NSC popülasyonunu in vivo olarak tanımlamak için kesin belirteçlerin bulunmaması nedeniyle, NSC'lerin analizi öncelikle ex vivo koşullarda nörojenik nişlerden izole edilen hücrelerin davranışlarının gözlemlenmesine dayanmaktadır. Reynolds ve Weiss'ın öncü çalışmaları, genç yetişkin (2 aylık) fare SVZ dokusundan tek tek hücrelerin yapışkan olmayan koşullar altında izolasyonunu ve genişlemesini sağlayan hassas kültür koşulları oluşturarak zemin hazırladı. Bu hücreler genellikle EGF ve bFGF içeren serumsuz bir ortamda çoğaltılır, bu da proliferasyonu teşvik ederken nöronlara ve glialara farklılaşmayı tamamen önleyen koşullardır. Gerçekten de, bu kültür koşulları9 altında, çoğu hücre kültürdeki ilk günlerde ölür, ancak küçük bir alt küme bölünmeye başlar ve öncelikle yüzen nörosferleroluşturur 9. Bu hücre agregatlarının enzimatik ayrışması ve alt kültürü, kültür yayılımını kolaylaştırarak bu kültürlerin kendini yenileme kapasitesini gösterir.
Özellikle, nörosfer kültürleri sadece EGF ilavesiyle genişleme potansiyeli gösterirken, sadece bFGF içeren bir ortamda yetiştirilen NSC'ler uzun süreli hücre proliferasyonu göstermez30. Her iki kanıt da EGF'yi birincil NSC kendini yenileyen mitojen olarak göstermektedir. Bununla birlikte, kültür ortamında hem EGF hem de bFGF'nin varlığı, NSC'lerin31 kendini yenileme kapasitesini geliştirir ve ayrıca astrositlere, nöronlara ve oligodendrositlere 32,33,34,35 farklılaşma potansiyelinin dengelenmesine katkıda bulunur. Ayrıca, besiyerini desteklemek için ticari alternatifler yerine tanımlanmış bir hormon ve faktör karışımının kullanılması, NSC kültürlerinin yüksek kalitesini ve tekrarlanabilirliğini sağlar. Bu koşullar altında, fare NSC kültürleri ölümsüzleşmeye uğramadan kararlı hücre hatları olarak devam edebilir. Bununla birlikte, nörosfer kültürlerinde bir endişe, proliferatif hücre popülasyonlarının genetik dönüşümlere uğrama, hücre döngüsü düzenleyici mekanizmalarını atlama ve ölümsüzleştirilmiş bir fenotipe yol açma potansiyelidir. Bu nedenle, nörosfer kültürleri oldukça genişletilebilir olmasına rağmen, 10 in vitro pasajın ötesindeki kültürler, replikatif yaşlanmaya maruz kalabilecekleri ve anormal kromozomal içeriğe veya düzensiz büyüme dinamiklerine sahip hücrelerin ortaya çıkabileceği için genellikle çalışmalar için atılır. Ayrıca, uzun süreli yerleşik nörosfer kültürlerinin kullanımı sürekli olarak izlenmelidir. Nörosfer kültürleri ayrıca, in vivo'dan daha doğru bir şekilde modüle edilebilen ve izlenebilen daha kesin ve ayarlanabilir bir ortam sağlayarak, kontrollü bir ortamda özelliklerini ve potansiyellerini inceleme fırsatı sunar. İn vitro klonojenik veya popülasyon analizleri yoluyla, bu hücrelerin kendini yenileme ve çoğalma kapasitelerini ölçmek ve bu özellikleri yöneten altta yatan mekanizmaların tanımlanmasını kolaylaştırmak mümkündür.
Bununla birlikte, NSC'lerle in vitro olarak çalışmanın çok sayıda avantajına rağmen, bu kültür protokolünün doğası ve NSC'lerin inceliği bu alanda bir zorluk teşkil etmektedir. Örneğin, tipik bir diseksiyon sırasında üretilen birincil nörokürelerin sayısı, deneycinin becerisine ve hassasiyetine bağlı olarak önemli ölçüde değişebilir. Birincil nörosfer sonuçları, 500 ila 3000 nörosfer arasında değişen 2 aylık farelerin SVZ'sinden elde edilen birincil nörosferlerin sayısındaki bu değişkenliği göstermektedir. Bu değişkenliğe çeşitli faktörler katkıda bulunabilir. İlk olarak, diseksiyonun hassasiyeti, primer küre oluşumunu engelleyen istenmeyen parankimal dokuyu en aza indirir. İkincisi, küçük SVZ doku parçaları üretmek, verimli enzimatik sindirim ve öğütmeye izin verir, böylece hücre kaybını azaltır. Bu, diseksiyon protokolünün yeterli ön uygulamasına ve nörosfer kültürlerinin kurulması sırasında doku işlemenin ince ayarlı bir şekilde geliştirilmesine olan ihtiyacı vurgulamaktadır.
Bu kültürlerin bir başka sınırlaması, nörosferlerin hem NSC'leri hem de progenitör hücreleri içerebilmesi gerçeğinde yatmaktadır, bu da birincil kültürler içinde bu iki popülasyon arasında ayrım yapmayı zorlaştırmaktadır. GFAP, Nestin, Musashi ve SOX2 gibi çeşitli belirteçlerin NSC8 tarafından ifade edildiği bildirilmiş olsa da, bunların hiçbiri yalnızca NSC'lerle ilişkili değildir. Hücre yüzeyi antijen ekspresyonuna dayanan yeni ortaya çıkan FACS teknikleri, NSC'lerin ve soylarının izolasyonunu sağlamıştır. Bu çalışmalar, transit amplifiye edici progenitörlerin geçiş sırasında nöroküre oluşturamadıklarını göstermiştir25,36. Bu nedenle, SVZ hücreleri ve nörosfer başlatan hücreler arasındaki ilişki daha fazla iyileştirme gerektirirken 18,19,20,21,22,23, nörosferlerin uzun bir süre boyunca seri olarak geçirilebilme yeteneği, kültürlerdeki NSC'lerin varlığını yansıtabilir.
Bu nörosfer kültür sistemi, NSC'nin kendini yenileme kapasitesinin sürdürülmesinde sinyal yolaklarının ve gen ekspresyonunun etkisini araştırmak için sağlam bir model olarak hizmet etmiştir in vitro15,29. Bu yönleri araştırmak için bir yaklaşım, belirli genleri aşırı eksprese etmek veya yıkmak için NSC'leri transfekte etmeyi içerir. Bu, viral ve viral olmayan yöntemler dahil olmak üzere çeşitli tekniklerle gerçekleştirilebilir. Viral vektörler genellikle yüksek gen transfer verimliliği elde ederken, yüksek güvenlik gereksinimleri ve zaman alıcı vektör üretimi gibi önemli sınırlamaları vardır26. Tersine, lipofeksiyon ve elektroporasyon gibi klasik transfeksiyon yöntemleri çok düşük transfeksiyon oranlarına ulaşır ve bu da onları transfekte edilmesi zor hücreler için olanaksız hale getirir. Nükleofeksiyon teknolojisi, hücre tipine özgü nükleofeksiyon solüsyonlarını her hücre tipi için benzersiz elektriksel parametrelerle birleştirerek kullanıcı dostu bir yaklaşım sunar37,38. Bu, DNA'nın doğrudan hücre çekirdeğine39 aktarılmasını sağlar ve DNA'nın hücre döngüsünden bağımsız bir şekilde dahil edilmesine izin verir. Sonuç olarak, nükleofeksiyon, fare NSC'leri28,40 gibi transfekte edilmesi zor hücrelerin transfekte edilmesi için uygun bir teknik olarak ortaya çıkmaktadır.
Bu yöntemin bir sınırlaması, her nükleofeksiyon için en az 2 x 106 hücrenin önerilmesi ve gerekli olmasıdır, ancak optimal koşullarda, tek nükleofeksiyon başına daha az sayıda hücre kullanılabilir (yani, 5 × 105 hücre). Yöntemin bir başka dezavantajı, nükleofeksiyon için kullanılan DNA'nın kalitesi ve konsantrasyonunun gen transfer verimliliğini önemli ölçüde etkilemesidir. Endotoksin varlığına bağlı yüksek hücre mortalitesini önlemek için endotoksin içermeyen hazırlanmış DNA'nın kullanılması şiddetle tavsiye edilir. Ek olarak, nükleofeksiyon için 6 μg'dan fazla toplam DNA kullanmak, hem gen transfer verimliliğini hem de hücre canlılığını önemli ölçüde azaltabilir. Son olarak, elektrik darbesi uygulaması, nükleofecte edilmiş hücrelerin hayatta kalması için de kritik öneme sahiptir.
Bu çalışmada, epizomal plazmitler kullanılarak ekspresyonunun aşağı regülasyonunu içeren bir strateji kullanarak Snrpn gen ekspresyonunun manipülasyonunu örnekledik. Bu plazmitler hücrelerin genomuna entegre değildir ve NSC'ler in vitro olarak çoğalmaya devam ettikçe, sokulan DNA daha sonra hücre bölünmesi boyunca seyreltilecek ve böylece genetik manipülasyonun etkisini kaybedecektir. Bu nedenle, bu strateji, kısa bir süre içinde akut bir değişikliğin etkisini incelemek veya in vitro olarak hücrelerin doğum tarihini incelemek için değerlidir. Gen pertürbasyonunun daha uzun süreli bir etkisini değerlendirmek için bazı alternatifler mevcuttur. Örneğin, transpozon tabanlı piggyBAC gibi bütünleştirici bir sistem kullanılabilir. Bu sistem, transpoze edilebilir dizilerle çevrili plazmitte bulunan istenen kodlama dizisinin tanıtılmasından ve hücrelerin, transpozaz41 enzimi için diziyi içeren bir plazmit ile birlikte nükleofect edilmesinden oluşur. Alternatif olarak, transpozonlar veya CRISPR / Cas sistemleri kullanılabilir.
Transfekte edici teknolojilerin daha da geliştirilmesi, farklı genlerin yetişkin nöral kök hücre fizyolojisi üzerindeki rolünü değerlendirmek için yüksek verimli tahlillere doğru önemli bir adım olacaktır. Giderek daha karmaşık saflaştırma ve genişletme yöntemleriyle birlikte, bu çalışmalar yetişkin NSC'lerin in vitro biyolojisinin anlaşılmasını ve yüzen nörosferler ile NSC'ler arasındaki biyolojik farklılıkların in vivo olarak karşılaştırılmasını sağlayacaktır.