CD4 T hücre farklılaşmasında gen fonksiyonunu araştırmak için murin naif CD4 T hücrelerinde CRISPR-Cas9 ribonükleoprotein kompleksi aracılı gen ablasyonunu kullanmak için oldukça uyarlanabilir bir yaklaşımın ana hatlarını çiziyoruz.
Yöntem makalesi
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| 0,5 M EDTA, pH = 8,0 | IPM Scientific | 11005-016 | |
| %16 Paraformaldehit, PFA | Elektron Mikroskobu Bilimleri | 15710 | %4 PFA fiksatif solüsyon yapmak için PBS ile seyreltin |
| 1x eBioscience Tamponu (1x Geçirgenleştirme tamponu) | Thermo Fisher Scientific | 00-5523-00 | 1x çözelti yapmak için kitten geçirgenleştirme tamponu kullanın |
| 1x PBS, pH = 7.4 | Kalite Biyolojik | 114-058-101 | |
| 2-merkaptoetanol (1000x) | Gibco | 21985-023 | |
| 4D Nükleofektör Çekirdek Ünitesi | Lonza | AAF-1003B | |
| 4D Nükleofektör X Ünitesi | Lonza | AAF-1003X | |
| 60 mm çanak | Falcon | 353002 | |
| 70 & mikro; m naylon örgü süzgeç | Fisherbrand | 22363548 | |
| ACK Lizing Tamponu | Gibco | A10492-01 | |
| Amaxa P3 Birincil Hücre 4D-Nükleofektör X Kiti | Lonza | V4XP-3032 | Bu kit şunları içerir: P3 Birincil Hücre Çözeltisi, Ek 1 ve 16 oyuklu nükleosite şeritleri |
| anti-FITC mikro boncuklar | Miltenyi Biotec | 130-048-701 | Miltenyi Anti-FITC Mikro Boncuk Protokolünü Takip Edin |
| anti-fare CD28 (37.51) | bioXcell | BE0015-1 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| anti-fare CD3e (145-2C11) | bioXcell | BE0001-1 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| , anti-fare IFN&gama; (XMG1.2) | bioXcell | BE0055 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| anti-fare IL-12p40 (C17.8) | bioXcell | BE0051 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| anti-fare IL-4 (11B11) | bioXcell | BE0045 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| BioLite 48 kuyulu Çok | Thermo Fisher Scientific | 130187 | |
| Sığır Serum Albümini, BSA | Sigma Life Bilim | A3059 | |
| Cas9 enzimi | IDT | 1081059 | Alt-R Sp Cas9 Nükleaz V3 (10mg / mL) - nükleer lokalizasyon dizisi içerir |
| Komple IMDM + IL-7 Ortamı | 5 ng / mL IL-7 ile | ||
| IMDM Komple IMDM Ortamı | IMDM + GlutMAX, %10 FBS, %1 L-Glutamin, %1 Pen/Strep, %0.1 BME | ||
| Komple RPMI Ortamı | RPMI-1640, %10 FBS, %1 L-Glutamin, %1 Kalem/Strep, %0.1 | ||
| BME CRISPick | |||
| https://portals.broadinstitute.org/gppx/crispick/public İstenilen crRNA'lar | IDT IDT | web sitesinden önceden tasarlanmış olarak kullanılır: https://www.idtdna.com/site/order/designtool/index/CRISPR_PREDESIGN | |
| eBioscience FOXP3/Transkripsiyon Faktörü Boyama Tampon Seti | Thermo Fisher Scientific | 00-5523-00 | Kit üç reaktif içerir: Fiksasyon/Geçirgenleştirme Konsantresi (4x), Fiksasyon/Geçirgenleştirme Seyreltici ve Geçirgenleştirme Tamponu (10x) |
| FACS Tamponu | 1x PBS, %1 FBS, 1 mM EDTA | ||
| Fetal Sığır Serumu (FBS) | VWR Seradigm Yaşam Bilimleri | 97068-085 | Kullanmadan önce ısıyı etkisiz hale getirin (56 ° C'ye kadar ısıtın; 45 dakika boyunca C) |
| FITC anti-fare CD4 (RM4-5) | Biolegend | 100510 | 1/200 seyreltme (0.5 mg / mL stok konsantrasyonu) |
| FITC anti-fare CD8 ve alfa; (53-6.7) | Biolegend | 100706 | 1/200 seyreltme (0.5 mg/mL stok konsantrasyonu) |
| Golgi Stop | BD Biosciences | 51-2092KZ | 1/2000 seyreltme |
| IMDM (1x) + GlutMAX-1 Media | Gibco | 31980-030 | |
| Streptomyces conglobatus'tan iyonomisin kalsiyum tuzu (1 mg/mL) | Sigma Aldrich | 10634 | Önerilen nihai konsantrasyon 500 ng/mL |
| L-Glutamin 200 mM (100x) | Gibco | 25030-081 | |
| LS sütunları | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
| MACS Tamponu | 1x PBS,% 0.5 BSA, 1 mM EDTA, filtre sterilize | ||
| Mitomisin C (0.5 mg / mL) | Millipore Sigma | M4287-2MG ve nbsp; | |
| Fare Naï ve CD4 T Hücre İzolasyon Kiti | Miltenyi Biotec | 130-104-453 | Miltenyi Naï'u takip edin; ve CD4 T Hücre İzolasyon Protokolü. Bu kit Naï içerir; ve CD4+ T Hücresi Biotin Antikor Kokteyli, Anti-Biotin Mikroboncuklar ve CD44 Mikroboncuklar |
| Negatif kontrol crRNA | IDT | 1072544 | kendi negatif kontrol tasarımına alternatif |
| Nükleaz İçermeyen Dubleks Tampon | IDT | 1072570 | |
| PCR tüp şeritleri | ABD Bilimsel | 1402-2700 | |
| Penisilin Streptomisin | Gibco | 15140-023 | |
| Phorbol 12-miristat 13-asetat, PMA (100 & mikro; g/mL) | Sigma Aldrich | P8139 | Önerilen nihai konsantrasyon 50 ng/mL |
| ProSeries Yüksek Performanslı 15 mL Santrifüj Tüpleri | Alkali Scientific | PS5600 | 15 mL konik tüpler |
| rekombinant insan (h) IL-2 | Peprotech | 200-02 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| rekombinant insan TGF-b1 (HEK293 türevi) | Peprotech | 100-21 | stok için Tablo 1'e bakınız konsantrasyon |
| rekombinant murin IL-12p70 | Peprotech | 210-12 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| rekombinant murin IL-4 | Peprotech | 214-14 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| rekombinant murin IL-6 | Peprotech | 216-16 | stok konsantrasyonu için Tablo 1'e bakın |
| REKOMBINANT | IL-7 | 217-17 | 100 ng/mL'de hazırlayın |
| RPMI 1640 Medya | Gibco | 21870-076 | |
| Termal Döngüleyici | Uygulamalı Biyosistemler | 4375786 | Bu termocycler modelini kullanıyoruz, ancak benzer herhangi bir ekipman bu protokolde iyi çalışacaktır |
| tracrRNA Atto550 etiketli | IDT | 1075928 | Okuma olarak Atto550 floresan kullanılarak nükleoefasyondan sonra Cas9-gRNA komplekslerinin saptanmasına izin verir. Mümkünse bu reaktifi öneriyoruz. |
| Triton-X Tampon | 1x PBS, %0,5 TritonX-100, %0,1 BSA | ||
| TritonX-100 | BioRad | 161-0407 | |
| etiketsiz tracrRNA | IDT | 1072534 | daha uygun maliyetli bir tracrRNA seçeneğidir, ancak Cas9-gRNA komplekslerinin çekirdek elevoskop verimliliğinin değerlendirilmesine izin vermez |
| Veriti Thermal Cycler, 96 kuyulu Fast | Thermo Fisher Scientific | 4375305 | Bu termosikleyici modelini kullanıyoruz, ancak benzer herhangi bir ekipman bu protokolde iyi çalışacaktır |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste