Etik beyanı
Çalışma, Helsinki Deklarasyonu'na uygun olarak yürütülmüş ve Ganzhou Geleneksel Çin Tıbbı Hastanesi Tıbbi Etik Kurulu tarafından onaylanmıştır (onay no. GZSZYYKYLL20240092, Tarih: 2024-12-20).
Bu protokolde kullanılan tüm materyaller, reaktifler, analiz kitleri ve ekipmanlar Materyal Tablosu'nda listelenmiştir.
Çalışma tasarımı
Bu retrospektif vaka-kontrol çalışmasına, Haziran 2024 ile Ağustos 2025 tarihleri arasında Ganzhou Geleneksel Çin Tıbbı Hastanesi kadın hastalıkları polikliniğinde tanı alan 62 PCOS'lu hasta ve aynı dönemde hastanenin sağlık yönetim merkezinde muayene edilen üreme çağındaki 71 sağlıklı kadın dahil edilmiştir. Kontroller, grup düzeyinde yaş karşılaştırılabilirliğini sağlamak için seçilmiştir; BMI eşleştirme değişkeni olarak kullanılmamış ve temel bir özellik olarak değerlendirilmiştir.
Çalışma özneleri
Dahil edilme kriterleri: PCOS grubunun dahil edilme kriterleri şu şekildeydi: (1) yaş >18 yıl; (2) ilgili bozuklukların dışlanmasının ardından, 2023 Uluslararası Kanıta Dayalı Kılavuz tarafından onaylanan modifiye Rotterdam kriterlerine göre PCOS tanısı; bu tanı için aşağıdaki üç özellikten en az ikisinin bulunması gerekir: 35 günden daha uzun adet döngüleri veya yılda sekizden az döngü olarak tanımlanan oligo-ovülasyon veya anovülasyon; klinik hiperandrojenizm ve/veya biyokimyasal hiperandrojenizm (biyokimyasal hiperandrojenizm, serum toplam T konsantrasyonunun analiz spesifik üst referans limitinin üzerinde olması olarak tanımlanmıştır); ve tam folikül sayımının mümkün olmadığı durumlarda, tek bir yumurtalıkta en az 20 folikül veya en az 10 mL yumurtalık hacmi olarak tanımlanan polikistik over morfolojisi14; (3) eksiksiz elektronik tıbbi kayıtlar; (4) önceki 3 ay boyunca hormon replasman tedavisi, hipoglisemik ajanlar veya immünosupresanlar kullanmamış olmak; ve (5) kayıt sırasında toplanan ve kurumsal biyobankada saklanan açlık serum örneğinin mevcut olması.
Kontrol grubu için dahil edilme kriterleri şunlardı: (1) aynı dönemde sağlık taraması için başvurmuş olmak; (2) düzenli menstrüel döngülere sahip olmak; (3) transvajinal ultrasonografide normal over morfolojisi; (4) endokrin bozukluk, jinekolojik hastalık, infertilite veya klinik olarak anlamlı hepatik ya da renal disfonksiyon öyküsü bulunmaması; ve (5) muayene gününde toplanmış ve kurumsal biyobankada saklanmış açlık serum örneğinin mevcut olması.
Dışlama kriterleri şunlar olurdu: (1) endometriozis, uterin miyomlar, over tümörleri, pelvik inflamatuar hastalık veya diğer jinekolojik bozukluklar; (2) tiroid disfonksiyonu, Cushing sendromu, hiperprolaktinemi, konjenital adrenal hiperplazi veya ovülasyon disfonksiyonu ya da hiperandrojenizmi açıklayabilecek diğer endokrin bozukluklar; (3) şiddetli kardiyak, hepatik, renal veya pulmoner disfonksiyon, malign tümörler, otoimmün hastalıklar veya hematolojik bozukluklar; (4) önceki 6 ay içinde gebelik, doğum veya abortus; (5) önceki 3 ay boyunca glukokortikoidlerin, oral kontraseptiflerin veya glukoz ya da lipid metabolizmasını etkileyen diğer ilaçların kullanımı; (6) psikiyatrik bozukluklar veya bilişsel bozulma; (7) temel klinik bilgilerin eksikliği; ve (8) hemoglobin konsantrasyonu >2.0 g/L olarak tanımlanan şiddetli serum hemolizi, lipemi, sarılık, birden fazla dondurma-çözme döngüsü veya kesintili numune saklama. Tiroid disfonksiyonu, hiperprolaktinemi ve klasik olmayan konjenital adrenal hiperplazi; sırasıyla tiroid uyarıcı hormon, serum prolaktin ve 17-hidroksiprogesteron ölçümleri kullanılarak dışlandı; uygun durumlarda folikül uyarıcı hormon incelenirken, klinik olarak endike olduğunda Cushing sendromu veya adrenal tümör araştırıldı. Tüm klinik numunelere aynı pre-analitik prosedür uygulandı ve birincil analize dahil edilen hiçbir numune birden fazla dondurma-çözme döngüsüne maruz kalmadı.
Serum örneği toplama ve saklama
Açlık venöz kanı (10 mL), sabah saatlerinde antikoagülan içermeyen tüplere toplandı, oda sıcaklığında 30 dk boyunca pıhtılaşmaya bırakıldı ve 4 °C'de 15 dk boyunca 1,505 x g hızda santrifüj edildi. Serum, 200 µL'lik alikotlara ayrıldı ve analiz edilene kadar −80 °C'de saklandı. Tüm klinik örneklere aynı pre-analitik prosedür uygulandı ve birincil analize dahil edilen hiçbir örnek birden fazla dondurma-çözme döngüsüne maruz kalmadı.
Metodik validasyon için numunelerin hazırlanması
Santrifüj hızının (15 dakika boyunca 1,505, 3,000 ve 4,000 x g), dondurma-çözdürme sıklığının (0, 1, 3 ve 5 döngü), saklama sıcaklığının (7 gün boyunca 4 °C, −20 °C ve −80 °C), saklama süresinin (−80 °C'de 1, 3, 6 ve 12 ay) ve hemolizin (<0.1, 0.1–0.5 ve 0.5–2.0 g/L hemoglobin) etkilerini değerlendirmek için sağlıklı gönüllülerden alınan on adet havuzlanmış serum numunesi kullanılmıştır.
Laboratuvar testleri
Tüm laboratuvar analizleri, aynı eğitimli teknisyen tarafından, standartlaştırılmış çevresel koşullar altında ve önceden belirlenmiş çalışma prosedürlerine uygun olarak gerçekleştirilmiştir. Serum miRNA'ları qRT-PCR ile kantifiye edilmiştir; ADPN, LEP ve RBP4 sandwich ELISA ile ölçülmüştür; T ve IL-6 kemilüminesans tabanlı immünolojik testlerle ölçülmüştür; glukoz metabolizma değişkenleri ise rutin otomatik laboratuvar yöntemleri kullanılarak elde edilmiştir.
qRT-PCR ile serum miRNA kantifikasyonu
Toplam RNA, TRIzol reaktifi kullanılarak 200 µL serumdan ekstre edilmiştir. Arşivlenmiş serum RNA preparatları için spektrofotometrik RNA konsantrasyonu ve A260/A280 saflık verileri mevcut değildi. Bu nedenle, qRT-PCR analizi kabul edilebilirliği, tek bir spesifik erime eğrisi piki varlığına ve üç teknik tekrarlanabilirlik arasındaki uyuma göre değerlendirilmiştir. Kloroform faz ayrımı, izopropanol çöktürmesi ve %75 etanol ile iki yıkama işleminden sonra, RNA peleti enzim içermeyen suda çözülmüştür. 20 µL'lik reaksiyon sistemi 4 µL 5x tampon, 1 µL ters transkriptaz, 1 µL 10 µM stem-loop primeri ve 5 µL RNA kalıbı içermiştir. Reaksiyon koşulları 30 dk boyunca 16 °C, 30 dk boyunca 42 °C ve 5 sn boyunca 85 °C olarak uygulanmıştır. Ters transkripsiyon ürünleri −20 °C'de saklanmıştır. Kantitatif PCR, TaKaRa SYBR Premix Ex Taq II kiti kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Her 20 µL'lik reaksiyon 10 µL 2× SYBR karışımı, her birinden 0.8 µL ileri ve geri primer (10 µM) ve 2 µL cDNA kalıbı içermiştir. Amplifikasyon, Applied Biosystems 7500 gerçek zamanlı PCR sistemi üzerinde şu koşullarda gerçekleştirilmiştir: 95 °C'de 30 sn ön-denatürasyon; 95 °C'de 5 sn ve 60 °C'de 30 sn şeklinde 40 döngü; ardından amplifikasyon spesifikliğini doğrulamak için erime eğrisi analizi yapılmıştır. U6 snRNA iç referans gen olarak kullanılmış ve miR-146a, miR-642a ve miR-2861'in bağıl ekspresyon seviyeleri 2-ΔΔCt yöntemi kullanılarak hesaplanmıştır. Her örnek üç kez test edilmiştir. Bu çalışmada kullanılan tüm primerlerin dizileri Tablo 1'de listelenmiştir.
Serum protein belirteçlerinin saptanması
Serum ADPN, LEP ve RBP4 konsantrasyonları, sırasıyla Human Total ADPN/Acrp30 Quantikine ELISA Kit (analitik hassasiyet, 0.891 ng/mL; ölçüm aralığı, 3.9–250 ng/mL), Human Leptin Quantikine ELISA Kit (analitik hassasiyet, 7.8 pg/mL; ölçüm aralığı, 15.6–1,000 pg/mL) ve Human RBP4 Quantikine ELISA Kit (analitik hassasiyet, 0.628 ng/mL; ölçüm aralığı, 1.56–100 ng/mL) kullanılarak çift antikorlu sandviç ELISA yöntemiyle ölçülmüştür. Her bir analiz ilgili insan analiti için spesifiktir ve serum örnekleri üreticinin talimatlarına göre dilüe edilmiştir. Absorbans 450 nm'de ölçülmüş ve konsantrasyonlar dört parametreli lojistik standart eğriler kullanılarak hesaplanmıştır. Analiz içi veya analizler arası CV değerleri ADPN için %2.5 veya %3.2, LEP için %2.7 veya %3.4 ve RBP4 için %2.6 veya %3.3 olarak belirlenmiştir.
T ölçümü
Serum T seviyeleri, Roche Cobas e601 otomatik immünassay analizörü kullanılarak elektrokemilüminesans immünassay ile ölçülmüştür.
Glikoz metabolik ve inflamatuar ölçümler
Açlık plazma glikoz, açlık insülin ve HbA1c değerleri, miRNA ve metabolik protein analizleri için kullanılan arşivlenmiş serum alikotlarından ziyade, aynı güne ait rutin klinik laboratuvar kayıtlarından elde edilmiştir. Açlık plazma glikozu glikoz oksidaz yöntemiyle, açlık insülini immunoturbidimetri ile ve HbA1c yüksek performanslı sıvı kromatografisi ile ölçülmüştür. HOMA-IR, [açlık plazma glikozu (mmol/L) × açlık insülini (mIU/L)]/22.5 şeklinde hesaplanmıştır. Serum IL-6, kemilüminesans immünassay ile ölçülmüştür.
Metodolojik doğrulama
Alternatif yöntem karşılaştırmaları, birincil ölçümlerin analiz platformuna karşı dayanıklı olup olmadığını belirlemek amacıyla gerçekleştirilmiştir ve gruplar arası temel sonuçların oluşturulmasında kullanılmamıştır. Üç miRNA ve beş biyokimyasal belirtecin ekspresyon seviyeleri, yukarıda açıklanan farklı işlem koşulları altında ölçülmüş ve her bir gösterge için varyasyon katsayısı CV = (standart sapma/ortalama) x 100% şeklinde hesaplanmıştır. Bir CV <Farklı örnek işleme ve saklama koşulları altında analiz sonuçlarının stabilitesini değerlendirmek için %15 kabul edilebilir olarak belirlenmiştir. Gün içi kesinlik, aynı havuzlanmış serum örneğinin tek bir günde 10 kez tekrarlanan ölçümleriyle değerlendirilmiş; günler arası kesinlik ise beş ardışık gün boyunca günde bir kez gerçekleştirilen ölçümlerle belirlenmiştir. Her bir gösterge için ortalama, standart sapma ve ilgili CV hesaplanmıştır. Analitik uyum testi için beş biyokimyasal analit (ADPN, LEP, RBP4, IL-6 ve T), validasyon örneklerinde birincil analiz yöntemi ve Roche kemilüminesans tabanlı bir immünassay platformu kullanılarak ölçülmüştür. %95 uyum sınırlarını hesaplamak için Bland-Altman analizi kullanılmıştır. Tüm klinik miRNA ölçümleri için birincil qRT-PCR analizi kullanılmış, miScript SYBR Green PCR Kit ise yalnızca analitik uyum deneyinde ortogonal bir yöntem olarak kullanılmıştır; iki qRT-PCR sistemi arasındaki Pearson korelasyon katsayıları hesaplanmıştır.
İstatistiksel analiz
Veri analizi istatistiksel yazılım kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Tüm sürekli değişkenler öncelikle Shapiro-Wilk testi ile normallik açısından test edilmiştir. Normal dağılım gösteren veriler ortalama ± standart sapma olarak ifade edilmiştir. İki grup arasındaki karşılaştırmalar bağımsız örneklemler t testi ile yapılırken, çoklu gruplar arasındaki karşılaştırmalar tek yönlü varyans analizi ve ardından ikili karşılaştırmalar için LSD-t testi kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Normal dağılıma uymayan veriler medyan (çeyrekler arası aralık) [M (P25, P75)] olarak sunulmuştur. Bu durumda iki grup arasındaki karşılaştırmalar Mann-Whitney U testi, çoklu gruplar arasındaki karşılaştırmalar ise Kruskal-Wallis H testi ile yapılmıştır. Kategorik veriler frekans ve yüzde olarak sunulmuştur. Grupları karşılaştırmak için χ2 testi veya Fisher'ın kesin testi kullanılmıştır. Değişkenler arasındaki korelasyonlar, veri dağılımına göre Pearson korelasyon analizi veya Spearman sıra korelasyon analizi kullanılarak değerlendirilmiştir. Keşifsel bir analiz olarak, her bir miRNA ile altı metabolik belirteç arasındaki Pearson korelasyonları, obez olmayan (BMI <28 kg/m2) ve obez (BMI ≥28 kg/m2) PCOS alt grupları içerisinde tekrarlanmıştır. Korelasyon katsayıları Fisher r-to-z dönüşümü kullanılarak karşılaştırılmış ve ortaya çıkan alt gruplar arası p değerleri Benjamini–Hochberg yanlış keşif oranı prosedürü ile düzeltilmiştir. Tanısal performans, alıcı işletim karakteristik (ROC) eğrileri ve eğri altındaki alan (AUC) kullanılarak değerlendirilmiştir. Ayrıca, kombine tespit lojistik regresyon modeli kullanılarak analiz edilmiştir. Tüm testler çift yönlüydü ve p < 0.05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi.