Bu protokol, deniz kestanesi Paracentrotus lividus'tan (Echinoderm) biyoaktif bileşiklerin ekstraksiyonu ve karakterizasyonunun yanı sıra kadmiyum maruziyetinden sonra oksidatif stres parametrelerinin belirlenmesi yöntemlerini vurgulamaktadır.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Yöntem makalesi
Bu protokol, deniz kestanesi Paracentrotus lividus'tan (Echinoderm) biyoaktif bileşiklerin ekstraksiyonu ve karakterizasyonunun yanı sıra kadmiyum maruziyetinden sonra oksidatif stres parametrelerinin belirlenmesi yöntemlerini vurgulamaktadır.
Kadmiyum (Cd), suda yaşayan organizmalar için en zararlı ağır metallerden biridir ve deniz biyotasında yaygın bir kirleticidir. Yüksek biyoyararlanımı, kalıcılığı ve biyolojik olarak birikme kabiliyeti nedeniyle, madencilik akışı, endüstriyel deşarj ve tarımsal girdiler tarafından boşaltılan toksik bir ağır metal olan kadmiyum (Cd), suda yaşayan organizmalar için en zararlı kirleticilerden biridir ve deniz biyotasında yaygın bir kirleticidir. Bu çalışma, kadmiyumun 96 saat boyunca bir dizi konsantrasyona (0.0183, 0.183 ve 1.83 mg / L) maruz kalan Paracentrotuslividus gonadlarındaki oksidatif stres biyobelirteçleri ve metabolit profilleri üzerindeki potansiyel toksik etkilerini değerlendirdi. Sonuçlar, Cd'nin kontrol grubuna kıyasla malondialdehit, hidrojen peroksit ve lipid hidroperoksit seviyelerini artırarak ve ayrıca antioksidan aktiviteleri artırarak (azaltılmış glutatyon ve katalaz) oksidatif stresi indüklediğini gösterdi. Ek olarak, gaz kromatografisi-kütle spektrometresi analizine dayanarak, hem tedavi edilen deniz kestanelerinin hem de kontrolün gonadal ekstraktlarında 74 metabolit tanımlandı. Kısmi En Küçük Kareler Diskriminant Analizi, net bir sınıf ayrımı ortaya çıkardı ve VIP puanları aracılığıyla ilgili dokuz metaboliti ayırt etti. Gerçekleştirilen ısı haritası analizi, steroller ve Cholest-5-en-3-ol (3.beta) gibi yağ asidi bileşiklerinin seviyelerindeki bozukluğu vurguladı.-, Desmosterol ve (23S)-etilkolest-5-en-3.beta.-ol ve eikosapentaenoik asit (EPA) ile retinoik asit gibi antioksidan savunmalar ve Pregna-5-en-20-one, 3-hidroksi-, (3β). Genel olarak, verilerimiz nispeten düşük konsantrasyonlarda bile gonadların Cd'ye karşı yüksek hassasiyetini ortaya koydu.
Deniz ortamı, ağır metaller gibi çeşitli toksik kimyasallar için de önemli bir lavabo olarak kabul edilebilir. Lipofiliklikleri nedeniyle, bu elementler asılı partikül madde ile bağlanma eğilimindedir ve hareketlilik ve biyoyararlanımın azaldığını gösterdikleri deniz çökeltilerinde giderek daha fazla birikir. Sonuç olarak, deniz çökeltileri büyük bir ağır metal yutağıgörevi görür 1. Bu kirleticiler arasında, Kadmiyum (Cd) uzun zamandır ekosistemleri ve ilgili biyotaları tehdit eden önemli bir küresel su kirleticisi olarak kabul edilmektedir2. Sucul ekosistemlerde bulunan Cd'nin üçte biri fosfatlı gübrelerin üretimi ve kullanımından gelmektedir2. Çevreye salınan diğer Cd kaynakları arasında madencilik sektörü, galvanik şirketler ve yer kabuğunun doğal süreçleri yer alır3. Bu kirletici, sulu ortamlarda kolayca taşınabilme kabiliyeti ve diğer ağır metallerin aksine nispeten büyük hareketliliği nedeniyle oldukça yaygındır2. Literatüre göre, Cd konsantrasyonları Baltık Denizi'nde4 12 ila 16 x 10−3 μg/L arasında ve Galiçya kıyıları (KB İber Yarımadası) boyunca çok kirli bir bölgede 13.4 x 10−3 ila 1.49 μg/L arasında değişmektedir5. Akdeniz'deki bazı kirli bölgelerde, konsantrasyonların Sicilya Adası (İtalya) yakınlarında 80,4 x 10-3 μg/L'ye6 ve Gabès Körfezi'nde (Tunus) 48 μg/L'ye ulaşabileceği çok daha yüksek Cd seviyeleri kaydedilmiştir7. Bu kalıcı, biyo-birikimli ve esansiyel olmayan geçiş metali, hem insan hem de suda yaşayan organizmalar için ciddi sağlık sorunlarına neden olma yeteneği ile tanınmaktadır8. Cd, proteinlere bağlanarak, enzim aktivitelerini inhibe ederek ve kalsiyum homeostazı9 ile müdahale ederek toksisitesini doğrudan uygulayabilir. Ayrıca, reaktif oksijen türlerinin (ROS) oluşumu yoluyla dolaylı olarak etki ederek lipitler, proteinler ve DNA10 gibi biyomoleküllerde oksidatif hasara yol açabilir. Çeşitli bilimsel çalışmalar, Cd kontaminasyonunun sucul organizmalarda yapısal ve fonksiyonel bozuklukları tetikleyebileceğini bildirmiştir11.
Diğer deniz bentik omurgasızlarında olduğu gibi, deniz kestaneleri de özellikle deniz kirliliğine maruz kalmaktadır. Yüksek düzeyde ağır metal biriktirme kapasitelerine rağmen, deniz kestaneleri metal kirliliği ile başa çıkabilir ve kirli ortamlarda dayanabilir12. Bu nedenle, yaygın olarak sentinel organizmalar olarak tanınırlar ve ekotoksikolojik ve çevresel çalışmalar için model olarak yaygın olarak kullanılırlar13. Çok sayıda çalışma, Cd maruziyetinin yetişkin organizmalar, embriyolar ve larvalar dahil olmak üzere farklı yaşam evrelerinde çeşitli deniz kestanesi türleri üzerindeki etkisini araştırmıştır13. Cd maruziyetinin yumurta döllenme hızında azalma, embriyo ve larva gelişiminde anormallikler, oksidatif stres, apoptoz ve otofajiye kadar çeşitli yan etkilere yol açabileceği bulunmuştur13. Mevcut literatürün çoğu, Cd'nin deniz kestanesi gelişmekte olan embriyolar üzerindeki etkisine odaklanmaktadır 13,14; Bununla birlikte, bu metalin yetişkin deniz kestanelerinin metabolik profili üzerindeki etkilerini anlamak için sadece birkaç çalışma15yapılmıştır ve lipid metabolizması hakkında herhangi bir bilgi mevcut değildir.
Paracentrotus lividus (Lamarck, 1816) embriyolarının subakut/subletal kadmiyum konsantrasyonlarına sürekli maruz kalması, iskelet uzaması ve desenlenmesindeki kusurlarla birlikte anormal gelişime neden olur, buna protein sentezinde genel bir azalma ve diferansiyel metallotiyonin ekspresyonu16 neden olur.
Önerilen yöntem, gaz kromatografisi-kütle spektrometresi (GC-MS) kullanılarak biyokimyasal tahlilleri hedefli ve hedefsiz metabolomik profilleme ile birleştirerek deniz organizmalarında kadmiyum (Cd) toksisitesinin ve oksidatif stresin değerlendirilmesini geliştirir. Yalnızca lipid peroksidasyonu veya antioksidan enzim aktiviteleri (örneğin, SOD, CAT) gibi tek biyobelirteçlere dayanan geleneksel yaklaşımlarla karşılaştırıldığında, GC-MS bazlı metabolit taramasının eklenmesi, organizmanın fizyolojik durumunun kapsamlı bir biyokimyasal parmak izini sağlar17. Bu entegrasyon, düşük Cd konsantrasyonlarında bile öldürücü etkilerin daha hassas ve sistemik olarak tespit edilmesini sağlar ve gözlemlenebilir toksikolojik hasardan önce meydana gelen enerji metabolizması, amino asit döngüsü ve oksidatif yollardaki erken bozulmaları tespit edebilir. Daha da önemlisi, bu yöntem, daha yüksek çözünürlüklü veriler sağlayarak ve geleneksel tahlillerin gözden kaçırabileceği yeni biyobelirteçlerin tanımlanmasına izin vererek mevcut toksikolojik değerlendirmeleri tamamlar18. Ayrıca, öngörücü ekotoksikoloji modellerini geliştiren yol düzeyinde analiz yoluyla mekanik anlayışı teşvik eder19. Bu yöntem, kirli kıyı ve nehir ağzı sistemleri20 ile ilgili olan 1-100 μg/L aralığında kadmiyum maruziyetini tespit eder. Yaklaşım, kontrollü laboratuvar maruziyetleri veya orta derecede karmaşık saha çalışmaları için en uygun olanıdır. Bununla birlikte, birden fazla stres faktörünün (örneğin, ağır metaller, PAH'lar, ortaya çıkan kirleticiler) etkileşime girdiği ve potansiyel olarak biyobelirteç özgüllüğünü karıştırdığı yüksek derecede kontamine matrislerde yorumlama zor olabilir. Buna rağmen, uygun şekilde tasarlandığında, GC-MS'nin sağlamlığı ve özgüllüğü, çok değişkenli veri analizi (örneğin, PCA, PLS-DA) ile birleştiğinde, örtüşen etkileri çözmek için güçlü bir ayırt edici güç sağlar.
Bu entegre biyokimyasal-metabolomik platform, Deniz Stratejisi Çerçeve Direktifi (MSFD) gibi çerçeveler altında sentinel türlerin izlenmesi ve ekolojik risk değerlendirmeleri için özellikle yararlıdır ve omik tabanlı çevresel izlemeyi ilerletmeye yönelik mevcut çabalarla tutarlıdır21.
Bu çalışmada, Cd kontaminasyonunun redoks durumu ve gonadların metabolomik profili üzerindeki etkisini değerlendirmek için Atlantik ve Akdeniz kıyıları22 boyunca en çok sömürülen ve ekonomik açıdan önemli türlerden biri olan mor deniz kestanesi P. lividus'u kullandık.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. Örnekler ve deneysel tasarım
2. Doku hazırlama
3. Azaltılmış glutatyon testi
4. Katalaz aktivitesi
5. Hidrojen peroksit üretiminin ölçülmesi
6. Malondialdehit testi
7. Lipid hidroperoksit ölçümü
8. Gonadlardan biyoaktif bileşiklerin ekstraksiyonu ve analitik tarama
9. Gonadal ekstraktların gaz kromatografisi-kütle spektrometresi analizi
10. İstatistiksel analiz
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yöntemlerimizin geçerliliği ve etkinliği, tutarlı ve güvenilir ölçümler sağlayan biyolojik ve teknik kopyaların kullanılmasıyla sağlanmıştır. Tahliller, standart sapmaların tipik olarak 'dan az olduğu düşük değişkenlik gösterdi ve bu da yüksek tekrarlanabilirliği gösterdi. Doğru metabolit miktarını sağlamak için GC-MS analizleri, kalibrasyon eğrilerini ve dahili standartları içeriyordu. Kullanılan tüm teknikler, makalede belirtildiği gibi, daha önce deniz ekotoksikolojisi ve çevresel meta...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu çalışma, Cd'nin deniz kestanesi P. lividus gonadları üzerindeki toksik etkisini biyokimyasal biyobelirteçler ve aktif metabolitleri analiz ederek değerlendirmek amacıyla planlandı. P. lividus'un farklı Cd konsantrasyonlarına maruz kalması oksidatif bir stres tepkisi üretti. Bu bulgular, deniz kestanesi alanlarındaki artan antioksidan seviyeleri ile kirletici seviyeleri13 arasındaki yakın korelasyonları gösteren önceki raporlara benzer.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarların ifşa edecek hiçbir şeyi yok.
Yazarlar, Bisha Üniversitesi Lisansüstü Çalışmalar ve Bilimsel Araştırma Dekanlığı'na, Hızlı Araştırma Destek Programı aracılığıyla bu çalışmayı desteklediği için teşekkür eder.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Dondurarak kurutucu | Biobase | BK-FD12PT dondurarak kurutucu | Liyofilizasyon |
| Gaz kromatografı | Agilent Technologies | HP 6890 gaz kromatografı | Alev İyonizasyon Dedektörü (FID) |
| GC sütunu | Agilent Technologies | HP-5 (%5-Fenil)-metilsiloksan sütunu | Polar olmayan Sütun çok çeşitli uygulamalarda üstün performans sunan |
| Kütle spektrometresi | Agilent Technologies | HP 5973 kütle spektrometresi | Dört kutuplu MS |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu makale yayımlandı
Video yakında