$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Akciğer, hava yolları, alveoller ve interstisyumdan oluşur. İmmün ve immün olmayan hücreler, hem homeostatik akciğer fonksiyonuna (gaz değişimi) hem de viral enfeksiyon gibi çevresel hakaretlere karşı konak savunmasına katkıda bulunmak için bu bölmelerde bulunur. Büyük ve küçük hava yolları veya bronşlar ve bronşiyoller, epitel hücreleri ile kaplıdır. Bu bölgelerdeki baskın epitel hücreleri, koruyucu moleküllerin salgılanmasından ve mukosiliyer klirensinkolaylaştırılmasından sorumlu olan kulüp ve siliyer hücrelerdir 1. Alveoller, akciğerdeki en distal yapılardır ve iki epitel hücre tipi, alveolar tip I hücreler (ATI'ler) ve alveolar tip II hücreler (ATII'ler) ile kaplıdır. ATI'ler gaz değişiminden sorumludur ve ATII'ler uygun yüzey gerilimini sağlamak için yüzey aktif maddeleri salgılar ve geri dönüştürür 2,3. ATII'ler kendi kendini yeniler ve ayrıca özellikle akciğer hasarından sonra önemli bir rol olan ATI'lere farklılaşabilir4. Ek olarak, ATII'ler, alveolar nişi dolduran ana bağışıklık hücresi tipi olan alveolar makrofajlar ('ler) için destekleyici bir niş sağlar5,6. Epitelin ötesinde, fibroblastlar, endotel hücreleri ve interstisyel makrofajlar (IM'ler) (hem sinir hem de damarla ilişkili olabilir) interstisyum 7,8,9,10'u içerir. Enfeksiyon ve yaralanmaya yanıt olarak, çok sayıda akciğer hücresi ölür ve monositler ve nötrofiller dahil olmak üzere bağışıklık hücreleri dokuya sızar11,12. Akciğere sızan monositler makrofajlara farklılaşır ve makrofaj bölmesine uzun süreli katkıda bulunabilir13.
Fare akciğerinden tek hücreli süspansiyonlar hazırlamak için mevcut yöntemler genellikle kollajenaz bazlıdır ve dokunun fiziksel olarak ayrışmasını gerektirir14. Bu, düşük sayıda canlı bağışıklık dışı hücre popülasyonu ile sonuçlanabilir. Epitel hücrelerini izole etmek için bazı protokoller dispaz bazlıdır ve daha yüksek oranlarda canlı epitel hücresi verir; Bununla birlikte, bu protokoller genellikle bağışıklık hücresi verimlerini ve canlılığını araştırmaz 15,16,17. Akış sitometrisi, sindirilmiş bir doku içindeki hücre popülasyonlarını ayırt etmek için kullanılan yaygın bir yöntemdir. Başlangıçta,'ler, IM'ler, monositler ve nötrofiller için akış sitometrisi geçiti açıkça tanımlanmıştır. Bununla birlikte, iltihaplanma sırasında, makrofajlara farklılaşan sızan monositlerin yüzey işaretleyici ekspresyonundaki süreklilik nedeniyle geçit işlemi değişken ve yorumlanması zor hale gelir. Bu nedenle, burada sunulan protokol, enfeksiyonu takiben ilgilenilen miyeloid hücre popülasyonlarını tanımlamak için geçit stratejilerini de özetlemektedir.
Akciğer epitel ve miyeloid hücrelerinin sağlam bir şekilde ayrılması, homeostatik ve inflamatuar fonksiyonlarını ayırt etmek için gereklidir. Bu hücre bölmelerini paralel olarak izole etmek için bir yöntem, hem sağlığı koruyan hem de hastalığa neden olan anahtar hücre tiplerinin aşağı akış analizlerini mümkün kılacaktır. Bu protokolün iş akışına şematik bir genel bakış Şekil 1'de bulunabilir.