Bu yazıda, PMA ile farklılaşmış THP-1 makrofajlarının LPS ve ATP'ye bağlı ölümünü saptamak için iki yöntem kullanılmıştır. Annexin V/7-AAD çift boyama kullanıldı ve sonuçlar genel boyamadan akış sitometrisi ile analiz edildi. Diğer akış sitometrik analizlerinde olduğu gibi, yanlış pozitif ve yanlış negatif sonuçları dışlamak için bir grup boyanmamış hücre ve iki grup tek boyanmış hücre kuruldu. Sonuçlar, LPS / ATP stimülasyonundan sonra, birkaç hücrenin zar bütünlüğünü kaybettiğini ve bu da hücre ölümünün meydana gelmiş olabileceğini göstermektedir. Bu tespit yöntemi, tüm hücrelerden hücre ölümünü değerlendirmemizi sağlar. Annexin V/7-AAD çift boyamanın piroptoz, apoptoz ve nekrotoz arasında ayrım yapmak için yeterli olmadığını belirtmekte fayda var. Bu üç formun erken aşamalarında, PS plazma zarının dışına maruz kalacaktır ve Annexin V boyaması pozitiftir. Bu üç formun geç evresinde membranın bütünlüğü kaybolur ve boyama sonuçları çift pozitif boyama gösterir. Bu nedenle, meydana gelebilecek olası hücre ölümü biçimlerini daha fazla gözlemlemek için SEM kullandık.
Apoptozda mitokondriyal dış zarda BAX/BAK gözenek oluşumu, ardından hücre küçülmesi ve hücre zarında kanama meydana gelir. Nekrotoz, hücre zarındaki gözenekleri açmak için MLKL'yi kullanırken, piroptoz sinyali, hücre zarında gözenekler oluşturmak için gasdermin'i aktive eder. Hem piroptoz hem de nekrotoza, son aşamada hücre zarı yırtılmasının eşlik ettiğini belirtmek gerekir. Bununla birlikte, gasedermin gözenekleri MLKL gözeneklerinden çok daha büyüktür, bu nedenle gasdermin gözenekleri iyon seçiciliğine sahip değildir. Nekrototik hücreler morfolojide önemli şişlik gösterir15. Sonuçta zar yırtılması ile sonuçlanırlar. Hücre zarı geçirgenlik aktivasyonunun yukarı akışındaki sinyal yolundan bağımsız olarak, hücre zarındaki değişiklikler bu üç hücre ölümü biçimine eşlik eder. Hücre ölümünü incelemek için sezgisel bir yol sağlayan hücre zarını daha fazla gözlemlemek için SEM kullandık. Önceki araştırmacılar tarafından incelenen özelliklerle tutarlı olarak, membran kanaması ve rüptür membranı dahil olmak üzere piroptozun özelliklerini ve hücre şişmesi ve rüptür membranı dahil olmak üzere nekrotozun özelliklerini gözlemledik15. Önceki araştırmacılar tarafından incelenen apoptozun özellikleriyle tutarlı olarak membran kanaması ve hücre büzülmesi gözlemledik16.
Önceki çalışmalarda, LPS ve ATP kombinasyonu genellikle piroptozu indüklemek için kullanılmıştır. İlginç bir şekilde, apoptoz ve nekrotozun özelliklerini gözlemledik. Her üç form da LPS / ATP'nin neden olduğu hücre ölümünde ortaya çıkabilse de, önceki çalışmalar piroptozun baskın ölüm şekli olmaya devam ettiğini göstermiştir. LPS, en karakterize edilen patojenle ilişkili moleküler modellerden biridir. Ölmekte olan hücrelerden salınan ATP, hücre içinde yüksek bir konsantrasyona sahiptir. Hücre dışı ATP, tehlikeyle ilişkili moleküler modellerden biridir17. LPS/ATP, piroptozu indüklemek için klasik iki aşamalı bir stimülasyon yöntemidir. Araştırmalar, LPS ile uyarılan hücrelere ATP ilavesinin kaspaz-118'i hızla aktive edebildiğini, kaspaz-1 geninin susturulmasının ise LPS / ATP'nin neden olduğu hücre ölümünü önemli ölçüde tersine çevirebileceğinigöstermiştir 19. Önceki çalışmalarda, apoptotik ve nekrototik hedef proteinlerin LPS/ATP ile indüklenen aktivasyonunu da bulduk20,21. LPS/ATP klasik bir piroptoz indükleyicisi olmasına rağmen, apoptoz ve nekrotoza da neden olabilir.
Aslında, bu üç form genellikle bağımsız olarak mevcut değildir ve sinyal aşamaları arasında karışma vardır. Örneğin, gasdermin proteinleri, mitokondriyal apoptotik yol22'yi arttırmak için sitokrom c salınımını teşvik etmek için mitokondriyi hedefler. Kaspaz-3'ün aktivasyonu gasdermin E'yi parçalayabilir ve daha sonra piroptozutetikleyebilir 23. Bir çalışma, MLKL / PIPK3 sinyallemesinin NLRP3 inflamatuarlarının24 aktivasyonunda rol oynadığını göstermektedir. Bu karmaşık çapraz konuşma, PANoptozis kompleksi tarafından düzenlenen ve piroptoz, apoptoz ve/veya nekrotozun temel özelliklerine sahip ve tek başına bu programlanmış hücre ölüm yollarının hiçbiri tarafından açıklanamayan inflamatuar programlanmış bir hücre ölüm yolu olarak tanımlanan PANoptosis kavramına yol açmıştır25. PANoptosis kavramı önerildiğinde, bilim adamları programlanmış hücre ölümünün oluşumunu daha kapsamlı bir şekilde tanımladılar, bu aynı zamanda programlanmış hücre ölümünün karmaşıklığını da vurgulamaktadır. Bu arada, bu aynı zamanda bu araştırma yönteminin sınırlılıklarını da göstermektedir. LPS / ATP'nin neden olduğu hücre ölümünde piroptoz baskın olarak kabul edilse de, bu ölüm formlarının oranı veya hepsinin var olup olmadığı, hatta diğer programlanmış ölüm formlarını da içerip içermediği belirlenemez. Bu, gelecekte araştırılması gereken bir alan olabilir.
Bu protokol, LPS ve ATP'nin neden olduğu makrofaj ölümüne dayanmaktadır. Diğer modeller ve hücreler için de geçerli olan, bütünden bireye kadar bir test yöntemi tanımladık. Sonuçlar, hücrelerin piroptozla sınırlı olmayan piroptoz, apoptoz veya nekrotoz geçirmiş olabileceğini ve araştırmacıların LPS ve ATP stimülasyonundan sonra hücre ölümünü daha iyi anlamalarına ve daha iyi bir deneysel yöntem seçmelerine yardımcı olabileceğini göstermektedir. Önceki çalışmalarda, Annexin V/7-AAD veya Annexin V/PI çift boyama, apoptoz26,27 oluşumunu belirtmek için yaygın olarak kullanılmıştır, bazı araştırmacılar bunu apoptoz28'i incelemek için de kullanmışlardır. Aslında, bu çift boyama yoluyla üç tür hücre ölümü arasında ayrım yapamayız. Bu protokol, araştırmacılara, özellikle yeni başlayanlara, Annexin V/7-AAD veya Annexin V/PI çift boyamanın hücre ölümü tipini kalitatif hale getiremeyeceğini hatırlatır. Sadece hücre hasarını ve ölümünü bir bütün olarak gösterebilir veya hücrenin bir tür ölüm geçirmiş olabileceğini gösterebilir. Daha hedefli araştırmalarda, kesin olarak program ölümünün el altında olduğunu göstermek için diğer ölümleri engelleyen bir kontrol grubu tanıtmak gerekir. Benzer şekilde, daha fazla mekanik araştırma, farklı programlanmış ölümlerin kritik hedeflerini araştıracaktır.
Ek olarak, deneyin hazırlanması sırasında, şu anda asılı hücrelerin çok az tanımı olan, yapışık hücrelerin SEM'i için birçok ayrıntılı deneysel prosedür olduğunu bulduk. Burada, askıda hücreler için numune hazırlama yönteminin daha ayrıntılı bir açıklamasını sunuyoruz. Adım 5.5, askıya alınmış hücrelerin hücre slaytları üzerine hareketsiz hale getirilmesine yardımcı olmak için gerekli bir adımdır. Hücre ayrılmasını önlemek için sonraki işlemler nazikçe yapılmalıdır. Krom şap çözeltisine ek olarak, poli-L-lizin de hücreleri hareketsiz hale getirebilir.