Şekil Morfometrik Analizleri: Zebrafish'te Kraniofasiyal Şekil Nicelesi için Analiz Yazılımı Araç Kutusu

Makenzie C. Stearsman; Jennan A. Lahamer; Raèden Gray; C. Ben Lovely

doi:10.3791/70345

Method Article

Şekil Morfometrik Analizleri: Zebrafish'te Kraniofasiyal Şekil Nicelesi için Analiz Yazılımı Araç Kutusu

DOI:

10.3791/70345

⸱

February 27th, 2026

Makenzie C. Stearsman¹ , Jennan A. Lahamer¹ , Raèden Gray¹^,² , C. Ben Lovely¹

¹Department of Biochemistry and Molecular Genetics, Alcohol Research Center, University of Louisville, ²Department of Pediatrics, Section of Developmental Biology, University of Colorado School of Medicine, Anschutz Medical Campus

Summary

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu çalışma, zebrafish larvalarında yüz yapısındaki değişiklikleri ölçmek için ücretsiz yazılım (tpsDigs2, MorphoJ ve PAST) kullanılarak kraniofasiyal kıkırdak şeklinin nicelendirilmesine yönelik bir protokolü tanımlar.

Abstract

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Fetal alkol spektrum bozuklukları (FASD), doğum öncesi etanol maruziyeti nedeniyle oluşan çeşitli fiziksel, bilişsel ve davranışsal bozukluklarla karakterize edilir; bunlar yüz iskeletini de etkiler. Etanole duyarlı genetik lokuslar, FASD'deki bu yüksek çeşitliliğe katkıda bulunur ve bu da yüz şekli analizlerini karmaşıklaştırır. Daha önce zebrabalıklarda gen-etanol etkileşimlerinden kaynaklanan yüz şeklindeki bu değişiklikleri analiz edebileceğimizi göstermiştik. Zebra balıkları bu varyasyonu analiz etmek için birkaç nedenle ideal bir modeldir; (i) genlerin %70'i insanlar ile zebrabalıklar arasındaki ortologlardır; (ii) dış döllenme, araştırmacıların etanol tedavilerinin zamanlamasını ve dozunu kontrol etmesine olanak tanır; (iii) yüz iskeletlerinin yapısı omurgalılarla korunmuştur; (iv) saydam larvalar, gelişim sırasında kraniofasiyal iskelet yapısındaki değişikliklerin doğrudan görüntülenmesini sağlar. Ancak, kraniofasiyal iskeletin şeklini analiz etmek, basit doğrusal ölçümlerle tam olarak değerlendirmek zor olabilir, çünkü bu ölçümler genel şekil değişikliklerini yakalamaz. Ayrıca, kafa boyutundaki değişiklikler veri yorumlamayı zorlaştırabilir. Bunu ele almak için, ücretsiz yazılım tpsDigs2, MorphoJ ve PAST üzerinden ana bileşen analizleriyle genel yüz şeklini analiz eden morfometrik bir yaklaşım uyguladık. Bu yazılımın birleşimi, genel yüz morfolojisinin çift olarak karşılaştırılmasına olanak tanır. Burada, etanol ile işlenmiş zebrafish mutantlarında yüz şekline yaklaşımımızı ve analizimizi bu programları kullanarak tamamlayıcı çok değişkenli istatistiksel analizler yaparak özetliyoruz.

Introduction

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Fetal Alkol Spektrum Bozuklukları (FASD), davranışsal, nörolojik^{ve fiziksel} ^1,2 dahil olmak üzere geniş bir gelişimsel kusur yelpazesiyle karakterize edilir. Bu fiziksel kusurlar arasında çene^hipoplazisi 3,4,5,6 gibi kraniofasiyal kusurlar da bulunmaktadır. Etanol maruziyetinin zamanlaması ve dozu FASD'nin karmaşık etiyolojisine katkıda bulunurken, genetik katkı FASD^{etiyolojisinde önemli rol oynar} 6,7,8,9,10,11,12.<....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Protocol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu işlemde kullanılan tüm zebrafish larvaları, Louisville Üniversitesi tarafından onaylanan IACUC protokollerine uygun olarak yetiştirilmiş ve yetiştirilmiştir²³.

NOT: Bu çalışmada zebra balığı türü bmp7a^ty68a²⁴ ve vahşi tip kardeşler (hepsi AB arka planında) kullanıldı; yetişkin balıklar 28,5 °C'de 14/10 saat ışık/karanlık döngü ile tutuldu. İstenilen deneysel sonuçlara göre uygun çizgileri kullanın. Ters osmozla sterilize edilmiş su kullanın. Biyolojik değişken olarak cinsiyet, incelenen gelişim aşamalarına uygulanmaz; çünkü cinsiyet, zeb....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Results

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Zebrabalıklarda etanol kaynaklı yüz şekli değişikliklerini tespit etmek için, ücretsiz erişilebilir yazılım uygulamalarını birleştirerek yüz iskeletinin morfolojik verilerini ürettik ve nicelikle ölçtüktük. BMP7a heterozigot yetişkin taşıyıcı balıklardan embriyolar 6-24 hpf arasında etanol ile üretildi ve muamele edildi. Bu çaprazlardan alınan larvalar 5 dpf olarak sabitlendi ve yüz kıkırdakları Alcian Mavisi ile boyandı. Her genotip ve tedavi grubundaki her larva için visserokr.......

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Discussion

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

FASD, çene hipoplazisi gibi kraniofasiyal kusurlar da dahil olmak üzere çok çeşitli gelişimsel kusurlarla karakterize edilir. Zebra balıkları, insanlarla genetik korumaları, yüksek doğurmaları, saydam larvaları ve dış döllenmeleri nedeniyle FASD için güçlü bir modeldir. Zebra balıkları, kraniofasiyal iskeletin oluşumunu ve etanolun gelişim üzerindeki etkisini incelemek için onlarca yıldır ^{kullanılmaktadır.} 6,12,13,15,18,28,29.

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Disclosures

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yok.

Acknowledgements

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu makalede sunulan araştırma, Ulusal Sağlık Enstitüleri/Ulusal Alkol Kötüye Kullanımı Enstitüsü (NIH/NIAAA) tarafından C.B.L.'R01AA031043 desteklenmiştir.

....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Materials

List of materials used in this article
Name	Company	Catalog Number	Comments
tpsUtil, tpsDig2, MorphoJ	https://sbmorphometrics.org		Ücretsiz Yazılım - indirme için yönetici izinleri gerekebilir
GEÇMIŞ	https://www.nhm.uio.no/english/research/resources/past/		Ücretsiz Yazılım - indirme için yönetici izinleri gerekebilir
Bileşik Parlak Alan Mikroskobu	Olympus	BX53

References

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

May, P. A., Baete, A., Russo, J., et al. Prevalence and characteristics of fetal alcohol spectrum disorders. Pediatrics. 134 (5), 855-866 (2014).
May, P. A., Gossage, J. P., Kalberg, W. O., et al. Prev....

Access restricted. Please log in or start a trial to view this content.

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Şekil Morfometrik Analizleri: Zebrafish'te Kraniofasiyal Şekil Nicelesi için Analiz Yazılımı Araç Kutusu

In This Article

Summary

Abstract

Introduction

Protocol

Results

Discussion

Disclosures

Acknowledgements

Materials

References

Reprints and Permissions

Tags

Related Articles