Tükürük bezlerinden başlayarak organ diseksiyonu sırasına özellikle dikkat etmenizi öneririz. Gerçekten de, sivrisineğin bütünlüğü korunduğu takdirde Culex örneklerinin göğüs kafesinden daha kolay çıkarıldıklarını gözlemledik. Karın veya göğüs kafesinin hasar görmesi, sivrisineğin vücudundaki basıncı azaltarak prosedürü engelleyebilir. Bununla birlikte, göğüs kafesi ile karın arasında kesi yapmak ve daha sonra tükürük bezlerini baş ve göğüs kafesinden çıkarmak da mümkündür (A. B. Failloux, kişisel iletişim). Ek olarak, yetkin diseksiyon becerileri edinmek zor olabilir, bu nedenle deneyden önce yeterli sayıda örnek üzerinde pratik yapmanızı öneririz.
Sistematik bir şekilde çapraz kontaminasyondan kaçınırken sivrisinek organlarını izole etmek, çok çeşitli aşağı havza sivrisinek mikrobiyota analizleri için çok önemlidir. Güney Fransa'daki Culex pipiens örneklerinden tek yumurtalıkların diseksiyonunu takiben genomla çözülmüş bir metagenomik çalışma, Culex pipiens'te Wolbachia'nın ilk plazmidinin keşfedilmesine izin verdi (pWCP14). Benzer bir yaklaşım kullanarak, çeşitli çevresel ve laboratuvar koşullarında dünya çapında hem kıta hem de ada bölgelerinden Culex pipiens ve Culex quinquefasciatus örneklerinde pWCP'nin dağılımını ve sıklığını araştırdık. Genel olarak, veriler Culex sivrisineklerinde dikkate değer ölçüde korunmuş bir Wolbachia plazmit elementini ortaya çıkardı ve bu da endosimbiyont biyolojisinde bu hareketli element için çok önemli bir rol oynadığını düşündürüyor15 ve daha fazla analiz gerektiriyor.
Burada, bu sistematik prosedür kullanılarak elde edilen orta bağırsak ve yumurtalık örnekleri üzerinde sivrisinek mikrobiyom analizlerinin ek örneklerini sunuyoruz. Dokular arasında mikrobiyotada belirgin bir fark gözlemledik (Şekil 5), hem paylaşılan hem de organa özgü bakteri taksonları ile. Beklendiği gibi, Wolbachia'nın varlığı her iki organda da tespit edildi, daha yüksek nispi bolluk (birleştirilmemiş kısa okumalara dayanarak) ve sivrisinek yumurtalıklarında orta bağırsaklara kıyasla MAG'lerin ortalama kapsamı, bu endosimbiyotun yumurtalıklar yoluyla iletildiği ve daha sonra somatik dokulara yayıldığı gözlemiyle tutarlı olarak. Bu çalışma Yeni Kaledonya'dan alınan örneklerle sınırlı olmasına rağmen, bu protokol Wolbachia'nın genomik değişkenliğinin küresel ölçekte araştırılmasını ve kendisinin yoğunluk regülasyonu ve viral koruma dahil olmak üzere çeşitli fenotiplerdeki rolünü kolaylaştırabilir. Ayrıca, bu çalışma, burada sunulan diseksiyon prosedürünün, orta bağırsak örneklerinde sivrisinek simbiyontlarının taksonomik çeşitliliğinin ve potansiyel fonksiyonel yeteneklerinin incelenmesine nasıl izin verdiğini örneklemektedir.
Sadece iki orta bağırsak örneğinde bulunan iki enterobakteriyel taslak genomu elde ettik ve bu iki örnek için organlar arasında kontaminasyon olmadığını doğruladık. 3. bireyin hem bağırsaklarında hem de yumurtalıklarında tespit edilen spiroketlerle ilgili olarak, Juma ve meslektaşları, 2020 yılında bu bakterilerin yumurta sallarının yüzeyinde varlığını gözlemledi. Yazarlar, yumurta sallarında bulunan bakteri topluluklarının, yumurta sallarının deiyonize ve bakteri içermeyen suda tutulduğu göz önüne alındığında, öncelikle yumurtalıklardan maternal olarak kalıtsal olabileceğini öne sürdüler. Bununla birlikte, yumurtlamadan hemen sonra meydana gelen bakteri kolonizasyonu olasılığını göz ardı edemediler ve yumurtalık mikrobiyomu16 üzerinde daha fazla çalışma yapılmasını önerdiler.
Başlangıçta Culex pipiens tür kompleksinin örnekleri için tasarlanmış olsa da, bu protokolün Anopheles veya Aedes gibi diğer vektörleri inceleyen daha geniş bir tıbbi entomolog topluluğuna uygulanabilirliğini öngörüyoruz. Bu yöntem, bireysel organlar düzeyinde çalışarak, vektör kontrol stratejilerini ilerletme potansiyeli ile birlikte, simbiyont genomik değişkenliği hakkında ince bir ölçekte içgörüler sunarak hem birey içi hem de bireyler arası genomik karşılaştırmaları mümkün kılabilir. Tükürük bezlerinin, yumurtalıkların ve orta bağırsağın mikrobiyal çapraz kontaminasyonu önleyen bu diseksiyon ve izolasyon yöntemi, bu üç organdaki viral enfeksiyon dinamiği çalışmaları için de yararlı bir protokol olabilir.