Her gün yaklaşık 280 milyar kırmızı kan hücresi (RBC) tüm vücutta oksijen taşınmasını sağlamak için kemik iliğinde üretilir1. Eritropoez, hematopoietik kök hücrelerden olgun, fonksiyonel kırmızı kan hücreleri üreten ince ayarlanmış bir farklılaşma sürecidir. Miyelodisplastik sendrom, aplastik anemi, talasemi ve konjenital diseritropoietik anemi dahil olmak üzere hem edinilmiş hem de doğuştan gelen birçok hastalık bu süreci etkileyebilir2.
Bozulmuş eritropoezin klinik belirtisi, dünya çapında önemli bir morbidite nedeni olan anemidir. Anemi belirtileri yorgunluk, nefes darlığı ve baş dönmesinden kalp yetmezliği ve kalp durması gibi yaşamı tehdit eden durumlara kadar değişir3. Dünya çapında 1,8 milyar insanı etkileyen anemiile 4, bu koşulları ve altta yatan mekanizmaları araştırmak için eritropoezin ex vivo modellenmesi küresel bir öncelik olmaya devam etmektedir. Burada açıklanan yöntem, hem sağlıklı hem de hastalıklı eritroid farklılaşmasını incelemek için basit ve sağlam bir model sağlamayı amaçlamaktadır. Bu model, bu süreçte belirli genlerin rollerinin diseksiyonuna izin verir ve anemik hastalara fayda sağlayabilecek bileşiklerin test edilmesini sağlar. Tarihsel olarak, etkisiz eritropoezin modellenmesi, bazı hastalıklı kemik iliklerinde kök hücre azlığı ve kemik iliği nişini taklit eden zorluklar da dahil olmak üzere birçok zorluğa sahip olmuştur.
Önceki çalışmalar benzer veya daha karmaşık protokoller kullanmıştır; örneğin, Bondu ve ark. eritroid farklılaşma kokteylinden IL6'yı çıkarmadan önce 4 gün boyunca eritropoietin (EPO), kök hücre faktörü (SCF) ve interlökin-6 (IL6) dahil olmak üzere bir sitokin kokteyli kullandılar, aksine, Yip ve ark. sitokin kokteyllerine sadece 7 günlük sıvı kültürden sonra EPO eklediler. Elvarsdóttir ve ark. eritroid hücrelerin en yüksek genişlemesini ve olgunlaşmasını kolaylaştırmak için CD34+ hücreleri için üç boyutlu (3D) bir kültür modeli geliştirdi, eritroblastik adaların ve enükleasyonlu eritrositlerin oluşumu da dahil olmak üzere, halka sideroblastları 5,6,7,8 . Bu protokol, hücreleri genişletirken sadece üç sitokin kullanır (yani, SCF, trombopoietin [TPO] ve FMS benzeri tirozin kinaz 3 [FLT3]) ve tüm farklılaşma süreci boyunca tutulan üç sitokin (yani, EPO, IGF1 ve SCF). Bu farklı çalışmalarda paylaşılan temel kriterlerden biri, CD34 + hücrelerinin kullanımıdır. Bu hücrelerin kökeni değişse de, bu farklı protokollerde tutarlı bir şekilde kullanılırlar. Kaynaklar, granülosit koloni uyarıcı faktör (G-CSF) mobilize edilmiş hastalardan veya kemik iliği ponksiyonlarından toplanabilen yetişkin kemik iliği örnekleri elde etmek için UCB'nin non-invaziv toplanmasından daha invaziv prosedürlere kadar değişebilir. Genel olarak, sıvı kültür modelleri 14 gün boyunca taşınırken, 3D modeller hücreleri daha uzun süreler boyunca koruyabilir. Bu protokoller, genetik hastalıkların ve eritropoezdeki bozulmaların modellenmesi için gereklidir. Kısa firkete RNA (shRNA) knockdown'ları gibi genetik yaklaşımlar, ilgilenilen genleri susturmak ve eritropoezdeki rollerini incelemek için kullanılabilir. Gen susturmanın etkisi daha sonra farklılaşmanın çeşitli aşamalarında izlenebilir ve hem sağlıkta hem de hastalıkta anemiyi incelemek için ex vivo bir insan kırmızı kan hücresi üretimi modeli sağlar. Bu protokol, CD34+ kordon kanı hücrelerinin, gelişmiş yeşil floresan proteini (EGFP) gibi bir muhabir geni yapısal olarak eksprese eden shRNA ile transdüksiyonunu içerir ve örneklerin floresanla aktive edilen hücre sınıflandırması (FACS) ile sıralanmasına izin verir. Hücreler daha sonra 2 hafta boyunca farklılaşma ortamında inkübe edilir ve akış sitometrisi analizi ve immünokimya boyaması ile izlenir.