Fotosentez, ışık enerjisinin kimyasal enerjiye dönüştürüldüğü ve karasal trofik ağların temel taşı olarak hizmet eden temel bir süreçtir. Bitkilerin çoğu, birincil fotosentetik ürünün üç karbonlu bileşik gliserat 3-fosfat olduğuC3 fotosentez yolunu takip eder. C3 fotosentezi, 2 milyar yıldan fazla bir süre önce, CO2'de bol veO21'de düşük olan atmosferde gelişti. Bu koşullar altında gelişen anahtar fotosentetik enzim ribuloz 1,5 bifosfat karboksilaz/oksijenaz (Rubisco), O2 ile rekabetçi bir şekilde reaksiyona girerek fotorespirasyon2'yi başlattığı için mevcut düşük CO2 yüksek O2 koşulları için yetersizdir. Fotorespirasyon, enerjiyi üretmek yerine tüketen ve yan ürün olarak CO2 salan savurgan bir yoldur. Sonuç olarak, oksijenasyonu önlemek için kloroplastlarda Rubisco çevresinde yüksek CO2 konsantrasyonunun korunması çok önemlidir 3,4. C3 bitkilerinin CO2'yi konsantre edememesi nedeniyle, ortam havasından kloroplastlara önemli bir CO2 düşüşü olur, bu da fotosentezi engeller ve bitki büyümesini ve biyokütle üretimini etkiler 2,5,6.
C3 bitkilerinde fotosentez, CO2'nin stoma yoluyla girişi, mezofil yoluyla difüzyonu ve fotosentetik enzimlerin biyokimyasal aktivitesi ile sınırlıdır. CO2'nin girişi ilk olarak hava sıcaklığı ve nem gibi çevresel koşullar tarafından kontrol edilen stoma iletkenliği ile sınırlıdır. Daha sonra CO2 yaprağın iç gaz ve sıvı fazından Rubisco7'ye yayılır. C3 bitkilerinde, fotosentezin tüm aşamaları mezofil hücrelerinin kloroplastlarında meydana gelir ve bitkilerin atmosferden kloroplastlara sürekli bir CO2 akışı sağlaması gerekir. Kloroplastlardaki CO2 mevcudiyetinin stoma açıklığına, mezofil mimarisine ve bireysel hücre ve kloroplast özelliklerine bağımlılığı, bitkileri düşük su mevcudiyeti ve yüksek sıcaklıklar 7,8,9,10 gibi sonunda fotosentezi etkileyen çevresel kısıtlamalara karşı hassas hale getirir ve özellikle iklim değişikliği koşullarına karşı savunmasızlıklarını vurgular11.
C3 yolunun verimsizliklerinin ortaya çıkardığı zorlukların yanı sıra optimal CO2 seviyelerinin korunmasındaki sınırlamalar ve çevresel faktörlere duyarlılık göz önüne alındığında, bazı bitkilerde başka bir yol olanC4 fotosentez yolu gelişmiştir. Karakteristik olarak,C4 bitkilerinin mekansal olarak ayrılmış iki biyokimyasal yolu vardır; ilk CO2 fiksasyonu, mezofil hücrelerinde, CO2 için Rubisco'dan daha yüksek bir afiniteye sahip olan ve aynı zamanda oksijenasyon aktivitesinden yoksun olan fosfoenolpiruvat karboksilaz ile meydana gelir. OluşanC4 ürünü ayrıca dekarboksilatlandığı demet kılıf hücrelerine taşınır ve CO2 tekrar salınır ve Rubisco (C3 fotosentezi) ile sabitlenir12,13,14. PEP karboksilazın CO2'ye ve demet kılıf hücrelerinin kalın hücre duvarlarına daha fazla afinitesi, demet kılıf hücrelerinde CO2 konsantrasyonuna izin verir ve bu nedenle,C4 bitkileri, CO2 fiksasyonunu ve Calvin döngüsünü uzamsal olarak ayırarak fotorespirasyonu en aza indirir. C4 yolunun benimsenmesi, doğanın çevresel kısıtlamalara uyarlanabilir tepkisini sergileyerek, değişen iklim koşullarında mahsul verimliliğini ve direncini artırmak için potansiyel stratejiler hakkında içgörüler sunar15.
C4 bitkilerindeki yaprak yapısının özel anatomisi, kloroplast içeren genişlemiş vasküler demet kılıf hücreleri ile çevrili damarlar ve demet kılıf hücreleri etrafında bir dış halka deseninde mezofil hücrelerinin radyal bir düzenlemesi ile karakterize edilir. Özofil hücreleri, iki hücre tipi arasında metabolitlerin hızlı ve sürekli bir şekilde taşınmasını sağlayan demet kılıf hücrelerine yakındır. Bu hücrenin düzeniC4 bitkileri için tipiktir ve Kranz anatomisi16 olarak adlandırılır. C3 türlerinde, mezofil hücresi uzmanlaşması ve eğilimi değişebilir, ancak demet kılıf hücreleri belirgin şekilde daha küçüktür ve birkaç kloroplast içerir veya hiç kloroplast içermez. Spesifik Kranz anatomisi, C 3-karboksilatlayıcı enzim Rubisco'nun bulunduğu demet kılıf hücrelerindeki kloroplastlarda CO2'nin konsantre edilmesine izin verir ve fotorespirasyonu etkili bir şekilde engeller 4,17,18. Görünüşte karmaşık düzenlemesine rağmen, bu değişiklikler kapalı tohumluların evriminde bağımsız olarak birçok kez meydana gelmiştir, bu da bunun nispeten uygulanabilir bir evrimsel yol olduğunu gösterir 19,20,21 ve çeşitli taksonlarınC3-C 4 veya C2 olarak adlandırılan C3 ve C4 karbon metabolizması arasında bir ara aşamada olduğu gösterilmiştir. CO2 22,23,24,25'i konsantre etme ve yeniden özümseme yeteneklerine sahip olmak.
BirçokC4 bitkisi, yüksek ekonomik öneme sahip ürünlerdir ve iklim direncini artırmak ve verimi güvence altına almak için pirinç gibiC3 bitkilerinin genetik mühendisliği, son on yılda ilgi konusu olmuştur26,27. Bununla birlikte, mühendislik çabaları,C4 özel anatomisinin ve fotosentezi nasıl kontrol ettiğinin ayrıntılı bir şekilde anlaşılmasını gerektirir 2,28.
C4 Kranz anatomisini oluşturmak, C4 fotosentezini C3 ekinlerine25 mühendislik gibi iddialı bir hedefe ulaşmak için bir ön koşuldur. Bununla birlikte, Kranz anatomisinin düzenlenmesi ve temel anatomik özelliklerinin hızlı bir şekilde taranması için kullanılan yöntemlere ilişkin mevcut anlayış sınırlıdır ve bu da melez türlerin tanımlanmasını zorlaştırmaktadır. Önceki çalışmalar,C3 veC4 bitkilerinde fotosentetik verimliliği düzenleyen temel özelliklerin damarlar arası mesafeyi, demet kılıf kompleksinin çapını ve demet kılıf hücrelerinin boyutunuiçerdiğini göstermiştir 14,29. Bu özellikler, serbest el kesitleri kullanılarak kolayca taranabilir ve yarı ince kesitler kullanılarak kantitatif olarak analiz edilebilir. Burada, serbest el çapraz ve ışık mikroskobu yoluylaC3 veC4 anatomik farklılaşma teşhisine izin veren özellikleri, yani demet kılıf alanı, damarlar arası mesafe ve damar frekansını değerlendirme yöntemini açıklıyoruz.