Bu prosedür, patojenik Th17 hücrelerinin in vitro üretimi için farelerin splenik naif CD4 + T hücrelerinin sayısını artırmak için verimli bir yol sundu. Bildirilen diğer Th17 hücre kültürü ortamlarından daha fazla sitokin kullanmamıza rağmen, patojenik Th17 hücrelerinin büyüme koşullarını optimize etmeye kararlıyız. Uyarılmış farklılaştırma protokolümüzün daha da optimize edilmesini düşünüyoruz.
Burada, ayırt edici sitokinlerin üretimini incelemek için basitçe akış sitometrisi ve qPCR kullandık. Birkaç küçük değişiklikle, bu yaklaşım hücre proliferasyonu gibi diğer fonksiyon testleri için de kullanılabilir.
Fare dalağı lenfositlerini izole etmek için Çin yapımı bir lenfosit izolasyon kiti kullandık çünkü etkili ve zaman kazandırıyor. Diğer markalara dayalı lenfosit ayırma çözümleri, fare dalağı lenfositlerini farklı adımlarla ayırma amacına da ulaşabilir. Diğer bir yöntem, elde edilen dalak hücresi süspansiyonunun kırmızı kan hücrelerini doğrudan parçalamaktır; Bununla birlikte, dalak kırmızı kan hücrelerinin genellikle bir kerede parçalanamadığını bulduk.
Bu protokolün yürütülmesi sırasında bazı sorunlar ortaya çıkabilir. İlk olarak, manyetik boncuk ayıklama ile elde edilen saf CD4 + T hücrelerinin sayısı çok düşük olabilir (protokol adımı 3). Bu, organları kırma işleminin yetersiz olmasına bağlanabilir. Organın uygun şekilde homojenize edildiğinden emin olmak önemlidir. Homojenizasyon işlemi sırasında durulama sıklığının arttırılması geri kazanım oranını artıracaktır. Daha fazla sayıda splenic naif CD4 + T hücresi elde etmek için, daha genç fareler (6-10 haftalık) kullanmanızı öneririz. Dalak lenfositlerini ayırmak için çeşitli yöntemler mevcuttur ve verim kullanılan ayırma sıvısına bağlı olarak değişebilir. Evrensel olarak onaylanmış bir ayırma sıvısı kullanılması ve lenfosit tabakasını mümkün olduğunca çıkarmaya çalışılması önerilir.
İkincisi, akış sitometrisindeki CD4 + T hücrelerinin oranı %<80 olabilir (protokol aşaması 5). Bu sorunun olası bir nedeni, ek antikor kokteyli ve manyetik boncuklarınkinden daha büyük bir hücre sayısına neden olan yanlış bir splenosit sayısı olabilir. Naif CD4 + T hücresi saflaştırmasının etkinliğini artırmak için hücre sayımı kesin olmalıdır. Ek olarak, bu protokolün önerdiğinden %10 daha fazla antikor kokteyli ve manyetik boncuk kullanılabilir. Son olarak, saf CD4 + T hücreleri sıralandıktan hemen sonra akış sitometrisi yapılabilir.
Üçüncüsü, kültür sırasında çok sayıda T hücresi kümesi oluşmayabilir ve hücrelerin çoğu T hücrelerinin farklılaşması sırasında ölmüş olabilir (protokol aşaması 4). Bu sorunun olası nedeni, tohumlamadan önce saf CD4 + T hücreleri için hücre sayılarının yanlış belirlenmesi ve bunun sonucunda düşük hücre yoğunluğu olması olabilir. 48 oyuklu bir plakada her bir kuyucuk için yaklaşık 4 ×10 5 hücre/mL istenen hücre yoğunluğunu elde etmek için daha doğru bir sayım yönteminin benimsenmesi önerilir. Başka bir olası neden, yanlış sıcaklık veya CO2 konsantrasyonu gibi CO2 inkübatörü ile ilgili teknik sorunlar olabilir. Son olarak, hücre kültürü ortamını değiştirirken aşırı kuvvet potansiyel olarak hücre ölümüne neden olabilir.
Dördüncüsü, imza sitokin genlerinin nispi ekspresyon seviyeleri düşük olabilir (protokol aşaması 7). Ekstrakte edilen RNA'nın gerçekliğini sağlamak için, 100 ng/mL'den daha yüksek bir nano damlacık tespit konsantrasyonu kullanılması önerilir. Konsantrasyondaki azalmanın potansiyel nedeni, toplanan hücrelerin büyük bir kısmının ölmüş veya ölüm sürecinde olması gibi kültürlenmiş hücrelerin sağlıksız doğası olabilir. Gerçek RNA konsantrasyonunu elde etmek için, hücre kültürü sırasında zayıf büyümeye yol açabilecek durumu çözmek gerekir. Bu endişenin arkasındaki alternatif bir neden, muhtemelen süpernatan imhası sırasında kasıtsız hücre kaybı nedeniyle, RNA ekstraksiyonu sırasında elde edilen aşırı düşük nihai hücre sayısı olabilir. Tek adımlı RNA ekstraksiyon kitleri gibi gelişmiş RNA ekstraksiyon tekniklerinin kullanılması avantajlı olabilir. Nanodrop ile ölçülen ideal OD260/OD280 oranı 1.9-2.1 aralığında olmalıdır. Aşırı düşük bir oran durumunda, protein kontaminasyonu bir olasılık haline gelir. RNaz içermeyen tampon yıkama sıklığının arttırılması bu sorunun hafifletilmesine yardımcı olabilir. Tersine, alışılmadık derecede düşük bir oran, potansiyel RNA bozulması anlamına gelir. Bu sorunu önlemek için, RNaz içermeyen su kullanılması ve RNase dekontaminasyonu amacıyla 1,5 mL'lik tüplerin kullanılması önerilir.
Sonuç olarak, mevcut protokol, in vitro olarak patojenik Th17 hücrelerine farklılaşmak için saf CD4 + T hücrelerini doğrudan indüklemek için yeni hücre kültürü ortamının kullanımını açıklamaktadır. Doğrudan ayırma ile karşılaştırıldığında, bu yöntemin daha doğrudan, ucuz ve daha verimli olduğuna şüphe yoktur. Ortamın konfigürasyonu da çok basittir, böylece yapılandırılmış Th17 hücreleri sonraki deneyler için daha sezgisel olarak kullanılabilir ve birçok hastalığın incelenmesi için çok iyi bir hücre modeli sağlar.