Bu protokol, bir sıçan modelinde optimize edilmiş iki aşamalı kollajenaz karaciğer perfüzyon tekniği sunar ve in vitro uzun süreli 3D organoid kültürü için izole hepatositlerin kullanımını gösterir.
Yöntem makalesi
Bu protokol, bir sıçan modelinde optimize edilmiş iki aşamalı kollajenaz karaciğer perfüzyon tekniği sunar ve in vitro uzun süreli 3D organoid kültürü için izole hepatositlerin kullanımını gösterir.
Primer hepatositler, in vitro karaciğer ile ilgili çalışmalar için yaygın olarak kullanılan bir araçtır. Bununla birlikte, kültürdeki hızlı morfoloji, canlılık ve işlevsellik kaybı nedeniyle bu hücrelerin bakımı her zaman bir zorluk olmuştur. Uzun vadeli kültüre yeni bir yaklaşım, karaciğerin kendini yenileme konusundaki muhteşem yeteneğine dayanan bir tabaktaki dokuları özetleyebilen bir in vitro araç olan üç boyutlu (3D) organoidlerin üretilmesidir. Yayınlanmış protokoller, primer erişkin hepatositlerden (Hep-Orgs) uzun süreli fonksiyonel 3D organoidler elde etmek için tasarlanmıştır. 3D organoid son teknoloji araç, hücreleri yetişkin dokusundan izole etme yeteneği gerektirir ve bu ilk adım, yüksek kaliteli bir nihai sonuç için çok önemlidir. 1970'lerde tanıtılan iki aşamalı kollajenaz perfüzyonu, tek hepatositler elde etmek için hala geçerli bir prosedürdür. Bu makale, cerrahi prosedürün tüm önemli adımlarını tanımlamayı ve böylece sıçan modelinde primer hepatosit izolasyon prosedürünü optimize etmeyi amaçlamaktadır. Ayrıca, başarılı prosedürlerin olasılığını artırmak ve yüksek kaliteli sonuçlar elde etmek için PREPARE yönergelerine özellikle dikkat edilir. Ayrıntılı bir protokol, araştırmacıların birincil yetişkin sıçan hepatositlerinden 3D organoidler oluşturmak için aşağı akış çalışmasını hızlandırmasına ve optimize etmesine olanak tanır. 2D hepatositlerle karşılaştırıldığında, Hep-Org'lar hala yaşayabilir ve 15. günde aktif proliferasyondaydı ve uzun vadeli bir potansiyel gösterdi.
Primer hepatositler, in vitro karaciğer ile ilgili çalışmalar için önemli ve yaygın olarak kullanılan bir araçtır. Bununla birlikte, kültürde birkaç gün geçirdikten sonra morfolojilerini ve işlevselliğini kaybettikleri için genişlemeleri ve bakımları tarihsel olarak zor olmuştur1. 2D kültür, özellikle poligonal bir şekle ve farklılaşmış apikal ve bazolateral membranlara sahip polarize yapıya sahip hepatositler için sınırlayıcı bir durumdur. Aslında, hepatositlerin plakaya yapışması normal aktivitelerine müdahale eder, çünkü hücreler arasında ve hücreler ile hücre dışı matris (ECM) arasında sınırlı etkileşime sahip düz bir hücre iskeletine yol açar, polarizasyonu ve ilgili sinyal yollarını azaltır2.
Bu yöntemin sınırlamalarını aşmak için, Dunn ve meslektaşları3 önce kollajen çift tabakasını kullandılar. "Sandviç kültürü yöntemi" olarak bilinen bu kültür yöntemi, matrisin iki tabakası arasındaki birincil hepatositlerin tohumlanmasına dayanır. Bu yöntemin, uzun süreli kültür, poligonal morfolojinin sürdürülmesi ve taze izole edilmiş hepatositlerinkiyle karşılaştırılabilir transkripsiyonel aktiviteler dahil olmak üzere birçok avantajı vardır4. Aynı prensibe dayanan, alt tabakanın Matrigel'den oluştuğu, kollajen kaplamasının ise iyi kurulmuş bir kanaliküler ağın varlığını kanıtlamıştır5.
Hepatosit büyümesi için sandviç kültür yönteminin güvenilirliğine rağmen, bu çalışma, bir tabaktaki dokuları özetlemek ve kişiselleştirilmiş tıbba doğru potansiyel bir köprü oluşturmak için kullanılan bir in vitro araç olan 3D organoid kültürün kurulmasını, hastalığa özgü biyolojik içgörülerin üretilmesine, moleküler hedeflerin belirlenmesine, ilaçların test edilmesine, biyobankaların kurulmasına ve çip üzerinde organ gibi yenilikçi teknolojiler için yeni ufuklar açılmasına izin vermeyi dört gözle beklemektedir6. Birincil hepatositler, kubbelerin içinde organoidlerin sağlam bir şekilde büyümesine izin vermek ve hepatosit büyüme faktörü (HGF) ve epidermal büyüme faktörü (EGF) dahil olmak üzere çözünür faktörlerin kültür ortamından akışını garanti etmek için "kubbeler" olarak bilinen yarım küre matris damlacıklarına gömüldü. Bu büyüme faktörleri, hepatositlerin hayatta kalmasını sağlamak için sinyal yollarını doğrudan aktive eder7. Karaciğer organoidleri genellikle embriyonik aşamalardan veya yetişkin sıçanlardan, farelerden, insan (ve ayrıca köpekler ve kediler) karaciğerinden izole edilen kök/progenitör hücrelerden elde edilir8. 3D konformasyon, kök hücrelerin yetişkin hepatositlere farklılaşmasını iyileştirse bile, bu araç hala orijinal birincil dokununolgunluğundan yoksundur 9. Bu sorunun üstesinden gelmek için, 2018'de iki farklı grup 9,10 aynı anda yetişkin birincil fare hepatositlerinden (Hep-Orgs olarak anılır) başlayarak uzun vadeli bir 3D karaciğer organoidleri kültürü elde etmek için bir protokol yayınladı. Protokolleri, karaciğer rejenerasyonunun proliferatif hasar yanıtını, parsiyel hepatektomi sonrası ortaya çıktığı gibi yüksek düzeyde inflamatuar sitokin ile büyüyen hepatositleri özetlemektedir. Gerçekten de, yukarıdaki çalışmalar, hepatositlerin yaralanmayı12 takiben veya kolanjiyosit proliferasyonu baskılandığında13 duktal duruma geçebileceğini göstermektedir. Bipotent kapasiteleri, organoidler gibi karmaşık yapılar için önemli olan hücresel plastisiteye izin verir. Bu nedenle, bu protokoller primer hepatositlerin in vitro olarak genişletilememesi sorununun üstesinden gelir.
3D organoid son teknoloji araç, hücreleri yetişkin dokusundan izole etme yeteneği gerektirir ve bu ilk adım, yüksek kaliteli bir nihai sonuç için çok önemlidir. 3D organoid preparasyonu yeni ve gelişmekte olan bir teknik olarak kabul edilebilirken (organoid tanımı sadece on yıl önce Lancaster14 ve Huch15 tarafından icat edildiği için), iki aşamalı kollajenaz perfüzyonu, 1970'lerde Seglen tarafından tanıtılan eski bir prosedürdür16. Alandaki en son yayınlara odaklanarak, Ng17 ve Shen18'in protokolleri, fareler için Cabral19 ve Charni-Natan20'nin protokolleri sıçanlarda prosedürü gerçekleştirmek için altın standart olarak kabul edilebilir. Araştırmacıların, 3D organoidleri geliştirmek için en iyi hücre dışı matrisi (ECM) ve büyüme faktörlerini seçmeye odaklanmaları, ancak yanlış cerrahi prosedür, düşük hepatosit canlılığı ve verimi veya yüksek düzeyde bakteriyel kontaminasyon gibi başarısızlıklarla karşılaşmaları alışılmadık bir durum değildir. Bu problemler, aşağı akış deneylerini uzatır ve sonraki deneyler için gereken hayvan sayısını artırır. Tersine, cerrahi ve izolasyon prosedürleri iyi kurulmuşsa, elde edilen yüksek sayıda canlı hepatosit, çok sayıda organoidin hazırlanmasına izin verir, böylece hayvanların kullanımını sınırlar. Mevcut protokol esas olarak ticari çözümler kullanarak ve karaciğer in situ ile optimal perfüzyon ve sindirim adımlarını sağlayan hassas bir portal ven kanülasyonunu optimize ederek bu sorunları ele almaktadır.
Hayvan araştırmalarımızın kalitesini, tekrarlanabilirliğini ve tercüme edilebilirliğini geliştirmek için PREPARE yönergelerini dikkatlice değerlendirdik: Hayvanlar Üzerinde Araştırma ve Deneysel Prosedürlerin Planlanması: Mükemmellik için Öneriler21. Bu raporlama yönergeleri, planlama yoluyla başarı olasılığını artırmaya çalışır ve Russel ve Burch'un 3R'lerinin (değiştirme, azaltma ve iyileştirme) uygulanmasında önemli bir adımı temsil eder. PREPARE kılavuzu, her bir araştırma projesine göre ele alınması gereken 15 ana konuyu kapsamaktadır. Projenin planlanması ve hazırlanması sırasında odaklandığımız konuları anlatacağız.
Bu çalışma, araştırmacıların aşağı akış çalışmasını hızlandırmalarına ve optimize etmelerine izin vermek için sıçan modelindeki cerrahinin önemli adımlarını kapsamlı, ayrıntılı ve sonuç olarak ortaya çıkan bir protokolde tanımlamayı amaçlamaktadır. Bu protokollere ilk başta yaklaştığımızda, tekniğin başarısını kolayca etkileyebilecek bakteriyel kontaminasyon, düşük karaciğer sindirim etkinliği, düşük primer hepatosit verimi ve düşük hepatosit canlılığı sorunları yaşadık. Kritik özelliklerin nasıl ele alınacağını ve çözüleceğini gösteren bu protokol, birincil sıçan hepatosit izolasyonu prosedürünü optimize etti. Sıçan karaciğer perfüzyonu ve müteakip primer erişkin hepatosit izolasyonu, farklı uygulamalar için ana ön adımlardır. Özellikle, bu protokol, yüksek kaliteli ve yüksek canlılığa sahip yetişkin hepatositlerin iyi bir verimini gerektiren tüm prosedürler için uygundur. Protokol sonuçları, karaciğer fizyolojisi ve patolojisini incelemek için in vitro modeller oluşturmak için uygundur.
Tüm prosedürler ve hayvan barınağı, İtalyan Hukuku ve Avrupa Topluluğu direktifinin yönergelerine göre yürütülmüştür. Deney protokolü, yerel Hayvan Bakım Komitesi ve İtalya Sağlık Bakanlığı tarafından 26/2014 sayılı kararnamenin 31. maddesine göre (izin no/321/2022-PR) onaylanmıştır.
1. Hayvan prosedürü için hazırlık
NOT: Ortam ve tampon bileşimi için lütfen Tablo 1'e ve ticari ayrıntılar için Malzeme Tablosuna bakın.
2. Hepatosit izolasyonu için hazırlık
3. İlk hayvan prosedürü ve anestezi
4. Kanülasyon ve karaciğer perfüzyonu
5. Karaciğer sindirimi
6. Hepatosit saflaştırma
7. Hepatosit kültürü ve RNA toplanması
3D organoidler, kişiselleştirilmiş tıp için bir sınırdır ve uzun süreli bir hepatosit kültürüne izin verir. Bu yenilikçi tekniğin kalitesi, iyi bir canlı primer hepatosit verimi ve iyi uygulanmış karaciğer perfüzyonu ve hepatosit izolasyonu gerektirir. Bu eski prosedür hala yaygın olarak kullanılmaktadır; ancak, zorlayıcı olabilecek farklı adımlardan oluşur. Prosedüre yaklaşırken, bakteriyel kontaminasyon, düşük karaciğer sindirim verimliliği, düşük primer hepatosit verimi ve düşük hepatosit canlılığı gibi kritik sorunlar yaşadık ve bunların tümü tekniğin başarısını kolayca etkileyebilir. Altın standart protokoller 17,18'den başlayarak, burada yaygın sorunların nasıl üstesinden gelineceğini vurguluyor, primer sıçan hepatosit izolasyonundaki en kritik adımları açıklığa kavuşturuyor ve sıçan modelinde tekniğin başarısını kolayca etkileyebilecek dağınık ipuçlarını özetliyoruz. Karaciğer perfüzyonu prosedürü oldukça zorlu olmasına ve operatörden hassas uzmanlık gerektirmesine rağmen, primer hepatositlerin verimi, bütünlüğü, canlılığı ve işlevselliği açısından yüksek kaliteli sonuçları garanti eder. Bu özellikler sonraki aşamalar için gereklidir.
Projenin planlanması sırasında, PREPARE kılavuz kontrol listesi21'i dikkatlice dikkate aldık. Geçmiş literatüre özel önem verildi, önceki farklı çalışmalar karşılaştırıldı ve bazı yazarlarla temasa geçildi (PREPARE guidelines kontrol listesi _topic A1). Organoid aracın kendisi, hücreler kültürde 7 aya kadar çoğaltılabildiğinden, hayvan sayısını azaltmanın önemli bir yoludur (PREPARE kılavuzları kontrol listesi _topic A3). Hayvan tesisi personeli ile diyalog kurarak, prosedüre yardımcı olan ve fazla deney hayvanlarının kullanımından kaçınılmasına katkıda bulunan deneyimli bir teknisyen seçtik (PREPARE yönergeleri kontrol listesi _topic B5). Karaciğer perfüzyonu yapmak için gerekli uygun bir peristaltik pompa elde edildi (PREPARE kılavuzları kontrol listesi _topic B6).
Ng17 ve Shen18'in yayınları, sıçanlarda prosedürü açıklayan en son yayınlardır. Bu protokol tarafından ele alınan, daha öncekiler tarafından ele alınmayan ana sorular, ticari çözümlerin kullanımı ve karaciğeri yerinde tutan optimal perfüzyon ve sindirim adımlarını sağlayan kesin bir portal ven kanülasyonunun optimizasyonu ile ilgilidir. Shen18 ve Ng17'nin protokolleri ev yapımı solüsyonlar kullanırken, protokolümüz tampon hazırlamada azaltılabilirlik için ticari perfüzyon ve sindirim solüsyonlarına dayanmaktadır. Aşırı sindirim enzimi konsantrasyonu hepatositlere karşı agresif olabilir ve hücrenin kalitesini ve canlılığını etkileyebilir25. Ticari çözümlerin kullanılması, protokolün tekrarlanabilirliğini artırmak ve standardizasyonu garanti etmek için kritik öneme sahiptir. Ayrıca, Ng17 tarafından gerçekleştirilen protokol, sindirim aşamasından önce karaciğerin çıkarılması gerekliliği nedeniyle zor olabilir. Protokolümüz, her iki faz da gerçekleştirilene kadar karaciğerin çıkarılmadan perfüzyonu ve sindirimi üzerine kuruludur, bu da prosedürü basitleştirir. Hücre verimi ve hücre canlılığı açısından protokolümüzün sonuçları önceki çalışmalarla karşılaştırılabilir.
İşlem öncesi ve sonrası perfüzyon tüplerinin temizlenmesi ve dezenfeksiyonu, ameliyata başlamadan önce cilt dezenfeksiyonu ile birlikte bakteriyel kontaminasyonu sınırlamak için çok önemlidir. Ayrıca, etanol temizliğinden sonra borunun tamamen kurutulması ve ardından ortamla yıkanması, hücre canlılığını artırmak için çok önemlidir. Aslında, karaciğere enjekte edilen tek bir etanol atışı bile işlem sırasında hücre ölümüne neden olur.
Enjekte edilen çözeltinin sıcaklığı önemlidir, ancak aynı zamanda kollajenaz enziminin sıcaklığa duyarlılığı da dikkate alınmalıdır. Bu nedenle, cerrahi işleme başlamadan önce Perfüzyon tamponunu 42 °C'de önceden ısıtırken, Sindirim tamponunu sadece perfüzyon adımı sırasında ısıtma banyosuna koyduk. Kateterin yukarı akışındaki boruya bir baloncuk kapanı eklemek, kaçan kabarcıkların katetere ulaşmasını ve perfüzyon solüsyonu bittiğinde havanın karaciğere girmesini önler17.
Tampon bileşimi, perfüzyon basıncı ve akış hızı uygun aralıktaolmalıdır 17. Düşük basınç ve düşük akış hızının düşük verime neden olduğunu ve tamponun küçük damarlara ulaşamaması nedeniyle hücre canlılığını olumsuz etkilediğini deneyimledik. Öte yandan, Glisson kapsülünü sağlam tutmak için akış hızı çok yüksek olmamalıdır. Hücre yapışmasının bütünlüğü Ca2 + 18 gerektirdiğinden, perfüzyon tamponu, hücreler arasındaki kalsiyum içeren köprülere saldırmak için EDTA içeren Ca2 + içermeyen bir çözeltidir, bu nedenle kalsiyumun uzaklaştırılması ve karaciğerden kanın yıkanması için gereklidir. 10 mL / dk'lık bir akış hızı ile 8-15 dakikalık perfüzyon süresi, tüm hücrelere EDTA, Ca2 + içermeyen çözelti ile ulaşılmasını sağlamak için çok önemlidir. Optimal olmayan bir perfüzyon, sindirimin azalmasına neden olabilir.
Sindirim tamponu Ca2+ içerir, çünkü kollajen matrisini sindiren kollajenaz Ca2 + 'ya bağımlıdır. Sindirim tamponunun akış hızı en az 20 mL / dk'da tutulmalıdır ve süre kollajenaz kapasitesine bağlıdır. Kullandığımız spesifik Sindirim tamponu durumunda, 300 mL'lik bir çözeltinin son hacmi için 15 dakika perfüze etmemiz gerekir. Sindirim tamamlanmazsa, hücre-hücre bağlantıları korunur ve ardışık mekanik basınç hücrelere zarar vererek canlılığı azaltır. Akış hızının yavaşça arttırılması, perfüzyonun hücrelere olan stresli etkisinin azalmasına katkıda bulunur. Ameliyat sırasında, geçici inferior vena kava klemplenmesine ve ardından karaciğer şişmesine odaklandık: bu geçiş hem sindirim verimliliğini hem de hücre iyileşmesini önemli ölçüde iyileştirdi. Sindirimin sonunda karaciğer açık kahverengi ve yumuşak görünmelidir. Karaciğer rezeksiyonu tamamlandığında, izole edilen karaciğerin PBS +%3 P/S'de yıkanması bakteri unvanını azaltır ve işlemin sonraki kısmında kontaminasyonu önlemeye yardımcı olur.
Biyolojik başlığın altındaki hepatosit izolasyon adımları için, 25 mL serolojik pipetlerin kullanılması, daha küçük delikli pipetler tarafından hepatosit canlılığının azaltılmasını önler. Birincil hepatosit verimini artırmak için isteğe bağlı bir adım ekledik, bu da William'ın tam ortamının kaputun altındaki kazıma adımını tekrarlamak için parçalanmış karaciğerin üzerine dökülmesidir. Bu adım, hücre tarafından salınan ortamın izole edilmiş karaciğerden filtrelenmesinden sonra yapılır ve Petri'nin temizlenmesine ve karaciğer kapsülünden daha fazla hücrenin geri kazanılmasına yardımcı olur. Hepatositleri filtrelerden geçirmek için yüksek basınç uygulamak gerekirse, hücre canlılığı düşük olacaktır19.
Hepatositlerin 2 günden fazla bir süre 2 boyutlu olarak kültürlenememesi, bizi alternatif bir uzun dönem kültür modeli bulmaya yöneltti. Hepatositleri daha uzun süre kültürlemek için uygun bir model erişkin Hep-Org'dur. 2D hepatositlerle karşılaştırıldığında, Hep-Org'ların 15. günde hala canlı ve aktif proliferasyonda olduğu ortaya çıktı ve bu da uzun vadeli bir potansiyel gösterdi.
Sıçan karaciğer perfüzyonu ve müteakip primer erişkin hepatosit izolasyonu, farklı uygulamalar için ana ön adımlardır. Prosedür birçok adım ve değişken içerdiğinden tekrarlanabilirlik tekniğin bir sınırlaması olabilse de, prosedürün görsel tanımına dikkat etmek, yöntemin yüksek bir başarı oranı ile tekrarlanmasına yardımcı olur. Kritik aşamalara işaret eden ve bunların nasıl ele alınacağını gösteren bu protokol, primer sıçan hepatosit izolasyonu prosedürünü ve karaciğer fizyolojisi ve patolojisini incelemek için Hep-Orgs nesli olarak in vitro modeller oluşturmaya uygun sonuçları optimize eder.
Tüm yazarlar her türlü çıkar çatışmasını açıklamıştır.
Trieste Üniversitesi SorrentinoLab'dan Dr. Davide Selvestrel ve Prof. Giovanni Sorrentino'ya EdU proliferasyon testini gerçekleştirmemize yardımcı oldukları için teşekkür ederiz. Çalışma, Banca d'Italia ad hoc hibesi ve okul içi FIF hibeleri ile desteklendi.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| A83-01- ALK5 İnhibitörü IV | İkiz Sarmal | T3031 | |
| B27 | Thermofisher Scientific | 0080085SA | |
| CFX Connect Gerçek Zamanlı PCR Tespit Sistemi | Bio-Rad | ||
| CHIR99021 | İkiz Sarmal | T2310 | |
| Click EdU Alexa 488 görüntüleme kiti | Thermofisher Scientific | C10499 | |
| Kollajen, Tip I, sıçan kuyruğundan çözelti | Merck | C3867-1VL | |
| Deksametazon | Merck | D4902 | |
| EGF | Merck | E9644 | |
| Fetal sığır serumu (FBS) | Euroclone | ECS0180L | |
| GELTREX LDEV FREE RGF BME | Thermofisher Scientific | A1413202 | |
| Heparin Sodyum 25000 IU / 5 ml | B. Braun Melsungen AG | B01AB01 | |
| HGF | Peprotech | 100-39H | |
| İnsülin-Transferrin-Selenyum çözeltisi 100x | Thermofisher Scientific | 41400045 | |
| L-Glutamin çözeltisi | Euroclone | ECB3000D | |
| Karaciğer Digest Ortamı | Thermofisher Bilimsel | 17703-034 | |
| Karaciğer Perfüzyon Ortamı | Thermofisher Scientific | 17701038 | |
| N2 takviyesi | Thermofisher Scientific | 17502048 | |
| N-asetilsistein | Merck | A9165 | |
| Nikotinamid | Merck | N-0636 | |
| Esansiyel Olmayan Amino Asitler | Merck | M7145 | |
| Normosin | Aurogene | ant-nr-1 | |
| PBS tamponu 1X | PanReac AppliChem | A0964,9050 | |
| Penisilin-streptomisin çözeltisi 100x | Euroclone | ECB3001D | |
| Percoll | Santa Cruz | sc-296039A | |
| Peristaltik pompa | İsmalekt ve ticaret; | MS-4/12 Reglo Dijital Pompa | |
| TNFa | Peprotech | 300-01A | |
| TRI Reaktif | Merck | T9424 | |
| Boru ve nbsp; | İsmalekt ve ticaret; | ID.2,79mm | |
| Williams' E Medium, glutamin içermez | Thermofisher Scientific | 31415029 | |
| Y27632 | İkiz Sarmal | T1725 |