atın, şişe başına 5 mL. 10 s için maksimum hızda vorteks.
    4. Şişeleri takın ve ışıktan korumak için koyu renkli kumaşa sarın. Şişeleri en az 12 saat (gece boyunca) kurumaya bırakın.
  5. Ertesi gün, sinekleri Adım 1.3'ten sürekli olarak yumurta bırakarak aktarın. ATR içeren gıdalara sahip şişelere (Adım 1.4.4.). Rafları şişelerle ışıktan koruyun.
  6. 24-48 saat sonra (döşenen yumurta sayısına bağlı olarak), şişenin aşırı popülasyonunu önlemek için ebeveynleri atın.
  7. Tb olmayan soyları toplayın ve kalp görüntülemesi için kullanın.
    NOT: Larva ve pupa evrelerindeki fenotipik farklılıklar Şekil 2C'de gösterilmiştir. Numune hazırlama adımlarının özeti ve yaklaşık zaman çizelgesi Şekil 3'te gösterilmiştir.

2. Drosophila kalbinin optogenetik kontrolü

  1. Şişeden UAS-opsin / Hand-GAL4 larva / pupa'yı seçin (Adım 1.7.), mendil üzerine koyun ve bir boyama fırçası kullanarak ortamı vücut yüzeyinden nazikçe silin.
  2. Mikroskop slaytını hazırlayın ve ortasına küçük bir çift taraflı bant parçası yerleştirin.
  3. Bir fırça veya ince cımbız kullanarak, larva / pupa'yı sırt tarafı yukarı ve slaytın uzun tarafına dik olacak şekilde bant yüzeyine yavaşça yerleştirin. Larva / pupa'yı bant yüzeyine tutturmak için hafif basınç uygulayın.
  4. Kaydırmayı görüntüleme aşamasında, larva / pupa aşağı bakacak şekilde ayarlayın.
  5. Lazer kontrol yazılımı ile OCT ışık kaynağını açın (bkz. Özel olarak yazılmış SD-OCT kontrol yazılımını açın, ardından Önizleme penceresine tıklayın.
  6. SD-OCT yazılımında tarama parametrelerini ayarlayın.
    NOT: Amaç, atan kalbin optimum görüntülenmesi için numuneyi hizalamaktır, bu nedenle X aralığı ve Y aralığı seçildiğinde kalbin bölgesi kapsanır. Bu adımda, hem A-tarama hem de B-tarama sayısı 400'dür. X ve y yönlerindeki aralık ~490 μm ve ~537 μm'dir ve kalbin iki ortogonal kesitini (xz ve yz) gösterir.
  7. Sinek kalbini odak noktasına getirmek için numune aşamasını kontrol etmek için mikromanipülatörler kullanın. Sinek kütikülü yüzeyinden ışık yansımasını en aza indirmek için odak konumunu ayarlayın. Yansımayı en aza indirmek için larva / pupa yüzeyine mineral yağ uygulamayı düşünün.
    NOT: Yağ, bant yapıştırıcı özelliklerinden ödün vererek hayvan hareketi riskini artırabilir.
  8. Sinek kalbinin görüntü penceresinde herhangi bir bozulma, doku tarafından engellenme ve ihmal edilemez gölgeler ve yansımalar olmadan tam olarak görülebilmesini sağlayın; aksi takdirde, Adım 2.7'ye geri dönün.
  9. M modu OCT görüntü alma için tarama parametrelerini ayarlayın.
    NOT: A-tarama sayısı Adım 2.7'ye kıyasla daha azdır. sinek kalbinin atış dinamiklerini yakalamak için daha hızlı kare hızı için (birkaç Hz). B-tarama sayısı, kayıt süresine ve kullanılabilir sistem belleğine göre ayarlanabilen M modu görüntüleme için tekrarlanan karelerin sayısını gösterir. Bu deneyde, 128 A-taraması ~ 125 kare / sn hıza izin verebilir ve ~ 32 s'lik sürekli bir kayıt sağlayan 4.000 tekrarlanan B-taraması kaydedilir.
  10. Dinlenme kalp atış hızını (RHR) hesaplamak için kırmızı ışık stimülasyon darbeleri olmadan beş kontrol verisi kümesi alın.
  11. Özel OCT kontrol yazılımında hız stimülasyonu için ışık darbesini tasarlayın. "Ayarlar" da, farklı stimülasyon protokollerine göre darbe frekansını, darbe genişliğini, stimülasyon süresini ve bekleme süresini kontrol etmek için tasarlanmış ışık darbesi dizilerini ekleyin.
    NOT: RHR, ışık aydınlatması olmadan kontrol deneyinden ölçülür ve taşiklik ve bradikat deneyleri22 için ışığın hangi frekansta yanıp sönmesi gerektiğini hesaplamak için kullanılır.
  12. Kırmızı ışık darbeleri oluşturmak için ışık kontrol cihazı yazılımını açın (bkz. Malzeme Tablosu). " Mod Seçimi " nde Darbe Modunu seçin. "Darbe Profili" ayarları için rakama çift tıklayın ve Takipçi Modu'nu seçin. KAPALI yoğunluğunu 0 olarak tutun ve gerçek güç yoğunluğunu hesaplarken AÇIK yoğunluk yüzdesini ayarlayın.
    NOT: Stimülasyon ışığı darbeleri, Adım 2.12'deki ayarlara göre OCT kontrol yazılımından gelen bir sinyalle tetiklenir.
  13. OCT kontrol yazılımında Acquire (Elde Et) seçeneğine tıklayarak atan Drosophila kalbinin ışık stimülasyonlu M-mode videolarını edinin . Ölçümleri 5x tekrarlayın.

3. Görüntü analizi

  1. Özel olarak geliştirilmiş sinek kalbi segmentasyon yazılımını açın.
  2. Dosya Seç'e tıklayın ve ardından görünen GUI'de analiz edilecek dosyayı seçin.
  3. Kalp bölgesinin hem dikey hem de yatay sınırlarını üstteki metin kutularına piksel cinsinden girin. Yeniden Boyutlandır'a tıklayın. Alttaki kaydırıcıyı kullanarak tüm kalp bölgesinin görünür olduğundan ve tüm koleksiyon için tüm kutuyu doldurduğundan emin olun. Değilse, bu işlemi tekrarlayın ve sınırları ayarlayın.
  4. Kalp bölgesini tahmin etmek için Tahmin Et'e tıklayın. Program şimdi koleksiyondaki her dilimden geçecek ve yaklaşık 3 dakika sürecek şekilde kalp bölgesini seçecek.
  5. Tahmin tamamlandıktan sonra İK Grafiği'ne tıklayın. Bu, zaman içinde kalp bölgesinin bir grafiğini gösteren yeni bir pencere açacaktır. Doğru tepe veya vadi alanlarının seçildiğinden emin olun. Son bir rakam oluşturmak için Pulse'u ve ardından HR'yi seçin ve işlevsel parametreler aynı anda .csv dosyalarına kaydedilecektir.

Sonuçlar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Kalp tüpünde kırmızı ışığa duyarlı opsinler eNpHR2.0 veya ReaChR'yi eksprese eden D. melanogaster hayvanları, her UAS-opsin transgenik hattı ile Hand-GAL4 sürücüsü arasındaki haçtan soy elde edilerek üretildi. GAL4 sürücüsünün doku özgüllüğü GFP ekspresyonu görüntülenerek doğrulandı (Şekil 4). Drosophila 3. instar larva ve erken pupa gelişim aşamaları, kırmızı ışıkla eNpHR2.0 ve ReaChR aktivasyonunun etkilerini göstermek için kullanıldı. LED tarafından verilen ~ 617 nm kırmızı ışık darbeleri tasarlandı, larva / pupa'yı aydınlattı ve kalpteki eNpHR2.0 ve ReaChR'yi aktive etti. NpHR'nin bildirilen maksimum yanıt dalga boyu ~ 580 nm ve ReaChR'nin ~ 600 nm olmasına rağmen, 617 nm ışık aydınlatması, opsin eksprese eden kalp dokusuna doğru gelişmiş ışık enerjisi iletimi ile daha derine nüfuz edebilir22.

Ters çevrilmiş mikroskop kurulumunda dorsal tarafı aşağı bakacak şekilde mikroskop kaydırağına monte edilen larva / pupa, A7 vücut segmentine yönlendirilen bir LED ışık demeti ile aydınlatıldı. Vücut kesit görüntülerinin örnekleri Şekil 5A ve Şekil 6A'da gösterilmiştir. Kalp, 4.000 kareden oluşan video kayıtlarında kasılan ve genişleyen dairesel bir şekil olarak görünür (Ek videolar 1-6). Farklı kalp rahatsızlıklarını taklit etmek için, dört tip ışık darbesi tasarlandı. 5 s bekleme süresinden sonra 10 s süren tek bir nabız, Şekil 5B'de gösterildiği gibi eNpHR2.0 tarafından indüklenen restore edilebilir kalp durması üretti. eNpHR2.0'ın aracılık ettiği dinlenme kalp atış hızından (RHR) daha yavaş frekanslardaki kalp atış hızı için, aralarında 6 sn bekleme süresi olan RHR / 2 ve RHR / 4'e eşit tempo frekanslarına sahip iki ışık darbesi dizisi kullanılmıştır (Şekil 5C). Her ışık darbesi dizisinin görev döngüsü% 90 idi. Bu hafif stimülasyon rejimi, bradikardiye benzeyen bir kalp rahatsızlığına neden oldu. ReaChR aktivasyonu nedeniyle kalp atış hızını artırmak için stimülasyon paterni, sırasıyla RHR + 0.5 Hz, RHR + 1 Hz ve RHR + 1.5 Hz frekanslarında, 20 ms nabız genişliğine sahip üç ışık darbesi dizisinden oluşuyordu (Şekil 5D). Bu nabız rejimi taşikardik kalp rahatsızlığına neden olmayı amaçlıyordu. Işık gücü yoğunluğu tüm deneyler sırasında 7.49 mW /mm2 idi. Kontrol deneyleri için ışık aydınlatması ayarlanmadı.

Her deneysel varyant beş kez kaydedildi. Sinek kalbinin M modu videoları, FlyNet 2.027 kullanılarak 2D maskelere işlendi. Bu yazılım, kalp fonksiyonu veri kümelerini üretmek için kalp bölgesini otomatik olarak bölümlere ayırır. Program, her karede, kalp atış hızı (HR), diyastolik son boyut (EDD) ve sistolik sonu boyutu (ESD), fraksiyonel kısalma (FR), diyastolik sonu alanı (EDA), son sistolik alan (ESA) gibi atan kalbin fonksiyonel parametrelerinin doğru bir şekilde ölçülmesini sağlamak için gerekirse manuel olarak daha da düzeltilebilen bir kalp maskesi sağlar. Kalp atış hızı, kalp bölgesini zaman içinde analiz ederek ölçülür. Işık darbesi olmayan kontrol videosu, her hayvan için bir temel kalp atış hızı (örneğin, RHR) oluşturmak için kullanılır.

Şekil 5B ve Şekil 6B, larva ve pupada sırasıyla kırmızı ışık (617 nm) kullanan Hand>eNpHR2.0 aktivasyonunun neden olduğu 10 s uzunluğundaki kalp durmasını göstermektedir. Kırmızı ışık yandığında, Drosophila'nın kalbi atmayı bıraktı ve ışık aydınlatmasının sonuna kadar bu durumda kaldı. Kırmızı ışık kapatıldıktan sonra kalp fonksiyonu geri yüklendi. Opsin eksprese edilmeyen hayvanlar ("opsin" kontrolü yok) kırmızı ışık aydınlatmasına cevap vermedi (Ek Şekil 2A ve Ek Şekil 3A). 10 s kırmızı ışık aydınlatmasının açılmadığı Hand>eNpHR2.0 hayvanlarıyla yapılan kontrol deneyleri ("ışık yok" kontrolü), kalbin normal şekilde attığını gösterdi (Ek Şekil 4A ve Ek Şekil 4C).

Hand>eNpHR2.0 hayvanları kullanılarak, RHR'den daha düşük frekanslarda kırmızı ışık darbeleri uygulandı. Işık sinyallerini takiben kalp kasılma frekansı azaldı; Bu daha yavaş kalp atış hızı, bir tür kalp aritmisini, bradikardiyi taklit eder (larva ve pupa için sırasıyla Şekil 5C ve Şekil 6C). Daha yavaş kalp temposu "opsin yok" (Ek Şekil 2B ve Ek Şekil 3B) ve "ışık yok" (Ek Şekil 4A ve Ek Şekil 4C) kontrol deneylerinde gözlenmedi.

Kalp atış hızlarının arttırılması , Hand>ReaChR opsin'in kırmızı ışıklı darbe trenleri ile verilen hayvanın RHR'sinden daha yüksek bir frekansta aktive edilmesiyle sağlanabilir. Hand>ReaChR larvaları ve pupa kalplerine farklı stimülasyon frekanslarında (örneğin, RHR + 0.5 Hz, RHR + 1 Hz, RHR + 1.5 Hz) bir dizi üç ışık darbe treni uygulandı. Elde edilen veriler, ışık darbelerini takiben artmış kalp atış hızını açıkça göstermektedir (larva ve pupa için sırasıyla Şekil 5D ve Şekil 6D ). Bu deneylerde gösterilen kalp rahatsızlığı taşikardiyi taklit eder. Negatif kontrol deneyleri Ek Şekil 2C, Ek Şekil 3C ve Ek Şekil 4B, D'de gösterilmiştir.

Genel olarak, sonuçlar D. melanogaster'in transgenik hayvan modellerinde çeşitli gelişim aşamalarında kalp ritminin non-invaziv ve spesifik optogenetik kontrolünün fizibilitesini göstermektedir.

figure-results-1
Şekil 1: Drosophila kalp fonksiyonunun optogenetik kontrolü için 617 nm LED modülü ile entegre OCT görüntüleme sistemi . Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-2
Şekil 2: Kalpte opsin eksprese eden D. melanogaster hayvanlarının üretilmesi. (A) Genetik çapraz diyagram. Hand-GAL4/TM6 SbTb dişileri eNpHR2.0 taşıyan erkeklere geçti. Elde edilen Hand-GAL4 / eNpHR2.0 soyu (kırmızı yıldız ile işaretlenmiş) OCT görüntüleme için toplandı ve Hand-GAL4 / TM6 Sb Tb, fenotipik görünümlerine göre atıldı. (B) Genetik çapraz diyagram. Hand-GAL4/TM6 SbTb dişileri ReaChR taşıyan erkeklere geçti. Elde edilen Hand-GAL4 / ReaChR soyu (kırmızı yıldız ile işaretlenmiş) OCT görüntüleme için toplandı ve Hand-GAL4 / TM6 Sb Tb fenotipik görünümlerine göre atıldı. (C) Hand-GAL4/opsin (kırmızı yıldız) ve Hand-GAL4/TM6 Tb soyu arasındaki fenotipik farklar. TM6 kromozomunda Tb gen mutasyonunu taşıyan hayvanlar, normal, Tb olmayan larva veya pupaya kıyasla "tubby" vücut şekline sahiptir. Sol panel larvaları gösterir; sağ panel erken pupaları gösterir. Görüntüler ayrıca 1 mm işaretli bir cetvel içerir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-3
Şekil 3: Görüntüleme hazırlama prosedürlerinin şematik sunumu ve zaman çizelgesi. Ebeveyn stokları sinek şişelerinde tutulur; bakire dişiler ve erkekler, normal yiyeceklerle dolu dar şişelerde (sarı renkle gösterilir) çaprazlanır. Aktif olarak yumurtlayan sinekler, ATR içeren ortamlara (kahverengi olarak gösterilmiştir) şişelere aktarılır. Gelişmekte olan soyu olan şişelerin bu adımdan karanlıkta tutulması gerekir. 3. instar larvaları ve erken pupalar görüntüleme için flakon duvarlarından toplanır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-4
Şekil 4: Hand-GAL4 (BDSC 48396) tarafından tahrik edilen UAS-GFP'YI (BDSC 6658) ifade eden D. melanogaster erken pupa. Floresan desen, Hand-GAL4 sürücüsünün kalbe özgüllüğünü doğrular. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-5
Şekil 5: D. melanogaster larvalarında kalp durması, bradikardi ve taşikardi simülasyonu. (A) Larva gövdesi kesitinin OCT görüntüsü. Kalp, vücut yüzeyinin altında bir daire olarak görünür. (B) Geri yüklenebilir kalp durmasının grafik sunumu. Üst panel, kırmızı ışık aydınlatmasının zamanlamasını (X ekseni) gösterir (Y ekseni, ışık kaynağı güç seviyesi yüzdesi). Orta panel, kalp alanındaki (Y ekseni, mikrometre kare) zamanla (X ekseni) değişimi gösterir. Alt panel, kalp atış hızının zaman içindeki değişimini (Y ekseni, hertz) gösterir (X ekseni). (C) eNpHR2.0 aracılı restore edilebilir bradikardisinin grafik sunumu. Üst panel, iki bradikardi periyoduna neden olan kırmızı ışık aydınlatmasının darbelerini gösterir: RHR'nin% 50'si ve RHR'nin% 25'i. Kalp alanı ve kalp atış hızı değişiklikleri sırasıyla orta ve alt panellerde gösterilir. (D) Aktif ReaChR ile kalp hızının grafik sunumu. Üst panel, RHR + 0,5 Hz, RHR + 1 Hz ve RHR + 1,5 Hz frekanslarında meydana gelen bir dizi 20 ms kırmızı ışık darbesini gösterir. Kalp kasılmaları, orta ve alt panellerde gösterildiği gibi ışık darbesi frekanslarını takip eder. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-6
Şekil 6: D. melanogaster pupasında kalp durması, bradikardi ve taşikardi simülasyonu . (A) Pupa vücut kesitinin OCT görüntüsü. Kalp, vücut yüzeyinin altında bir daire olarak görünür. (B) Geri yüklenebilir kalp durmasının grafik sunumu. Üst panel, kırmızı ışık aydınlatmasının zamanlamasını (X ekseni) gösterir (Y ekseni, ışık kaynağı güç seviyesi yüzdesi). Orta panel, kalp alanındaki (Y ekseni, mikrometre kare) zamanla (X ekseni) değişimi gösterir. Alt panel, kalp atış hızının zaman içindeki değişimini (Y ekseni, hertz) gösterir (X ekseni). (C) eNpHR2.0 aracılı restore edilebilir bradikardisinin grafik sunumu. Üst panel, iki bradikardi periyoduna neden olan kırmızı ışık aydınlatmasının darbelerini gösterir: RHR'nin% 50'si ve RHR'nin% 25'i. Orta ve alt paneller sırasıyla kalp alanı ve kalp atış hızı değişikliklerini gösterir. (D) Aktif ReaChR ile kalp hızının grafik sunumu. Üst panel, RHR + 0,5 Hz, RHR + 1 Hz ve RHR + 1,5 Hz frekanslarında bir dizi 20 ms kırmızı ışık darbesi gösterir. Kalp kasılmaları, orta ve alt panellerde gösterildiği gibi ışık darbesinin frekanslarını takip eder. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Ek Şekil 1: TM3 Sb dengeleyici kromozomunu TM6 Sb Tb ile değiştirmek için genetik haçlar. Bakire dişiler Hand-GAL4 w+/ TM3 Sb nub-GAL4NP3537 tub-GAL80ts w+/ TM6 Sb Tb erkeklerle çaprazlandı. Bakire dişiler ve erkekler de dahil olmak üzere Hand-GAL4 w+/ TM6 Sb Tb soyu seçildi (tubby vücut şekli ile birlikte pigmentli gözlerin taranması). Seçilen sinekler istikrarlı bir stok oluşturmak için kendiliğinden geçti. Bu Dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Şekil 2: Kontrol deneylerinde, vahşi tip (wt) larvaların kalp ritmi kırmızı ışık aydınlatması üzerine değişmez. (A) Larvalarda kırmızı ışık aydınlatması sırasında kalp durması gözlenmedi. Üst panelde M modu kalp görüntüleri gösterilir. Kırmızı çizgi aydınlatma zamanlamasını gösterir. Orta ve alt paneller, 32 s görüntüleme süresi boyunca kalp bölgesini ve kalp atış hızlarını gösterir. (B,C) Kırmızı ışık darbeleri wt larvalarında kalp atış hızlarını değiştirmez. Üst paneller M modu kalp görüntülerini gösterir. Kırmızı çizgi aydınlatma zamanlamasını gösterir. Orta ve alt paneller, 32 s görüntüleme süresi boyunca kalp bölgesini ve kalp atış hızlarını gösterir. Bu Dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Şekil 3: Kontrol deneylerinde, vahşi tip (wt) pupa'nın kalp ritmi kırmızı ışık aydınlatması üzerine değişmez. (A) Larvalarda kırmızı ışık aydınlatması sırasında kalp durması gözlenmedi. Üst panelde M modu kalp görüntüleri gösterilir. Kırmızı çizgi aydınlatma zamanlamasını gösterir. Orta ve alt paneller, 32 s görüntüleme süresi boyunca kalp bölgesini ve kalp atış hızlarını gösterir. (B,C) Kırmızı ışık darbeleri wt pupadaki kalp atış hızlarını değiştirmez. Üst paneller M modu kalp görüntülerini gösterir. Kırmızı çizgi aydınlatma zamanlamasını gösterir. Orta ve alt paneller, 32 s görüntüleme süresi boyunca kalp bölgesini ve kalp atış hızlarını gösterir. Bu Dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Şekil 4: El>eNpHR2.0 veya El>ReaChR'yi ifade eden D. melanogaster larvaları ve pupaları, kırmızı ışık aydınlatması olmadan OCT görüntüleme sırasında önemli İK değişiklikleri göstermez. (A) Hand>eNpHR2.0 larvalarının kalp atış hızları. (B) Hand>ReaChR larvalarının kalp atış hızları. (C) Hand>eNpHR2.0 pupasının kalp atış hızları. (D) Hand>ReaChR pupa'nın kalp atış hızları. Bu Dosyayı indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Video 1: Aktif eNpHR2.0, D. melanogaster larvalarında kalp durmasına neden olur. Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Video 2: Aktif eNpHR2.0, D. melanogaster pupa'da kalp durmasına neden olur. Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Video 3: D. melanogaster larvalarında eNpHR2.0 aracılı restore edilebilir bradikardi. Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Video 4: D. melanogaster pupasında eNpHR2.0 aracılı restore edilebilir bradikardi. Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Video 5: D. melanogaster larvalarında aktif ReaChR ile kalp temposu. Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.

Ek Video 6: D. melanogaster pupasında aktif ReaChR ile kalp temposu. Bu videoyu indirmek için lütfen tıklayınız.

Tartışma

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Opsinlerin ekspresyonunun sadece kalpte değil, aynı zamanda çevredeki kas dokularında da sürüldüğü önceki raporlarımızla karşılaştırıldığında, mevcut çalışma kalbe özgü bir sürücü olan Hand-GAL4 kullanılarak rapor edilmektedir. Optogenetik kalp regülasyonu için kullanılan bu yeni El > opsin genetik konfigürasyonu, daha önce bildirilen sonuçları doğrular ve daha iyi bir Drosophila kardiyovasküler araştırma modeli oluşturur.

Medya hazırlığı, deneylerin başarısı için esastır. Opsin proteinleri,28'in çalışması için bir ligand, all-trans retinal (ATR) gerektirir. Sinekler yeterli ATR üretmez, bu nedenle ATR'nin sinek ortamına eklenmesi gerekir. Bu çalışmada, daha önce bildirilen hazır gıda, Yarı Tanımlı medya29 ile değiştirilmiştir. ATR'nin eşit bir şekilde dağıtılmasını sağlamak için ATR içeren ortamın yeni tarifi tanıtıldı. ATR suda çözünmez; su bazlı ortama etanol bazlı 100 mM ATR stoğu eklendiğinde, sıcak Yarı Tanımlı ortam içeren şişelerin vorteklenmesiyle dağılır. Ayrıca, daha önce bildirilen ATR konsantrasyonu, eNpHR2.0 için 10 mM'den ve ReaChR22 için 3 mM'den her ikisi için de 1 mM'lik bir nihai konsantrasyona düşürüldü. Bu konsantrasyon, uygun eNpHR2.0 ve ReaChR fonksiyonunu sağlamak için yeterlidir.

Deneysel başarının hayati bir bileşeni, FlyNet 2.027 ile geliştirilmiş veri işlemedir. Laboratuvar, otomatik sinek kalp segmentasyon algoritmasının hem hesaplama verimliliğini hem de doğruluğunu artırmak için bu yazılımı geliştirmeye devam etti. Bu yazılım tarafından üretilen kesitsel maskeler, fraksiyonel kısalma ve kalp duvarı hızı gibi Drosophila fizyolojik verilerini elde etmek için kullanılır. Bu yaklaşım, minimum insan gözetimi ile verimli veri analizini mümkün kılarak büyük sinek kalp görüntüleme veri kümeleri için kalp fonksiyonunu karakterize etmeyi daha hızlı ve daha güvenilir hale getirmiştir.

Miyokard enfarktüsü önde gelen ölüm nedeni olmaya devam etmektedir ve miyokard iskemisi, Amerika Birleşik Devletleri'nde önde gelen mortalite ve morbidite nedenleri arasında hızla ortaya çıkan tüm kalp yetmezliği vakalarının üçte ikisine katkıda bulunmaktadır30. Yeni terapötiklerin ve tıbbi cihazların geliştirilmesi, kalp hastalıklarının fizyolojik ve biyokimyasal düzeylerdeki mekanizmaları hakkında derin bilgi gerektirir. Bu hedeflere model organizmaların yardımıyla ulaşılabilir. D. melanogaster, en güvenilir ve verimli modellerden biri olarak kendini kanıtlamıştır 31,32,33,34,35. Bu çalışma, invaziv olmayan bir optogenetik yaklaşımın neden olduğu simüle edilmiş Drosophila kalp bozuklukları modellerini üretti. Non-invaziv optik kalp pacing teknolojilerinin geliştirilmesi, geleneksel elektrikli kalp pacing cihazlarına bir alternatif geliştirmek için bir temel oluşturmaktadır. Kalp fonksiyonunu gerçek zamanlı olarak gözlemlemek için OCT'nin kullanılması, çalışmaların ilaç adayı taraması da dahil olmak üzere ileri araştırmalar için Drosophila modellerinde ilgili kalp fizyolojisini doğru bir şekilde karakterize etmesini sağlar. OCT görüntüleme, Drosophila kalp çalışmaları için iyi çalışan, ancak daha büyük hayvan modellerinde kalp fonksiyonunu karakterize etmek için kullanımını sınırlayan ~ 1 mm'lik bir penetrasyon derinliğine sahiptir. Ayrıca, Drosophila araştırmasını doğrudan memeli modellerine çevirmek bir meydan okumayı temsil ediyor. Kardiyovasküler araştırmalar için opsinlerin hassasiyetini artırmak ve bunları zebra balığı, fareler, sıçanlar ve insan kalp organoidleri de dahil olmak üzere çeşitli model sistemlere çevirmek için yeni optogenetik araçların geliştirilmesi gerekmektedir.

Açıklamalar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyleri yoktur.

Teşekkürler

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarlar, Andrey Komarov, Yuxuan Wang ve Jiantao Zhu'ya veri analizindeki yardımları için teşekkür ediyor ve değerli tartışmaları için Zhou laboratuvar üyelerine teşekkür ediyor. Dr. Zhou'nun laboratuvarındaki çalışmalar, St. Louis'deki Washington Üniversitesi'nden bir başlangıç fonu, Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) R01-EB025209 ve R01-HL156265 ve Clayco Vakfı Yenilikçi Araştırma Ödülü ile desteklendi.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
All-trans retinalCayman Kimyasalları18449
Bacto PeptoneGibco02-10-2025
BioLED Işık Kaynağı Kontrol Modülü, 4 kanallıMigtex SistemleriBLS-SA04-USOptogenetik stimülasyon modülünün bir parçası
Geniş Bant Işık Kaynağı ModülüSuperlumcBLMD-T-850-HPSD-OCT görüntüleme sistemi
Cobra-S'nin bir parçası 800 Ekim Spektrometreler  Wasatch PhotonicsCS800-840/180-80-OC2K-U3SD-OCT görüntüleme sisteminin bir parçası
Hassas Görev SilecekleriKimberly-Clark Professtional34155dokular
Drosophila agarGenesee Scientific66-103
Drosophila kültür şişeleriGenesee Scientific32-131
FlyNet 2.0 YazılımıZ-LabZhou laboratuvarında geliştirilen sinek kalp segmentasyonu ve kalp fonksiyon analizi için özel yazılım
Yüksek Güçlü LED Kolimatör KaynaklarıMigtex SistemleriBLS-LCS-0617-03-22Optogenetik stimülasyon modülünün bir parçası
Aktif olmayan kuru mayaGenesee Scientific62-106
Mikroskop slaytlarıAmScopeBS-72P
Drosophila kültürü Genesee için dar tapalar Scientific59-200
Drosophila kültürü için dar şişelerGenesee Scientific32-116SB
Drosophila şişeleri için
Propiyonik AsitSigmaP1386-1L
Zhou laboratuvarında geliştirilen görüntü elde etme ve ilerleme hızı kontrolü için özel yazılım
SD-OCT görüntüleme ve optogenetik ilerleme hızı sistemiZ-LabGörüntüleme ve optogenetik ilerleme hızı sistemi Zhou laboratuvarında geliştirilen (~ 50 bin $ BOM)
SucroseCarolina89-2871
w [*]; P{y[+t7.7] w[+mC]=UAS-eNpHR-YFP}attP2Bloomington Drosophila Stok Merkezi (BDSC)stok # 41752eNpHR2.0 transgenik hat
w[*]; P{y[+t7.7] w[+mC]=UAS-ReaChR}su(Hw)attP5/CyOBloomington Drosophila Stok Merkezi (BDSC)stok # 53748ReaChR transgenik hat
w[1118]; P{y[+t7.7] w[+mC]=GMR88D05-GAL4}attP2/TM3 Sb[1]Bloomington Drosophila Stock Center (BDSC)stock # 48396El geni düzenleyici fragmanı içeren kalbe özgü GAL4 sürücüsü
y[*] w[*]; P{w[+mC]=UAS-2xEGFP}AH3Bloomington Drosophila Stok Merkezi (BDSC)stok #6658GFP muhabir hattı
Maya özüLaboratuvarı Bilimsel bioKEMIX978-907-4243
kalıcı çift taraflı bant Scotch Fişler Genesee Scientific 59-194 SD-OCT kontrol yazılımı Z-Lab

Kaynaklar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Nature Methods. Method of the Year 2010. Nature Methods. 8, 1(2011).
  2. Boyden, E. S., Zhang, F., Bamberg, E., Nagel, G., Deisseroth, K. Millisecond-timescale, genetically targeted optical control of neural activity. Nature Neuroscience. 8 (9), 1263-1268 (2005).
  3. Deisseroth, K. Optogenetics: 10 years of microbial opsins in neuroscience. Nature Neuroscience. 18 (9), 1213-1225 (2015).
  4. Tsai, H. -C. Phasic firing in dopaminergic neurons is sufficient for behavioral conditioning. Science. 324 (5930), 1080-1084 (2009).
  5. Wykes, R. C., et al. Optogenetic and potassium channel gene therapy in a rodent model of focal neocortical epilepsy. Science Translational Medicine. 4 (161), (2012).
  6. Entcheva, E., Kay, M. W. Cardiac optogenetics: a decade of enlightenment. Nature Reviews Cardiology. 18 (5), 349-367 (2021).
  7. Bruegmann, T., et al. Optogenetic control of heart muscle in vitro and in vivo. Nature Methods. 7 (11), 897-900 (2010).
  8. Arrenberg, A. B., Stainier, D. Y. R., Baier, H., Huisken, J. Optogenetic control of cardiac function. Science. 330 (6006), 971-974 (2010).
  9. Nussinovitch, U., Gepstein, L. Optogenetics for in vivo cardiac pacing and resynchronization therapies. Nature Biotechnology. 33 (7), 750-754 (2015).
  10. Nyns, E. C. A., et al. An automated hybrid bioelectronic system for autogenous restoration of sinus rhythm in atrial fibrillation. Science Translational Medicine. 11 (481), (2019).
  11. Bier, E., Bodmer, R. Drosophila, an emerging model for cardiac disease. Gene. 342 (1), 1-11 (2004).
  12. Wolf, M. J., Amrein, H., Izatt, J. A., Choma, M. A., Reedy, M. C., Rockman, H. A. Drosophila as a model for the identification of genes causing adult human heart disease. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103 (5), 1394-1399 (2006).
  13. Yu, L., Lee, T., Lin, N., Wolf, M. J. Affecting rhomboid-3 function causes a dilated heart in adult Drosophila. PLOS Genetics. 6 (5), 1000969(2010).
  14. Cooper, A. S., Rymond, K. E., Ward, M. A., Bocook, E. L., Cooper, R. L. Monitoring heart function in larval Drosophila melanogaster for physiological studies. Journal of Visualized Experiments. (33), e1596(2009).
  15. Zhu, Y. C., Yocom, E., Sifers, J., Uradu, H., Cooper, R. L. Modulatory effects on Drosophila larva hearts: Room temperature, acute and chronic cold stress. Journal of Comparative Physiology. B, Biochemical, Systemic, and Environmental Physiology. 186 (7), 829-841 (2016).
  16. Zhu, Y. C., Uradu, H., Majeed, Z. R., Cooper, R. L. Optogenetic stimulation of Drosophila heart rate at different temperatures and Ca2+ concentrations. Physiological Reports. 4 (3), 12695(2016).
  17. Malloy, C., et al. Using optogenetics to assess neuroendocrine modulation of heart rate in Drosophila melanogaster larvae. Journal of Comparative Physiology. A, Neuroethology, Sensory, Neural, and Behavioral Physiology. 203 (10), 791-806 (2017).
  18. Men, J., et al. Drosophila preparation and longitudinal imaging of heart function in vivo using optical coherence microscopy (OCM). Journal of Visualized Experiments. (118), e55002(2016).
  19. Choma, M. A., Izatt, S. D., Wessells, R. J., Bodmer, R., Izatt, J. A. In vivo imaging of the adult Drosophila melanogaster heart with real-time optical coherence tomography. Circulation. 114 (2), 35-36 (2006).
  20. Li, A., et al. Changes in the expression of the Alzheimer's disease-associated presenilin gene in drosophila heart leads to cardiac dysfunction. Current Alzheimer Research. 8 (3), 313-322 (2011).
  21. Li, A., et al. Silencing of the Drosophila ortholog of SOX5 in heart leads to cardiac dysfunction as detected by optical coherence tomography. Human Molecular Genetics. 22 (18), 3798-3806 (2013).
  22. Men, J., Li, A., Jerwick, J., Li, Z., Tanzi, R. E., Zhou, C. Non-invasive red-light optogenetic control of Drosophila cardiac function. Communications Biology. 3 (1), 1-10 (2020).
  23. Alex, A., Li, A., Tanzi, R. E., Zhou, C. Optogenetic pacing in Drosophila melanogaster. Science Advances. 1 (9), 1500639(2015).
  24. Stanley, C. E., Mauss, A. S., Borst, A., Cooper, R. L. The effects of chloride flux on Drosophila heart rate. Methods and Protocols. 2 (3), 73(2019).
  25. Lindsley, D. L., Zimm, G. G. The Genome of Drosophila melanogaster. , Elsevier. (1992).
  26. Bloomington Drosophila Stock Center. , Available from: https://bdsc.indiana.edu/information/recipes/germanfood.html (2022).
  27. Dong, Z., et al. FlyNet 2.0: Drosophila heart 3D (2D + time) segmentation in optical coherence microscopy images using a convolutional long short-term memory neural network. Biomedical Optics Express. 11 (3), 1568-1579 (2020).
  28. Deisseroth, K. Optogenetics. Nature Methods. 8 (1), 26-29 (2011).
  29. Backhaus, B., Sulkowski, E., Schlote, F. W. A semi-synthetic, general-purpose medium for Drosophila melanogaster. Drosophila Information Service. 60, 210-212 (1984).
  30. Benjamin, E. J., et al. Heart disease and stroke statistics-2019 update: A report from the American Heart Association. Circulation. 139 (10), 56(2019).
  31. Wolf, M. J., Rockman, H. A. Drosophila, genetic screens, and cardiac function. Circulation Research. 109 (7), 794-806 (2011).
  32. Choma, M. A., Suter, M. J., Vakoc, B. J., Bouma, B. E., Tearney, G. J. Physiological homology between Drosophila melanogaster and vertebrate cardiovascular systems. Disease Models & Mechanisms. 4 (3), 411-420 (2011).
  33. Ocorr, K., Vogler, G., Bodmer, R. Methods to assess Drosophila heart development, function and aging. Methods [Supplement to Methods in Enzymology]. 68 (1), 265-272 (2014).
  34. Ugur, B., Chen, K., Bellen, H. J. Drosophila tools and assays for the study of human diseases. Disease Models & Mechanisms. 9 (3), 235-244 (2016).
  35. Rotstein, B., Paululat, A. On the morphology of the Drosophila heart. Journal of Cardiovascular Development and Disease. 3 (2), 15(2016).

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

Drosophila Heart ModelsOCT ImagingHeart PacingRed Light StimulationChannelrhodopsin ActivationHalorhodopsin ExpressionUAS GAL4 SystemCardiac Arrhythmia Models

İlgili makaleler