Paraziter enfeksiyonlar insan sağlığı üzerinde büyük bir yük oluşturmaktadır 1,2. Sanayi ülkelerinde otoimmün hastalıklardaki artış ile paraziter enfeksiyonlardaki azalma arasında bir korelasyon gözlenmiştir. Parazitlerin aşırı konak bağışıklık tepkilerini azaltarak faydalı etkileri olabileceği bilinmektedir. H. polygyrus, kemirgenlerde bağırsakta bulunan doğal bir parazittir ve bu parazitin, diğer mekanizmaların yanı sıra, enfekte konakçıda düzenleyici T hücrelerinin (Treg) indüksiyonu yoluyla konakçının anti-parazitik bağışıklık tepkisini azaltan immün düzenleyici mekanizmaları indüklediği bilinmektedir 3,4,5,6,7,8,9,10,11 . Bu düzenleyici mekanizmalar özellikle dejeneratif otoimmün hastalıklarda ilgi çekicidir.
Konakçı ve bağırsak nematodları arasındaki metabolik karışmanın analizi yaygın olarak ihmal edilmektedir, ancak metabolizma hem konakçıda hem de parazitlerde savunma, hayatta kalma ve işlev için önemli bir rol oynar. Canlı dokularda konak ve nematod metabolizmasını korelasyonlu olarak araştırmak için memeli hücreleri ve dokularında farklı fizyolojik ve patofizyolojik durumlarda halihazırda yaygın olarak kullanılan bir teknoloji olan iki foton uyarımı üzerine NADH ve NADPH floresan ömür boyu görüntülemeyi uyarlamayı ve uygulamayı öneriyoruz12.
NADH (P) h olarak adlandırılan NADH ve NADPH, tüm hücre bazlı yaşam formlarında korunan ve çeşitli metabolik yollarda koenzimlerin rolünü oynayan her yerde bulunan moleküllerdir. Örneğin, esas olarak hücre savunması ve hücre iletişimi ile bağlantılı olan enerji üretimi, indirgeyici biyosentez ve NADPH oksidaz aracılı reaktif oksijen türleri (ROS) üretiminde yer alırlar 13,14,15,16,17,20. Her iki koenzim de 750 nm'de iki foton uyarımı üzerine ~ 450 nm'de floresan yayar, böylece hücrelerde ve dokularda belirteçsiz metabolik görüntülemeye izin verir19,21. Hem NADH hem de NADPH'yi sadece bir dalga boyu ile heyecanlandırmak, benzer ve oldukça geniş iki foton uyarma spektrumları21 nedeniyle mümkündür.
NAD(P)H koenziminin floresan ömrü doğrudan bağlandığı enzime bağlıdır 18,21,22,23. Molekül içi enerji transferine izin veren kimyasal yapısı nedeniyle, uyarılmış NADH veya NADPH molekülü, gevşemeden ve bir floresan fotonu yaymadan önce, bağlanma özelliklerine bağlı olarak bir oranda enzimlere (katalizör) iç dönüşüm süreçleri yoluyla enerji kaybeder. Bu ömür, enzim üzerindeki NAD(P)H bağlanma bölgesi ve dolayısıyla 19,21,22,23,24,25 gerçekleşen tercihli biyokimyasal reaksiyon hakkında fikir verir. Serbest NADH ve NADPH moleküllerinin floresan ömrü ~ 450 ps'dir, oysa bir enzime bağlandığında floresan ömürleri çok daha uzundur (~ 2.000 ps) ve ilgili enzim21 üzerindeki bağlanma yerlerine bağlıdır.
NAD (P) H ile bağlantılı süreçlerde yer alan 370'den fazla enzim vardır; bununla birlikte, yalnızca en bol olanı, mikroskobun uyarma aralığı içinde ortaya çıkan NAD (P) H floresan ömrüne katkıda bulunabilecektir. Memeli hücrelerinden elde edilen RNASeq verilerini kullanarak, en bol bulunan NAD (P) H'ye bağımlı enzimleri belirledik ve doku ve hücre örneklerinde üretilen verileri yorumlamak için bir floresan ömrü referansı oluşturduk18. Bu nedenle, bu çalışma, örneğin, anaerobik glikolitik metabolik yollarla ilişkili laktat dehidrojenazın (LDH) tercihli aktivitesi ile esas olarak aerobik glikoliz/oksidatif fosforilasyon metabolik yollarında yer alan izositrat dehidrojenaz (IDH) ve piruvat dehidrojenaz (PDH) aktivitesi arasında ayrım yapmıştır16,20. Ek olarak, oksidatif patlamadan esas olarak sorumlu olan enzimler olan NADPH oksidazlara NADPH bağlanması, bu enzimlerin hücre içindeki karakteristik konumu (zara bağlı) ve özellikle uzun NADPH floresan ömrü (3,650 ps) nedeniyle kolayca çözülebilir18,24,29,30,32. H. polygyrus'tan elde edilen RNASeq verileri, memeli hücreleri için üretilen referansın bu nematod27'ye uyarlanmış formda da geçerli olduğunu göstermektedir.
Bu nedenle, bu çalışmada, H. polygyrus ile enfekte olmuş farelerin taze ekilmiş duodenum örneklerinde NAD (P) H floresan ömür boyu görüntüleme (FLIM) gerçekleştirilerek, tüm dokulardaki genel metabolik aktiviteyi ve görüntünün her pikselindeki baskın olarak aktif enzimi gösteren serbest ve enzime bağlı NAD (P) H arasındaki oran hakkında bilgi elde edildi (örn. NAD(P)H'nin tercihen o spesifik konumda bağlandığı enzim). Bu deneylerin başarısı, ekilen bağırsağın doğru numune hazırlanmasına, hücre altı çözünürlükte NAD(P)H floresan ömrünün güvenilir canlı görüntülenmesine ve bu protokolde tartışıldığı gibi standartlaştırılmış veri değerlendirmesine dayanır.