$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Bu çalışmada kullanılan CaDIS ve SICS-105 veri setleri kamuya açık olup, ilgili yayınlarında bildirildiği üzere önceden kurumsal inceleme kurulu onayı ve bilgilendirilmiş onayı ile toplanmıştır. Bu çalışma, tamamen anonimleştirilmiş verilerin yalnızca ikincil analizini içeriyor ve bu nedenle ek etik onay veya bilgilendirilmiş onay gerekmemektedir.
Önerilen model, ameliyat sonrası vitrektomi komplikasyonlarını, intraoperatif mikroskopi videolarından alınan mekansal zamansal desenlerden yararlanarak tahmin etmek üzere tasarlandı. Pipeline dört ana aşamadan oluşur: ön işleme, segmentasyon, özellik çıkarma, özellik optimizasyonu ve sınıflandırma, Şekil 1'de gösterildiği gibi.
Ameliyat sonrası komplikasyon riskinin intraoperatif değerlendirmesi, çalışmanın tahmin hedefidir. Model, CaDIS ve SICS-105 veri setlerinde uzunlamasına takip verisi bulunmadığı için klinik olarak doğrulanmış ameliyat sonrası olayları belirli bir zaman aralığında tahmin edemez. Bunun yerine, olası sorunların olasılığını çıkarmak için ameliyat içi cerrahi kalıplar kullanır. Bu bağlamda "komplikasyon"un operasyonel tanımları arasında düzensiz faz geçişleri, anormal enstrüman-doku etkileşimleri ve cerrahi karmaşıklıkla ilişkili cerrahi iş akışındaki değişiklikler yer alır. Yorumlanabilirlik ve güvenilir değerlendirme sağlamak için, tahmin işi vakaları düşük ve yüksek riskli gruplara ayıran ikili bir sınıflandırma problemi olarak tasarlanmıştır. Bu formülasyon, doğrudan bir klinik tanı sistemi olarak hizmet vermek yerine, önerilen çerçevenin ameliyat sırasında bir karar destek aracı olarak hizmet vermesine olanak tanır.
Veri Seti Açıklaması:
Önerilen model iki veri seti üzerinde değerlendirildi: veri seti A (CaDIS, Görüntü Segmentasyonu için Katarakt Veri Seti) ve SICS-105 (Küçük İnsüzyonlu Katarakt Cerrahisi) veri seti.
(i) CaDIS31: Bu veri seti, katarakt ameliyatı videolarında segmentasyon görevi için geliştirilmiştir. Bu, kamuya açık CATARACTS challenge veri setini tamamlamak için tanıtılmış ve böylece cerrahi videoların analizi için DL şemalarının geliştirilmesini ilerletmeyi amaçlamaktadır. Veri seti, katarakt ameliyatının birkaç aşamasını gösteren toplam 4.670 annotlu çerçeveye sahip 25 video kaydından oluşmaktadır (Ek Şekil 1). Her kare titizlikle notlanmıştır; bu da eğitim ve segmentasyon şemasının tahmini için gereken piksel düzeyinde etiketler sağlar. DL modelinin cerrahi videolardaki performansını değerlendirmek için bir kıyastır görevi görür.
(ii) SICS-105 (küçük kesili katarakt cerrahisi) veriseti 32: Bu veri seti, 2023–2024 yılları arasında 6 aylık bir dönemde cerrahlar tarafından yapılan ve dört göz doktoru tarafından notasyonlanmış 105 kayıttan oluşmakta olup, 20 aşamayı kapsar (Ek Şekil 2). Toplam video süresi 22 saat 39 dakika olup, çözünürlük 1920 × 1080 piksel (960 × 540'a düşürülmüş) ve 30 fps çözünürlüktür. Ortalama bir video süresi 12 dakika 57 saniyedir (σ=4:31 dakika). Bir veri seti, Zenodo deposunda şu URL'de kamuya açık erişilebilir: https://doi.org/10.5281/zenodo.13847781. Temsilci giriş örnekleri Ek Şekil 1 ve Ek Şekil 2'de gösterilmiştir. CaDIS ve SICS-105 veri setleri başlangıçta katarakt cerrahisinde cerrahi faz tanıma ve segmentasyon için tasarlanmış olsa da, ameliyat sonrası vitrektomi komplikasyonları hakkında sınırlı bilgi bulunmaktadır. Postoperatif vitrektomi komplikasyonları hakkında bilgi eksikliğini gidermek için, video dizisindeki intraoperatif görsel desenlere ve olaylara dayanarak risk bilgisi için bir dizi vekil etiket öneriyoruz. Veri setlerindeki çerçeveler ve video dizileri klinik anlayıştan ilham alan sezgisel yöntemlere göre üç seviyeli risk bilgisi (düşük, orta, yüksek) ile notlandı; bunlar arasında enstrümant-doku etkileşim karmaşıklığı, cerrahi süre anormallikleri, tıkanma, kararsızlık ve anormal hareket dahil. Önerilen formülasyon, klinik sonuçları etiket olarak kullanmaz, aksine, ameliyat sonrası komplikasyonlara ilişkin risk bilgisi için vekil etiketler olarak ele alır.
cGAN yaklaşımıyla ön işleme
Genellikle, ham kareler genellikle aydınlatma varyasyonu, bulanıklık ve sözel artefaktlar nedeniyle bozulur. Bunu çözmek için, videoyu geliştirmek için koşullu Üretken Karşıt Ağ (cGAN) kullanılır. Ham kareler, herhangi bir geliştirme veya normalizasyon öncesinde, ameliyat içi mikroskopik video kayıtlarından doğrudan çıkarılan orijinal, işlenmemiş karelerdir. Bu çerçeveler genellikle aydınlatma değişkenliği, hareket bulanıklığı, sözel yansımalar ve cerrahi aletler ile kamera hareketinden kaynaklanan gürültü gibi artefaktlar içerir. Bir jeneratör temiz çerçeveleri geri getirirken, ayrımcı görsel gerçekçiliği sağlar. Piksel yeniden yapılandırma, karşıt ve zamansal tutarlılık kayıplarını entegre eden hedef fonksiyon, daha fazla analiz için artefaktsız ve kararlı video dizilerini sağlar.
Zaman adımı t'de kare I t olarak azalan bir kare jeneratörün girişidir, geliştirilmiş bir kare ise Yt = G(It) onun çıktısıdır. Giriş It ile koşullu olan ayrımcı, üretilen çıktı ile zemin gerçekliği temiz çerçevesi Yt arasındaki ayrımı yapacak şekilde eğitilir. Eğitim amacı, yüksek kaliteli yeniden yapıyı garanti etmek için birkaç kayıp fonksiyonunu içermektedir: (i) gerçekçiliği sağlamak için rakip kayıplar; (ii) yoğunluk doğruluğunu korumak için piksel bazında yeniden yapılandırma kaybı (L1 kaybı); (iii) derin özellik temsilleri kullanılarak yapısal tutarlılığı korumak için algısal kaybı; ve (iv) ardışık kareler arasında akıcı geçişler sağlamak ve titreme artefaktlarını önlemek için zaman tutarlılığı kaybı.
Özellik çıkarımı için yüksek kaliteli girdi sağlamak amacıyla, ameliyat sırasında mikroskopik videolar başlangıçta cGAN kullanılarak geliştirilir. Her ham çerçeve, temiz bir çerçevenin bozulmuş bir gözlemi olarak kabul edilir. Bir üreteç G, geliştirilmiş çerçeveleri geri yüklemek için G(It) = It eşleme yaparken, ayrımcı D gerçek ve üretilmiş örnekleri ayırt eder. Bir eğitim amacı, düşmanca kayıp Ladv, , algısal kayıp L perc piksel tabanlı yeniden yapılandırma kaybıL1 ve zamansal tutarlılık Ltemp.. Bu model, bulanıklık, speküler artefaktları ve gürültüyü bastırırken, zamansal ve yapısal tutarlılığı korurken, sonraki analiz için stabil, artefaktsız video dizileri sağlar. GAN'ın formülasyonu, Ek Dosya 1'in [1-6] Denklemlerinde ifade edilmiştir.
Kontur Adaptif Segmentasyon (CAS) kullanılarak segmentasyon
Bu yöntemde, segmentasyon kontur-adaptif segmentasyon modeli kullanılarak gerçekleştirilir. Bu, etkilenen vitrektomi görüntülerini mikroskopik görüntülerde segmente ayırmak için ön önsüretler tanımlar; böylece enerji fonksiyonu azalır; bu, Ek dosya 1'deki [7-12] denklemlerinde gösterildiği gibi. Düşük enerji değeri, risk altındaki bölgelerin kesin temsillerini ve yerel değerlendirmelerini sağlar. Bu da etkilenen bölgelerin kesin segmentasyonuna olanak tanır ve bu da sonraki bölümde özelliklerin çıkarılmasını kolaylaştırır.
Dinamik uzaylı-zamansal GCN(dGCN) kullanılarak Özellik Çıkarımı
Ön işleme aşaması tamamlandıktan sonra, bir sonraki adım ayırt edici uzaylı-zaman özelliklerini çıkarmaktır. Bu nedenle, yapılandırılmış bağımlılıkları yakalamada etkili olduğu için Grafik Konvolüsyon Ağı (GCN) kullanılır. Benimsenen model, aşırı uyumu azaltan ve gradyan yok olma sorununu normalizasyon mekanizmasıyla ele alan doğrusal olmayan aktivasyonlara sahip üst üste yığılmış GCN katmanlarından oluşur. GCN formülasyonu, grafik konvolüsyonlarının birinci dereceden spektral yaklaşımına dayanır ve bu da onu büyük ölçekli yarı denetimli öğrenme görevleri için uygun kılar. Ayrıca, doğrusal temsil optimizasyonu basitleştirerek etkili parametre öğrenimini sağlar. Basitleştirilmiş GCN'nin işletilmesi Ek Dosya 1'in [13–15] Denklemlerinde ifade edilir. Uygulandığında, GCN operasyon içi video verilerinden daha yüksek seviyeli yapısal temsilleri verimli bir şekilde çıkarır. Sonuç olarak, yalnızca en ilgili veya uygun özellikler, sonraki bölümde açıklanan optimizasyon destekli bir seçim mekanizması üzerinden korunur.
Uyarlanabilir Ayçiçeği tabanlı özellik optimizasyonu (ASFO) kullanarak özellik optimizasyonu
Adaptif Ayçiçeği Optimizasyon Algoritması (ASFO), Klasik Ayçiçeği Optimizasyon Yaklaşımı'nın (SFOA) geliştirilmiş bir versiyonudur. Önerilen modelde, bu biyolojik olarak yönlendirilen süreç, yüksek boyutlu bir veri setinde iyileştirme ve özellik seçimini ele almak için matematiksel olarak modellenmiştir. Özellikle, bu yaklaşım yakınsama hızını artırmak, çözüm çeşitliliğini korumak ve erken yakınsamayı azaltmak için keşif ve sömürü dengelemek için tasarlanmıştır. ASFO'nun matematiksel formülasyonu, Ek Dosya 1'in [16–21] Denklemlerinde belirtilmiştir. Bu şema, çözümler optimale yaklaştığında yakınsamayı hızlandırır. Detaylı algoritma Ek Dosya 1'de sunulmaktadır. Önerilen boru hattında, transformatör tabanlı füzyondan sonra özellik vektörünü iyileştirmek için ASFO kullanılır. Seçilen özellikler doku tabanlı, renk ve yoğunluk, morfolojik ve yapısal, hareket ve zamansal, yüksek boyutlu ve dikkat ağırlıklı bölge tanımlayıcılarıdır. Amaç, özellik-alaka kaybı fonksiyonunu en aza indirmek, böylece tekrarı azaltarak sınıflandırma doğruluğunu artıran özellikleri seçip ağırlıklandırmaktır.
Uzaylı-zaman dikkat havuzlu transformator tabanlı sınıflandırma başlığı
Cerrahi video dizileri boyunca zamansal bağımlılıkları yakalamak için transformator tabanlı bir model kullanılır. Model, son risk tahmini için çok başlı öz-dikkat, konumsal kodlama ve tamamen bağlı katmanlarla yapılandırılmıştır. Hiperparametre optimizasyonu ASFO kullanılarak gerçekleştirilir. Entegre boru hattı, ön işleme, özellik çıkarma, optimizasyon ve transformatör tabanlı sınıflandırmayı birleştirerek doğru cerrahi risk tahminini mümkün kılar.