Method Article

Fitoplanktondaki Uzun Vadeli Değişiklikleri Göstermek için Oşinografik Verileri Görselleştirme

DOI:

10.3791/65571

July 28th, 2023

In This Article

Erratum Notice

Important: There has been an erratum issued for this article. Read More ...

Erratum

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Formal Correction: Erratum: Visualizing Oceanographic Data to Depict Long-term Changes in Phytoplankton
Posted by JoVE Editors on 1/01/1970. Citeable Link.

An erratum was issued for: Visualizing Oceanographic Data to Depict Long-term Changes in Phytoplankton. The Authors section was updated from:

Patricia S. Thibodeau1
Jongsun Kim2
1Graduate School of Oceanography, University of Rhode Island
2School of Earth, Environmental and Marine Sciences, The University of Texas - Rio Grande Valley

to:

Patricia S. Thibodeau1
Jongsun Kim2
1School of Marine and Environmental Programs, University of New England
2School of Earth, Environmental and Marine Sciences, The University of Texas - Rio Grande Valley

Summary

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Burada, 60 yıl boyunca fitoplankton taksonlarında ve biyokütlede meydana gelen değişimlerin görselleştirilmesini sağlamak için fitoplankton mikroskobik görüntülerini vektör grafiklerine ve tekrarlayan desenlere dönüştürmek için bir protokol sunuyoruz. Bu protokol, küresel olarak diğer plankton zaman serileri ve veri kümeleri için kullanılabilecek bir yaklaşımı temsil eder.

Abstract

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Oşinografik zaman serileri, ekosistemlerdeki çevresel süreçler hakkında önemli bir bakış açısı sağlar. Narragansett Körfezi, Rhode Island, ABD'deki Narragansett Körfezi Uzun Vadeli Plankton Zaman Serisi (NBPTS), dünyadaki türünün en uzun plankton zaman serilerinden birini (1959'dan günümüze) temsil ediyor ve bir su ekosistemi içindeki uzun vadeli değişimi görselleştirmek için eşsiz bir fırsat sunuyor. Fitoplankton, Narragansett Körfezi de dahil olmak üzere çoğu deniz sisteminde besin ağının temelini temsil eder. Bu nedenle, kıyı okyanusunda yaşayan 2,4 milyar insana önemlerini iletmek çok önemlidir. NBPTS'den toplanan fitoplanktonun mikroskobik görüntülerini zaman içinde tekrarlayan görsel desenlere uydurulabilecek vektör grafiklerine dönüştürmek için Adobe Illustrator'ı kullanarak fitoplanktonun çeşitliliğini ve büyüklüğünü görselleştirmek amacıyla bir protokol geliştirdik. Sayısal olarak bol olan taksonlar veya zararlı alg patlaması taksonları, Pseudo-nitzschia spp. gibi ekonomik ve sağlık tehditleri oluşturanlar görüntü dönüştürme için seçildi. Daha sonra, toplanan onlarca yıllık veriler (1970'ler, 1990'lar ve 2010'lar) için göreceli bolluklarına dayalı olarak çeşitli fitoplankton görüntülerinin kalıpları oluşturuldu. Fitoplankton biyokütlesinin on yıllık modelleri, her on yılın ana hatlarını bilgilendirirken, Narragansett Körfezi'nde gözlemlenen uzun vadeli bir sıcaklık artışını ortaya çıkarmak için maviden kırmızıya bir arka plan renk gradyanı kullanıldı. Son olarak, zaman içinde fitoplankton bolluğundaki potansiyel değişiklikleri göstermek için tekrar eden fitoplankton desenleriyle büyük, 96 inç x 34 inç paneller basıldı. Bu proje, sanat eserinin kendisindeki gerçek zamanlı seri verilerinden (örneğin, fitoplankton biyokütlesi ve bolluğu) yararlanırken, tipik olarak çıplak gözle görülemeyen fitoplankton biyokütlesindeki gerçek değişimlerin görselleştirilmesini sağlar. Veri görselleştirme, iletişim, eğitim ve sosyal yardım çabaları için diğer birçok plankton zaman serisi için kullanılabilecek bir yaklaşımı temsil eder.

Introduction

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Fitoplanktonlar, sucul ekosistemlerdebesin ağının tabanını temsil eden birincil üreticilerdir 1,2. Fitoplankton izleme programları, deniz ekosistemlerindeki mevcut ve gelecekteki değişiklikleri belirlemenin anahtarı olsa da, destekleri zamanla azalmaktadır 3. Nispeten kısa üretim süreleri ve sınırlı hareketlilikleri nedeniyle, fitoplanktonlar iklim değişikliğine özellikle duyarlıdır ve bu da onları zaman serisi izlemede önemli bir araç haline getirir. Fitoplankton zaman serileri, kaynak mevcudiyetinin ekosistem tabanlı yönetimini bilgilendirmek ve deniz ısı dalgaları gibi epizodik olayl....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

1. Fitoplankton görüntülerinin vektör grafiklerine dönüştürülmesi

  1. Narragansett Körfezi Uzun Vadeli Plankton Zaman Serisinden (NBPTS) alınan fitoplankton mikroskobik görüntülerini .JPG, .PNG veya .PDF dosyaları olarak seçin (Şekil 1A).
    NOT: Taksonlar arasında Thalassiosira nordenskioeldii, Thalassionema nitzschioides, Tripos spp., Odontella aurita, Skeletonema tür kompleksi, Chaetoceros diadema, Eucampia zodiacus, Dinophysis spp. ve Pseudo-nitzschia spp. bulunur. Görüntüler ışık mikroskobu ile çekildi.
  2. Bu çalışma için kullanılan belirli bir yazıl....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Sonuçlar, 1970'lerden 1990'lara ve 2010'lara kadar fitoplankton biyokütlesinde bir düşüşü belgelemektedir (Şekil 1). Tüm on yıllar, klorofil a (chl a) konsantrasyonunda iki modlu bir zirve sergiledi, ilk zirve kışın ve ikincisi yaz aylarında meydana geldi. 1970'ler, kışın yaza göre daha yüksek ortalama chl a sergiledi. Tersine, 1990'lar kışın yaza göre daha düşük chl a gösterdi. 2010'lar, kışın yaza göre daha yüksek bir ortalama chl a konsantrasyo.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Protokolün kritik adımları, fitoplanktonların mikroskobik görüntülerinin elde edilmesini ve bunların vektör grafiklerine dönüştürülmesini içerir. Çıplak gözle fark edilemeyen fitoplankton görüntülerinin duvar üzerinde büyüteç olmadan görülebilecek büyüklükte yapılması, izleyici için hayata geçirilmesine yardımcı olur. Bu duvar resmini sadece bir sanat eseri olarak değil, aynı zamanda bir veri görselleştirme yöntemi olarak gerçekleştirmek için, gözlemlenen verileri projeye dahil etmek önemlidir. Fitoplankton duvar resmi s.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarların beyan edecek herhangi bir çıkar çatışması yoktur.

Acknowledgements

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu araştırma Ulusal Bilim Vakfı (OIA-1655221, OCE-1655686) ve Rhode Island Sea Grant (NA22-OAR4170123, RISG22-R/2223-95-5-U) tarafından desteklenmiştir. Saha yardımı sağlayan çok sayıda kaptana ve 1970'ten beri veri toplayan birçok öğrenci ve araştırmacıya teşekkür ederiz. Plankton duvar resmini üreten Vis-A-Thon projesini geliştirdikleri için Stewart Copeland ve Georgia Rhodes'a ve proje geliştirme sırasındaki sanatsal rehberliği için Rhode Island Tasarım Okulu'ndan Rafael Attias'a teşekkür ederiz.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
NameCompanyCatalog NumberComments
Adobe IllustratorAdobesürüm 23.0.6Ücretsiz alternatifler şunları içerir: Inkscape, GIMP, Vectr, Vectornator
Eclipse E800NikonECLIPSE Ni/Ci Dik MikroskopArtık Eclipse Ni-U'nun yerini aldı
Epson Geniş Format YazıcıEpsonSCT5475SR
Ağır Mat KağıtEpsonS041596
RStudioRstudio, PBCsürüm 2022.07.1Herhangi bir istatistiksel yazılım aracı yeterli olacaktır

References

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,
  1. Cloern, J. E., Jassby, A. D. Complex seasonal patterns of primary producers at the land-sea interface. Ecology Letters. 11 (12), 1294-1303 (2008).
  2. Cloern, J. E., Jassby, A. D. Patterns and Scales of Phytoplankton Variability in Estuarine-Coastal Ecosyste....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Tags

Phytoplankton VisualizationOceanographic Time SeriesPlankton Community ShiftsLong Term Plankton DataHarmful Algal BloomsPlankton Imaging TechnologyChlorophyll A BiomassVector Graphic ConversionClimate Change EffectsNarragansett Bay

Related Articles