$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bu protokol, hafif-orta şiddette ET-1 kortikal inme modeli bağlamında Neurod1'in ektopik ekspresyonunu araştırmak için iki AAV sistemini ve fare modelini detaylandırır. ET-1 inme ile ilgili bir dizi kritik adımın, yaralanmanın tekrarlanabilirliği ve tutarlılığı için dikkate alınması önemlidir. İstenmeyen cerrahi yaralanmaları önlemek için çapak delikleri dura mater delinmeden dikkatlice delinmelidir. Benzer bir ilgi alanını sağlamak için tutarlı yer işaretleri, bu durumda bregma kullanmak önemlidir (bu çalışmada sensorimotor korteks). Bu, lezyonun yeri ve boyutu fonksiyonel sonuçları etkileyeceğinden, davranışsal değerlendirmeleri kullanan çalışmalar için özellikle önemlidir 13,22,25,27. En önemlisi, ET-1'in enjeksiyon hızı ve cerrah tarafından şırıngaya uygulanan basıncın, tekrarlanabilir sonuçlar için tutarlı olması gerekir. Unutulmamalıdır ki, şırınganın iğnesi tıkanabilir ve doğru ET-1 dağıtımını sağlamak için hayvanlar arasında temizlenmesi gerekir. Dokunun hücresel analizi sırasında, bir inme lezyonu gözlenmezse, iğne muhtemelen ameliyat sırasında tıkanmıştır. Sorun devam ederse, geçmişte partiye bağlı potens sorunları gözlemlendiği için üreticiden yeni bir lot endotelin-1 alın.
AAV vermek için cerrahi prosedürün adımları, ET-1 inme indüksiyon protokolününkine benzer. Bu nedenle, yukarıda belirtilen hususlar kritiktir. Ek olarak, transdüksiyon verimliliğinin gruplar arasında karşılaştırılabilmesini sağlamak için AAV viral titresi ve hacmi tutarlı olmalıdır. Bu protokolde akut çalışma için 1 x 109 GC/μL AAV ve kronik çalışma için 1 x10 10 GC/μL AAV uygulandı. Artefakt yanlış ekspresyonunu en aza indirecek kadar düşük, ancak yeterli hücre transdüksiyonunu sağlamak için yeterince yüksek olan ve deney grupları arasındaki farklılıkların tespit edilmesini sağlayan bir viral doz seçmek çok önemlidir. Bu tür çalışmalar için optimal viral doz aralığı 107-10 10 GC/μL13,24 olarak belirlenmiştir. Daha yüksek AAV titreleri sadece kontrol grubundaki nöronların kapsamlı bir şekilde etiketlenmesine neden olmakla kalmaz, aynı zamanda astrositozu indüklediği, kan-beyin bariyerini bozduğu ve inflamatuar yanıtları yukarı regüle ettiği gösterilmiştir28,29. İnme sonrası viral aracılı transkripsiyon faktörü dağıtımını araştıran çalışmalar, AAV enjeksiyonları için farklı uygulama bölgeleri kullanmıştır. Bir çalışma, inme lezyon bölgesine tek bir AAV enjeksiyonu kullanılarak transdüksiyon hücrelerinin başarılı bir şekilde etiketlenmesini tanımladı13. Diğer çalışmalar, enfarktüs alanı30 etrafındaki bir ila üç alanı hedeflemektedir. Burada, AAV, perilezyonel glial sınır9'daki reaktif astrositleri dönüştürmek amacıyla ET-1 enjeksiyon bölgesinin koordinatlarında bir enjeksiyon ve lezyon bölgesini çevreleyen 2 enjeksiyon (1.0 mm anteriorda bir enjeksiyon ve 1.0 mm posteriorda bir enjeksiyon) olmak üzere üç yerde verildi. Dokunun hücresel analizi sırasında, hiç veya çok az (1-10 hücre / bölüm) floresan hücre gözlenmezse, iğne enjeksiyon sırasında tıkanmış olabilir veya AAV çok fazla dondurularak çözülmüş olabilir, bu da virüsün inaktivasyonuna yol açar.
Transdüksiyonun etkinliği hafif-orta dereceli inme modelinde farklı zamanlarda incelendi ve sonuçlar, inme sonrası hem subakut hem de kronik zamanlarda Neurod1 ile tedavi edilen beyinlerde önemli ölçüde daha fazla nöronun etiketlendiğini gösterdi. Burada gösterilen çalışma, inme sonrası kronik fazda Neurod1 transdüksiyonunu gösteren ilk çalışmadır ve inme sonrası 8 hafta boyunca Neurod1'i ektopik olarak eksprese eden nöronları ortaya çıkarır. Kontrol vektörlerine karşı Neurod1 alan inme yaralı beyinlerde artan sayıda transdüksiyon nöronunun görüldüğüne dair bulgular, Neurod1'in AtN dönüşümünde rol oynaması ile tutarlı olsa da, hücresel sonuçları yorumlamak, deneysel paradigmanın sınırlamaları hakkında sağlam bir bilgi gerektirir. AtN dönüşümünü araştıran yayınlanmış çalışmaların büyük çoğunluğu, inme 4,31 dahil olmak üzere nörodejeneratif hastalıklarda reaktif astrositlerde GFAP yukarı regüle edildiğinden, promotör olarak GFAP'yi kullanır. Bununla birlikte, düşük GFAP ekspresyonunun nöronlarda da meydana geldiği gösterilmiştir32. Bu, kontrol grubundaki (Stroke-Cre) transdüksiyona uğrayan hücrelerin bir yüzdesinin önceden var olan nöronlar olduğu burada bildirilen bulgularla tutarlıdır32. Spesifik olarak, bu protokoldeki Stroke-Cre kontrol grupları, önceden var olan nöronların etiketlenmesini temsil eden ve nöronlarda GFAP promotörü güdümlü ekspresyonunu gösteren NeuN + Reporter% 18.43 +/- %3.03 ve 53.05 +/- %5.028 etiketleme gösterdi. Gerçekten de, Neurod1'in hedeflenen ekspresyonu, viral tropizm de dahil olmak üzere bir dizi faktöre bağlıdır. AAV5'in, sensorimotor korteks de dahil olmak üzere farklı beyin bölgelerinde farklı verimlilikte nöronları transdüksiyon ettiği gösterilmiştir, bu da AAV serotiplerinin transkripsiyon faktörlerinin ektopik ekspresyonunu indükleyen çalışmalarda dikkate alınması gereken bölgesel hücre tropizmine sahip olduğunu gösterir31,33. Fare suşları ayrıca AAV iletiminide etkileyebilir 14,34. Yabani tip (C57BL / 6J) ve FVB / N farelerinin striatumunda AAV transdüksiyonunu karşılaştıran bir çalışma, iki suşta değişken hücre tropizmi ve transdüksiyon verimliliği buldu34.
Cre-Flex sisteminin bir avantajı, vahşi tip farelerde uzun süreli etiketleme için kullanılabilmesidir, bu da Cre-reporter fare serilerinde15,35 bulunan spesifik olmayan Cre ekspresyonu sorununu azaltabilir. Cre-Flex sisteminin bir dezavantajı, viral üretim sırasında yeniden birleştirilmiş LoxP bölgelerine sahip viral partiküllerin %0.1-0.8'i nedeniyle Cre'den bağımsız transgen ekspresyonunun meydana gelebilmesidir36. Bu bulgular, soy izleme deneylerinin önemini vurgulamaktadır, örneğin, Aldh1l1-CreERT2 fare hattını kullanarak AAV uygulamasından önce astrositleri önceden etiketlemek, sonuçları15 bildirirken AtN dönüşümünün fazla tahmin edilmemesini sağlamak için. Çalışmalar, insan GFAP promotörünün, aşağı akış genleri (Neurod1 gibi) tarafından cis-regülasyonu yoluyla aktivasyonunun, endojen nöronlarda GFAP ekspresyonuna yol açabileceğini ve tedavi grubunda daha fazla sayıda etiketli nörona yol açabileceğini göstermiştir15,32. Birlikte, bu çalışmalar ve buradaki bulgular, analiz sırasında önceden var olan ve endojen nöronları ayırt etmek için AAV uygulamasından önce astrositleri veya nöronları önceden etiketlemek gibi soy izleme deneylerinin önemini vurgulamaktadır15.
Nöronal transdüksiyonu azaltabilecek sonraki adımlar göz önüne alındığında, farklı AAV serotipleri ve / veya daha az karışık astrosite özgü bir promotörün kullanılması yararlı olacaktır19. Astrosit heterojenliğini tanımlayan artan sayıda rapor, astrositlerin farklı alt popülasyonlarının genel olarak AtN dönüşümüne daha duyarlı olması durumunda gen ekspresyon özgüllüğünü daha da etkileyebilir 37,38,39,40.
Klinik öncesi yaralanma veya hastalık modellerinde kullanılan hayvanların yaşı da değişken sonuçlara yol açabilecek önemli bir husustur. Örneğin, nörotravma durumunda, yaş astrosit reaktivitesini etkileyebilir ve bu da AtN dönüşümü41 için çalışma sonuçlarını etkileyecektir. Ek olarak, Cre ile indüklenebilir raportör satırları zaman içinde ifade özgüllüğünü kaybedebilir ve bu da sonuç ölçümlerinietkileyebilir 42. Bugüne kadar, yaşlı hayvanlarda yeniden programlama kapsamlı bir şekilde araştırılmamıştır43.
Protokol, inme sonrası 2 fazda AAV dağıtımını tanımlar: (1) subakut faz (7 günde) ve (2) kronik faz (21 günde) iskemik inme sonrası. Kronik inme modelinde Neurod1'in ektopik ekspresyonu incelenmemiştir; Bu nedenle, bu geç aşamada önemli ölçüde daha fazla nöronun etiketlendiği gözlemi, kronik inmede inme iyileşmesini teşvik etmeyi amaçlayan gelecekteki çalışmalar için önemli etkilere sahiptir. İnme sonuçlarını iyileştirmek için Neurod1'in ektopik ekspresyonu potansiyelini inceleyen çalışmaların, inme sonrası fonksiyonel sonuçlar terapötik bir müdahale için klinik olarak en ilgili başarı ölçütleri olduğundan, davranışsal değerlendirmeleri içermesi gerekecektir 13,22,25,27.
Şu anda, inme sonrası subakut ve kronik fazlarda inmeye bağlı sakatlıklardan muzdarip hastalar için, sınırlı yararı olan rehabilitasyon dışında, herhangi bir tedavi mevcut değildir. Glia'da nörojenik bHLH genlerinin zorla ekspresyonunun inme sonrası fonksiyonel sonuçları iyileştirdiği gösterilmiştir 22,30. Bulgular, Neurod1'in ektopik ekspresyonunun, kontrol vektörünü alan farelere kıyasla AAV doğumundan 3 ve 7 hafta sonra nöronal transdüksiyonu artırdığını gösteren AtN yeniden programlama çalışmaları ile tutarlıdır. En önemlisi, birkaç makale, AtN yeniden programlama alanında çalışma kontrolleri, tasarım ve yorumlar için önerileri özetlemiştir 17,18,19,22. Bu amaçla, bu protokol, gözlemlerin altında yatan hücresel mekanizmalara ilişkin daha fazla araştırmayı bilgilendirmek ve ilerletmek için kullanılabilecek inme sonrası transkripsiyon faktörlerinin ektopik ekspresyonu için AAV sistemlerini ve fare modellerini tanımlamıştır.