Etik bildirisi
Bu çalışma in vitro bakteriyel çalışmaydı ve insan katılımcıları, hayvan denekleri veya hasta kaynaklı materyalleri içermedi. Bu nedenle, kurumsal inceleme kurulu onayı ve hayvan etiği onayı gerekmiyordu.
Vitamin C destekli Fenton sisteminde AO7 ayrışmasının değerlendirilmesi
Fenton reaksiyonunun gözlemlenebilir oksidatif davranışı üzerindeki C vitamini etkisini değerlendirmek için, oksidatif aktivitenin dolaylı kimyasal okuması olarak Acid Orange 7 (AO7) ayrıştırması kullanıldı. Bu test, bireysel reaktif oksijen türlerini özel olarak niceliklendirmez. 5 mg/L ile 100 mL AO7 çözeltisi hazırladım ve çözeltiyi pH 3'e ayarladım. H₂O₂ ve FeSO₄ eklenmiş olarak sırasıyla 2,2 mM ve 0,055 mM nihai konsantrasyonlara eklenmiştir. Reaksiyon başlatıldığında tek bir bolus olarak ya da üç aşamalı dozlama yöntemiyle C vitamini eklendi. Doz-yanıt deneyi için, 0,0,12, 0,24, 0,48, 2, 4, 6 ve 8 olan Vc:Fe 2⁺ molar oranları kullanıldı; bunlar FeSO₄ 0,055 mM'de kullanıldığında sırasıyla 0, 0,0066, 0,0132, 0,0264, 0,110, 0,220, 0,330 ve 0,440 mM olan nihai C vitamin konsantrasyonlarına karşılık geldi. Üç aşamalı toplama koşulu için, aynı toplam C vitamini miktarı üç eşit aliquot'a bölündü ve reaksiyon başlatıldıktan 3, 5 ve 7 dakika sonra bir aliquot eklendi. Örneğin, Vc:Fe2⁺ oranı 0.48 olduğunda, aliquot başına 0.0088 mM C vitamini eklenerek toplam konsantrasyon 0.0264 mM olur.
Reaksiyon çözeltisini 10 dakika boyunca karanlıkta sürekli karıştırdım ve sıcaklığı 30 °C'nin altında tuttuk. Reaksiyondan önce ve sonra 2 mL örnek topladım. UV-Vis spektrofotometre ile 483 nm'de soğurma ölçümü ve Denklem 1'i kullanarak AO7 bozulma oranı hesaplandı:
Bozulma oranı (%) = [(A₀ − A₁) / A₀] × %100 (1)
Burada, A₀ reaksiyon öncesi numunenin emilimini temsil ederken, A₁ reaksiyon sonrası numunenin emilimini temsil eder.
•OH ile ilişkili floresan sinyalinin TA probu kullanılarak değerlendirilmesi
Antibakteriyel deneylerde kullanılan aynı asidik in vitro koşullarda hidroksil radikal ilişkili floresan sinyallerini değerlendirmek için, floresan probu olarak disodyum tereftalat (TA, 1 mM) kullanılarak hücresiz bir kimyasal sistem kuruldu. Bu test, •OH ile ilişkili ürün oluşumunun göreceli bir göstergesi olarak kullanıldı ve hidroksil radikal oluşumunun mutlak nicelenmesi olarak yorumlanmadı. Yedi grup dahil edildi: (1) boş (sadece reaksiyon tamponunda 1 mM TA), (2) yalnızca H₂O₂, (3) Fe2⁺ yalnız, (4) Vc tek başına (kademeli toplama), (5) geleneksel Fenton (Fe2⁺ + H₂O₂), (6) bolus Vc eklemeli vitamin C destekli Fenton (Fe2⁺ + H₂O₂ + Vc, bolus) ve (7) Vc destekli Fenton ve adım adım Vc ekleme ile (Fe2⁺ + H₂O₂ + Vc, adım adı). Adım ekleme koşulunda, Vc reaksiyon başlatıldıktan sonra 3, 5 ve 7 dakika sonra eşit aliquotlarda uygulanırken, bolus koşulu tek bir ekleme ile aynı toplam Vc alır.
Aliquotlar 10 dakikalık bir reaksiyon süresince toplanmış, hemen NaOH ile alkalinize edilerek daha fazla radikal reaksiyonu söndürülmüş ve floresansı stabilize edilmiş ve ölçüm öncesi 4 °C sıcaklıkta saklanmıştır. TA-kaynaklı ürünün floresans yoğunluğu mikroplaka okuyucu (Ex/Em: 315/425 nm) kullanılarak ölçüldü. Radikal üretimi, boş çıkarmadan sonra floresans yoğunluğu olarak ifade edildi ve radikal oluşumunun göreceli bir göstergesi olarak kullanıldı. En az üç bağımsız deney yapıldı ve veriler 10 dakikada zaman kulturası profilleri ve uç nokta karşılaştırmaları olarak sunuldu.
Koloni sayımı ile antibakteriyel performansın değerlendirilmesi
H. pylori suşları, %25 gliserol içeren beyin kalp infüzyon (BHI) çorbasında −80 °C sıcaklıkta depolandı. Ana koloni sayma testi, kurtarma testi, matriks girişimi testi, canlı/ölü floresan boyama ve taramalı elektron mikroskopi analizi için kullanılan birincil suş H. pylori G27'ydi. Her deneyden önce, bakteriler Columbia kan agar plakalarına damlatıldı ve %5 O₂, %10 CO₂ ve %85 N₂22 içeren mikroaerofilik koşullarda 37 °C'de kuluçka altına alındı.
Birincil suşta koloni sayımı testi
Farklı tedavi koşullarında antibakteriyel aktiviteyi değerlendirmek için koloni oluşturan birim (CFU) sayımı kullanıldı. Aşağıdaki grupları içeriyordu: tedavi edilmemiş kontrol, sadece H₂O₂, yalnızca C vitamini, geleneksel Fenton reaksiyonu ve C vitamini destekli Fenton reaksiyonu. Eğer orijinal deneyde yalnızca bir Fe2⁺ grubu dahil edilmediyse, birincil testi sadece demir etkilerini Fenton reaksiyonu aracılı oksidatif etkilerden tamamen ayıran olarak yorumlamaktan kaçının. H . pylori kültürü yapıldı ve bakteriyi fizyolojik tuzlu suyla yeniden askıya alındı. 600 nm (OD₆₀₀) optik yoğunluğunu 0.5'e ayarladı ve süspansiyon, pH 3'e ayarlanmış 3 mM üre içeren fizyolojik tuzlu suyuna aktarıldı. Atanan tedavi grubuna göre H₂O₂, FeSO₄ ve C vitamini eklendi. Nihai konsantrasyonları 2,2 mM H₂O₂ ve 0,055 mM FeSO₄ olarak kullanıldı. C vitamini destekli Fenton tedavisinde, 3, 5 ve 7 dakikada üç eşit aliquot içinde C vitamini eklendi ve toplam konsantrasyon 0,0264 mM oldu.
10 dakikalık işlemden sonra, her örnek hemen fosfatla tamponlanmış tuzlu sıvıda (PBS, pH 7.4) 100 kat seyreltilerek asidik süspansiyonu nötralize etti ve kalıntı oksidanların ile demirin kaplama aşamasına aktarılmasını azalttı. Sulandırılmış bakteriyel süspansiyonu Columbia kan agar plakalarına kaplama yaptı ve %5 O₂, %10 CO₂ ve %85 N₂ mikroaerofilik koşullarda 3 gün boyunca 37 °C'de inkübe edildi. CFU'ları saydı ve antibakteriyel aktivite olarak hesaplandı, tedavi edilmemiş kontrole göre Denklem 2 kullanılarak hesaplandı:
log10 CFU indirgenmesi = log10(CFUkontrolü) − log10(CFU işlenmiş) (2)
Kurtarma testi
C vitamini destekli Fenton sisteminin antibakteriyel aktivitesinin demir bulunabilirliği ve radikal ilişkili süreçlerle ilişkili olup olmadığını incelemek için, deferoksamin (DFO) demir kelatörü ve thiourea hidroksil radikal temizleyici olarak kullanılarak kurtarma deneyleri yapıldı. DFO veya thiourea, FeSO₄ ve H₂O₂ eklenmeden 5 dakika önce bakteriyel süspansiyona eklendi. DFO ve thiourea, sırasıyla 100 μM ve 5 mM nihai konsantrasyonlarda kullanıldı.
Altı deneysel grup dahil edildi: tedavi edilmemiş kontrol, C vitamini destekli Fenton, vitamin C destekli Fenton ve DFO, C vitamini destekli Fenton ve tiorea ile, sadece DFO ve sadece tiorea ile birlikte. PH, salin/urea arka planı, H₂O₂ konsantrasyonu, FeSO₄ konsantrasyonu, C vitamini dozlama programı, tedavi süresi, kaplama öncesi seyreltme/nötralizasyon ve kuluçka koşulları dahil olmak üzere diğer tüm deneysel parametreler, birincil koloni sayımı testinde kullanılanlarla aynıydı. Antibakteriyel aktivite, CFU sayımıyla nicel edilmiş ve tedavi edilmeyen kontrole göre log₁₀ CFU azalması olarak ifade edilmiştir.
Çok sürün doğrulaması
Birincil suşta gözlemlenen antibakteriyel etkiyi sınırlı çapraz suş desteği sağlamak amacıyla, koloni sayma testi iki ek H. pylori referans suşuna da uygulandı: ATCC 43504 ve ATCC 26695. Her suş için üç deneysel grup dahil edildi: tedavi edilmemiş kontrol, geleneksel Fenton reaksiyonu ve adım adım C vitamini eklenen vitamin C destekli Fenton reaksiyonu. Deneysel koşullar ve prosedürler, birincil koloni sayımı testinde kullanılanlarla aynıydı. Antibakteriyel aktivite, her suş için tedavi edilmemiş kontrole göre log₁₀ CFU azalması olarak ifade edildi. Her deney n = 3 bağımsız biyolojik kopya ile gerçekleştirildi ve veriler ortalama ± standart sapma ile bireysel veri noktaları olarak sunuldu.
Matris girişim testi
Organik matris bileşenlerinin vitamin C destekli Fenton sisteminin antibakteriyel etkinliğini zayıfladımıp azaltamayacağını değerlendirmek için, sığır serum albümini (BSA) kullanılarak bir protein girişim modeli oluşturuldu. BSA, 0, 1 ve 3 g· nihai konsantrasyonlarında dahil edildi L⁻1. Her BSA konsantrasyonunda üç deneysel grup dahil edildi: (1) tedavi edilmemiş kontrol, (2) geleneksel Fenton (Fe2⁺ + H₂O₂) ve (3) adım adım C vitamini eklenen C vitamini destekli Fenton. Test, birincil koloni sayımı testinde tanımlanan aynı protokol altında birincil suş kullanılarak gerçekleştirildi; aynı pH koşulları, tuzlu/üre arka planı, reaktif konsantrasyonları, tedavi süresi (10 dakika) ve kaplama prosedürleri kullanıldı. Antibakteriyel aktivite, her BSA konsantrasyonunda tedavi edilmemiş kontrole göre log₁₀ CFU indirgenmesi olarak ifade edildi. Her deney en az üç kez bağımsız olarak gerçekleştirildi. Birincil karşılaştırma, geliştirilmiş Fenton durumunun, protein içeren koşullarda geleneksel Fenton durumundan üstün olup olmadığına veya en azından zayıf olup olmadığına odaklanmıştır.
Bakteriyel canlı/ölü floresan boyama
Tedaviden sonra, bakteriyel süspansiyon yukarıda tarif edildiği gibi PBS ile 100 kat seyreltilerek kalıntı asidik ve oksidatif transferi azaltmıştır. Süspansiyonu 1.800 × g ile oda sıcaklığında 10 dakika santrifüjlendirdim ve üst yüzeyi attım. Bakteriyel pellet 200 μL fizyolojik tuzlu suyla yeniden süspansiyona alındı. SYTO9 ve propidium iyodid (PI) sırasıyla 6 μM ve 30 μM nihai konsantrasyonlara eklendi. Süspansiyonu oda sıcaklığında 20 dakika karanlıkta inkubasyon yaptım. 5–10 μL boyalı bakteri süspansiyonunu temiz bir cam kaydırığa yerleştirip örtü ile kapattı. Tüm tedavi grupları için aynı pozlama ayarlarında yeşil ve kırmızı floresans kanallarıyla floresan mikroskobu kullanılarak floresan görüntüleri alındı. Her grup için en az üç rastgele seçilmiş alan yakalandı. Görüntüleri, bakteriyellerin canlılığının nicel ölçümü olarak değil, canlı/ölü boyama desenlerinin niteliksel görsel kanıtı olarak kullandı.
Taramalı elektron mikroskopisiyle bakteriyel morfoloji analizi
İşlemden sonra, bakteri örnekleri toplandı ve 0,1 M fosfat tamponunda (pH 7,4) 4 °C'de 12 saat boyunca hazırlanmış %2,5 glutaraldehit içinde sabitlendi. Fiksasyondan sonra, örnekler fosfat tamponu ile yıkanarak kalıntı fiksator çıkarıldı. Örnekler ardışık olarak %50, %70, %90 ve %100 dereceli etanol çözeltilerinde kurutuldu. Susuz kaldıktan sonra kritik nokta kurutma gerçekleştirildi. Kurutulmuş örnekler SEM kıvılcımlarına monte edilip yaklaşık 10 nm ince bir altın tabaka ile sputter kaplandı. Bakteriyel morfoloji, 5 kV hızlandırıcı voltajda taramalı elektron mikroskopisi kullanılarak incelenmiştir. Her tedavi grubu için düşük ve yüksek büyütmede temsil edici görüntüler alındı. SEM görüntüleri, tanımlanmış bir hasar mekanizmasının nicel kanıtı olarak değil, nitel morfolojik gözlemler olarak kullanıldı.
İstatistiksel analiz
İstatistiksel analizler GraphPad Prism sürüm 10.0 kullanılarak gerçekleştirildi. Tüm nicel deneyler n = 3 bağımsız biyolojik kopya ile yapıldı ve veriler ortalama ± standart sapma (SD) olarak sunuldu. TA floresans testleri için, birden fazla tedavi grubu arasında istatistiksel karşılaştırmalar tek yönlü varyans analizi (ANOVA) kullanılarak yapıldı ve ardından Tukey'nin çoklu karşılaştırma testi yapıldı. Birden fazla tedavi koşullarını içeren birincil suşta koloni sayımı testleri için, istatistiksel karşılaştırmalar tek yönlü ANOVA kullanılarak yapıldı ve ardından Tukey'nin çoklu karşılaştırma testi yapıldı. Kurtarma testleri için, gruplar arası karşılaştırmalar tek yönlü ANOVA kullanılarak yapıldı, ardından Dunnett'in çoklu karşılaştırma testi yapıldı; referans olarak vitamin C destekli Fenton grubu seti yapıldı. Sınırlı çapraz suş doğrulama deneyleri için, her suş içindeki geleneksel Fenton ve vitamin C destekli Fenton grupları arasında çiftsiz iki kuyruklu t-testi kullanılarak log₁₀ CFU indirimleri karşılaştırıldı. Matris-girişim testleri için, iki yönlü ANOVA tedavi ve BSA konsantrasyonu olarak etkileşim terimi dahil olmak üzere faktörler olarak gerçekleştirildi. Her BSA konsantrasyonunda tedaviler arasında çift karşılaştırmalar Šídák'ın çoklu karşılaştırma testi kullanılarak yapıldı. İstatistiksel anlamlılık P < 0.05 olarak tanımlandı. Anlamlılık seviyeleri *p < 0.05, ** P < 0.01, ***P < 0.001 ve ****p < 0.0001 olarak belirtilmiştir.