İnme, dünya çapında önde gelen bir ölüm ve sakatlık nedenidir. İnme vakalarının çoğu iskemiktir ve orta serebral arterin (MCA) tıkanmasından kaynaklanır. İskemik inme tedavisi için mevcut farmakolojik yaklaşımlar sınırlıdır; Bu nedenle, inme sonrası iskemik hasara karşı etkili nöroproteksiyon sağlayan yeni tedavilere acilen ihtiyaç duyulmaktadır. İskemik inmeyi takiben beyin dokusunda, iskemik penumbra alanı kurtarılabilir ancak geri dönüşü olmayan hasara ilerleme riski vardır. Enfarktüslü çekirdeği çevreleyen penumbral alan, nöroproteksiyon için kavramsal bir hedeftir. Penumbral bölgede kan akımı kısmen sağlandığından, bu bölgedeki nöronal ve nöronal olmayan hücreler inme sonrası geçici olarak hayatta kalır ve hala canlı olan bu hücreler uygun tıbbi müdahaleler ile kurtarılabilir. Penumbranın patofizyolojisini anlamak, nöroprotektif tedavilerin geliştirilmesinde önemlidir, çünkü iskemik penumbrada aktive olan hücre ölüm yolları, RUNX1 ve katepsinler gibi terapötik hedefleri gösterebilir. Programlanmış hücre ölümünün aracıları olarak işlev gören bu protein hedefleri, translasyonel araştırmalarda daha fazla kullanılabilir. Orta büyüklükte ve insan beynine benzerlik gösteren, MCA oklüzyonunun (MCAO) in vivo sıçan modeli, insan iskemik inmesini taklit eder ve penumbral patolojiyi araştırmak, hücre ölümü sinyalini incelemek ve MCAO bağlamında potansiyel hedeflerin etkilerini değerlendirmek için uygulanabilir bir araç sunar. Burada, sıçanlarda MCAO'nun nasıl indükleneceğini ve MCAO'yu takiben sıçan beyninde hücre ölümü sinyalinin tespiti için immünofloresan boyamanın nasıl gerçekleştirileceğini açıklıyoruz.