Son yirmi yılda, giderek daha fazla araştırmacı, kış uykusuna yatan türlerin üstün adaptasyon yeteneklerinin, biyolojik adaptasyonda yeni mekanizmaları ortaya çıkarmak için paha biçilmez fırsatlar sunduğunu ve organ koruma ve metabolik rehabilitasyon gibi çeşitli tıbbi alanlarda atılımlara ilham verebileceğini fark etti 1,2,3,4,5,6,7,8 . Bir kış uykusunda karaciğer uzun süreli soğuk koruma ve ortotopik transplantasyon için ilk kapsamlı cerrahi protokol olan Daurian yer sincabı (DGS; Spermophilus dauricus), yakın zamanda kurulmuştur. Görünüşe göre, DGS'nin soğuğa adaptif doğası, donör greftlerinin uzun süreli soğuk depolanmasına ve alıcı hayvanların transplantasyon sonrası yüksek sağkalımına olanak tanır. Bu nedenle, ameliyat sonrası hayvan iyileşmesini izlemek ve çeşitli histopatolojik ve omik çalışmalar için örnekler hazırlamak için bir takip protokolüne ihtiyaç vardır.
DGS'ler ve standart kemirgen modelleri arasındaki önemli fizyolojik farklılıklar ve alıcı hayvanlardaki karmaşık ve dinamik karaciğer nakli sonrası fizyolojik değişiklikler göz önüne alındığında, bunlardan yüksek kaliteli numuneler elde etmek, aşağı akış analizleri ve dolayısıyla nakil sonrası greft-konakçı fizyolojisinin anlaşılması için çok önemlidir. Kan ve karaciğer dokusu örneklerinin geleneksel yöntemlerle elde edilmesi, işlenmesi ve incelenmesi dışında, hepatosit olan karaciğer parankimal hücrelerinin ve endotel hücrelerini, yıldız hücrelerini, Kupffer hücrelerini ve diğer bağışıklık hücrelerini içeren parankimal olmayan hücrelerin (NPC'ler) başarılı bir şekilde ayrışması, hızla gelişen tek hücre tabanlı multi-omiklerle karmaşık post-operatif hücresel ve moleküler etkileşimlerin aydınlatılmasını sağlayacaktır. Bu amaçla, klasik kollajenaz perfüzyon bazlı yöntem 1950'lerin başından beri geliştirilmiş ve sürekli olarak rafine edilmiştir 9,10,11. Bununla birlikte, DGS karaciğerinin farklı anatomik yapısı, vasküler rekonstrüksiyona bağlı ameliyat sonrası yapışıklıklar ve karaciğer greftlerindeki ameliyatla tetiklenen fizyolojik değişikliklerin tümü, ekstraksiyon koşullarının ince ayarını gerektirir.
Bu protokol, karaciğer nakli sonrası DGS'lerde ameliyat sonrası yönetim ve örnek toplama için ayrıntılı bir kılavuz sağlar. Spesifik olarak, bu protokol, hepatositlerin karaciğer greftlerinden yüksek verim ve hücre canlılığı ile izolasyonunu sağlar ve tek hücreli RNA dizilimi (scRNA-seq) için izole edilmiş hepatositlerin müteakip işlenmesini detaylandırır.