Bu yöntemler kullanılarak, normal insan ve farelerin kanındaki ve kemik iliğindeki nadir epitel hücresi popülasyonları görselleştirildi. Tarif edildiği gibi uygun kompanzasyonlar ve kontrollerle, murin kemik iliğindeki hücrelerin% 4-5'ini tutarlı bir şekilde gösteren sonuçlar, Şekil 4 ve Şekil 5'te gösterildiği gibi, kaç hücrenin sayıldığına bakılmaksızın EpCAM + idi. Murin kan örneklerinde, Şekil 6'da gösterildiği gibi, hücrelerin% 0.5'inden azı EpCAM + idi. İnsan kemik iliği örneklerinde, Şekil 7 ve Şekil 8'de gösterildiği gibi, hücrelerin% 2 -% 5'i EpCAM + idi. % 2 -% 5 büyük bir aralık olsa da, her bir donör içindeki yüzdeler, kademeli olarak daha fazla hücre sayıldığı için tutarlıydı. İnsan kan örneklerinde, hücrelerin yaklaşık% 0.3'ü Şekil 9'da gösterildiği gibi EpCAM + idi. Kontrol numunelerimiz (lekesiz, izotip kontrolü ve FMO'lar), Şekil 4 ve Şekil 7'de gösterildiği gibi çok az yanlış pozitif EpCAM+ sonucu vermiştir. Slaytlar halinde sıralanan EpCAM+ ve EpCAM gruplarından hücreler, Şekil 10'da gösterildiği gibi, EpCAM+ örneklerinde pan-sitokeratin için pozitif boyama ve EpCAM- örneklerinde pan-sitokeratin için negatif olmuştur. Bu sonuçlar, deneylerin uygun şekilde tasarlandığını ve tekrarlanabilir olduğunu göstermektedir.

Resim 1: Krt14Cre;mTmG transgenik fareler, kemik iliğinin artımlı sayımlarına sahiptir. Krt1-14;mTmG farelerin kemik iliği artımlı olarak sayıldı. GFP pozitif hücreler keratin 14 ekspresyonunu gösterir ve akım sitometrisi kullanılarak tanımlanmıştır. Daha fazla kemik iliği hücresi sayıldıkça, bu keratin 14 pozitif hücre popülasyonu daha kolay tanımlanabilirdi. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: EpCAM+ ve sitokeratin+ hücreleri için iş akışı. Kemik iliği ve kan hücreleri ilk olarak EpCAM + ve EpCAM hücrelerini ayırmak için floresan aktive hücre sıralama (FACS) kullanılarak sıralandı. Bu hücreler iki farklı test tüpüne ve iki farklı slayda ayrıldı. Test tüplerine ayrılan hücreler, bir sitosantrifüj kullanılarak slaytlara döndürüldü. Slaytlar daha sonra bir pan-sitokeratin primer antikoru kullanılarak boyandı, daha sonra ikincil bir antikor ile boyandı. Slaytlar, pan-sitokeratin ekspresyonunu gözlemlemek için floresan mikroskobu kullanılarak analiz edildi. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Akış sitometrisi analiz yazılımı. Analiz yazılımı kullanarak akış sitometrisi verilerini analiz ederken, ilgilenilen hücreleri seçmek için leke kontrolü yoktur. Hücreler ilk olarak, hücrelerin iç karmaşıklığını ve boyutunu gösteren SSC-A ve FSC-A ile seçilir. (A) Hücrelerin etrafına bir çokgen kapısı çizilir. (B) Tek hücreler, SSC-A'nın SSC-W ile geçitlenmesiyle elde edilir. (C) Canlı hücreler, FSC-A'nın DAPI'ye karşı geçitlenmesiyle elde edilir. (D) EpCAM negatif hücreleri, EpCAM negatif hücrelerinin sağına geçilerek hariç tutulur. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Fare kemik iliğindeki EpCAM+ hücrelerinin akış sitometrik analizi. Lekesiz, izotip ve FMO'suz kontroller üst panelde, 50.000, 100.000 ve 500.000 hücrenin artımlı sayıları alt panelde gösterilir. Bu grafikler, sayılan toplam hücrelerdeki genel artışa rağmen, sayımlar arasındaki yüzde tutarlılığını görselleştirir. Sağdaki paneller, daha önce akış sitometrisi analizi bölümünde tartışıldığı ve Şekil 3'te gösterildiği gibi geçit stratejisini göstermektedir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5: Fare kemik iliğindeki EpCAM+ hücreleri popülasyonun %5,17 ± %0,001'ini oluşturmaktadır. Üç ayrı farenin kemik iliği hücreleri analiz edildi. Uygun bilimsel titizlik için uygun kontroller dahil edildi. Pozitif hücrelerin yüzdesi, farelerin genetik olarak aynı olması nedeniyle örnekler arasında tutarlı kalmıştır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 6: Fare kanındaki EpCAM+ hücreleri popülasyonun %0,45 ± %0,0006'sını oluşturmaktadır. İki ayrı farenin kan hücreleri analiz edildi. Kesin sonuçlar üretmek için uygun prosedürün izlendiğini göstermek için kontroller dahil edildi. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 7: EpCAM+ insan kemik iliği üzerinde akış sitometrik analizi. Lekesiz, izotip ve FMO'ların kontrolleri üst panelde, 50.000, 100.000 ve 500.000 hücrenin artımlı sayıları ise alt panelde gösterilir. Bu grafikler, sayılan toplam hücrelerin genel artışına rağmen, sayımlar arasındaki yüzde cinsinden tutarlılığı görselleştirir. Sağdaki paneller, daha önce akış sitometrisi analizi bölümünde tartışıldığı ve Şekil 3'te gösterildiği gibi geçit stratejisini göstermektedir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 8: İnsan kemik iliğindeki EpCAM+ hücreleri popülasyonun %3.53 ± %0.006'sını oluşturmaktadır. Üç farklı insan kemik iliği örneği analiz edildi. Bilimsel titizlik için uygun kontroller dahil edildi. Pozitif hücrelerin yüzdesi, insanlar arasındaki genetik heterojenliğe bağlı olarak değişir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 9: İnsan kanının EpCAM+ hücreleri, popülasyonun %0.18 ± %0.0004'ünü oluşturmaktadır. Üç farklı insan kan örneği analiz edildi. Bilimsel titizlik için uygun kontroller dahil edildi. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 10: EpCAM+ ve EpCAM- slaytlarının immünofloresansı. FACS, EpCAM+ ve EpCAM hücrelerini ayırmak için kullanıldı. Pan-sitokeratin, DAKO pan-sitokeratin antikoru kullanılarak boyandı. Pan-sitokeratin, poliklonal bir antikor olduğu için normal serumda primer antikor kontrolü kullanılmadı. Bu sonuçlar FACS'ın doğruluğunu doğrulamaktadır. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.
| İnsan Kemik İliği veya Kanı |
| Antikor | Tüp # | # Hücrelerin | AB Conc |
| Lekesiz | 1 | 1x106 | X |
| Yalnızca DAPI | 2 | 1x106 | 1uL/mL |
| PE izotip kontrolü | 3 | 1x106 | 1 uL |
| CD49f-PE Tek Leke Kontrolü | 4 | 1x106 | 1x10 başına 100uL'de 20 uL6 |
| EpCAM-PE Düşük Titrasyon | 5 | 1x106 | 1x10 başına 100uL'de 3 uL6 |
| EpCAM-PE Orta Titrasyon | 6 | 1x106 | 1x10 başına 100uL'de 4 uL6 |
| EpCAM-PE Yüksek Titrasyon | 7 | 1x106 | 1x10 başına 100uL'de 5 uL6 |
| Slaytlarda EpCAM-PE Yüksek Sıralama | 8 | 10x106 | 1 mL'de 50 uL |
Tablo 1: Akış sitometri boyama paneli. Kan veya kemik iliği mononükleer hücreleri için bir akış sitometri boyama paneli örneği. Dahil edilen kontroller sadece DAPI, lekesiz kontrol ve PE tek leke kontrolüdür (PE-CD49f daha iyi bir pozitif kontrol olarak kullanılmıştır). Floresan eksi bir, yalnızca tek bir renk (PE) olduğu için bu panele dahil değildir. Floresein izotiyosiyanat (FITC) veya allofikosiyanin (APC) gibi daha fazla florofor rengi eklerken, her FMO kontrolü için bir florofor hariç tutularak FMO'lar dahil edilmelidir.
Ek Dosya 1: Hematositometre kullanılarak canlı hücre sayımı. Bu Dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.