Kanamanın durmasına yol açan bir delinme yarası trombüsünün oluşumu hayattaki en önemli olaylardan biridir1. Ancak bu gerekliliğe rağmen, trombüs oluşumu sırasında yapısal olarak ne olduğu, bir damarda, bir arterde, bir aterosklerotik olayda veya tıkayıcı bir pıhtı olsun, bilgi çözünürlük ve görüntüleme derinliği ile sınırlıdır. Konvansiyonel ışık mikroskobu, Z1'de 200 ila 300 μm olmak üzere tam formda bir ponksiyon yara trombüsü ile karşılaştırıldığında derinlik açısından ve trombosit organellerinin boyutu ve aralıkları ile karşılaştırıldığında, genellikle 30 nm2'den daha az çözünürlük seviyesinde sınırlıdır. İki fotonlu ışık mikroskobu, gerekli görüntüleme derinliğini sağlayabilir ancak çözünürlüğü önemli ölçüde iyileştirmez. Işık mikroskobundaki en son gelişmeler, örneğin, süper çözünürlük teknikleri, pratikte XY'de ~ 20 nm ve Z'de bunun iki katı ve derinlik sınırlı, geleneksel ışık mikroskobundan daha fazla olmayan çözünürlük sınırlıdır. Ayrıca, süper çözünürlüklü ışık mikroskobu, araştırma ışık mikroskobunun çoğu gibi, iyi antikorların veya iyi etiketlenmiş yapıların bulunduğu küçük bir aday protein setine doğal olarak önyargılı bir teknik olan floresan mikroskobuna dayanmaktadır3. Sonuç olarak, konvansiyonel taramalı elektron mikroskobu, en fazla, trombositten zengin trombüsün yüzeyini görselleştirebilir.
Trombüs yapısını karakterize etmedeki bu teknik sınırlamaların üstesinden gelmek için üç hedefimiz vardı. İlk olarak, bir fare damarında veya arterinde tekrarlanabilir bir şekilde tanımlanmış bir delinme yarası üretilir ve bu daha sonra kimyasal fiksasyon ile yerinde kolayca stabilize edilebilir. İkinci olarak, membran korumasını vurgulayan bir hazırlık prosedürü uygulayın, bu hedef oluşturan trombüs içindeki tek tek trombositlerin konumunu tanımlama hedefiyle tutarlı bir hedeftir. Üçüncüsü, tek bir görüntüde nanometre ile milimetre ölçeği arasında ölçeklendirilebilen tarafsız bir görselleştirme tekniği kullanın.
Montajlı, geniş alanlı elektron mikroskobu, tek bir önemli nedenden dolayı ana uç görselleştirme tekniği olarak seçildi: elektron mikroskobu görüntülemede, bir hücrenin organellerini ve organellerin içindeki özelliklerini özetleyen çok çeşitli özellikler görülür. Ribozomlar gibi küçük nesneler tanınabilir. Bu özellik yelpazesi, elektron mikroskobunun kontrast elde etmesi için kullanılan elektron yoğun ağır metal lekeleri, uranil, kurşun ve osmiyumun çok çeşitli moleküllere bağlanması nedeniyle görülür. Bir elektron mikroskobu görüntüsünde, orada olanın çoğu görülürken, immünofloresan ve protein etiketleme yaklaşımlarında sadece yanan şey görülür. Bu, örneğin, belirli bir bireysel protein türünde bulunan antijen bölgeleri anlamına gelir. Etiketli bir molekül, genellikle bir protein söz konusu olduğunda, bu proteinin bulunduğu bölge(ler)dir. Diğer tüm moleküller karanlıktır ve aydınlatılmaz. Ancak, bu elektron mikroskobu seçimi pratik midir? Delinme yaralı trombüsün boyutu 300 x 500 μm'dir ve 3 nm piksel boyutunda, yani 100.000 x 167.000 piksellik bir görüntüdür. Yüksek kaliteli bir elektron mikroskobu kamerası 4000 x 4000 piksele sahiptir. Bu, tek bir görüntü elde etmek için yaklaşık 1000 karenin dikilmesi/karıştırılması gerektiği anlamına gelir. Bu, son 15 yılda üretilen çoğu elektron mikroskobunda mevcut olan bir olasılıktır. Mikroskop aşaması bilgisayarlıdır ve görüntüler bir bilgisayarla birleştirilebilir. Sunulan protokolün formülasyonunun altında yatan seçimlere yol açan mantık budur.
Sonuç olarak, farelerin damarında veya arterinde tekrarlanabilir bir yara veren ve daha sonra yerinde fiksasyon adımlarını ve daha sonra gömme adımlarını takip eden, nm ölçeğinde montajlı, geniş alanlı transmisyon elektron mikroskobu ile görselleştirilebilen bir dizi adımı sunuyoruz ve gerçek in situ ölçeği olan mm'ye yakın ölçekte görselleştirilen dikişli görüntüde sabit trombüs. Bu tür bir ölçeklenebilirlik, trombüs oluşumunu hem hematoloji/sağlıkta bir sorun olarak hem de trombositlerin ana hücre tipi olduğu gelişimsel bir biyoloji sistemi olarak anlamak için gereklidir. Bu ilerlemeler, elektron mikroskobunun önemli bir erdemini sağlar, yani kişi sadece yanan şeyi değil, orada olanı görür. Seri blok yüz taramalı elektron mikroskobu (SBF-SEM) için numunelerin hazırlanmasına ilişkin ayrıntılı bir protokol için, okuyucu Joshi ve ark.4'ün yakın tarihli bir makalesine yönlendirilir.