Bu çalışma, C-glikozitleri parçalayabilen bağırsak bakterilerini verimli bir şekilde taramak ve izole etmek için bir dizi standart işletim prosedürü (SOP) oluşturur.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
* These authors contributed equally
Bu çalışma, C-glikozitleri parçalayabilen bağırsak bakterilerini verimli bir şekilde taramak ve izole etmek için bir dizi standart işletim prosedürü (SOP) oluşturur.
C-glikozitler tıbbi bitkilerde yaygın olarak bulunur ve antibakteriyel, antienflamatuar, antiviral, antioksidan ve antineoplastik aktiviteler dahil olmak üzere çeşitli biyoaktivitelerle birlikte geniş yapısal çeşitlilik sergiler. C-glikozitlerde, şeker parçasının anomerik karbonu, karbon-karbon bağı yoluyla doğrudan bir aglikona bağlanır. O-glikozitlerle karşılaştırıldığında, C-glikozitler yapısal olarak kararlıdır ve asitlere ve enzimlere karşı dirençlidir. Sonuç olarak, tipik olarak kırılamazlar, bu da zayıf emilebilirlik ve düşük biyoyararlanım ile sonuçlanır. İlginç bir şekilde, bazı bağırsak bakterileri C-C glikozidik bağlarını parçalayabilir ve C-glikozitleri parçalamak için spesifik ve çevre dostu bir biyolojik yaklaşım sağlar. Bu çalışmada, doğal bileşiklerin biyotransformasyon modeline dayalı olarak C-C glikozidik bağlarını parçalayabilen bağırsak bakterilerini taramak için bir dizi standart işletim prosedürü (SOP) geliştirilmiştir. SÇP'ler, bağırsak bakterilerinin hazırlanmasını ve zenginleştirilmesini, aktivite odaklı taramayı ve düşük karbonlu bir kaynak ortamında aktivite doğrulamasını içerir. Bu metodoloji, bu özel fonksiyonel bakterileri izole etmeyi ve incelemeyi amaçlayan araştırmacılar için temel bir referans sağlar.
C-glikozitler, glikosil gruplarının CC bağları1 yoluyla aglikonlara doğrudan bağlanması ile karakterize edilen bir bileşik grubudur. Doğada, orientin, vitexin, puerin ve türevleri yaygın olarak C-glikozitler2 olarak tanımlanır. Bu bileşikler sıklıkla Trollius chinensis3 gibi tıbbi bitkilerde ve Styela plicata4 gibi hayvanlarda bulunur. Çalışmalar, bu bileşiklerin sağlık yararları sağladığını ve antibakteriyel 5,6,7, anti-inflamatuar 8,9,10,11,12, antiviral 3,12,13, antioksidan 14,15,16 ve Antineoplastik aktiviteler17.
Glikosil gruplarının CC bağları yoluyla iskelete bağlanması nedeniyle, bu bileşikler asidik ve enzimatik hidrolize18 karşı yüksek stabilite ve direnç sergiler, bu da zayıf emilebilirliğe ve düşük biyoyararlanıma19 yol açar. Bu sınırlama, C-glikozitlerin gelişimini ve kullanımını etkiler. Bununla birlikte, genellikle oral yoldan uygulanan C-glikozitler içeren ilaçlar, spesifik enzimler tarafından deglikosile edilir ve daha güçlü biyoaktif aglikonlar üretir 20,21,22,23. Konağın kendi enzimleri C-glikozitleri deglikosile edemezken, bağırsak bakterilerinin belirli türleri metabolize ettiği bildirilmiştir. Örneğin, bazı bağırsak bakterileri mangiferini antidiyabetik veya antineoplastik bir ajan olarak daha fazla etki gösteren noratiriole dönüştürür24. Bu bulgulara rağmen, C-glikozitleri parçalayabilen sadece sınırlı sayıda bakteri karakterize edilmiştir ve altta yatan mekanizmalar tam olarak anlaşılamamıştır. Bu bakterilerin verimli ve standartlaştırılmış taraması, işlevlerinin anlaşılmasını artıracak ve C-glikozitlerin gelişimini hızlandıracaktır.
Tarama yöntemi zaman içinde geliştirilmiş ve rafine edilerek olgun bir sisteme dönüştürülmüştür. Temel yaklaşımlar, düşük karbonlu kaynak ortamlarında zenginleştirme, aktivite odaklı tarama ve aktivite doğrulamasını içerir. Bu yöntem, saf hedef suşların izolasyonunun yanı sıra türlerin, genomik verilerin ve hedef mikroorganizmaların özelliklerinin tanımlanmasını kolaylaştırır. Bu sistemi kullanarak, C-glikozitleri parçalayabilen bağırsak bakterileri etkili bir şekilde taranabilir ve izole edilebilir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yürütülen deneyler, her bir suşla ilişkili spesifik biyogüvenlik tehlikelerine uygun yerel, ulusal ve uluslararası biyogüvenlik muhafaza düzenlemelerine bağlı kalmıştır. En az bir hafta boyunca herhangi bir ilaç kullanmayan sağlıklı gönüllülerden dışkı örnekleri toplandı. Kullanılan reaktiflerin ve ekipmanın ayrıntıları Malzeme Tablosunda verilmiştir.
1. İnsan bağırsağı bakteriyel dönüşüm modelinin in vitro olarak oluşturulması
2. İnsan bağırsak bakteri florasından tek suşların izolasyonu
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
On sağlıklı gönüllüden alınan dışkı örnekleri, dönüşüm deneyleri kullanılarak tarandı ve bu, oryantini deglikosile etmede aktivite gösteren bir örnekle sonuçlandı. Bu bulgu, aktif numuneler için taramanın fizibilitesini doğruladı. Aktif numune, plaka işaretleme yöntemi kullanılarak izole edildi. Kolonilerin morfolojisine ve özelliklerine dayanarak, daha fazla analiz için sarı veya beyaz renkli, çeşitli şekillere ve düzensiz kenarlara sahip yaklaşık 18 tek bakteri kolonisi seçildi. Bunlar arasında, sadece bir koloni, orie...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
C-glikozitleri parçalayabilen insan bağırsak bakterilerini taramak için standart işletim prosedürü (SOP) oluşturulmuştur. Bu prosedürler kullanılarak, saf bir aktif suş başarılı bir şekilde elde edildi ve deglikosilasyon özelliği, dönüşüm testleri ile doğrulandı. SOP, bağırsak bakterilerinin hazırlanması ve zenginleştirilmesi, aktivite odaklı tarama ve düşük karbonlu kaynak ortamında aktivite doğrulamasından oluşur.
Tarama işleminin en önemli yönü, bakteri akt...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar herhangi bir çıkar çatışması beyan etmemektedir.
Çalışma, Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı 82374134 tarafından desteklendi.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Asetonitril | Termo Fisher Bilimsel | F2408R205 | HPLC |
| Anaerobik İnkübatör | Şangay CIMO Tıbbi Alet İmalat A.Ş., LTD | YQX-II | |
| Sığır Özü | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 01-009 | BR |
| Sindirim Serumu Tozu | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 01-087 | BR |
| Dipotasyum Hidrojen Fosfat | Pekin Kimyasal İşler | M26298 | AR |
| Tek Kullanımlık Steril Dışkı Toplama Tüpü | Lang Fu Co., LTD | 5 mL | |
| Damıtılmış Su | Biyofarmasötik Bölümü, Pekin Geleneksel Çin Tıbbı | ||
| DMSO | Sigma-Aldrich Corporation | WXBD2861V | AR |
| EP Tüpü | Pekin Biodee Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 10 mL / 1.5 mL | |
| Eppendorf Santrifüj | Eppendorf AG | 5418 | |
| Glikoz | Pekin Kimyasal İşler | GC205003 | |
| AR Yüksek Performanslı Sıvı Kromatografı | Shimadzu Corporation | LC-20 | |
| Yüksek Basınçlı Buhar Sterilizatörü | Sanyo Denki Shanghai Co., LTD | MLS-3780 | |
| Innoval C18 Kromatografik Kolon | Agela Technologies Co., LTD | 4.6 mm ve kez; 250 mm, 5 ve mikro; m | |
| L-sistein Hidroklorür | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | BGASY01 | BR |
| Karaciğer Özü Tozu | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 01-085 | BR |
| Luteolin | Ulusal Gıda ve İlaç Kontrol | >% 98 | |
| Manyetik Karıştırıcı | Ika Werke Co., LTD | RCT temel | |
| Metanol | Thermo Fisher Bilimsel | 20240901312 | AR |
| Millipor Filtre Membranı | Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. | 0.22 ve mikro; L ve kez; 50 mm | |
| Orientin | Yishiming (Pekin) Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 19120601 | >98 |
| Pepton | Beijing Abxing Biotechnology Co., LTD | 1685787 | BR |
| Petri Kabı | Beijing Biodee Biotechnology Co., LTD | 150 mm | |
| Sodyum Klorür | Beijing Abxing Biotechnology Co., LTD | BN20008 | AR |
| Sodyum Tiyoglikolat | Şangay Jianglai Biyoteknoloji A.Ş., LTD | J031S219019 | AR |
| Çözünür Nişasta | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | S9765 | BR |
| Soya Pepton | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 2147955 | BR |
| Tripton | Agela Technologies Co., LTD | 1685787 | BR |
| Ultrasonik Temizleyici | Kun Shan Ultrasonik Aletler A.Ş., LTD | KQ-500DE | |
| Maya Özü | Pekin Abxing Biyoteknoloji A.Ş., LTD | 01-014 | BR |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.