G proteinine bağlı reseptörler (GPCR'ler), bilinen en çok çalışılan ve karakterize edilen protein süper ailelerinden biridir. En iyi bilinen işlevinde, GPCR'ler, sinyal iletiminde bir hücre yüzeyi reseptörü olarak görev yapar ve belirli bir ligandla bağlandıktan sonra hücre içi yanıtları başlatır. GPCR'ler, yedi transmembran (TM) sarmal alan ve toplam altı döngü alanı ile karakterize edilir. Altı halkadan, üç ilmek, ligand bağlanmasını kolaylaştırmak için hücre dışı olarak yönlendirilirken, diğer üç hücre içi ilmek, Gα, Gβ ve Gγ alt birimlerinden 1,2 oluşan heterotrimerik bir G proteinine bağlanır.
GPCR'ler, A Sınıfı Rodopsin Benzeri, B Sınıfı Sekretin Reseptör ailesi, C Sınıfı Glutamat, D Sınıfı Mantar Çiftleşme Feromon Reseptörleri, E Sınıfı Siklik AMP reseptörleri ve F Sınıfı Kıvırcık/Düzleştirilmiş 3,4 dahil olmak üzere çeşitli sınıflara ayrılır. Adından da anlaşılacağı gibi, GPCR rodopsin benzeri Sınıf A alt sınıfı, fototransdüksiyon ve görsel işlevden sorumlu kritik GPCR olan rodopsin içerir. Rodopsin, daha önce bahsedilen yedi TM sarmal alanı, altı hücre dışı ve hücre içi döngü ve fotoreseptörlerde transdüsin (Gt) olarak da bilinen heterotrimerik bir G proteini ile ilişki dahil olmak üzere, GPCR'lerin kanonik modelinde bulunan tüm ilgili temel özellikleri ve yapısal unsurları içerir 1,5,6,7. Rodopsinin bağlanma cebi içinde, ışığa duyarlı kromofor ligandı olan 11-cis-retinal, bir kovalent Schiff baz bağı yoluyla lizin 296 üzerindeki rodopsine bağlanır ve böylece 11-cis-retinylidene 1,8 oluşturur. Bir fotonun emilmesi üzerine, 11-cis-retinyliden fotoizomerleri, rodopsin içinde konformasyonel bir değişikliğe neden olarak all-trans-retinyliden'e dönüşür. Bu nedenle, 11-cis-retinal ligand, rodopsin GPCR'nin işlevi için kritik öneme sahiptir ve fotoreseptörler içindeki yüksek devir hızının üstesinden gelmek için sağlam ve verimli bir 11-cis-retinal kaynağı sürekli olarak sürdürülmelidir.
11-cis-retinal gibi retinaldehitler, topluca retinoidler olarak adlandırılan bir molekül grubuna aittir ve biyolojik olarak ilgili retinoidler daha yaygın olarak A vitamini olarak adlandırılır. A vitamininin retinaldehitleri ve ilişkili vitamerleri, siklik uç grup olarak β-iyonon halkasını, bir diterpen polien zincirini ve vitamere bağlı olarak farklı bir polar uç grubunu, yani retinaldehitler için aldehit grubunu, retinoller için hidroksil grubunu, retinoik asitler için karboksil grubunu, retinil esterler için ester bağını içeren bu karakterizasyonun bir istisnası değildir. vb (Şekil 1)9,10.
Memeliler A de novo vitaminini sentezleyemezler, ancak bitkiler sentezleyebilir; Bu nedenle, memeli sistemlerindeki tüm retinoidler, bitki bazlı üreticilerin diyetinden besin zincirindeki tüketicilere kadar kaynaklanmalıdır. A vitamini metabolizmasının kanonik modelinde, arketipsel bitki provitamin A olan β-karoten, çöpçü reseptör sınıfı B, üye 1 (SCARB1) yoluyla bağırsak enterositine emilir, β-karoten oksijenaz 1 (BCO1/BCMO1) tarafından iki all-trans-retinal molekülüne bölünür, bu da retinalit bağlayıcı protein 2'ye (RBP2) bağlanır ve all-trans-retinol dehidrojenazlar (RDH) ile retinol, lesitin retinol asiltransferaz (LRAT) tarafından retinil esterlere dönüştürülür ve daha sonra şilomikronlarda kan dolaşımına gönderilir 11,12,13,14. Öte yandan, retinil palmitat gibi retinil esterler, hayvansal kaynaklardan elde edilen baskın provitamin A görevi görür. Bağırsak lümeninden gelen retinil palmitat, karboksilestaz 1 (CES1) ile all-trans-retinole hidrolize edilir ve bağırsak enterositine15 yayılır. Karaciğer, retinil ester hidrolazları tarafından hücresel retinol bağlayıcı protein 1'e (CRBP1) bağlanan all-trans-retinol içine hidrolize edilen bu şilomikronların içindeki retinil esterleri emen A vitamini homeostazı için birincil depolama ve homeostatik organdır, hepatik yıldız hücrelerine girer ve depolama için LRAT tarafından tekrar retinil esterlere dönüştürülür 13,16, 17. Organizmada homeostatik bir A vitamini seviyesini korumak için karaciğer, retinol bağlayıcı protein 4 (RBP4) ve transtiretinden (TTR) oluşan bir serum taşıma kompleksine bağlı all-trans-retinol formunda A vitamini salgılar15,18,19. Bu kompleks, bu el yazmasında holo-RBP4 olarak anılacaktır.
Kandaki bu sistemik A vitamini kaynağını kullanmak için, sağlam bir A vitamini kaynağının korunduğu oküler doku da dahil olmak üzere sistemik dokuların, holo-RBP4'ü dokuya emmek için bir yönteme sahip olması gerekir. Oküler dokudaki fotoreseptörden zengin retina içinde, retinoik asit 6 (STRA6) tarafından uyarılan membran reseptörü bu fonksiyonda rol oynayan taşıyıcıdır. Mekanik çalışmalarda, STRA6'nın holo-RBP4'ten RPE20'ye hücre dışı all-trans-retinol alımını kolaylaştırabildiği gösterilmiştir. Bu ithal edilen all-trans-retinol daha sonra görsel döngüye girecektir, bu da all-trans-retinolün RPE ve fotoreseptör dış segmenti içinde 11-cis-retinal'e dönüştürüldüğü ve böylece rodopsin 9,21'e bağlandığında görsel işlevi kolaylaştırdığı süreçtir.
Dolaşım holo-RBP4'ten gelen all-trans-retinol, kan-retina bariyerini STRA6 yoluyla oküler doku içindeki RPE'ye geçtiğinde, RPE'deki all-trans-retinol önce LRAT ile retinil esterlere esterleştirilir, daha sonra retinal pigment epiteline özgü 65 kDa proteini (RPE65) ile 11-cis-retinol'e hidrolize edilir. 11-cis-retinol daha sonra retinol dehidrojenaz 5 tarafından 11-cis-retinal'e dönüştürülür. Bu 11-cis-retinal daha sonra interfotoreseptör retinoid bağlayıcı protein (IRBP) tarafından fotoreseptörün dış segmentine (OS) taşınır9,21. Dış nükleer tabaka (ONL) içindeki fotoreseptör çekirdeğini çevreleyen endoplazmik retikulum içinde, opsin GPCR'ler sentezlenir ve bağlantı silyumu (CC) boyunca taşınır. CC boyunca bu taşımada yer alan motor proteinler tartışmalıdır, ancak mevcut hipotezler, kinesin ve dynein bazlı intraflagellar taşıma (IFT) veya miyozin bazlı taşımayı bu sürecin olası kolaylaştırıcıları olarak göstermektedir 14,22,23,24,25,26. Bu iki bileşen, işletim sistemi içindeki membranöz diskler içinde buluştuğunda, 11-cis-retinal ve opsin, fototransdüksiyon8 için hazır olan rodopsin üzerindeki lizin 196'da bir Schiff baz kovalent bağı yoluyla 11-cis-retinyliden oluşturur.
Retinanın RPE'si içinde STRA6'nın ekspresyonu, holo-RBP4'ten all-trans-retinol alımını kolaylaştırmaya yardımcı olurken, STRA6'nın A vitamini için ana homeostatik organ olarak rolüne ve holo-RBP4'ten all-trans-retinol alımında yetenekler sergilemesine rağmen karaciğerde eksprese edildiği bulunmadı 15,19,27,28, 29,30,31. Sonunda, retinol bağlayıcı protein 4 reseptörü 2 (RBPR2) adı verilen benzer bir reseptör keşfedildi ve STRA6'ya çok benzeyen holo-RBP4'ten all-trans-retinol alma kabiliyetini sergiledi, ancak hepatik doku32'de eksprese edildi.
Bu nedenle, rodopsinin görsel işlevdeki rolünün tam olarak anlaşılması, görsel pigmentin yenilenmesiyle sonuçlanan biyolojik süreçlerin anlaşılmasını gerektirir. Bu da, provitamin A öncüllerinin metabolizması, karaciğer içinde depolama, holo-RBP4'ün karaciğer tarafından salınması ve nihai olarak holo-RBP4'ün STRA6 ve RBPR2 membran reseptörleri yoluyla alınması dahil olmak üzere daha önce açıklanan süreçlerle yakından ilişkilidir. Yukarıda bahsedildiği gibi, fareler gibi hayvan modelleri, bu tür süreçlerin incelenmesinde önde gelen modellerden biri olmaya devam etmektedir. Bu nedenle, murin dokusundaki retinoidler için bir ekstraksiyon yönteminin yanı sıra bu retinoidleri tespit edebilen ve miktarını belirleyebilen normal fazlı yüksek performanslı bir sıvı kromatografisi (HPLC) yöntemi sunmak istiyoruz. Bu yöntemler kullanılarak, 11-cis-retinal rodopsin ligandı veya ana taşıma retinoid all-trans-retinol gibi yukarıda tarif edilen önemli retinoidler oküler, hepatik ve sistemik organlarda analiz edilebilir. Fare dokusundaki retinoid arzını değerlendirerek, retinoidlerin lojistik tedariki ile ilgili hastalık durumları ve patolojileri hakkındaki anlayışımız daha da geliştirilebilir.
Retinoidler, opsin GPCR'leri ile ilişki yoluyla görsel işlevde bir kromofor olarak işlev görmenin yanı sıra, doğrudan DNA'ya bağlanan ve gen transkripsiyonunu düzenleyen iki nükleer reseptör ailesi, retinoik asit reseptörleri (RAR'lar) ve retinoid X reseptörleri (RXR'ler) tarafından kolaylaştırılan retinoik asit sinyali yoluyla memeli hücre sinyallemesinde de önemli bir rol oynar33. Bu iki aile veya reseptörün her ikisi de ligand olarak retinoik asitler şeklinde retinoidler kullanır. RAR'ların hem all-trans-retinoik asit hem de 9-cis-retinoik asit için afiniteye sahip olduğu gösterilmiştir, oysa RXR'ler sadece 9-cis-retinoik asit için afinite ifade eder 34,35. Kontrolsüz miktarlardaki retinoik asitler teratojeniktir ve retinoik asit sinyalizasyonu son derece sıkı bir şekilde kontrol edilmelidir36. Sinyalleme için retinoik asitlerin üretimi, arka beyin ve uzuv gelişimi gibi dokuların düzgün gelişimi için yerel olarak ve çok belirli zaman noktalarında gerçekleşmelidir, ancak sayısız başka örnek retinoik asit sinyalini kullanır37,38. Retinoik asit sinyalizasyonuna katılan hücreler içinde, retinoik asitler, STRA6 veya RBPR2 tarafından alınan retinollerin retinaldehitlere oksidasyonunu kolaylaştıran alkol/retinol dehidrojenazlar (ADH'ler/RDH'ler) ve retinaldehitlerin retinoik asitlere oksidasyonunu kolaylaştıran retinaldehit dehidrojenazlar (RALDH'ler) olmak üzere iki enzim grubu tarafından sentezlenir39. Retinoik asitler, kendi başına GPCR sinyalizasyonuna katılmamakla birlikte, yine de sinyal reseptörleri için bir ligand olarak işlev gören çok önemli bir retinoid olarak bulunur.
Burada ayrıntılı olarak açıklanmasa da, gıda araştırmaları ve mikrobiyal rodopsin çalışmaları gibi çeşitli bağlamlarda HPLC kullanarak retinoid tespiti için önceden belirlenmiş yöntemleri kabul etmek isteriz. Bu yöntemler, daha az uçucu ve tehlikeli mobil fazlar40,41,42, retinoik asitlerin ve bunlarla ilişkili izomerlerin40,41 tespiti ve farklı biyolojik kaynaklardan saflaştırma ve ekstraksiyon gerektiren ters faz tekniklerinin kullanılması dahil olmak üzere retinoid tespiti için farklı hedefler ve yaklaşımlar kullanır43. Yöntemimiz özellikle memeli dokusundan retinil palmitat, retinaldehit izomerleri ve retinol izomerlerinin tespitine odaklanmaktadır. Amaçlanan kullanım durumu bu özel uygulamadan farklıysa farklı protokoller dikkate alınmalıdır.