Memeli beyni, trilyonlarca sinaps ile devrelere bağlı birçok inhibitör, uyarıcı ve modülatör hücreden oluşur1. Sinirbilimin temel zorluklarından biri, beyin devrelerinin ve davranışlarının organizasyonu ve işlevinde farklı hücre tiplerinin rolünü çözmektir. Beyindeki genetik olarak tanımlanmış hücreleri manipüle etmek, transgenleri tanıtmak ve ifade etmek için yöntemler gerektirir. Viral tabanlı gen dağıtım sistemleri, merkezi sinir sistemine gen iletimi için açık ara en etkili ve basit yöntemdir2. Viral dağıtım sistemleri, genetik bilgiyi bir konakçı hücreyeiletme yeteneğine sahip virüslerin (adenovirüsler, adeno-ilişkili virüsler (AAV'ler), lentivirüsler ve retrovirüsler) replike edilmesine dayanır 2,3.
AAV tabanlı vektörler, hem temel sinirbilim araştırmaları hem de nörolojik hastalıklar için gen terapisi geliştirmek amacıyla, istenen transgenlerin beyindeki hücrelere iletilmesi için en yaygın kullanılan araçlardan biri haline gelmiştir. Diğer virüslerle karşılaştırıldığında, replikasyon kusurlu AAV'ler, onları bu amaçlar için ideal vektörler yapan birçok özelliğe sahiptir. En önemlisi, AAV vektörleri, nöronlar ve glial hücreler gibi bölünmeyen (terminal olarak farklılaşmış) hücreleri verimli bir şekilde dönüştürür ve bu da in vivo2'de yüksek seviyelerde transgen ekspresyonu ile sonuçlanır. Vektörler, in vivo kullanımauygun yüksek fonksiyonel bir titrede kolayca üretilebilir 3,4,5. Daha da önemlisi, adeno ilişkili virüs aracılı gen iletimi in vivo histopatolojik değişiklikler ve vektörle ilişkili toksisite üretmez6. Adenoviral vektörlerin aksine, hayvan modellerinde AAV vektörlerinin in vivo uygulaması genellikle transdüksiyonlu hücrelere karşı konakçı bağışıklık tepkileri ortaya çıkarmaz, bu da beyin parankimi içinde uzun süreler boyunca stabil transgen ekspresyonunu mümkün kılar 2,7,8.
AAV vektörlerinin popülaritesinin bir başka nedeni, benzersiz doku ve hücre tipi tropizmlerine sahip geniş AAV serotipleridizisidir 9,10,11,12,13,14. Farklı AAV serotipleri tarafından eksprese edilen farklı kapsid proteinleri, hücre girişi için farklı hücre yüzeyi reseptörlerinin kullanılmasına ve dolayısıyla spesifik tropizmlereneden olur 10,14.
AAV tropizmi sadece kapsid proteinleri tarafından değil, diğer birçok faktör tarafından da belirlenir14. AAV serotipleri 1, 2, 6, 7, 8 ve 9'un primer kültürde 15,16 hem nöronları hem de astrositleri transdüksiyona uğrattığı, ancak intraparankimal beyin enjeksiyonunu takiben güçlü nöronal tropizm sergilediğigösterilmiştir 17,18. AAV vektör hazırlığı için kullanılan yöntem, aynı serotip için bile sinir hücresi tropizmini etkileyebilir. Örneğin, CsCl ile saflaştırılmış AAV8, intraparankimal beyin enjeksiyonunu takiben güçlü astroglial tropizme sahipken, aynı koşullar altında enjekte edilen iyodiksanol ile saflaştırılmış AAV8, sadece nöronları19 transdüksiyona tabi tuttu. AAV tropizmi, enjekte edilen doz ve hacim14'ten de etkilenebilir. Örneğin, yüksek titreli rAAV2/1, hem kortikal uyarıcı hem de inhibitör nöronları verimli bir şekilde transdüksiyon etti, ancak daha düşük titrelerin kullanılması, kortikal inhibitör nöronların transdüksiyonu için güçlü bir tercihi ortaya çıkardı20.
Bu nedenle, yalnızca kapsid serotipine dayalı olarak sağlam hücre tipi özgüllüğü elde etmek mümkün değildir. Hücre tipine özgü promotörler, AAV kapsidinin geniş doğal tropizminin üstesinden gelmek için kullanılabilir. Örneğin, insan sinapsin I, nöronları21 hedeflemek için kullanılır, CaMKII promotörü, yüksek özgüllüklü20 glutamaterjik uyarıcı nöronlarda transgen ekspresyonunu yönlendirebilir, ppHcrt promotörü, lateral hipotalamus22'deki hipokretin (HCRT) eksprese eden nöronları hedefler, PRSx8 promotörü, dopamin beta-hidroksilaz23'ü eksprese eden noradrenerjik ve adrenerjik nöronları hedefler ve GFAP promotörü, astrosite özgü ekspresyon24'ü çalıştırabilir. Bununla birlikte, bazı hücreye özgü promotörler zayıf transkripsiyonel aktiviteye sahiptir ve yeterli düzeyde transgen ekspresyonusağlayamaz 25. Ayrıca, AAV viral vektörlerine uyan kısa promotörler genellikle hücre tipi özgüllüğünü 1,26 korumaz. Örneğin, bir CaMKII yapısının aynı zamanda inhibitör nöronlarıda dönüştürdüğü gösterilmiştir 12.
Hücre tipi özgüllüğünün (tropizm) yanı sıra, AAV'lerin bir diğer önemli özelliği de transdüksiyon verimliliğidir. Çeşitli AAV serotipleri farklı difüzyon özelliklerine sahiptir. AAV2 ve dört viral vektör beyin parankimi boyunca daha az kolay yayılır ve bu nedenle daha küçük bir alanda transdüksiyona aracılık eder17,27. En yaygın nöronal transdüksiyon AAV serotipleri 1, 9 ve rh.10 11,17,18,19,28 ile gözlenir.
Belirli bir beyin bölgesinde istenen bir transgenin ekspresyonunu sağlamak için en popüler yöntem, AAV vektörünü doğrudan ilgilenilen beyin bölgesine (parankim) enjekte etmektir3. İntraparankimal enjeksiyonu takiben, beyin yoluyla daha etkili difüzyona sahip AAV serotipleri bile tipik olarak enjeksiyon bölgesi 12 çevresinde sadece lokal bir alanı dönüştürür. Ayrıca, intraparankimal enjeksiyon invaziv bir prosedürdür ve ilgilenilen bölgeye bitişik doku hasarına yol açar. Bu nedenle, bu virüs enjeksiyon yöntemi bazı deneysel görevler için uygun değildir. Örneğin, bir veya iki foton mikroskobunun kullanımı da dahil olmak üzere, serbestçe hareket eden hayvanlarda kortikal nöron fonksiyonlarını incelemeyi amaçlayan deneylerde hücrelerin kapsamlı bir şekilde etiketlenmesi oldukça arzu edilir 29,30,31,32.
Burada, yetişkin farelerde neokortikal nöronların yaygın transdüksiyonunu sağlamak ve nöronal aktivitenin müteakip optik veya elektrofizyolojik kayıtları için beyin dokusunu korumak için subaraknoid virüs infüzyonunu kullanan yeni bir adeno-ilişkili virüs enjeksiyon tekniğini açıklıyoruz. Bu yöntem sadece yüzeysel neokortikal katmanlarda nöronların yaygın transdüksiyonunu sağlamakla kalmadı, aynı zamanda CAG gibi güçlü bir seçici olmayan promotör kullanıldığında bile yüksek özgüllüğe sahip beşinci katman piramidal nöronların geniş bir popülasyonunda transgenin ekspresyonu ile sonuçlandı.