Osteomielitte Bağışıklık Sisteminin Bibliyometrik ve Görsel Analizi (1990-2024)

Özet

Burada, yazarlar bağışıklık ilişkili osteomielit araştırmalarının bibliyometrik ve görsel analizini yapmak için bir protokol sunmuşlardır (1990–2024). Bu yaklaşım, küresel yayın eğilimlerini, iş birliği ağlarını ve tematik sıcak noktaları tanımlayarak iskelet enfeksiyonlarında bağışıklık merkezli yönetime geçişin sistematik bir genel bakışını sunar.

Özet

Osteomielit (OM), bağışıklık mikroçevresinin düzensizliğinin hastalığın ilerlemesine önemli ölçüde katkıda bulunduğu bir inflamatuar kemik hastalığıdır. Bu çalışma, 1990'dan 2024'e kadar bağışıklıkla ilgili OM araştırmalarının küresel manzarasını haritalamak için bibliyometrik bir analiz yürütmektedir. Web of Science Çekirdek Koleksiyonu'ndan toplam 3.031 orijinal makale ve inceleme alındı. Görselleştirme yazılımı, yayın eğilimlerini, işbirlikçi ağları ve anahtar kelime evrimini değerlendirmek için kullanıldı. Sonuçlar, yıllık yayınların istikrarlı bir şekilde arttığını, Amerika Birleşik Devletleri ve Çin'in başlıca araştırma katkı sağlayıcıları olarak öne çıktığını gösteriyor. Yüksek etkili çalışmalar, genetik-otoimmün bağlantıları araştırmaktan, Staphylococcus aureus-konak etkileşimleri ve bağışıklık kaçışını incelemeye geçiş yaptı. Disiplin eğilimleri cerrahiden immünoloji ve hesaplamalı biyolojiye kaydı. Anahtar kelime analizi, erken enfeksiyonla ilgili terimlerden moleküler bağışıklık mekanizmalarına, IL-1β ve Th17 sinyalizasyonuna geçiş olduğunu ortaya koydu. Bu analiz, osteomielit alanında patojen odaklı yaklaşımlardan bağışıklık merkezli bakış açılarına yapılan araştırma geçişinin kapsamlı bir genel bakışını sunmaktadır.

Giriş

Osteomielit (OM), mikrobiyal enfeksiyon tarafından neden olan inflamatuar bir kemik hastalığıdır ve patolojik olarak ilerleyici kemik yıkımı ile bitişik yumuşak dokuların tutulmasıyla^{karakterize edilir 1,2}. OM için ana tedavi genellikle uzun süreli kültür rehberli antibiyotik tedavisini içerir; genellikle enfekte veya ölü kemik dokusunu çıkarmak için cerrahi debridmanla birlikte^{kullanılır 3,4}. Epidemiyolojik çalışmalar, Staphylococcus aureus hematojen yayılmasını OM^5'in başlıca nedeni olarak tanımlar. Antibiyotik direncinin artan yaygınlığıyla, OM ile ilişkili neski ve engellilik oranları, özellikle diyabet, damar yetmezliği veya nöropati gibi eş hastalıkları olan yaşlı hastalar arasında artmakta ve sağlık sistemleri üzerinde önemli bir yük^{oluşturmaktadır 6}.

Son klinik gözlemler, OM ve otoinflamatuar sendromlar arasında örtüşmeler ortaya koymuştur; bu da bağışıklık düzensizliğinin hastalık patogenezinde kritik bir rol oynayabileceğini^{göstermektedir 7}. Bağışıklık mikroçevresinin düzensizliği artık kronik ve refrakter OM'de önemli bir patolojik itici güç olarak kabul edilmektedir. Bağışıklık mikroortamı düzensizliğine ek olarak, osteojenik farklılaşma gibi bozulmuş kemik metabolizması, ferroptoz gibi belirli hücresel ölüm süreçleriyle bağlantılı olabilir ve giderek OM^8'in refrakter doğasına katkıda bulunan bir faktör olarak kabul edilmektedir. Araştırmalar, patojenlerin virülans faktörleri yoluyla nötrofil kemotaksisini bozabileceğini ve makrofaj polarizasyonunu indükleyebileceğini göstermiştir. Patojenle ilişkili moleküler desenlere akut maruziyet genellikle mikrobiyal temizlenmeyi kolaylaştırmak için M1 makrofaj polarizasyonunu tetiklerken, kalıcı enfeksiyonlar ve biyofilmler genellikle immünosupresif M2 benzeri fenotipe geçişi tetikleyerek immünosupresif bir ortam^{oluşturur 9,10}. Kemik enfeksiyonu sırasında bağışıklık yanıtı oldukça karmaşıktır: miyeloid kaynaklı baskılayıcı hücrelerin anormal genişlemesi T hücresi aktivasyonunu inhibe eder ve bu da T yardımcı hücre işlev bozukluğuna yol açarken, artan B hücresi apoptozu humoral bağışıklık gözetimini^{zayıflatır 11}. Ayrıca, son genetik çalışmalar, hafıza B hücreleri dahil olmak üzere çeşitli bağışıklık hücre tiplerini, yüksek OM^{riski 12'de} rol oynadığını öne sürmektedir. OM'nin önemli toplumsal ve klinik etkisi göz önüne alındığında, hedefli tedavi stratejilerinin geliştirilmesini kolaylaştırmak için bağışıklık etkileşimlerinin temel mekanizmalarını açıklamak önemlidir.

Bibliyometrik analiz, belirli bir araştırma alanında akademik çıktı özelliklerini değerlendirmek için kullanılan metodolojik bir^{yaklaşımdır 13} ve literatürdeki temel eğilimleri ve tematik yoğunlaşmaları belirlemeyi amaçlar¹⁴. Geleneksel araştırma yöntemlerinin aksine, bibliyometrik analiz akademik yayınları keşfetmek için görselleştirme araçları kullanır; daha derin içgörüler ve önemli analitik avantajlar^{sunar 15}. Bu yaklaşım, akademik etkinin değerlendirilmesini, araştırma noktalarının ve ortaya çıkan temaların belirlenmesini ve tarihsel ve güncel odak alanlarının haritalanmasını sağlayarak gelecekteki araştırmalar için değerli rehberlik sağlar. OM'nin immünolojik boyutları son yıllarda giderek daha fazla ilgi görse de, kemik enfeksiyonu alanındaki önceki bibliyometrik çalışmalar öncelikle genel cerrahi teknikler veya antibiyotik malzemeler üzerine odaklanmıştır. Şu anda özellikle bağışıklık mikroçevresi ve konakçı-patojen etkileşimlerine odaklanan sistematik bir analiz eksik durumda. Bu çalışma, immünolojik araştırmaların nasıl geliştiğini netleştirmek ve gelecekteki konak odaklı tedaviler için boşlukları belirlemek için zamanında ve gereklidir. Bu boşluğu gidermek için yazarlar, 1 Ocak 1990'dan 31 Aralık 2024'e kadar olan dönemi kapsayan Web of Science Core Collection veritabanını kullanarak bibliyometrik bir analiz gerçekleştirdiler. Yazarlar, araştırma odaklarının bakteriyel enfeksiyonun fenotipik tanımlarından bağışıklık mikroçevresi düzensizliğinin moleküler anlayışına doğru değiştiğini, OM'de hassas yönetime doğru bir kaymayı işaret ettiğini öne sürüyorlar.

Protokol

Bu çalışmada kullanılan tüm bibliyografik veriler, halka açık veri tabanlarından (Web of Science Core Collection) alınmıştır. Bu araştırma insan katılımcıları veya hayvan denekleri içermedi; Bu nedenle, bu analiz için etik onay ve bilgilendirilmiş onay gerekmemiştir.

Veri toplama ve arama stratejisi
Osteomielitin genetik ve immünolojik mekanizmalarıyla ilgili çalışmalar, çevrimiçi bibliyografik veritabanlarından (bkz. Materyal Tablosu), özellikle bibliyometrik araştırmalarda yaygın olarak kullanılan Bilim Atıf İndeksi ve Sosyal Bilimler Atıf İndeksinden alınmıştır. Veritabanı, hakemli literatür kapsamını kapsamlı kapsamı ve dergi sınıflandırmasında yüksek doğruluk^{nedeniyle seçilmiştir 16,17}. Arama stratejisi, Başlık, Özet, Yazar Anahtar Kelimeleri ve Anahtar Kelimeler Plus'ı kapsayan Konu (TS) alanını kullandı. Kullanılan anahtar kelimeler şöyleydi: TS = (Osteomiyelit VEYA Osteomielitler) ve TS = (Bağışıklık* VEYA "T Hücresi" VEYA "B HÜCRESİ" YA DA "NK HÜCRESİ" veya nötrofil VEYA makrofaj YA da "Treg hücre"). 1 Ocak 1990'dan 31 Aralık 2024'e kadar indekslenen tüm İngilizce orijinal makale ve incelemeler dahil edilmiştir. Arama dönemi 2024 sonuna kadar araştırmayı kapsıyorken, nihai veri ihracatı 15 Nisan 2025'te gerçekleştirildi ve böylece 2024 dönemine ait tüm geç indekslenmiş yayınlar yakalandı. Otomatik tarama araçları kullanılmadı. Bibliyometrik veriler, tam kayıtlar ve atıf verilen kaynaklar dahil olmak üzere "düz metin" formatında dışa aktarıldı. İki araştırmacı bağımsız olarak aramayı yürüttü ve tutarsızlıklar tartışma yoluyla çözüldü. Bu çalışmada kullanılan tüm veriler halka açık veri tabanlarından alınmıştır; bu nedenle bu analiz için etik onay gerekmiyordu.

Veri kataloglama ve standartlaştırma
Tablo yazılımı (bkz. Materyaller Tablosu), başlıklar, bağlantılar, yayın kaynakları (dergi veya kitaplar), yazarlar, referanslar, konu kategorileri ve anahtar kelimeler dahil olmak üzere temel bilgileri kataloglamak için kullanıldı. İşlem sırasında, veri temizliği anahtar kelime eşanlamlılarının standartlaştırılması (örneğin, "S. aureus" ve "Staphylococcus aureus" birleştirilmesi) ve kurumsal isimlerin birleştirilmesiyle gerçekleştirildi. Bu standartlaşma, analitik yazılımın işbirlikçi bağlantıları ve tematik kümeleri tekrarlanmadan doğru şekilde tanımlamasını sağlar.

Yazılım tabanlı bibliyometrik analiz
Bibliyometrik analiz, özel görselleştirme ve istatistiksel araçların birleşimi kullanılarak gerçekleştirildi. Bibliyometrik görselleştirme VOSviewer (sürüm 1.6.20) (bkz. Materyaller Tablosu), ülkeler ve kurumlar arasında iş birliği ağları oluşturmak için kullanıldı. Bu görselleştirmeler için, grafiksel temsilde netliği sağlamak için minimum bir eşik (örneğin, düğüm başına 5 veya 10 yayın) belirlenmiştir. Bibliyometrik görselleştirme CiteSpace (sürüm 6.2.R2) ( bkz. Materyaller Tablosu), referans ortak alıntı ve anahtar kelime patlama analizi için kullanıldı. 35 yıllık çalışma dönemi için zaman dilimleme süresi 1 yıl olarak belirlendi. Seçim kriterleri, k = 25 ölçek faktörü olan g-indeksini kullandı. Araştırma sıcak noktalarını belirlemek için alıntı-patlama hassasiyeti (gamma) 0.7 olarak ayarlandı ve minimum patlama süresi 2 yıl olarak belirlendi. İstatistiksel yazılım (bkz. Materyal Tablosu) yayın eğilimlerini ve disiplin dağılımlarını değerlendirmek için kullanılırken, kaynaklı analiz yazılımı ( bkz. Materyal Tablosu) atıf sıklıklarını değerlendirmek için kullanıldı. Tanımlanan ana tematik terimleri entegre etmek ve özetlemek için bilgi sentezi yaklaşımı^{uygulanmıştır 18}. Tüm istatistiksel prosedürler iki araştırmacı tarafından bağımsız olarak gerçekleştirildi ve anlaşmazlıklar bulguların doğru tekrarlanmasını sağlamak için tartışma yoluyla çözüldü.

Sonuçlar

Yayınların Genel Özellikleri
Başlangıçta toplam 3.658 yayın geri alındı. Bağımsız tarama ve uygun olmayan kayıtların kaldırılmasının ardından, bibliyometrik analize 3.031 makale dahil edildi; bunların 2.480 orijinal araştırma makalesi ve 551 inceleme yer almaktadır. 627 hariç tutulan kayıtların ayrıntılı bir analizi, 212 toplantı özeti, 154 editoryal materyal, 118 mektup, 85 kitap bölümü, 42 erken erişim öğesi ve 16 İngilizce olmayan yayın tespit etti. Bu yayınlar, 3....

Tartışma

Bu bibliyometrik çalışma, osteomielitte bağışıklık sistemiyle ilgili küresel araştırma alanının sistematik bir değerlendirmesini sunar ve patojen-odaklı araştırmalardan bağışıklık mikroçevresinin moleküler anlayışına doğru önemli bir geçişi belirler. Kemik enfeksiyonu alanındaki önceki bibliyometrik analizler genel cerrahi teknikler veya antibiyotik malzemelere odaklanmışken, bulgularımız disiplinal sınırların derin bir yeniden yapılandırılmasını vurguluyor; bu süreçte immünoloji ve hesa...

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi

Ad	Şirket	Katalog numarası	Yorumlar
VOSviewer (sürüm 1.6.20)	Leiden Üniversitesi Bilim ve Teknoloji Çalışmaları Merkezi (CWTS)	NA	Veri analizi yapmak ve görsel ile grafiksel temsiller oluşturmak için diğer araçlarla birlikte kullanılır (örneğin, en üst konu kategorilerini ve anahtar kelimeleri en güçlü atıf patlamalarına sahip şekiller).
CiteSpace (sürüm 6.2.R2 Basic)	Dr. Chaomei Chen.	NA	Veri analizi yapmak ve görsel ile grafiksel temsiller oluşturmak için diğer araçlarla birlikte kullanılır (örneğin, iş birliği ağları, atıf ağları).
R (sürüm 4.3.1)	İstatistiksel Hesaplama için R Projesi (R Vakfı)	NA	Veri analizi yapmak ve görsel ile grafiksel temsiller oluşturmak için diğer araçlarla birlikte kullanılır.
Hiscite Pro (sürüm 2.0)	Bilimsel Bilgi Enstitüsü	NA	Veri analizi yapmak ve görsel ile grafiksel temsiller oluşturmak için diğer araçlarla birlikte kullanılır.
Microsoft Excel	Microsoft Corporation	NA	Başlıklar, bağlantılar, yayın kaynakları, yazarlar, referanslar, konu kategorileri ve anahtar kelimeler gibi bilgileri kataloglamak için kullanılır.