nTAEC'leri izole etmek için, YYBÜ'deki entübe yenidoğanlardan trakeal aspiratlar topladık ve aspiratları daha sonraki işlemler için buz üzerinde laboratuvara taşıdık (Şekil 1A). Trakeal aspirat örnekleri hava yolu epitelyal büyüme ortamında (Rho / Smad, GSK3 ve mTOR inhibitörleri içeren BLEAM-I) tohumlandıktan sonra, küboidal hücreler 7-10 gün içinde ortaya çıktı. 14 gün sonra, hücreler% 50 -% 60 birleşikti ve kaplamadan yaklaşık 21 gün sonra, hücreler yoğun bir şekilde paketlendi ve sonraki geçiş ve genişleme için tripsinasyon gerektirdi. Bu hücrelerin seri geçişleri (P3'e kadar) uzun süreli depolama için sıvı nitrojen içinde dondurularak saklandı. Hücreler (≤ geçiş 3) daha sonra ALI kültürü için çözüldü.
nTAEC'ler, batık koşullarda bir T75 plakasında yaklaşık% 80 -% 90 birleşmeye ulaştıklarında ALI'de kültürlendi. ALI 0. günde bazal hücreye özgü belirteçler olan sitokeratin-5 (KRT5)53 ve tümör proteini p63 (TP63)54 (Şekil 1B) ile nTAEC tek tabakasının immünofloresan boyamasını gerçekleştirdik. ALI 0. günde, neredeyse tüm hücreler KRT5 ve TP63 pozitiftir, bu da minimal farklılaşma ile hava yolu bazal hücre fenotipini düşündürür. ALI kurulduktan sonra, TEER, EVOM (Şekil 1C) kullanılarak ölçüldü ve nTAEC'ler olgun bir polarize hücre tek tabakası oluşturmaya başladığında, ALI kültürünün erken fazında (ALI gün 0 ila 7) hızla arttı ve ardından ALI 7. gün ile 28. gün arasında TEER'in platosu oldu (Şekil 1D). Ayrıca, ALI farklılaşması sırasında paraselüler geçirgenliği değerlendirmek için iki moleküler ağırlıkta (10 kD ve 20 kD) FITC-dekstran kullanıldı ve zaman içinde genel olarak kademeli bir floresan azalması gösterdi (Şekil 1E). Bu, ALI farklılaşması sırasında olgun bir hücre tek tabakasının oluşumu ile ilişkilidir ve çözünen maddelere karşı geçirgenliğin azalması ile ilişkilidir.
ALI kültürü sırasında, bazal hücreler, kirpikli hücreleri, mukus salgılamayan kulüp hücrelerini ve mukus salgılayan goblet hücrelerini içeren olgun epitel soylarına farklılaşır39. ALI 0. günde olgun epitel hücresine özgü belirteçlerin gen ekspresyonu analizi, çatal başlı kutu proteini J155 (FOXJ1, siliyer hücre belirteci), uteroglobin56 (SCGB1A1, kulüp hücre belirteci) ve müsin-5AC57 (MUC5AC, goblet hücre belirteci; Şekil 2A), müteakip artışla (ALI gün 7 ve 28), ALI kültürü sırasında bu olgun hava yolu epitel alt tiplerine farklılaşmayı düşündürmektedir. Ek olarak, olgun epitel hücresine özgü belirteçler ve asetillenmiş tübülin58 (TUBA4A) pozitif siliyer hücreler (~% 22), SCGB1A1 pozitif kulüp hücreleri (~% 13) ve MUC5AC pozitif goblet hücrelerinden (~% 3) oluşan nicel epitel farklılaşması kullanılarak ALI 28. günde immünofloresan boyama gerçekleştirdik, geri kalanı KRT5 pozitif bazal hücreler (~% 51) ve diğer nadir hücre tipleri (Şekil 2B).
Rho ve Smad inhibitörleri, ALI kültürünün ilk 7 günü boyunca (ALI günleri 0 ila 7) kullanıldı ve daha sonra ALI kültürü süresinin geri kalanı boyunca farklılaşma ortamından çıkarıldı (Şekil 3A). ALI kültürü sırasında hücre tek tabakasının apikal yüzeyi havaya maruz bırakılır ve atmosferik pertürbasyon çalışmalarına olanak tanır. Hücre tek tabakasının hiperoksi maruziyeti, TriGas İnkübatörü kullanılarak ALI 7. günden 14. güne kadar 7 gün boyunca sürekli olarak `O2 ile gerçekleştirildi. Kontrol grubu, oda havasına (! O2) maruz kalan ayrı bir inkübatörde tutuldu. O2 maruziyetinin hava yolu epitel gelişimi ve rejenerasyonu üzerindeki uzun süreli sonuçlarını (O2 maruziyetinin tamamlanmasını takiben 1-2 hafta) incelemek için gelecekteki niyet göz önüne alındığında, O2 maruziyetinin akut olarak ciddi sitotoksisite veya ALI hücre tek tabakasını önemli ölçüde bozacak ölçüde membran hasarı ile sonuçlanmaması esastı. Hücre zarı hasarını değerlendirmek için, ALI 14. günde bazolateral ortamda LDH salınımını ölçtük, bu da hiperoksi ve oda havası ile muamele edilmiş kültürler arasında anlamlı bir fark göstermedi (Şekil 3B). O2'den kaynaklanan sitotoksik etkilerin nTAEC'lerde apoptozu indükleyecek kadar önemli olup olmadığını daha fazla değerlendirmek için, ALI 14. günde hiperoksi ve oda havasına maruz kalan gruplardan hasat edilen hücre lizatları üzerinde toplam kaspaz-3 ve parçalanmış kaspaz-359 için immünoblot gerçekleştirdik (Şekil 3C). Toplam kaspaz-3 ekspresyonu iki grup arasında karşılaştırılabilirdi ve bölünmüş kaspaz-3 ekspresyonu tespit edilmedi, bu da 7 günlük `O2 maruziyetinin ALI 14. günde nTAEC'lerde apoptozu indüklemediğini düşündürdü. Ek olarak, artan staurosporin konsantrasyonları (0.5 μM, 1 μM ve 2 μM), bir sitotoksik ajan ve bir apoptoz indükleyicisi ile batık koşullar altında nTAEC'lerin gece boyunca inkübasyonu ile pozitif bir kontrol tasarlanmıştır. Total kaspaz-3 ve bölünmüş kaspaz-3 ekspresyonu için immünoblotlama, apoptozun başarılı indüksiyonunu doğruladı. % 60O2 maruziyetinin neden olduğu oksidatif stresi ölçmek için, ALI 14 üzerindeki nTAEC hücre tek tabakaları üzerinde floresan yoğunluk ölçümü ile bir hücresel oksidatif stres testi yapıldı (Şekil 3D). Hiperoksiya maruz kalma, oda havasına maruz kalan hücrelere kıyasla floresan yoğunluğunda (düzeltilmiş toplam hücre floresansı veya CTCF ile hesaplanan) önemli bir artışa neden oldu ve bu da hücresel oksidatif stresin arttığını düşündürdü. Antioksidan genlerin gen ekspresyonu analizi,% 60O2'nin ALI 14. günde bu antioksidan genlerin yukarı regülasyonuna neden olduğunu, katalaz, SOD1, SOD2 ve GPX3'ün önemli ölçüde yukarı regüle edildiğini gösterdi (Şekil 3E).

Şekil 1: Neonatal trakeal hava yolu epitel hücreleri (nTAEC'ler) neonatal trakeal aspiratlardan başarılı bir şekilde izole edildi ve hava-sıvı arayüzünde (ALI) kültürlendi. (A) Entübe yenidoğanlardan trakeal aspirasyon kullanılarak izole edilen nTAEC'ler, müteakip ALI kültürü ile batık durumda pasaja tabi tutuldu. (B) Hücreler, hava yolu bazal hücre belirteçleri - KRT5 (kırmızı) ve TP63 (kırmızı) ile immünofloresan boyama için ALI 0. günde hasat edildi. Çekirdekler DAPI ile maviye boyanır. Ölçek çubuğu = 50 μm. (C) Bir Epitelyal Volt/Ohm Ölçer (EVOM) kullanılarak hücre kültürü eklerinde trans-epitelyal elektrik direncinin (TEER) ölçümü. (D) TEER, ALI farklılaşması sırasında ölçüldü. Veriler ortalama olarak sunulmuştur (n = 2 donör, zaman noktası başına donör başına 5-10 kuyu). (E) Floresein izotiyosiyanat-dekstran (FITC-dekstran) trans-epitelyal geçirgenlik testi, iki farklı FITC-dekstran moleküler ağırlığı (10 kD ve 20 kD) kullanılarak ALI farklılaşması sırasında gerçekleştirildi. FITC-dekstran çözeltisi (10 kD veya 20 kD) apikal odaya ilave edildi ve hücre kültürü ekleri oda sıcaklığında 60 dakika inkübe edildi. Bazolateral oda ortamındaki floresan, 96 oyuklu plakalarda spektrofotometrik olarak ölçüldü. Düzeltilmiş bir floresan değeri elde etmek için arka plan floresansı (HBTEC ortamı) test ölçümlerinden çıkarıldı (0. gün değerlerine kıyasla yüzde olarak ifade edilir). Veriler ortalama olarak sunuldu (n = 2 donör, FITC-dekstranın her moleküler ağırlığı için zaman noktası başına donör başına üç kuyu). Hata çubukları SEM'i gösterir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Neonatal trakeal hava yolu epitel hücreleri (nTAEC'ler), hava-sıvı arayüz (ALI) kültürü sırasında mukosiliyer farklılaşmaya uğrar. (A) Hücreler, epitel hücresine özgü belirteçlerin qPCR analizi için ALI 0, 7 ve 28. ALI günlerinde toplandı: bazal için sitokeratin-5 (KRT5), kirpikler için çatal başlı kutu proteini J1 (FOXJ1), kulüp için uteroglobin (SCGB1A1) ve goblet hücreleri için müsin-5AC (MUC5AC). Her bir genin nispi ekspresyonu, endojen kontrol olarak GAPDH ile δCt yöntemi kullanılarak belirlendi. Ortalama olarak sunulan veriler (n = 3 donörden, zaman noktası başına donör başına üç kuyu). Hata çubukları SEM'i gösterir. İstatistiksel analiz, Tukey post-hoc analizi ile iki yönlü ANOVA kullanılarak yapıldı, *p=0.0114, ***p=0.0005, ***p<0.0001. (B) Bazal (KRT5, kırmızı), siliyer (asetillenmiş tübülin veya TUBA4A, yeşil), kulüp (SCGB1A1, kırmızı) ve kadeh (MUC5AC, yeşil) hücrelerin immünofloresan boyaması, epitel farklılaşmasını ölçmek için ALI 28. günde gerçekleştirildi. Çekirdekler DAPI ile maviye boyanır. Ortalama olarak sunulan yüzde (%) pozitif hücreler için veriler (n = 2 donör, donör başına iki hücre kültürü eki, slayt başına 6-8 örtüşmeyen görüntü, slayt başına en az 3000 hücre sayılır). Hata çubukları SEM'i gösterir. Ölçek çubuğu = 50 μm. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Hiperoksi, neonatal trakeal hava yolu epitel hücrelerinde (nTAEC'ler) hücresel oksidatif strese neden olur, ancak önemli hücre zarı hasarına veya apoptoza neden olmaz. (A) Trigas inkübatörü kullanılarak nTAEC'lerin hiperoksi maruziyeti için deneysel zaman çizelgesi. Oksijen maruziyeti, ALI 7. günde inhibitörler farklılaşma ortamından çıkarıldıktan sonra başladı ve 7 gün boyunca devam etti (ALI 7 ila 14. gün). (B) ALI 14. günde oda havası (kontrol) ve% 60O2'ye (hiperoksi) maruz kalan grup arasındaki hücre zarı hasarını değerlendirmek için LDH salınım testi için bazolateral ortam hasat edildi. Veriler, her grup için genel ortalamayı gösteren çizgilerle bireysel veri noktaları (düzeltilmiş absorbans) olarak sunuldu, n=3 bağışçılar sırasıyla siyah daireler, kareler ve verici başına dört kuyucuklu üçgenlerle gösterilir. İstatistiksel analiz, eşleşmemiş t-testi (p=0.6184) kullanılarak yapıldı. (C) Hücreler ALI 14. günde toplandı ve oda havası ile O2'ye maruz kalan nTAEC'ler arasındaki yanıtları karşılaştırmak için apoptoz belirteçleri (kaspaz-3 ve bölünmüş kaspaz-3) için immünoblotlama yapıldı. Test için pozitif kontrol, nTAEC'lerin gece boyunca staurosporin (Stau 0.5 μM, 1 μM ve 2 μM) veya batık kültür koşulunda araç kontrolü (Veh Ctrl) ile inkübe edilmesiyle tasarlanmıştır. Hücreler, total kaspaz-3 ve parçalanmış kaspaz-3 antikoru ile immünoblot için toplandı. Dansitometri, temizlik geni olarak α-tübülin ile yapıldı. Ortalama olarak sunulan veriler (n = 2-3 donörden, donör başına bir ila iki kuyu). Hata çubukları SEM'i gösterir. Oda havası ile `O2 grubu arasındaki toplam kaspaz-3 ekspresyonunu karşılaştırmak için eşleşmemiş bir t-testi kullanıldı, p=0.4. Veh Ctrl ve Stau'ya maruz kalan gruplar arasında total kaspaz-3 ve bölünmüş kaspaz-3 ekspresyonunu karşılaştırmak için tek yönlü ANOVA kullanıldı, *p<0.05, ***p<0.0005. (D) Hücresel oksidatif stres için CM-H2DCFDA testi, oda havasındanve O2'ye maruz kalan nTAEC'lerden hasat edilen hücre kültürü ekleri ile ALI 14. günde gerçekleştirildi. Oda havası (kontrol) ve `O2 (hiperoksi) ile maruz kalan hücre kültürü eklerinin temsili floresan mikroskobu görüntüleri gösterilmektedir. Oda havası ile ` O2'ye maruz kalan nTAEC'ler arasındaki hücresel oksidatif stresi karşılaştırmak için düzeltilmiş toplam hücre floresansı (CTCF) hesaplandı. CTCF verileri, her grup için genel ortalamayı gösteren çizgi ile bireysel veri noktaları, 2 bireysel donörden (siyah daireler ve kareler) 6-7 görüntü/grup ve donör başına iki kuyucuk olarak sunulmuştur. İstatistiksel analiz, eşleşmemiş bir t-testi, *p<0.05 kullanılarak yapıldı. Ölçek çubuğu = 50 μm. (E) Hücreler, ALI 14. günde oda havasından ve katalaz, süperoksit dismutaz 1 ve 2 (SOD1 ve SOD2), glutatyon peroksidaz 1, 2 ve 3 (GPX1, GPX2 ve GPX3) dahil olmak üzere oksidatif stres genlerinin qPCR analizi için hiperoksiye maruz kalan kuyulardan toplandı. Her bir genin kat değişim verileri, endojen kontrol olarak 18s rRNA ile δCt yöntemi kullanılarak belirlendi. Veriler ortalama olarak sunulmuştur (n = 3 donörden, donör başına iki kuyu). Hata çubukları SEM'i gösterir. İstatistiksel analiz, eşleşmemiş bir t-testi, *p<0.05, **p=0.006 kullanılarak yapıldı. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
| Medya bileşeni | Miktar | Son konsantrasyon |
| BLEAM-I | | |
| BLEAM ortamı | 500 mL | |
| HLL takviyesi | 1,25 mL | 500 μg/mL insan serum albümini 0.6 μM Linoleik asit; 0.6 μg/mL Lesitin |
| L-Glutamin | 15 mL | 6 milyon |
| P'yi Çıkar | 2 mL | % 0.4 sığır hipofiz özü |
| TM1 Serisi | 5 mL | 1 μM Epinefrin; 5 μg/mL Transferrin 10 nM Triiyodotironin; 0.1 μg/mL Hidrokortizon 5ng/mL Epidermal büyüme faktörü (EGF) 5 ng/mL İnsülin |
| Normosin | 1 mL | 0.1 mg / mL |
| Y-27632 Serisi | Lot numarasına göre değişiklik gösterebilir | 5 μM |
| A83-01 Serisi | Lot numarasına göre değişiklik gösterebilir | 1 μM |
| CHIR 99021 | Lot numarasına göre değişiklik gösterebilir | 0,4 μM |
| Rapamisin | Lot numarasına göre değişiklik gösterebilir | 5 nM |
| HBTEC (HBTEC) | | |
| HBTEC ortamı | 500 mL | |
| Normosin | 1 mL | 0.1 mg / mL |
| HBTEC-I (İngilizce) | | |
| HBTEC ortamı | 500 mL | |
| Normosin | 1 mL | 0.1 mg / mL |
| Y-27632 Serisi | Lot numarasına göre değişiklik gösterebilir | 5 μM |
| A83-01 Serisi | Lot numarasına göre değişiklik gösterebilir | 0,5 μM |
Tablo 1: İnhibitörlü bronşiyal epitelyal hava yolu ortamı (BLEAM-I), İnsan bronşiyal/trakeal epitel hücresi inhibitörlü ALI ortamı (HBTEC-I) ve HBTEC için ortam bileşenleri.
| Hücre kültürü şişesi/Hücre kültürü ekleri | 804G hücreli ortam (mL) |
| T25 şişesi | 3 mL |
| T75 şişesi | 5 mL |
| 24 oyuklu hücre kültürü eki (0,4 μm gözenek boyutu, 0,33 cm2 yüzey alanı) | 400 μL |
Tablo 2: Kültür şişeleri ve hücre kültürü ekleri için gerekli olan 804G hücreden türetilmiş matris şartlandırılmış ortamın hacimleri.