Burada, gen ekspresyon analizleri yapmak için insan yumurtalık foliküllerinin dondurulmuş-çözülmüş kortikal dokudan nasıl izole edileceğini özetleyen bir protokol açıklıyoruz.
Yöntem makalesi
* These authors contributed equally
Burada, gen ekspresyon analizleri yapmak için insan yumurtalık foliküllerinin dondurulmuş-çözülmüş kortikal dokudan nasıl izole edileceğini özetleyen bir protokol açıklıyoruz.
Yumurtalık, farklı hücre tiplerinden oluşan heterojen bir organdır. Folikülogenez sırasında meydana gelen moleküler mekanizmaları incelemek için, proteinlerin lokalizasyonu ve gen ekspresyonu sabit doku üzerinde gerçekleştirilebilir. Bununla birlikte, bir insan folikülündeki gen ekspresyon seviyelerini doğru bir şekilde değerlendirmek için, bu karmaşık ve hassas yapı izole edilmelidir. Bu nedenle, Woodruff'un laboratuvarı tarafından daha önce tarif edilen uyarlanmış bir protokol, folikülleri (oosit ve granüloza hücreleri) çevrelerinden ayırmak için geliştirilmiştir. Yumurtalık kortikal dokusu ilk önce iki araç kullanılarak küçük parçalar elde etmek için manuel olarak işlenir: bir doku dilimleyici ve bir doku doğrayıcı. Doku daha sonra en az 40 dakika boyunca% 0.2 kollajenaz ve% 0.02 DNaz ile enzimatik olarak sindirilir. Bu çürütme adımı 37 °C ve %5 CO2'de gerçekleştirilir ve her 10 dakikada bir ortamın mekanik pipetlenmesi eşlik eder. İnkübasyondan sonra, izole edilmiş foliküller, mikroskop büyütme altında kalibre edilmiş bir mikrokapiller pipet kullanılarak manuel olarak toplanır. Doku parçalarında foliküller hala mevcutsa, prosedür manuel mikrodiseksiyon ile tamamlanır. Foliküller bir kültür ortamında buz üzerinde toplanır ve fosfat tamponlu tuzlu su çözeltisi damlacıkları içinde iki kez durulanır. Bu sindirim prosedürü, folikül bozulmasını önlemek için dikkatlice kontrol edilmelidir. Foliküllerin yapısı tehlikeye girer girmez veya maksimum 90 dakika sonra, reaksiyon% 10 fetal sığır serumu içeren 4 ° C'lik bir bloke edici çözelti ile durdurulur. Gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) için RNA ekstraksiyonundan sonra yeterli miktarda toplam RNA elde etmek için en az 20 izole folikül (75 μm'nin altında boyutlu) toplanmalıdır. Ekstraksiyondan sonra, 20 folikülden toplam RNA'nın miktarının belirlenmesi ortalama 5 ng / μL'lik bir değere ulaşır. Toplam RNA daha sonra cDNA'ya retrokribe edilir ve ilgilenilen genler RT-qPCR kullanılarak daha fazla analiz edilir.
Yumurtalık, korteks ve stroma içindeki foliküller de dahil olmak üzere fonksiyonel ve yapısal birimlerden oluşan karmaşık bir organdır. Folikülogenez, folikül aktivasyonu, büyümesi ve olgunlaşması süreci, ilkel sessiz bir durumdan döllenebilen ve erken embriyonik gelişimi destekleyen olgun bir foliküle kadar, araştırma1'de yaygın olarak incelenmiştir. Bu fenomeni yönlendiren mekanizmaların çözülmesi, kadınlar için doğurganlık bakımını iyileştirebilir2. Sabit insan dokusu üzerinde yapılan analizler, yumurtalığın fonksiyonel birimleri içinde protein ekspresyonunun ve gen lokalizasyonunun değerlendirilmesine izin verir 3,4. Bununla birlikte, yumurtalık folikülleri içindeki gen ekspresyon seviyelerini doğru bir şekilde değerlendirmek için folikülleri çevreleyen korteksten ayırmak için spesifik tekniklere ihtiyaç vardır. Bu nedenle, önceki bir çalışmada, gen ekspresyonunun doğrudan yumurtalık fonksiyonel biriminden analiz edilmesine izin vermek için bir folikül izolasyon tekniği geliştirilmiştir5. Enzimatik sindirim ve / veya mekanik izolasyonun yanı sıra lazer yakalama mikrodiseksiyonu gibi, bir doku parçası 6,7,8,9 içinde folikül izolasyonuna izin veren farklı yaklaşımlar geliştirilmiştir. Folikül izolasyonu, gelişimin her aşamasında foliküllerin gen ekspresyon profillerini değerlendirmek için insan veya hayvan yumurtalık dokusu ile yaygın olarak kullanılmaktadır10,11,12. Bununla birlikte, optimal bir izolasyon prosedürü, folikülün yoğun korteks içindeki kırılgan yapısını dikkate almalı ve bu nedenle herhangi bir hasarı önlemek için dikkatle yapılmalıdır7. Bu makale, Woodruff'un laboratuvarı tarafından tanımlanan bir protokolden uyarlanmış, gen ekspresyon analizleri yapmak için insan foliküllerini dondurulmuş-çözülmüş yumurtalık korteksinden izole etmek için bir prosedürü açıklamaktadır13.
Dondurulmuş insan dokusundan yumurtalık folikülü izolasyonunun ilk adımı çözme işlemidir. Bu işlem, daha önce tarif edildiği gibi, kriyokorunmuş yumurtalık dokusunun greftlenmesi için kullanılan klinik protokole dayanarak gerçekleştirilir14,15. İşlem, ortamın azalan konsantrasyonlarında yumurtalık korteksi durulayarak kriyoprotektan ajanların uzaklaştırılmasını amaçlamaktadır. Daha sonra, folikülleri almak için enzimatik ve mekanik izolasyondan önce doku parçalanır. Farklı aşamalardaki foliküller, ilgilenenleri izole etmek için yüksek büyütmeli ve kaliteli optiklere sahip bir stereomikroskop kullanılarak ayırt edilebilir. İzole edilen her folikül, mikroskopa entegre edilmiş bir cetvel kullanılarak ölçülür ve foliküller gelişim aşamalarına göre toplanabilir: ilkel foliküller (30 μm), birincil foliküller (60 μm), ikincil foliküller (120-200 μm) ve antral foliküller (>200 μm)16. Foliküllerin morfolojisine göre daha ileri sınıflandırma yapılabilir: primordiyal foliküller bir kat düzleştirilmiş granüloza hücresine (GC) sahiptir, primer foliküller bir kat küboidal GC'ye sahiptir, ikincil foliküller en az iki kat küboidal GC'ye sahiptir ve GC'ler arasında bir boşluğun varlığı antral aşamayı karakterize eder. İlgilenilen foliküller seçildiğinde, RNA ekstraksiyonu gerçekleştirilir. RNA miktarı ve kalitesi, gerçek zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonundan (RT-qPCR) önce değerlendirilir (Şekil 1).
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu proje Erasme Hastanesi Etik Kurulu (Brüksel, Belçika) tarafından onaylanmıştır. Bu protokole dahil edilen hastaya 2000 yılında kemoterapiye maruz kalmadan önce fertilitenin korunması için yumurtalık dokusu kriyoprezervasyonu (OTC) uygulandı. Hasta, kalan dondurulmuş dokusunu depolama süresinin sonunda araştırmaya bağışlamak için bilgilendirilmiş yazılı onay imzaladı.
1. Kriyokorunmuş yumurtalık dokusunun çözülmesi
2. Folikül izolasyonu
NOT: Tüm deneyler RNase içermeyen malzemeler kullanılarak ve dikey bir başlık altında gerçekleştirilir.
3. RNA ekstraksiyonu
NOT: RNA ekstraksiyonu, bir RNA ekstraksiyon kiti ile birlikte verilen talimatları izleyerek, elüsyon hacimlerini uyarlayarak gerçekleştirilir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu izolasyon prosedürünü kullanarak, deneyci spesifik gen ekspresyon analizleri yapmak için stromal ortamdan folikülleri alabilir. Foliküllerin büyüklüğüne ve morfolojisine dayanarak, folikülogenezin farklı aşamalarını ayırt etmek mümkündür. Deneyci, uyarlanmış bir mikrokapiler pipet kullanarak ilgilendiği folikülleri boyutlarına göre seçebilir. Maksimum 75 μm'lik bir mikrokapiller kullanarak, primordial ve primer folikülleri ikincil, antral ve matür foliküllerden ayırmak mümkündür. Ayrıca, deneyci folikül morfolojisine ...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yumurtalık dokusunun kriyoprezervasyonu, kanser hastalarının fertilitesini korumak için umut verici bir yaklaşımdır. Klinikte, çözülmüş kortikal doku remisyon sonrası hastaya tekrar aşılanır ve yumurtalık fonksiyonunun ve doğurganlığın yeniden başlamasına izin verir19,20. Klinik kullanımın yanı sıra, folikülogenezi düzenleyen mekanizmaları incelemek için depolama süresinin sonunda araştırma için artık yumurtalık fragmanları da bağışlanabilir. Dahası, bu doku,
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar birbiriyle çelişen çıkarlar olmadığını beyan ederler.
Bu çalışma bir Bilim Mükemmelliği (EOS) hibesi (ID: 30443682) ile desteklenmiştir. I.D. Fonds National de la Recherche Scientifique de Belgique'de (FNRS) yardımcı araştırmacıdır.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| 2 mm ızgaralı Petri kabı | Corning | 430196 | |
| 2100 Expert yazılımı | Agilent | sürüm B.02.08.SI648 | |
| 4 kuyulu plaka | Sigma Aldrich | D6789 | |
| 6 kuyulu plaka | Carl Roth | EKX5.1 | |
| Agilent toplam RNA 6000 pico kiti | Agilent | 5067-1513 | |
| Askorbik asit | Sigma Aldrich | A4403 | |
| Mikrokılcal pipetler için aspiratör tüpü tertibatları | Sigma Aldrich | A5177 | |
| Santrifüj | Eppendorf | 5424R | |
| Kollajenaz IV | Yaşam Teknolojileri | 17104-019 | |
| DMSO | Sigma Aldrich | D2650 | |
| DNase | Sigma Aldrich | D4527-10kU | |
| FBS | Gibco | 10270-106 | |
| GoScript ters transkriptaz | Promega | A5003 | |
| HSA | CAF DCF | LC4403-41-080 | |
| Leibovitz-15 | Yaşam Teknolojileri | 11415-049 | |
| L-Glutamin | Sigma Aldrich | G7513 | |
| McCoy ' s 5A + bikarbonat + Hepes | LifeTechnologies | 12330-031 | |
| McIlwain doku doğrayıcı | Stoelting | 51350 | |
| Mikrokılcal RI EZ-İpuçları 200 ve mikro; m | CooperSurgical | 7-72-2200/1 | |
| Mikrokılcal RI EZ-İpuçları 75 & mikro; m | CooperSurgical | 7-72-2075/1 | |
| NanoDrop 2000/2000c işletim yazılımı | ThermoFisher | sürüm 1.6 | |
| NanoDrop spektrofotometre | ThermoFisher | 2000/2000c | |
| Penisilin G | Sigma Aldrich | P3032 | |
| PowerTrack SYBR yeşil ana karışım | ThermoFisher | A46109 | |
| Primerler: GDF9 | F: CCAGGTAACAGGAATCCTTC R: GGCTCCTTTATCATTAGATTG | ||
| Primerler: HPRT | F: CCTGGCGTCGTGATTAGTGAT R: GAGCACACACAGAGGGCTACAA | ||
| Primerler: Kit Ligand | F: TGTTACTTTCGTACATTGGCTGG R: AGTCCTGCTCCATGCAAGTT | ||
| Gerçek Zamanlı qPCR Quantstudio 3 | ThermoFisher | A33779 | |
| RNAqueous-micro toplam RNA izolasyon kiti | ThermoFisher | AM1931 | |
| Selenyum | Sigma Aldrich | S9133 | |
| Sodyum piruvat | Sigma Aldrich | S8636 | |
| Stereomikroskop | Nikon | SMZ800 | |
| Streptomisin sülfat | Sigma Aldrich | S1277 | |
| Sükroz | Sigma Aldrich | S1888 | |
| Thermo Scientific Forma Serisi II su ceketli CO2 inkübatörler | ThermoFisher | 3110 | |
| Thomas Stadie-Riggs doku dilimleyici | Thomas Scientific | 6727C10 | |
| Transferrin | Roche |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste