Tavuğun Gastrointestinal Sisteminden Anaerobik Bakteri Yetiştiriciliğini Geliştirme Stratejileri

Harshita Naithani; Bibiana Rios-Galicia; Amélia Camarinha Silva; Jana Seifert

doi:10.3791/66570

Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

Tavuğun Gastrointestinal Sisteminden Anaerobik Bakteri Yetiştiriciliğini Geliştirme Stratejileri

2.3K görüntülenme

⸱

DOI:

10.3791/66570

⸱

10 Mayıs 2024

Harshita Naithani¹^,² , Bibiana Rios-Galicia¹^,² , Amélia Camarinha Silva¹^,² , Jana Seifert¹^,²

¹Institute of Animal Science, University of Hohenheim, ²HoLMiR - Hohenheim Center for Livestock Microbiome Research, University of Hohenheim

Bu makalede

Özet

Protokol, anaerobik bağırsak bakterilerinin izolasyonunu iyileştirmek için iki metodoloji sunar. Birincisi, farklı kültür ortamları kullanılarak çok çeşitli bakterilerin izolasyonuna odaklanır. İkincisi, ekolojik önemini tam olarak anlamak için muhtemelen miyo-inositol'ü asimile eden belirli bir mikrobiyal grubun yetiştirme adımlarına odaklanır.

Özet

Tavuğun gastrointestinal sistemi (GIT), konakçının fizyolojisinde, sindiriminde, besin emiliminde, bağışıklık sisteminin olgunlaşmasında ve patojen girişinin önlenmesinde çok önemli bir rol oynayan trilyonlarca mikropu barındıran karmaşık bir ekosistemdir. Optimal hayvan sağlığı ve verimliliği için, bu mikroorganizmaları karakterize etmek ve rollerini anlamak zorunludur. Kümes hayvanlarının GIT'i, potansiyel probiyotik uygulamalarına sahip bir mikroorganizma rezervuarına sahip olsa da, çeşitliliğin çoğu keşfedilmemiştir. Kültürlenmemiş mikrobiyal çeşitlilik konusundaki anlayışımızı geliştirmek için, bu mikroorganizmaları kültüre getirmek için ortak çabalar gerekmektedir. GIT kolonize edici mikroorganizmaların izolasyonu ve yetiştirilmesi, hücreler, DNA ve metabolitler dahil olmak üzere tekrarlanabilir materyal verir ve çevredeki metabolik süreçlere yeni bakış açıları sunar. Yetiştirme olmadan, bu organizmaların doğal ortamlarındaki rolü belirsiz kalır ve tanımlayıcı bir düzeyle sınırlıdır. Amacımız, hayvan fizyolojisi, hayvan beslenmesi, metagenomik, yem biyokimyası ve modern yetiştirme stratejilerinden elde edilen multidisipliner bilgilerden yararlanarak, tavuğun GIT'inden çok çeşitli anaerobik mikropların izolasyonunu iyileştirmeyi amaçlayan yetiştirme stratejileri uygulamaktır. Ek olarak, izolasyon başarısını etkilediği bilinen numune alma, taşıma ve medya hazırlığı için uygun uygulamaların kullanımını uygulamayı amaçlıyoruz. Uygun metodolojiler, tutarlı bir oksijensiz ortam, optimum atmosferik koşullar, uygun konakçı kuluçka sıcaklığı ve kendine özgü ihtiyaçlarıyla uyumlu olarak özel beslenme gereksinimlerinin sağlanmasını sağlamalıdır. Bu metodolojileri izleyerek, yetiştirme sadece izolasyon için tekrarlanabilir sonuçlar vermekle kalmayacak, aynı zamanda izolasyon prosedürlerini de kolaylaştıracak ve böylece tavuğun GIT'i içindeki karmaşık mikrobiyal ekosistemin kapsamlı bir şekilde anlaşılmasını teşvik edecektir.

Giriş

Mikroorganizmaların incelenmesinde yetiştiriciliğin yeniden canlanması, daha önce sadece kısmen tanımlanmış ve niceliksel olarak tanımlanmış metabolik hipotezleri test etmek için materyal sağlayarak metagenomik çalışmalardan elde edilen içgörüleri tamamlamıştır. Bağırsak bakterilerinin yetiştirilmesi, mikrobiyal-konak etkileşimleri üzerine gelecekteki araştırmaları sürdürmek, hedeflenen kolonizasyon çalışmalarını kolaylaştırmak ve moleküler etkileşim çalışmalarını geliştirmek için materyal sağlar ^1,2,3. Gastrointestinal mikroorganizmalar hakk....