Burada, Het-1A hücreleri kullanılarak HCl kaynaklı reflü özofajit hücre modeli oluşturmak ve moleküler ile hücresel testlerle miR-107/FGFRL1 eksenini incelemek için bir protokol sunuyoruz.
Yöntem makalesi
* These authors contributed equally
Burada, Het-1A hücreleri kullanılarak HCl kaynaklı reflü özofajit hücre modeli oluşturmak ve moleküler ile hücresel testlerle miR-107/FGFRL1 eksenini incelemek için bir protokol sunuyoruz.
Kapsamlı kanıtlar, mikroRNA'ların (miRNA'ların) gastrointestinal patofizyolojik süreçlerde kilit rol oynadığını göstermektedir. Ancak, reflü özofajitindeki (RE) spesifik mekanizmaları hâlâ yeterince anlaşılmamaktadır. Burada, asit kaynaklı RE modeli oluşturmak ve miR-107/FGFRL1 eksenini moleküler ve hücresel testlerle incelemek için bir protokol sunuyoruz. R E (n=94) ve sağlıklı kontrol (n=94) hastalarından serum toplama dahil olmak üzere klinik örnek analizleri yaptık, ardından RT-qPCR ile nicel tespiti yapıldı. In vitro, hidroklorik asite maruz kalan Het-1A hücreleri kullanılarak asit kaynaklı bir hasar modeli oluşturuldu. Ayrıca, hücrelerin fonksiyonel doğrulaması MTT hücre canlılık testleri ve çift lusiferaz raporlayıcı testleri kullanılarak gerçekleştirildi. Temsilci sonuçlar, miR-107'nin RE hastalarının serumunda ve asitle tedavi edilmiş Het-1A hücrelerinde aşağı regülasyonda olduğunu göstermektedir. miR-107, FGFRL1'i doğrudan hedefleyerek hidroklorik asit kaynaklı Het-1A hücre canlılığı ve iltihap seviyelerindeki değişiklikleri aracılık etti ve FGFRL1 hedefleme yoluyla hücre canlılığı ve iltihaplanma değişiklikleriyle ilişkilidir. Bu protokol, RE'de miR-107/FGFRL1 aracılı mekanizmaların araştırılmasını sağlar. Bu yaklaşım, RE'de moleküler mekanizmaların incelenmesi için tekrarlanabilir bir platform sağlar.
Reflü özofajit (RE), mide asidi ve mide içeriğinin tekrar tekrar özofagusa geri döndüğü, bu da özofagus mukozasında iltihaplanma, erozyon veya hatta ülserasyona yol açan bir sindirim hastalığıdır ve bu şiddet şiddeti reflü malzemenin doğası, reflü sıklığı ve özofagus mukozasının direnciile ilişkilidir 1,2. Gastroözofageal reflü hastalığının (GERD) çok yaygın bir türü olan RE, giderek artan bir sisinlik ve giderek genişleyen küresel etkigösterir 3. RE'nin spesifik olmayan klinik görünümü genellikle yanlış teşhis veya yetersiz teşhise yol açar. Ayrıca, hastalığın tekrarlayan seyrisi sıklıkla daha ciddi gastrointestinal komplikasyonlara ilerler ve etkilenen bireyler üzerinde önemli fizyolojik ve sosyoekonomik yükleroluşturur 4. RE'nin standart klinik yönetimi genellikle farmakoterapiyi (örneğin proton pompası inhibitörleri), minimal invaziv endoskopik işlemler veya cerrahi 5,6 içerir. Ancak, terapötik etkinlik genellikle ilaçlara bağlı yan etkiler ve prosedürel morbidite nedeniyle sınırlıdır. RE'nin moleküler patogenezi hakkında eksik anlaşılma nedeniyle, altta yatan mekanizmalarının açıklanması yeni terapötik hedefleri ortaya çıkarabilir ve RE, daha etkili, hastaya özgü tedavi stratejilerinin geliştirilmesine yol açabilir. Bu protokol, in vitro RE modeli oluşturmayı ve moleküler ve hücresel testler kullanarak miR-107/FGFRL1 ekseninin düzenleyici rolünü araştırmayı amaçlamaktadır.
MikroRNA'lar (miRNA'lar), mRNA çevirisini dizilere özgü bağlanma yoluyla düzenleme yetenekleriyle birçok insan hastalığının patogenezine katıldıkları kapsamlı şekildebelgelenmiştir. Örneğin, miR-3682-3p, FHL1 ifadesini düzenleyerek Wnt/β-katenin yolunu etkiler ve bu da özofagealkanserin 8 ilerlemesine yol açar. miR-21-5p ve miR-223-3p, aşağı yönlü hedef genlerin ekspresisini aracılık ederek eozinofilik özofajitin (EOE) seyrinietkiler 9. miR-107, insanlarda kromozom 10 üzerinde kodlanan bir miRNA'dır ve çeşitli tümörjenik süreçlerdeki etkileri nedeniyle önemli araştırma ilgisi çekmiştir(10,11,12). Mevcut kanıtlar, miR-107'nin mide kanseri ve özofageal kanserde bir sıcak nokta aracıolduğunu göstermektedir 13,14, ancak neoplastik olmayan sindirim hastalıklarındaki patofizyolojik işlevleri ve düzenleyici mekanizmaları kapsamlı şekilde incelenmelidir. Ancak, RE'de miR-107 fonksiyonunu incelemek için uygun in vitro modeller ve entegre analitik yaklaşımlar sınırlı kalmaktadır.
RE15'te yemek borusu mukoza hasarından sorumlu birincil patojenik faktör olarak gastrik asit reflüsü yaygın olarak kabul edilir. Son çalışmalar, RE'nin patojenik mekanizmasının doğrudan mide sıvılarının mukoza hasarını değil, özofagus epitel hücrelerinden kemokin salınımını uyararak inflamatorik aracılı doku hasarı zincirinibaşlattığını öne sürmektedir 16. Bu sürecin altında yatan moleküler mekanizmaları araştırmak için, Het-1A hücrelerini hidroklorik asitle işleyerek asit reflüsünün neden olduğu epitel hasarının temel patolojik özelliklerini kopyalayan bir in vitro asit hasar modeli oluşturduk. Bu yaklaşım, in vitro asit kaynaklı epitel yaralanmasını taklit etmek için kontrollü ve tekrarlanabilir bir sistem sağlar. MiR-107'nin RE ile ilişkili iltihaplanma ve apoptozdaki düzenleyici rolünü ve tanısal potansiyelini sistematik olarak inceledik. Bu protokol, özofagus epitel hücrelerinde inflamatuar ve apoptotik yolların miRNA aracılı regülasyonunun araştırılmasını sağlar. Geleneksel in vivo hayvan modelleri ve birincil hücre kültürleriyle karşılaştırıldığında, HCl ile indüklenen Het-1A modeli, miR-107 fonksiyonel testleriyle birleşerek olağanüstü kararlılık, kontrol edilebilirlik ve tekrarlanabilirlik sunar; bu da asit kaynaklı epitel hasarı, miRNA aracılı transkripsiyon sonrası düzenleme ve özofagus hücrelerinde iltihablı yanıtların incelenmesi için özellikle uygundur17. Bu yöntem, özellikle asit kaynaklı epitel hasarının moleküler mekanizmalarını ve miRNA aracılı regülasyonu inceleyen çalışmalar için uygundur. Hastaların klinik analizleriyle birleştirildiğinde, bu yaklaşım klinik verilerle birleştirilerek RE'de mekanik çalışmaları destekleyebilir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
1. Hasta alımı
2. Serum örnekleri toplama
3. Hücre kültürü
4. Hücre indüksiyonu
5. Gerçek zamanlı niceliksel polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR)
6. Hücre transfeksiyonu
7. Hücre yaşamı
8. ELISA testi
9. Hedef tahmini ve lusiferaz aktivite testi
10. İstatistiksel analiz
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Hasta alımı ve başlangıç özellikleri Bu sonuçlar, RE hastalarında miR-107'nin ifadesini ve tanısal performansını tanımlar. Tablo 1 , sağlıklı kontrol ve RE hastalarının genel özelliklerini kaydetmektedir. Sonuçlar, cinsiyet, yaş ve altta yatan tıbbi geçmiş açısından iki grup arasında istatistiksel olarak anlamlı farklar göstermemektedir (p > 0.05), bu da karşılaştırılabilirliği göstermektedir.
Serum miR-107 if...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
RE, gastroözofageal reflü tarafından neden olan özofagus mukozasının inflamatuar bir hastalığıdır ve yaşam kalitesini etkileyebilecek ve ciddi komplikasyonlar geliştirme riski taşıyabilecek geniş bir yelpazede semptomlartaşıyabilir. 19. Normal fizyolojik koşullarda, mide doğasında olan savunma mekanizmaları sayesinde mide asidi ve safra karşısında korunur. Buna karşılık, özofagus sağlam bir mukus bariyeri olmadığı için bu etenlerden kaynaklanan hasara daha
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar, rekabet eden çıkarları olmadığını belirtirler.
Guangzhou Geleneksel Çin Tıbbı ve Entegre Geleneksel Çin ve Batı Tıbbı Teknolojisi Projesi (Hibe Numarası: 20242A011007). Guangdong Eyalet Geleneksel Çin Tıbbı İdaresi Bilimsel Araştırma Projesi (Hibe Numarası: 20262041).
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| Amerikan Tip Kültürü Koleksiyonu | Manassas, ABD | Ticari hücre bankası | |
| Dimetil sülfoksit | Sigma, Almanya | D4540 | |
| Dual-luciferase reporter assay kit | Promega, ABD | E1910 | dual-luciferase reporter assay system |
| FastStart Universal SYBR Yeşil Master Kit | Roche, Almanya | 4913850 | SYBR Yeşil PCR master karışımı |
| Fetal sığır serumu | Gibco, NY, ABD | 10100147C | |
| GenePharma Şirketi | Şanghay, Çin | ||
| Hidrojen klorür | Sigma-Aldrich, MO, ABD | 1099730001 | |
| IL-6 ELISA Kiti | R& D Systems, ABD | D6050 | ELISA kiti |
| IL-8 ELISA Kiti | R& D Systems, ABD | D8000C | ELISA kiti |
| Kuluçka makinesi | Forma Scientific, MA, ABD | 311 S/N29035 | |
| Lipofektamin 3000 | Invitrogen, ABD | L3000015 | Lipofektamin reagenti |
| Metil tiazolil tetrazolyum | Sigma, Almanya | M5655 | |
| Microplate okuyucu | BioTek, VT, ABD | ELx808 | |
| NanoDrop spektrofotometresi | Thermo, MA, ABD | ND-1000 | |
| Penisillin/streptomisin | Gibco, NY, ABD | 15070063 | |
| PrimeScript RT kit | Takara, Japonya | DRR047A | Ters transkripsiyon kiti |
| TRIzol | Thermo, MA, ABD | 10296010 | Fenol-kloroform reaktifi |
| Ultra düşük sıcaklıklı dondurucu | Haier, Qingdao, Çin | DW-86W100 |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste
İzin iste