Nötrofillerin izolasyonu, güvenilir sonuçlar elde etmek için uygun bir izolasyon yönteminin seçilmesinin çok önemli olduğu NETosis çalışmasında çok önemli bir adım oluşturur. Tartılması gereken önemli bir faktör, izolasyon sırasında lenfosit kontaminasyonunun meydana gelmesidir. Bu zorluğun ele alınması, sıçan nötrofillerini kemik iliğinden izole ederken özellikle önemlidir. Lenfositlere (1.0337-1.0765, 1.0526'da bir zirve ile) kıyasla nötrofillerin farklı yoğunluk aralığına (1.0814-1.0919, 1.0919'da bir zirve) rağmen, lenfositlerle kontaminasyon kaçınılmazdır. Bu kısmen kemik iliğindeki lenfositlerin bolluğuna ve olgunlaşmamış lenfositlerin artan yoğunluğunabağlanabilir 15. Percoll ve Ficoll kullanımı gibi yoğunluk gradyan ayrımı gibi teknikler, lenfosit kontaminasyonunun engellenmesine yardımcı olabilir, ancak tam lenfosit eliminasyonunun sağlanması zor olabilir. Belirli bir yoğunluk gradyanına kalibre edilmiş özel bir Percoll çözeltisi, sıçan nötrofilleri ve diğer kemik iliği hücreleri arasındaki yoğunluk farkından yararlanarak kontaminasyonu en aza indirmek için kullanılabilir. Bu nedenle, araştırmacılar lenfosit kontaminasyonunun deneysel sonuçları üzerindeki potansiyel etkisini makul bir şekilde değerlendirmeli ve etkisini azaltmak için önlemler almalıdır.
Bu çalışma, izolasyon yöntemlerinin belirli deneysel gerekliliklere uyacak şekilde uyarlanmasının önemini vurgulamaktadır. Daha önce14 tanımlanan yöntemde, tek adımlı yöntem, zaman ve çaba açısından daha az talepkar olduğunu göstermiştir. Bu nedenle, kontamine lenfositlerin NET sekresyonu üzerindeki önemsiz etkisi nedeniyle NET edinimi için onaylanmıştır. Bu lenfositler daha sonra son santrifüj aşamasında elimine edilebilir. Tersine, nötrofil izolasyonu ve daha sonra NETosis ve NET sekresyonunun değerlendirilmesini gerektiren çabalar için iki aşamalı yöntem önerilmiştir14. Bu yaklaşım, nötrofiller tarafından üretilen NET'lerin hassas bir şekilde ölçülmesine izin verirken, diğer hücre kontaminasyonlarından kaynaklanan potansiyel karıştırıcı faktörlerin etkisini en aza indirdi.
Hem verimi hem de saflığı artırmak için izolasyon protokolünde değişiklikler yapılabilir. Örneğin, optimize edilmiş bir yoğunluk gradyan reaktif setinin kullanılması daha fazla nötrofil verebilir. Nazik pipetleme ve yıkama yöntemleri de aynı şekilde hücre kaybını azaltabilir ve saflığı artırabilir. Santrifüj parametrelerinin ayarlanmasının yanı sıra tampon pH'ı ve sıcaklığının izlenmesi gibi sorun giderme eylemleri, izolasyon işlemi sırasında karşılaşılan zorlukları etkili bir şekilde ele alabilir. Kemik iliği izolasyonunun ilişkili bir kısıtlaması, olgunlaşmamış nötrofil ve diğer kemik iliği hücre kontaminasyonu olasılığında yatmaktadır, bu nedenle hem saflığı hem de verimi etkiler. Lenfositleri dışarı atmak için aerodinamik bir yaklaşım geliştirmek, genel izolasyon verimliliğini artırabilir. Diğer bir kısıtlama, in vivo sıçan nötrofilleri üzerinde uzunlamasına araştırmalar için uygun olmayabilecek kemik iliği izolasyonu için hayvan kurban etme gerekliliği ile ilgilidir.
İnsanlar için nötrofil izolasyonu ağırlıklı olarak periferik kana dayanır. Konvansiyonel yöntemler Ficoll-Paque, Percoll ve immünomanyetik boncuk ayrımını kapsar 16,17,18. Ficoll yaklaşımı, lökosit popülasyonlarını kaldırma kuvvetine göre ayırır ve nötrofilleri ayırt etmek için bir kontrast maddeye dayanır. Basitlik ve maliyet etkinliği sunar, ancak saflık ve verimden ödün verir ve kırmızı kan hücrelerinin ortadan kaldırılmasında zorluklar sunar. Öte yandan, Percoll yoğunluk gradyanlarından yararlanarak, özel ekipman pahasına daha fazla nötrofil saflığı ve verimi sağlar ve artan masraflar ve zaman19. İmmünomanyetik boncuk ayrımı, diğer lökositlerden minimum kontaminasyon ile nötrofillere spesifik olarak bağlanan antikor konjuge manyetik boncukları kullanan daha yeni, daha spesifik bir tekniktir. Otomasyona uygun olmasına rağmen, özel ekipman gerektirir ve boncuk giderleri nedeniyle daha yüksek maliyetlere neden olur. Bir nötrofil izolasyon yöntemi seçerken, araştırmacılar verimi, saflığı, maliyeti ve karmaşıklığı tartmalıdır. Şu anda, insan nötrofil izolasyonu için en uygun yöntem PolymorphPrep20'nin kullanılmasını içerir. Bu yaklaşım, kısa bir süre içinde önemli miktarlarda yüksek oranda saflaştırılmış nötrofiller verir. PolymorphPrep'in prensibi, yoğunluğa göre hücre ayrımına dayanır.
Farelerde, nötrofillerin periferik kandan izole edilmesi, düşük kan hacimleri ve aşağı akış deneyleri için yeterli miktar ve saflığın sağlanmasının zorluğu nedeniyle tavsiye edilmez. Sıçanların yeterli kan miktarları sağlamasına rağmen (sıçan başına 10 mL), periferik kan özellikleri insanlardan ve farelerden farklıdır. Sıçanlar doğal olarak nötrofil ekstraksiyonunda eksiklikler sergilerler, monositler en bol çekirdekli hücrelerdir13,14. Bu nedenle, periferik kan izolasyonu, tek bir sıçandan sadece 2 x 105-5 x 105 nötrofil sağlar. Kemik iliği, hayvanın enfeksiyon durumundan bağımsız olarak kolayca bulunabilen ve bol miktarda tedarik sağlayan daha canlı bir nötrofil kaynağı olarak hizmet eder. Alternatif olarak, izolasyon için nötrofil infiltrasyonunu arttırmak için karın boşluğunda veya toraksta enflamatuar bir ortamın indüklenmesi güvenilmez ve karmaşıktır. Bu nedenle, kemik iliği ekstraksiyonu, sıçan nötrofil izolasyonu için pratik ve güvenilir bir yol olarak ortaya çıkmaktadır21.
NETosis, DNA dekonsülasyonu, otofaji ve hücre içi matriks atılımını kapsayan çeşitli hücresel süreçleri içerir1. İnsanlarda, NET ekstrüzyonu kapsamlıdır ve hücre zarının kalıntılarını geride bırakır. Şaşırtıcı bir şekilde, sıçan nötrofil çalışmaları, stimülasyon sonrası daha fazla hücre içi içeriği ortaya çıkaran farklı modeller sergiler. PMA stimülasyonuna rağmen, sıçan nötrofilleri, spontan NETosis ile uyumlu olarak eksik NET ekstrüzyonu sergiler. İlginç bir şekilde, sıçan NET'leri, potansiyel olarak çapraz bağlama yeteneğinin azalması nedeniyle, kapsamlı ağ yapısından ziyade toplu formlar (aggNET'ler) için bir eğilim göstermektedir. Bu fenomen, sıçanlarda daha geniş bağışıklık tepkisini etkileyerek nötrofil agregasyonunu önemli ölçüde etkileyebilir. Kemik iliği izolasyonunun gelecekteki uygulamaları, NETosis'te farklı sinyal yolaklarının ve bağışıklık hücrelerinin araştırılmasını içerebilir. Ek olarak, bu yöntem, nötrofillerin farklı patolojilerdeki rollerini çözerek çeşitli hastalık modellerinde NETosis eksplorasyonunu kolaylaştırabilir. Sonuç olarak, NET'leri izole etmek ve karakterize etmek için kullanılan yeni teknikler, NETosis'i yönlendiren mekanizmaları ve çeşitli hayvan modellerindeki işlevsel etkilerini çözmek için umut vaat etmektedir.