Verileri İnflamatuar Bağırsak Hastalığı Kohort Veritabanı'na (IBDCD) girilen tüm hastalar, veritabanı kaydı sırasında kimlik dışı klinik verilerin araştırma amaçlı kullanımı için yazılı bilgilendirilmiş onay vermiştir. Aynı etik onay ve onay çerçevesi, veritabanından çıkarılan tüm verilere, geliştirme ve doğrulama kohortları dahil olmak üzere uygulandı. Bu çalışmada tanımlanabilir bir hasta bilgisi kullanılmadı ve tüm veriler kimliği silinip depolama için şifrelendi. Bu çalışma, yerleşik bir veritabanından kimliği silinmiş verilerin geriye dönük analizini içerdiğinden, etik komite bu özel analiz için ek hasta rızası gerekliliğini kaldırdı. Protokolde kullanılan araştırma araçları Materyaller Tablosu'nda listelenmiştir.
1. Meta-analizde etkileyici faktörlerin taraması
- Literatür arama stratejisi
PubMed, Web of Science, Cochrane Kütüphanesi, Embase ve Çin Ulusal Bilgi Altyapısı (CNKI) genelinde sistematik bir arama stratejisi yürütüldü. İngilizce arama stratejisi şu şekilde tanımlandı:
("Crohn Hastalığı"[Mesh] YA da "CD"[tiab] YA da "Crohn*"[tiab]) VE ("Beslenme Eksikliği"[Ağ] VEYA "Beslenme Durumu"[Mesh] VEYA "Beslenme Riski"[tiab]) VE ("Risk Faktörleri"[Ağ] VEYA "Tahmin*"[tiab])
Arama dönemi, veritabanı kuruluşundan 31 Mart 2025'e kadar olan dönemi kapsıyordu. Ayrıca, dahil edilen çalışmalardan referans listelerinin manuel taraması yapılarak potansiyel olarak kaçırılan makaleler tespit edildi. Bu strateji, Crohn hastalığı (CD) hastalarında yetersiz beslenmeyle ilgili risk ve öngörücü faktörlerin kapsamlı bir literatür incelemesini mümkün kılmıştır; bu nedenle literatür koleksiyonunun tamamlanmasını sağlamak için net tanımlanmış veritabanları, arama terimleri, zaman dilimi ve ek manuel arama prosedürleri uygulanmıştır.
- Dahil etme ve dışlama kriterleri
Dahil etme kriterleri, çalışma popülasyonlarının 2018 İltihap Bağırsak Hastalığı Tanı ve Tedavisi Konsensüsü'ne göre Crohn hastalığı teşhisi konsensüsü konsensüsüne göre ≥18 yaşında) yetişkin hastalardan oluşmasını gerektiriyordu. CD'de malnütrasyonun klinik önemi göz önüne alındığında, Avrupa Klinik Beslenme ve Metabolizma Derneği (ESPEN) 2015 kriterleri, Küresel Liderlik Malnüsasyon Girişimi (GLIM) 2019 kriterleri veya Malnütrisyon Evrensel Tarama Aracı (MUST) puanı ≥2 kullanılarak malnütrisyonu tanımlayan çalışmalara vurgu yapıldı. Literatürde tanımlanan tanı kriterleri ile çalışma kohortu içinde sonuç tanımı için ESPEN 2015 kriterlerinin yalnızca uygulanması arasında net bir ayrım sağlandı.
Uygun çalışma tasarımları, malnütrisyon risk faktörlerinin çoklu bakış açılarından kapsamlı değerlendirilmesini sağlamak için kohort, vaka-kontrol, kesitsel ve karma yöntemler çalışmalarını içeriyordu. Dışlama kriterleri arasında hayvan çalışmaları, derleme makaleleri ve konferans özetleri bulunuyordu; çünkü yetersiz veri desteği veya hakem değerlendirmesi eksikliği vardı. Temel istatistiksel bilgiye sahip olmayan çalışmalar, örneğin olasılık oranları (OR) ve karşılık gelen %95 güven aralıkları (CI) de hariç tutuldu.
2. Literatür taraması ve veri çıkarma
Literatür taraması ve veri çıkarma, iki araştırmacı tarafından bağımsız olarak gerçekleştirilerek tamlık ve doğruluk sağlandı. İlk aşamada, dahil etme kriterlerini açıkça karşılamayan çalışmaların başlık ve özetler elemesi ve veri seti potansiyel olarak ilgili, yüksek kaliteli çalışmalara daraltıldı.
Daha sonra, potansiyel uygun görülen çalışmalar için tam metin taraması yapıldı. Bu aşama, çalışmanın tasarımı, metodolojisi, sonuçları ve önceden tanımlanmış dahil etme kriterlerine uyumun ayrıntılı değerlendirilmesini içeriyor; böylece nihai analizde yalnızca tüm gereksinimleri karşılayan çalışmalar yer aldı.
Veri çıkarımı, yazar isimleri, yayın yılı, ülke, örneklem büyüklüğü, Montreal sınıflandırma alt tür dağılımı, ortalama hastalık süresi, yetersiz beslenme tanımları, değerlendirme araçları ve yetersiz beslenme riskine ilişkin %95 CI ile ilgili çıkarılmış OR'lar dahil olmak üzere temel bilgileri sistematik olarak kaydetmek için standartlaştırılmış formlarla gerçekleştirildi.
Tarama ve veri çıkarma sırasında ortaya çıkan tutarsızlıklar veya belirsizlikler iç tartışmalarla çözüldü. Uzlaşma sağlanamadığında, üçüncü taraf bir uzmana danışıldı; bu da öznel önyargıyı en aza indirerek ve objektif karar alma sağlandı. Bu titiz süreç, metodolojik şeffaflığı artırdı ve CD'de malnütrisyon riskiyle ilişkili temel faktörlerin belirlenmesi için sağlam bir temel sağladı.
3. Kalite değerlendirmesi
Dahil edilen çalışmaların bilimsel geçerliliği ve güvenilirliğini sağlamak için titiz kalite değerlendirme kriterleri uygulandı. Kohort ve vaka-kontrol çalışmaları, çalışma kalitesini üç alanda değerlendiren Newcastle–Ottawa Ölçeği (NOS) kullanılarak değerlendirildi: seçim, karşılaştırılabilirlik ve maruziyet. Sadece NOS puanı ≥7 olan çalışmalar yüksek kaliteli olarak sınıflandırıldı ve analize dahil edildi.
Kesitsel çalışmalar, katılımcı seçimi, örneklem büyüklüğü yeterliliği, veri toplama yöntemlerinin geçerliliği ve istatistiksel analizlerin uygunluğunu inceleyen Sağlık Araştırma ve Kalite Ajansı (AHRQ) değerlendirme aracı kullanılarak değerlendirildi. AHRQ puanı ≥8 olan çalışmalar dahil edilmeye uygun kabul edildi.
Bu katı kalite değerlendirme kriterlerinin uygulanması, çalışma kalite değişkenliğiyle ilgili potansiyel önyargıyı en aza indirdi ve öngörücü modelin güvenilir bir kanıt tabanıyla desteklenmesini sağladı.
4. Tahmin modeli yapısı
- Veri kaynağı
İnflamatuar Bağırsak Hastalığı Kohort Veritabanı (IBDCD), Ocak 2018 ile Mart 2025 arasında toplanan Crohn hastalığı hastalarından toplanmış klinik verileri içeren çok merkezli prospektif kohort veritabanıdır; demografik bilgiler, klinik özellikler, laboratuvar göstergeleri, tedavi rejimleri ve beslenme durumu değerlendirmelerini içerir. Model geliştirme veri seti, eğitim kohortunda 520 hasta ve doğrulama kohortunda 280 hastadan oluşan IBDCD veritabanından türetilen 800 Crohn hastalığı hastasını içeriyordu.
Dahil etme kriterleri için en az 6 ay boyunca Crohn hastalığının doğrulanmış bir tanısı ve meta-analizden elde edilen belirlenen etki faktörleri ile beslenme değerlendirme verileri dahil olmak üzere tam klinik verilerin erişilebilirliği gerekiyordu. Beslenme durumunu etkileyebilecek eşlik edinen hastalıkları olan hastalar, örneğin maligniteler veya kronik böbrek hastalığı, veri doğruluğu ve model geçerliliği için dışlandı.
- Değişken tanımı ve ataması
Yeterli beslenme, ESPEN 2015 kriterlerine göre sıkı bir şekilde teşhis edildi; bu kriterler üç temel tanısal bileşeni içerir: istemeden kilo kaybı (3 ay içinde %≥%5 veya 6 ay ≥içinde %10), azalmış gıda alımı veya emilimi (≥%25 azalma) ≥14 gün için) ve kas kütlesinin azalması, fizik muayene ve antropometrik ölçümlerle, orta kol kas çevresi dahil. Düşük vücut kitle indeksi (BMI < 18,5 kg/m 2) kesin bir tanı göstergesi yerine destekleyici olarak kabul edildi. Yetersiz beslenme yalnızca en az bir temel kriter varsa doğrulandı, düşük BMI ise ek gösterge olarak hizmet verdi. Temel kriterlere dair kanıt olmadan düşük BMI ile başvuran hastalar yetersiz beslenmiş olarak sınıflandırılmadı. Bu tanım, düşük BMI (öngörücü bir değişken) ile düşük beslenme (bir sonuç) arasındaki döngüsel ilişkiyi önledi.
Yetkin beslenme yaygınlığı eğitim grubunda %42,5 (n = 520) ve doğrulama grubunda %40,4 (n = 280) idi. Meta-analiz sonuçlarına dayanarak, hastalık aktivitesi C-reaktif protein (CRP >10 mg/L; Evet = 1, No = 0), Montreal sınıflandırması ile tanımlanan ince bağırsak duruşu (LL1/LL3 vs LL2 kolon katılımı; Evet = 1, Hayır = 0), biyolojik kullanım (Evet = 1, Hayır = 0), bağırsak rezeksiyonu öyküsü (Evet = 1, Hayır = 0) ve düşük BMI (<18,5 kg/m 2; Evet = 1, Hayır = 0). Yaş ve cinsiyet temel demografik özellikler olarak toplandı ancak ön analiz sırasında istatistiksel olarak anlamlı olmadığı için nihai modelde öngörücü değişkenler olarak dahil edilmedi.
Meta-analizde toplam 17 yüksek kaliteli çalışma yer aldı. Toplanan OR'lar ve beş öngörücü faktör için %95 CI şunlardır: yüksek CRP (OR = 4,72, %95 GA: 3,21–6,95), ince bağırsak katılımı (OR = 2,89, %95 CI: 1,93–4,33), biyolojik kullanım (OR = 0,39, %95 GA: 0,15–1,01), bağırsak rezeksiyon öyküsü (OR = 6,17, %95 GA: 2,35–16,18) ve düşük BMI (OR = 3,56, %95 GA: 2.41–5.27).
- Model oluşturma yöntemi
Meta-analizden elde edilen havuza alınan OR'lar ve karşılık gelen %95'lik CI'ler, log-OR değerlerine dönüştürülerek çok değişkenli lojistik regresyon modelinin regresyon katsayılarını (β) türetmek için kullanıldı. Meta-analiz sonuçları ile model katsayıları arasındaki tutarlılık, Pearson korelasyon analiziyle doğrulandı (r = 0.98, P < 0.001). Belirlenen etki faktörlerine dayanarak, aşağıdaki denkleme göre çok değişkenli lojistik regresyon modeli oluşturulmuştur:
"logit"(P) = α + β1 X1 + β2 X2 + β3 X3 + β4 X4 + β5 X5
burada P, yetersiz beslenme olasılığını temsil eder ve β değerler meta-analizden elde edilen havuzlanmış OR değerlerinin doğal logaritmasını temsil eder.
R yazılımı (sürüm 4.2.1) ve "rms" paketi kullanılarak, model klinik olarak uygulanabilir bir nomograma çevrildi. Orijinal risk puanları (teorik aralık: 0–325.1) klinik okunabilirliği artırmak için doğrusal olarak 0–100 aralığına ölçeklendirilmiştir. Toplam nomogram puanlarına dayanarak, hastalar düşük riskli (≤20 puan), orta riskli (21–40 puan) ve yüksek riskli (>40 puan) kategorilerine göre yüzde tabanlı kalibrasyon kullanılarak gruplandırıldı.
Özellik optimizasyonu için rastgele orman (RF) ve gradyan artırma karar ağacı (GBDT) dahil makine öğrenimi algoritmaları kullanıldı. Bir üst üste yığma stratejisi, temel öğrenenler olarak RF ve GBDT'yi, meta-sınıflandırıcı olarak lojistik regresyonu birleştirdi. Hiperparametreler, 5 katlı çapraz doğrulama kullanılarak optimize edildi; RF n_estimators = 200 ve max_depth = 10 olarak yapılandırıldı; GBDT ise n_estimators = 150 ve learning_rate = 0.1 olarak yapılandırıldı. Sentetik Azınlık Aşırı Örnekleme Tekniği (SMOTE), eğitim veri setindeki küçük sınıf dengesizliğini gidermek için uygulandı.
5. Model doğrulama
- Doğrulama veri seti
Çift doğrulama stratejisi uygulandı. İçsel doğrulama, 1.000 tekrarla bootstrap yeniden örnekleme kullanılarak gerçekleştirildi. Bekletme doğrulaması, eğitim grubuna dahil edilen hastalar hariç tutulan IBDCD veritabanından çıkarılan 280 hastadan oluşan bağımsız, örtüşmeyen bir alt küme kullanılarak gerçekleştirildi. Doğrulama grubundaki tüm hastalar 2018 İltihapur Bağırsak Hastalığı Konsensusu kapsamında Crohn hastalığı teşhisi konmuş olup, Ocak 2018'den Mart 2025'e kadar perspektif olarak toplanan veriler bulunmaktadır.
Doğrulama grubu, eğitim grubuyla aynı belirleme prosedürlerini takip etti. Yetersiz beslenme, ESPEN 2015 kriterleriyle değerlendirildi ve CRP, lezyon konumu, biyolojik kullanım, bağırsak rezeksiyon öyküsü ve BMI gibi tüm öngörücü değişkenler hastaneye yatıştan sonraki 72 saat içinde ölçüldü. Eğitim ve doğrulama kohortları arasında yaş, cinsiyet ve hastalık süresi dahil olmak üzere başlangıç özellikleri açısından anlamlı farklar gözlemlenmedi (P > 0.05), bu da doğrulama sonuçlarının güvenilirliğini ve klinik uygulanabilirliğini destekledi.
Model performansını daha iyi değerlendirmek için ek performans metrikleri hesaplandı. Eğitim grubunda hassasiyet %92,3, özgüllük %94,1, pozitif öngörücü değer (PPV) %90,5 ve negatif öngörü değeri (NPV) %95,2 idi. Doğrulama kohortunda hassasiyet %90,2, spesifiklik %92,8, PPV %88,7 ve NPV %93,9 idi. Brier puanı eğitim grubunda 0.087, doğrulama grubunda ise 0.102 olarak kabul edilebilir tahmin hatasını gösteriyor.
- Doğrulama metrikleri
Model ayırımı, alıcı çalışma karakteristikası (ROC) eğrisinin (AUC) altındaki alan kullanılarak değerlendirildi. Kalibrasyon, Hosmer–Lemeshow testi kullanılarak değerlendirildi; burada P > 0.05, tahmin edilen olasılıklar ile gözlemlenen sonuçlar arasında anlamlı bir fark olmadığını gösterdi; Brier skoru ise <0.20 değerleri kabul edilebilir tahmin hatasını gösterdi. Karar eğrisi analizi (DCA) da çeşitli eşik olasılıklar arasında klinik net faydayı değerlendirmek için yapılmıştır.
Bu doğrulama çerçevesi, Bireysel Prognoz veya Tanı (TRIPOD) beyanı yönergeleri için çok değişkenli tahmin modelinin şeffaf raporlamasına bağlıydı.
6. İstatistiksel analiz
Meta-analiz RevMan sürüm 5.4 kullanılarak yapıldı ve karşılık gelen %95 CI'ye sahip havuzlanmış OR'lar hesaplandı. Heterojenlik I2 istatistiği kullanılarak değerlendirildi; Değerler>%50 önemli heterojenliği gösterir. Rastgele etki modelleri anlamlı heterojenlik olduğunda uygulandı; aksi takdirde, sabit etkili modeller kullanılıyordu. Hassasiyet analizi, sonuçların kararlılığını değerlendirmek için bireysel çalışmalar sıralı olarak hariç tutularak gerçekleştirildi. Yayın yanlılığı huni grafikleri ve Egger testi kullanılarak değerlendirildi.
Temel istatistiksel analizler SPSS versiyon 26.0 kullanılarak gerçekleştirilmiştir. R yazılımındaki "pROC", "rms" ve "glmnet" paketleri (sürüm 4.2.1) model oluşturma ve doğrulama için kullanıldı.