Burada, diğer Drosophila ve böcek hücre hatlarına uygulanabilen JW18 D. melanogaster hücre hattından tek hücreli klonlar üretmek için standart bir yöntemin ana hatlarını çiziyoruz. Protokol, tek tek hücreleri izole etmek için hazırlanmış bir hücre süspansiyonunun 96 oyuklu bir plaka boyunca seri seyreltilmesini içerir. Bu hücreler daha sonra sürekli kültürler oluşturmak için en uygun koşullar altında inkübe edilir. Protokol ayrıca hücre sağkalımını ve tek hücre bölünmesini teşvik etmek için %20 şartlandırılmış ortamın eklenmesini de içerir45,46.
Protokoldeki kritik bir adım, seri seyreltmeyi takiben her kuyucukta tek bir hücrenin varlığının doğrulanmasıdır. Bu adım, tüm protokolün başarısı için gerekli olduğu için titiz bir dikkat gerektirir. Tek hücreli kökenin gelecekteki onayını kolaylaştırmak için, seçilen kuyucukların görüntülerinin çeşitli açılardan yakalanması önerilir.
Diğer bir önemli adım, hücrelerin kültür kapları arasında aktarılmasını içerir. Sürekli bir kültürün başarılı bir şekilde kurulmasını sağlamak için, hücreler ancak birleşim noktasına ulaştıklarında transfer edilmelidir. Hücre büyümesi iki haftadan fazla durgunlaşırsa, ortamı yenilemek daha fazla büyümeyi teşvik edebilir. Birleşmeden önce hücrelerin erken transferi hücre ölümüne neden olabilir.
Bu protokol, Floresanla Aktive Edilen Hücre Sıralama (FACS)38,46 gibi yaygın olarak kullanılan diğer yöntemlerden daha fazla zaman alıcı ve emek yoğun olsa da, çeşitli avantajlar sunar. Bunlar arasında maliyet etkinliği, minimum hücre hasarı riski, floresan işaretleyicilere gerek olmaması, pahalı ekipman ve optimizasyon süresi yer alır. Genel olarak, bu protokol sürekli hücre hatlarından homojen böcek hücresi popülasyonları oluşturmak için çok uygundur.
Monoklonal kültürlerin özellikleri
Sonuçlarımız, monoklonal kültürlerin oluşum hızları ve Wolbachia enfeksiyon durumları açısından farklılık gösterdiğini göstermektedir (Şekil 2, Şekil 4 ve Şekil 5). Wolbachia içermeyen klon JW18-C7, tek hücreli izolasyon protokolümüzde birleşmeye en hızlı ulaşan klondu. Wolbachia ya bu hücre soyundan her zaman yoksun olabilirdi ya da konakçı hücrenin bölünme hızına ayak uyduramama nedeniyle kaybolmuş olabilirdi. Klonlama protokolümüzdeki başlangıçtaki düşük hücre yoğunluğu nedeniyle de kaybolmuş olabilir. Bununla birlikte, diğer klonal hücre dizileri için bu gerçekleşmediğinden, bunun olası olmadığını düşünüyoruz. JW18-C7'nin Wolbachia ile deneysel enfeksiyonu (diğer tetrasiklin ile tedavi edilmiş klonların yanı sıra), bu hattın simbiyont için izin verilip verilmediğini cevaplayabilir.
Hücresel heterojenlik, JW18 hücre hattına özgü değildir ve daha önce diğer Wolbachia ile enfekte hücre hatları 32,47,48,49,50,51,52 için bildirilmiştir. İyileştirilmesi için önceki bir girişim, Wolbachia'nın D. simulans yumurtalarından veya Aa23 hücrelerinden bir C7-10 A. albopictus hücre hattı53'e transferini içeriyordu. C7-10, Wolbachia transferlerinden 54,55 yıllar önce klonlanmıştır ve transferler, incelemeyi düşündüğümüz doğal enfeksiyonu oluşturmaz.
Bireysel JW18 klonları için Wolbachia enfeksiyon durumu ve monoklonal kültür kuruluş zamanındaki fark (hücre bölünme hızındaki farklılıkların göstergesi), spesifik tedavilere yanıt olarak Wolbachia titresi ve böcek hücresi büyüme hızını birbirine bağlayan önceki çalışmalar için derin etkilere sahip olabilir. Değişen hücre sayıları, simbiyont yoğunlukları veya tedavi sırasında gen ekspresyonundaki değişiklikler, karışık bir popülasyondaki tüm hücrelerin durumundaki değişikliklerden ziyade belirli özelliklere sahip hücre tiplerinin seçiminden kaynaklanabilir. Temel özelliklerde değişkenliğe sahip karışık bir hücre popülasyonuna tedavilerin uygulanması, bu nedenle önyargılı, tekrarlanamayan sonuçlar verebilir.